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The map label for this gene is ycaI [H]

Identifier: 218710043

GI number: 218710043

Start: 2212966

End: 2215296

Strand: Reverse

Name: ycaI [H]

Synonym: VS_2063

Alternate gene names: 218710043

Gene position: 2215296-2212966 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218710045

Following gene: 218710042

Centisome position: 67.14

GC content: 42.08

Gene sequence:

>2331_bases
TTGTTTAACATTTGGTTCTTGATTTCATTTGCTGCGACAGTTGTGTCTGCCAGCTTCTGGCCTGTGATGCCTCATTGGGT
TTGGGCACCATTGATGCTGTTGTTACTACTAGCATCAACAAAGTATAGCGTTTTCCGGAGTGCAAGAGGTCTAGCAACAG
CATTGATACTAGTTATCTGCCTAGGGAATGTAATTGAAATACAAACGAGTCGCTTATTTCAATCAGAGCAGAATACTACC
ATAAATGCTTCGGTTGTTAGCCTTTTTAGTGAAAATAGCCACGGTTTTGAAAGCGTAATAGTAGCTAGATCAATTGGCGG
CGAAAAATTAATCTTTCCTCAATTAATAAAATTACGTTTGTTTACTCCTTTTAAGTTAACACTCGGAGATGATGTCAATT
TATCTGTGTATATAAAGCCTGTATGGGGCAAACTCAATGAAGCAGGCTTTGATTTAGAAAAGTATCTGTTTAGCGCAGGT
GTGGTTGCCAATGCAATTTACAGATCTAATACAAAGTATCGCATTCATACCAATAGCAACTTACGGTCCTATTGGTTTGA
AAACAGTCTTGAAAGGTTAAGTCAACTGGCAAATCAAGACCTCATTATGGCTTTGAGTTTTGGTTATCGAGACCTTATTC
ACTCTCAGCGTTGGGACTTACTTAAAAGCAGTGGTTTGATTCACTTGATGGCTATTTCGGGGCTACATATTGGGATTGCC
TTTGGTATCGGCTATCAAGTAGGAAAGGTATTCAGGTTACTATCATCTTCACTTCTTTGGTTTCCCACAATATTTGGGGT
CGGCTTAGCCTATTTCTACAGTTGGTTTGCTGGGTTCACGCTGCCCACCTTGAGAGCTTTGGTGATGTGTATTATTGCCA
GCTATTTCTTATGGCGTGGGCAAAATATCAGTTTGTTTCGGTATGTCGCCTTAAGTTTGTGCATGGTTCTGCTAATTTGG
CCATTTTCAGCATTGTCGAGTAGCTTCTGGTTGTCTTTTGGTGCGTTAGGTGCCGTTCTTTACATTGCGTTAAATAGTCA
GTCATCCGATTCAAACCCAACATTTATCGACCGAGCACTGCAGCTCTTCAAGATTCAGTTAATGCTGACATTCCTGATTG
CTCCCTTTTCGATGCTGTTCTTTAATGGGGTCAGCTTAGTCTCTGTTTTCTACAACTTGCTCCTTTTACCTTGGGTGTCG
ATGGTGGTTATTCCACTATTGTTCCTGGCAATGTTCTTTAGCTTAATATTGGCGCCAGTATCAGGTGGCGTTGGCTTAAC
TACATTCAACAATGGTTTGTCTGAACAATTATGGATGTTGGTCAACCTATCGCTTGAGCCTCTCGTATTTAATCTTCCTT
TCTCTGAACGATTTTGGTTTCAAGTGGATAATCACACGATTGAGTTGTCTGTATTCCTCATCTTGTTTTTCGGTTTTGTC
AGTCGATATTTCAAGCGAGCACTATCTATATTGATTATTACCGTGTTTGTACTGTGGTGGGAGTTCGGCAAGCCTCAACA
AGACAAACTAATTATCGATATCTTGGATGTTGGTCACGGGTTGTCTTTGCTCTTAGAAAAGAACAATCAGATTGTTGTTT
ACGATCTTGGTAACGCATGGCCAGGAGGTTCCATTGTCGAATCCTTACTTATTCCTACTTTGAATCAGAGGGGAATTCAT
GAGTTGGAGGGTGTAATAGTGAGTCATTTCGATTCTGACCACGCTGGTGGCTATCCGTCGTTACTTGAAAATTACAACCC
TAAGTGGGTAAGAGCCAGTCAGAATATCAGTCAACAAGGACAATCTACGATTCAAGAATCGTCAAATATTCAAGCATGTA
TTTTAGGAGAAGTATGGACTTGGCAAGGGGTTGCTTTTGAGGTCTTGTGGCCTCCCAAACAAGTGAAGAGGGCGTATAAC
CCACATTCGTGCGTGGTCAGGCTTTTTGACCCCGCTCTAGAGTTCTCGATGTTACTTACTGGTGATATTGAATTGGTCAG
TGAGTGGTTACTTGCACGCGAAGGCGAACGGCTTCGAAGTGACGTAATGCTTGTTCCTCATCATGGTAGCAATACGTCTT
CGATCGCCAGTTTTATTGAGGCCGTTTCACCTCAGTTAGCGATCGCTTCTTTGGCCAAAGGCAATCAATGGGGGATGCCG
AGTGAATCCGTTATTGAACGTTATCACGACGCAGGGAGTGCTTGGCTTGATACTGGAGAAAGCGGCCAAATAACCATCAG
TATTGGTCAAGAAGGTTGGCAATATCATGAGATTAGAGAACAACAAGGCAGACAGTGGTATAGGCAGATGCTTCGTAAGG
GAGTAGAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACATTGCCAAAAACTTTCAATGCTTTCTGACGCTTGATTAGCTCATGGTCAGGCATAAATCGTTTGATAAACTTTCTTGG
CATAGGAGGAAGCTACTCTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAGATTATTGTGAGAAAATTAAGCGATTCTATGTCAACACAAACAGATGAAACTACCTGGGTCACATTTAAAAGACTTT
GGACTTATATTCGACTATAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 776; Mature: 776

Protein sequence:

>776_residues
MFNIWFLISFAATVVSASFWPVMPHWVWAPLMLLLLLASTKYSVFRSARGLATALILVICLGNVIEIQTSRLFQSEQNTT
INASVVSLFSENSHGFESVIVARSIGGEKLIFPQLIKLRLFTPFKLTLGDDVNLSVYIKPVWGKLNEAGFDLEKYLFSAG
VVANAIYRSNTKYRIHTNSNLRSYWFENSLERLSQLANQDLIMALSFGYRDLIHSQRWDLLKSSGLIHLMAISGLHIGIA
FGIGYQVGKVFRLLSSSLLWFPTIFGVGLAYFYSWFAGFTLPTLRALVMCIIASYFLWRGQNISLFRYVALSLCMVLLIW
PFSALSSSFWLSFGALGAVLYIALNSQSSDSNPTFIDRALQLFKIQLMLTFLIAPFSMLFFNGVSLVSVFYNLLLLPWVS
MVVIPLLFLAMFFSLILAPVSGGVGLTTFNNGLSEQLWMLVNLSLEPLVFNLPFSERFWFQVDNHTIELSVFLILFFGFV
SRYFKRALSILIITVFVLWWEFGKPQQDKLIIDILDVGHGLSLLLEKNNQIVVYDLGNAWPGGSIVESLLIPTLNQRGIH
ELEGVIVSHFDSDHAGGYPSLLENYNPKWVRASQNISQQGQSTIQESSNIQACILGEVWTWQGVAFEVLWPPKQVKRAYN
PHSCVVRLFDPALEFSMLLTGDIELVSEWLLAREGERLRSDVMLVPHHGSNTSSIASFIEAVSPQLAIASLAKGNQWGMP
SESVIERYHDAGSAWLDTGESGQITISIGQEGWQYHEIREQQGRQWYRQMLRKGVE

Sequences:

>Translated_776_residues
MFNIWFLISFAATVVSASFWPVMPHWVWAPLMLLLLLASTKYSVFRSARGLATALILVICLGNVIEIQTSRLFQSEQNTT
INASVVSLFSENSHGFESVIVARSIGGEKLIFPQLIKLRLFTPFKLTLGDDVNLSVYIKPVWGKLNEAGFDLEKYLFSAG
VVANAIYRSNTKYRIHTNSNLRSYWFENSLERLSQLANQDLIMALSFGYRDLIHSQRWDLLKSSGLIHLMAISGLHIGIA
FGIGYQVGKVFRLLSSSLLWFPTIFGVGLAYFYSWFAGFTLPTLRALVMCIIASYFLWRGQNISLFRYVALSLCMVLLIW
PFSALSSSFWLSFGALGAVLYIALNSQSSDSNPTFIDRALQLFKIQLMLTFLIAPFSMLFFNGVSLVSVFYNLLLLPWVS
MVVIPLLFLAMFFSLILAPVSGGVGLTTFNNGLSEQLWMLVNLSLEPLVFNLPFSERFWFQVDNHTIELSVFLILFFGFV
SRYFKRALSILIITVFVLWWEFGKPQQDKLIIDILDVGHGLSLLLEKNNQIVVYDLGNAWPGGSIVESLLIPTLNQRGIH
ELEGVIVSHFDSDHAGGYPSLLENYNPKWVRASQNISQQGQSTIQESSNIQACILGEVWTWQGVAFEVLWPPKQVKRAYN
PHSCVVRLFDPALEFSMLLTGDIELVSEWLLAREGERLRSDVMLVPHHGSNTSSIASFIEAVSPQLAIASLAKGNQWGMP
SESVIERYHDAGSAWLDTGESGQITISIGQEGWQYHEIREQQGRQWYRQMLRKGVE
>Mature_776_residues
MFNIWFLISFAATVVSASFWPVMPHWVWAPLMLLLLLASTKYSVFRSARGLATALILVICLGNVIEIQTSRLFQSEQNTT
INASVVSLFSENSHGFESVIVARSIGGEKLIFPQLIKLRLFTPFKLTLGDDVNLSVYIKPVWGKLNEAGFDLEKYLFSAG
VVANAIYRSNTKYRIHTNSNLRSYWFENSLERLSQLANQDLIMALSFGYRDLIHSQRWDLLKSSGLIHLMAISGLHIGIA
FGIGYQVGKVFRLLSSSLLWFPTIFGVGLAYFYSWFAGFTLPTLRALVMCIIASYFLWRGQNISLFRYVALSLCMVLLIW
PFSALSSSFWLSFGALGAVLYIALNSQSSDSNPTFIDRALQLFKIQLMLTFLIAPFSMLFFNGVSLVSVFYNLLLLPWVS
MVVIPLLFLAMFFSLILAPVSGGVGLTTFNNGLSEQLWMLVNLSLEPLVFNLPFSERFWFQVDNHTIELSVFLILFFGFV
SRYFKRALSILIITVFVLWWEFGKPQQDKLIIDILDVGHGLSLLLEKNNQIVVYDLGNAWPGGSIVESLLIPTLNQRGIH
ELEGVIVSHFDSDHAGGYPSLLENYNPKWVRASQNISQQGQSTIQESSNIQACILGEVWTWQGVAFEVLWPPKQVKRAYN
PHSCVVRLFDPALEFSMLLTGDIELVSEWLLAREGERLRSDVMLVPHHGSNTSSIASFIEAVSPQLAIASLAKGNQWGMP
SESVIERYHDAGSAWLDTGESGQITISIGQEGWQYHEIREQQGRQWYRQMLRKGVE

Specific function: Unknown

COG id: COG2333

COG function: function code R; Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis ComEC, N.gonorrhoeae ComA, and H.influenzae Rec2 [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081801, Length=672, Percent_Identity=31.25, Blast_Score=291, Evalue=1e-79,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001279
- InterPro:   IPR004477
- InterPro:   IPR004797 [H]

Pfam domain/function: PF03772 Competence; PF00753 Lactamase_B [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 87550; Mature: 87550

Theoretical pI: Translated: 6.96; Mature: 6.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFNIWFLISFAATVVSASFWPVMPHWVWAPLMLLLLLASTKYSVFRSARGLATALILVIC
CEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGNVIEIQTSRLFQSEQNTTINASVVSLFSENSHGFESVIVARSIGGEKLIFPQLIKLRL
HCCHHEEHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHC
FTPFKLTLGDDVNLSVYIKPVWGKLNEAGFDLEKYLFSAGVVANAIYRSNTKYRIHTNSN
CCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCC
LRSYWFENSLERLSQLANQDLIMALSFGYRDLIHSQRWDLLKSSGLIHLMAISGLHIGIA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEHH
FGIGYQVGKVFRLLSSSLLWFPTIFGVGLAYFYSWFAGFTLPTLRALVMCIIASYFLWRG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QNISLFRYVALSLCMVLLIWPFSALSSSFWLSFGALGAVLYIALNSQSSDSNPTFIDRAL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHH
QLFKIQLMLTFLIAPFSMLFFNGVSLVSVFYNLLLLPWVSMVVIPLLFLAMFFSLILAPV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SGGVGLTTFNNGLSEQLWMLVNLSLEPLVFNLPFSERFWFQVDNHTIELSVFLILFFGFV
CCCCEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCEEHHHHHHHHHHHHH
SRYFKRALSILIITVFVLWWEFGKPQQDKLIIDILDVGHGLSLLLEKNNQIVVYDLGNAW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCC
PGGSIVESLLIPTLNQRGIHELEGVIVSHFDSDHAGGYPSLLENYNPKWVRASQNISQQG
CCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEECCCCHHHHH
QSTIQESSNIQACILGEVWTWQGVAFEVLWPPKQVKRAYNPHSCVVRLFDPALEFSMLLT
HHHHHHCCCCCEEEECCCEECCCEEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
GDIELVSEWLLAREGERLRSDVMLVPHHGSNTSSIASFIEAVSPQLAIASLAKGNQWGMP
CCHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCC
SESVIERYHDAGSAWLDTGESGQITISIGQEGWQYHEIREQQGRQWYRQMLRKGVE
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MFNIWFLISFAATVVSASFWPVMPHWVWAPLMLLLLLASTKYSVFRSARGLATALILVIC
CEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGNVIEIQTSRLFQSEQNTTINASVVSLFSENSHGFESVIVARSIGGEKLIFPQLIKLRL
HCCHHEEHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHC
FTPFKLTLGDDVNLSVYIKPVWGKLNEAGFDLEKYLFSAGVVANAIYRSNTKYRIHTNSN
CCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCC
LRSYWFENSLERLSQLANQDLIMALSFGYRDLIHSQRWDLLKSSGLIHLMAISGLHIGIA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEHH
FGIGYQVGKVFRLLSSSLLWFPTIFGVGLAYFYSWFAGFTLPTLRALVMCIIASYFLWRG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QNISLFRYVALSLCMVLLIWPFSALSSSFWLSFGALGAVLYIALNSQSSDSNPTFIDRAL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHH
QLFKIQLMLTFLIAPFSMLFFNGVSLVSVFYNLLLLPWVSMVVIPLLFLAMFFSLILAPV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SGGVGLTTFNNGLSEQLWMLVNLSLEPLVFNLPFSERFWFQVDNHTIELSVFLILFFGFV
CCCCEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCEEHHHHHHHHHHHHH
SRYFKRALSILIITVFVLWWEFGKPQQDKLIIDILDVGHGLSLLLEKNNQIVVYDLGNAW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCC
PGGSIVESLLIPTLNQRGIHELEGVIVSHFDSDHAGGYPSLLENYNPKWVRASQNISQQG
CCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEECCCCHHHHH
QSTIQESSNIQACILGEVWTWQGVAFEVLWPPKQVKRAYNPHSCVVRLFDPALEFSMLLT
HHHHHHCCCCCEEEECCCEECCCEEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
GDIELVSEWLLAREGERLRSDVMLVPHHGSNTSSIASFIEAVSPQLAIASLAKGNQWGMP
CCHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCC
SESVIERYHDAGSAWLDTGESGQITISIGQEGWQYHEIREQQGRQWYRQMLRKGVE
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905232; 9278503; 8094880 [H]