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The map label for this gene is nhaC2 [H]

Identifier: 218902933

GI number: 218902933

Start: 1711257

End: 1712660

Strand: Direct

Name: nhaC2 [H]

Synonym: BCAH820_1816

Alternate gene names: 218902933

Gene position: 1711257-1712660 (Clockwise)

Preceding gene: 218902932

Following gene: 218902936

Centisome position: 32.27

GC content: 36.04

Gene sequence:

>1404_bases
ATGAAAAGTGTAAGATTACCATCGATGCTAGAAATCATAGTTCTTTTATTATTATTTCTTGCTGTTGTCTTTTCCTTCCA
AACGATTTTTGATCTCCCAATTCAATTAGCGCTATTTATTTCATGGTTTTTAGTAATTGCGCTTGGATTAAGATTAGGAT
TTCGTTATCAAGAATTGCAGGATGCAATTACGAAAGGGATTTCTAACGGATTAGAAGCAATACTCATTTTAGTTGCAGTA
GGTGCTTTAATTGGAACATGGATTGCTGGTGGGATAGTACCAACATTAATTTATTATGGATTAGAATTTATTCACCCTAG
CATATTCCTATTAGCAACATTAATTATTTGTTCGATAACTTCTATCGCAACAGGAACATCTTGGGGAACGGTAGGAACAG
CAGGTATTGCTATGATGGCAATTGGTGAAGGTCTTGGGTTACCATTACCACTTGTTGCTGGTGCAGTTCTTTCAGGTGCT
TATTTCGGGGATAAATTATCGCCACTTTCTGATAGTACAGTACTTGCAGCATCTATGGCAAAAGTAGATGTTATTGCACA
TGTACGAGCTATGCTTGTATTAGACGTTCCAGCGTATATTATTACTAGCATTATGTTTACTGTAGCTGGTTGGATGTATG
GCGGAGATAACGTAGATTTAAATCGAGTAGAATTTTTAAAGGAATCATTATTAAAACACTTTGATATTAAAATATGGATG
TTAGTTCCGGCGATTATTGTCATTGTACTATTAGCAATGAAGAAGCCTTCTATGCCTACAATTGCAATGGGAGCTTTACT
TGGCGCAATTTGGGCAACTGTTTTCCAAGGAATGCACTTTGGAGACGCAATTGGAACAGCATATAACGGATTCTCAATTC
AATCAGGCGTTGAGTTTGTCGATAAGTTATTAAACCGTGGCGGAATTAACGGTATGCTCGGTTCAGTAGCCGTAATTATT
TTCGGTTTAGGGTTTGGTGGATTACTTGAAAAATTAGGTGTTTTAAAAGTAATCGTATCAAAATTCGAAAAGAAATTAAA
TTCTGCTGGTAATGTAACATTATCTACATTAATCGTTGCATTTTTAGCGAACATATTTGGCTGTGCGATGTACGTATCAC
TTATTTTAACACCGAAAATTATGCAAGAAAGTTATGATAAACTAAAAATCGACCGCCGCGTATTAGCGCGTAACTCAGAA
GTAGGTGGAACATTAACTTCAGGTATGGTTCCATGGTCGGATAACGGTATTTTTATGGCTGGTATTTTAGGTGTTGCGAC
GATATCATACATTCCATTTATGTGGTTAAGCTTCGTATCGTTAATTTTAGCAGTTATTTACGGATATACAGGCAAGTTCA
TTTGGTATGTAGATGATGCTGAAAAAGGAAAAGAAGCGTCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGAAATAATATGAAAATTTTGTTTTGTCTTCGCTAATTGTATACTGCATATACGTAAGACGACATACATCATGTTATCG
ACTTGTAAGGAGAGAAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAAAATCACCTTCTACGTGTTGTAGAAGGTGATTTTTTATTTTGTAGTAACATTTGCTGAACTTATTTCGTCCTCAT
ATTTAGCAATTTTTTGTTGT

Product: Na+/H+ antiporter NhaC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 467; Mature: 467

Protein sequence:

>467_residues
MKSVRLPSMLEIIVLLLLFLAVVFSFQTIFDLPIQLALFISWFLVIALGLRLGFRYQELQDAITKGISNGLEAILILVAV
GALIGTWIAGGIVPTLIYYGLEFIHPSIFLLATLIICSITSIATGTSWGTVGTAGIAMMAIGEGLGLPLPLVAGAVLSGA
YFGDKLSPLSDSTVLAASMAKVDVIAHVRAMLVLDVPAYIITSIMFTVAGWMYGGDNVDLNRVEFLKESLLKHFDIKIWM
LVPAIIVIVLLAMKKPSMPTIAMGALLGAIWATVFQGMHFGDAIGTAYNGFSIQSGVEFVDKLLNRGGINGMLGSVAVII
FGLGFGGLLEKLGVLKVIVSKFEKKLNSAGNVTLSTLIVAFLANIFGCAMYVSLILTPKIMQESYDKLKIDRRVLARNSE
VGGTLTSGMVPWSDNGIFMAGILGVATISYIPFMWLSFVSLILAVIYGYTGKFIWYVDDAEKGKEAS

Sequences:

>Translated_467_residues
MKSVRLPSMLEIIVLLLLFLAVVFSFQTIFDLPIQLALFISWFLVIALGLRLGFRYQELQDAITKGISNGLEAILILVAV
GALIGTWIAGGIVPTLIYYGLEFIHPSIFLLATLIICSITSIATGTSWGTVGTAGIAMMAIGEGLGLPLPLVAGAVLSGA
YFGDKLSPLSDSTVLAASMAKVDVIAHVRAMLVLDVPAYIITSIMFTVAGWMYGGDNVDLNRVEFLKESLLKHFDIKIWM
LVPAIIVIVLLAMKKPSMPTIAMGALLGAIWATVFQGMHFGDAIGTAYNGFSIQSGVEFVDKLLNRGGINGMLGSVAVII
FGLGFGGLLEKLGVLKVIVSKFEKKLNSAGNVTLSTLIVAFLANIFGCAMYVSLILTPKIMQESYDKLKIDRRVLARNSE
VGGTLTSGMVPWSDNGIFMAGILGVATISYIPFMWLSFVSLILAVIYGYTGKFIWYVDDAEKGKEAS
>Mature_467_residues
MKSVRLPSMLEIIVLLLLFLAVVFSFQTIFDLPIQLALFISWFLVIALGLRLGFRYQELQDAITKGISNGLEAILILVAV
GALIGTWIAGGIVPTLIYYGLEFIHPSIFLLATLIICSITSIATGTSWGTVGTAGIAMMAIGEGLGLPLPLVAGAVLSGA
YFGDKLSPLSDSTVLAASMAKVDVIAHVRAMLVLDVPAYIITSIMFTVAGWMYGGDNVDLNRVEFLKESLLKHFDIKIWM
LVPAIIVIVLLAMKKPSMPTIAMGALLGAIWATVFQGMHFGDAIGTAYNGFSIQSGVEFVDKLLNRGGINGMLGSVAVII
FGLGFGGLLEKLGVLKVIVSKFEKKLNSAGNVTLSTLIVAFLANIFGCAMYVSLILTPKIMQESYDKLKIDRRVLARNSE
VGGTLTSGMVPWSDNGIFMAGILGVATISYIPFMWLSFVSLILAVIYGYTGKFIWYVDDAEKGKEAS

Specific function: Couples proton uptake and Na(+) efflux to the substrate- product malate/lactate antiport, in an electroneutral malate- 2H(+)/Na(+)-lactate exchange. Plays a role in supporting growth to high density on malate at reduced protonmotive force [H]

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the nhaC Na(+)/H(+) antiporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004770
- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50119; Mature: 50119

Theoretical pI: Translated: 7.55; Mature: 7.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377; 10903309 [H]