| Definition | Escherichia fergusonii ATCC 35469 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011740 |
| Length | 4,588,711 |
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The map label for this gene is 218550407
Identifier: 218550407
GI number: 218550407
Start: 3185854
End: 3190140
Strand: Reverse
Name: 218550407
Synonym: EFER_3099
Alternate gene names: NA
Gene position: 3190140-3185854 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218550408
Following gene: 218550406
Centisome position: 69.52
GC content: 48.1
Gene sequence:
>4287_bases ATGAGTTTTGAATTAAACGAACAGATGGTTGATAGCCTGGCAAAACAACATCGCTGGGCGGCGACGGGTGTATCAGATTA TCCACCTCGCGACCCGTTAGTGGGCCAGAGCCGCTTTTTTAAACGCTTTCAAACCTTTTTGCATACGGTGGATCACGACG ATGATCGCTTTGCCCATGTGTTTGCCGTCGAAGCCGAATGGGGTCGGGGTAAATCACGTTTAGGCCATGAATTGGTCGCA CAAATTAACGACTGCTCCAGGGGCTGGTTTGTCCGCGACGAACAAGGCCAACTGCACGATAAGCAGCTGTTTAATCGCGA CACGCAAGACAAATACCTGGCGCTCTACATTCGCTACTCGCAAGTGGCATCAGATTATCAAAACTCGGATAACTGGTTTG CTTTTGGTTTATATCAGGCGCTATTACCACTGGCCACCCAAACCTTTGATGGATCGATTCAAAGTGAAATTGCCAAACAA GCCTATGAACGCTTAATGCCATTTGGCTTTAAATCTGAACTGTTAGCAGACGCCTTACAGCTGAACGCCAACCACAGCGA AGAAGACCTCTATACTGACCAAACGCTGGTAGTCAGTTTGGTGCAAGCCGCCTATAAAGTATTAAAGAGTTTTGGCGTGC AGTATATGTTGGTGGTGCTGGATGAGCTGGAAACCGTTGCAGAAGCCGCCACCTTTGGCCTGGAAGATGAACAAGATAAA CGCCTCGATGGCCAGGCCATTCGCCTGATTGGTAAAGCAATTAAAGAGGAAGACCCTCGGCGTAAACTTCCATGGTTGCG CTATGTGGCGCTGTGTTCACCACTGCTTGGCCAGCAATTGCGCGAAATTCAATCTGTCGCACGCCGCTTTGAGTTAGTAG AACTTGAGCATAATGCCTTTGCCGATGTATCAGACTATGTGGCAAGCCTCTTAAAAGACGGCAAACTGGGTTTTAATTAC CCTGCTGGTTTAGTGGAAGCTGCATACGCCATGAGTGGTGCCAACTTCGGTTGGTTTAACGTGGTCATGGCTAATGTGGA TGCAGTGCTGAGCCAATACCAACAAGCAGGCCGCAGTATCAAGGATGTGGGCGATTTATTTGAAGCTGTGCTGGCAGGCT CTGGCCGCGTGGCCAGGCATGTGCTGGATAAAGGTGCGATAGAAGGCATTCAAACCCGCGACCAGGCACTATTGACCGAA TGCCGTACTTTGCTATACGGCCAATTACCCGTGCGCTTAACTGAAGTGAGCCATGCAACTGAATTGCTGGCGCTGAAAAA CGAAGATCTGGAACCCATAGCCGCTCATTACCGCAAACTAAGCATTGACCGCCTACAGTGCCGACAAGCCCTGGAGCAAG CCAAATTCCGCCGCGATAAAGATGAATGGTACTACCCTGCAGTAGATCAAGCGCTGAACTTAGACACTTTGCTGGATAAC CTGCGTACTTTTTCGATTAAAGAACAAGCCGCAAGTGGTGATAAAGGCGCAGTATTACTGCCTCTGTCAAAAGGTGAGTT TAAATACTTACTCAGCTTGCTGTATGACCACCCAGCGATTGAATTCGCTGCCGATGCCTTATGGCACAAGCTAGTGGGTG AAACTACCGAACTGGACGCCAGCGAAGCAACGCATATTGGCCCCAGTGTGGCGATGTTACTGCGCCTGGATTTGCGCTAT CGCAGTGCCCAGCAGAACTCACTGATTTTTAAAGATCCCGCCATGGGCGACGCTCATGAACAGGCAATGAGTGAACTTAG CAAACAAAGTAGCCAGAAGCCGCTCATCAAGCTATTAGCTCGTGTAACGGGTTTTGTGAGATTACTGGATAACAACTGGA CCTATGATGAAAACTTACTGAGTAATAAAGCGGGCAGCGACGATGCACCTTTGGCCATTTTAACCGAGCCCCGTGGCCGC CAGGGTGGTTTACTTACCCTGGATGGATTTAAGCTTCACCCAGAAGGTAAAGCCTTGTTTGCCTGGGTCAGCAACCTAAT TGAGCTGAACAATCTTCACACCTTTGCGGCAAACCACAGCCACCAAAATGGTCGCACGCCAGTATTAGCGTTAACTGCTT CTGCACATCTCATGGAGCAATACAGCCGACTGGATGAAAGAAATGAGTTGCGTGATGCGATACTGCTGCATTATGTCAAC CCAAGCGAAGCAGACCAGTTAGAGCGTATTGGCTTAAGTTTGGCAGCATGTCAGTTGCACGGCGTGAATTTAACTGCCGA CAGCTTTACCGCGAAATTCAAAAACAAGCTGCATGCCTTGACAACCTTTGCCACGGACGCCATTCACAAGTGGCGCCAGC GTTTGCAGCAGCGCGGTTTAATTGCCTGGCCGTTAAAGGTAGATGGTAAATTATCATCGAATGACCGAGACCTGTTGTTT AAAGGCTGGTATCAGCTGGCCATTGCTCACCCTGAGTTAAATGGCATTCTCGATTTACAGCAGCAACACGGCGTGCCAGT GAATGAGCTGAGCAGCTTGTTGGATAAGCTTAAGGTGCCGGGCAGCTATATTGCCAAAGGCTACACGGCCGATGAACATG CCGGGCTATTTACTGAACTTAATAATGTGCAGCGAAGCCAGGCGCAGATCCCATTATTTTTAGCCCGTATTGCTCATCCT AATAAAAAGCACAAGTGGCAATTCGAAGGCTTTAAGCAGCAGTTTTATTTCGCCTATGTGGCTGAAACGAGTATTACTGC CAAAGGCGTGTTTAATGACTGGATGTGGTGGTGTGGAGAGCTGAACTTACTCACTTTAACCAATCCAACAGAAAAACAGG CAATTTGGGAGCACTACCCGCGCTCCCGCTTAGAAAATGCCATTAGAGAAGCGCAAAACTGGTTCCGCGGTAACGATATG GGCAGCTACGCAGCCAATGTGGAAGTCATGAGCCGCGTGTATGGTTATGCACGCATTAATGAAATGTTCGCGCCACTGGG TAAAAATAAGCTGGGGTTTGTCACCGTAGAAGCTAAAGAGCAGTTGGAAAAAGCACAATCACTATTTAACGTGCTCAAAC AGCAAGAAGAACAACTGGCTGATATGGCCGAGGCCAATGACACGCAAGTACTGGCTGGGCTTATCCACAAACGTGCTGAA GTGCTGGAACTGGTAGCAAAGGTTAAACCGCTTAATAGTTCCAGGCCTATGCTAAAAGATGCTCATATTCTCAGCTTAGA AGACAAAACGACCTCGCTTTATCAACGGATTGAACAGGCCTGTTTATTTGCCGAGTTTGTTGAGCGCAGCGCTGAGCGTA TCAACAACCGACTCGCTGATTTAATCATAGATGTTGAAACAGAGTGTGCCCCGCTGACGAATTTCCCGAAACGTCTGTAC ACCAACACGCTGCGCACTATAGGTCATATTTTAGATGGAGCGTTAAAAGACGATACCAGCAGTGCCACTGGCCGAAAAGA GCAGCAAGCAGACAGCGATACCTTACTGCATTACCTGCGTAAACTCGATTTAGGTAGAGCGCATGACAAGCTTTCAGCCT TAGCGCAAGAAGTGGGTTTAAACCTGCACAATGATCAACAGTTGCCGATAGCGGAGATTCAGGGGCATATTTTGTCCAGC TACCGCAACTGCAAAGAACGATTTAGTAAGCTGGTTAATAACCTCACAGAGCAAAAACTACGTGCACAACAACTGCAAGA ATGGCTTAGTAGCGCCACGGCTGAGTATCAGTTCACCGATGACATTGCAGAGCTACCAAAACTGGTAATGAAATTACAGC TCATTGAAGATGCTACTGCCGATCTCCCCAACGATGCCGAGAGCAAGCGTCAAAGTATGCAAAACAGTTTGCGCAATGGG CAGTTTTCATCGTTACGGGATTTACCAGAAGAGCTTTTAAAACCGGCACGCGGTCAACTTACACCGATTCAAGGCCAGCT ACTTAAAATTGAAGAGCGTCTAAACCAAGTAAGACGCAACTCCATCGCGCAGGTAAACAGCTGGCTGCCGTTATTAAAAC CGCTATTGGCTTCTCAAAAGCAAGCGGAACCAGCAGCGTTGACTCTGGAGGATGTGAGCAATTTGGGTGTCAGAGAACTT CAACAGGTGTGTGAAAGCACCCAGGCCAAATGGCAGAGTCAAGGTGAGCAGATATTAAAAAATACAGGCTTAACACTGGC GGATTGGCAACCGATTTATCAGGCTTTGAGCCAAAATCAGGAACCCGTGTTAACACCTGAGCAACAGAAAGGACTTGTAG ACAAAGGTATTCTAAAAATGCGCCTTACCTTTGCCACTGGTTTATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAGCCAAACGTTACAACGGGCCATTAAGCAACTGGCGCAAAACTGCTATGCCAATAAAAAACGCGCCGCCAATAGAATA AACCTTCAAGGATCGTCGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGGTGACGCGATGAGTCTTTATTTATCTGCGGCACTGGCCAGTAATCGTAAAGGCCGTTTTTTGCAAACTGTTGCGGGGG CTACTCCCTTAACGAAGGAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1428; Mature: 1427
Protein sequence:
>1428_residues MSFELNEQMVDSLAKQHRWAATGVSDYPPRDPLVGQSRFFKRFQTFLHTVDHDDDRFAHVFAVEAEWGRGKSRLGHELVA QINDCSRGWFVRDEQGQLHDKQLFNRDTQDKYLALYIRYSQVASDYQNSDNWFAFGLYQALLPLATQTFDGSIQSEIAKQ AYERLMPFGFKSELLADALQLNANHSEEDLYTDQTLVVSLVQAAYKVLKSFGVQYMLVVLDELETVAEAATFGLEDEQDK RLDGQAIRLIGKAIKEEDPRRKLPWLRYVALCSPLLGQQLREIQSVARRFELVELEHNAFADVSDYVASLLKDGKLGFNY PAGLVEAAYAMSGANFGWFNVVMANVDAVLSQYQQAGRSIKDVGDLFEAVLAGSGRVARHVLDKGAIEGIQTRDQALLTE CRTLLYGQLPVRLTEVSHATELLALKNEDLEPIAAHYRKLSIDRLQCRQALEQAKFRRDKDEWYYPAVDQALNLDTLLDN LRTFSIKEQAASGDKGAVLLPLSKGEFKYLLSLLYDHPAIEFAADALWHKLVGETTELDASEATHIGPSVAMLLRLDLRY RSAQQNSLIFKDPAMGDAHEQAMSELSKQSSQKPLIKLLARVTGFVRLLDNNWTYDENLLSNKAGSDDAPLAILTEPRGR QGGLLTLDGFKLHPEGKALFAWVSNLIELNNLHTFAANHSHQNGRTPVLALTASAHLMEQYSRLDERNELRDAILLHYVN PSEADQLERIGLSLAACQLHGVNLTADSFTAKFKNKLHALTTFATDAIHKWRQRLQQRGLIAWPLKVDGKLSSNDRDLLF KGWYQLAIAHPELNGILDLQQQHGVPVNELSSLLDKLKVPGSYIAKGYTADEHAGLFTELNNVQRSQAQIPLFLARIAHP NKKHKWQFEGFKQQFYFAYVAETSITAKGVFNDWMWWCGELNLLTLTNPTEKQAIWEHYPRSRLENAIREAQNWFRGNDM GSYAANVEVMSRVYGYARINEMFAPLGKNKLGFVTVEAKEQLEKAQSLFNVLKQQEEQLADMAEANDTQVLAGLIHKRAE VLELVAKVKPLNSSRPMLKDAHILSLEDKTTSLYQRIEQACLFAEFVERSAERINNRLADLIIDVETECAPLTNFPKRLY TNTLRTIGHILDGALKDDTSSATGRKEQQADSDTLLHYLRKLDLGRAHDKLSALAQEVGLNLHNDQQLPIAEIQGHILSS YRNCKERFSKLVNNLTEQKLRAQQLQEWLSSATAEYQFTDDIAELPKLVMKLQLIEDATADLPNDAESKRQSMQNSLRNG QFSSLRDLPEELLKPARGQLTPIQGQLLKIEERLNQVRRNSIAQVNSWLPLLKPLLASQKQAEPAALTLEDVSNLGVREL QQVCESTQAKWQSQGEQILKNTGLTLADWQPIYQALSQNQEPVLTPEQQKGLVDKGILKMRLTFATGL
Sequences:
>Translated_1428_residues MSFELNEQMVDSLAKQHRWAATGVSDYPPRDPLVGQSRFFKRFQTFLHTVDHDDDRFAHVFAVEAEWGRGKSRLGHELVA QINDCSRGWFVRDEQGQLHDKQLFNRDTQDKYLALYIRYSQVASDYQNSDNWFAFGLYQALLPLATQTFDGSIQSEIAKQ AYERLMPFGFKSELLADALQLNANHSEEDLYTDQTLVVSLVQAAYKVLKSFGVQYMLVVLDELETVAEAATFGLEDEQDK RLDGQAIRLIGKAIKEEDPRRKLPWLRYVALCSPLLGQQLREIQSVARRFELVELEHNAFADVSDYVASLLKDGKLGFNY PAGLVEAAYAMSGANFGWFNVVMANVDAVLSQYQQAGRSIKDVGDLFEAVLAGSGRVARHVLDKGAIEGIQTRDQALLTE CRTLLYGQLPVRLTEVSHATELLALKNEDLEPIAAHYRKLSIDRLQCRQALEQAKFRRDKDEWYYPAVDQALNLDTLLDN LRTFSIKEQAASGDKGAVLLPLSKGEFKYLLSLLYDHPAIEFAADALWHKLVGETTELDASEATHIGPSVAMLLRLDLRY RSAQQNSLIFKDPAMGDAHEQAMSELSKQSSQKPLIKLLARVTGFVRLLDNNWTYDENLLSNKAGSDDAPLAILTEPRGR QGGLLTLDGFKLHPEGKALFAWVSNLIELNNLHTFAANHSHQNGRTPVLALTASAHLMEQYSRLDERNELRDAILLHYVN PSEADQLERIGLSLAACQLHGVNLTADSFTAKFKNKLHALTTFATDAIHKWRQRLQQRGLIAWPLKVDGKLSSNDRDLLF KGWYQLAIAHPELNGILDLQQQHGVPVNELSSLLDKLKVPGSYIAKGYTADEHAGLFTELNNVQRSQAQIPLFLARIAHP NKKHKWQFEGFKQQFYFAYVAETSITAKGVFNDWMWWCGELNLLTLTNPTEKQAIWEHYPRSRLENAIREAQNWFRGNDM GSYAANVEVMSRVYGYARINEMFAPLGKNKLGFVTVEAKEQLEKAQSLFNVLKQQEEQLADMAEANDTQVLAGLIHKRAE VLELVAKVKPLNSSRPMLKDAHILSLEDKTTSLYQRIEQACLFAEFVERSAERINNRLADLIIDVETECAPLTNFPKRLY TNTLRTIGHILDGALKDDTSSATGRKEQQADSDTLLHYLRKLDLGRAHDKLSALAQEVGLNLHNDQQLPIAEIQGHILSS YRNCKERFSKLVNNLTEQKLRAQQLQEWLSSATAEYQFTDDIAELPKLVMKLQLIEDATADLPNDAESKRQSMQNSLRNG QFSSLRDLPEELLKPARGQLTPIQGQLLKIEERLNQVRRNSIAQVNSWLPLLKPLLASQKQAEPAALTLEDVSNLGVREL QQVCESTQAKWQSQGEQILKNTGLTLADWQPIYQALSQNQEPVLTPEQQKGLVDKGILKMRLTFATGL >Mature_1427_residues SFELNEQMVDSLAKQHRWAATGVSDYPPRDPLVGQSRFFKRFQTFLHTVDHDDDRFAHVFAVEAEWGRGKSRLGHELVAQ INDCSRGWFVRDEQGQLHDKQLFNRDTQDKYLALYIRYSQVASDYQNSDNWFAFGLYQALLPLATQTFDGSIQSEIAKQA YERLMPFGFKSELLADALQLNANHSEEDLYTDQTLVVSLVQAAYKVLKSFGVQYMLVVLDELETVAEAATFGLEDEQDKR LDGQAIRLIGKAIKEEDPRRKLPWLRYVALCSPLLGQQLREIQSVARRFELVELEHNAFADVSDYVASLLKDGKLGFNYP AGLVEAAYAMSGANFGWFNVVMANVDAVLSQYQQAGRSIKDVGDLFEAVLAGSGRVARHVLDKGAIEGIQTRDQALLTEC RTLLYGQLPVRLTEVSHATELLALKNEDLEPIAAHYRKLSIDRLQCRQALEQAKFRRDKDEWYYPAVDQALNLDTLLDNL RTFSIKEQAASGDKGAVLLPLSKGEFKYLLSLLYDHPAIEFAADALWHKLVGETTELDASEATHIGPSVAMLLRLDLRYR SAQQNSLIFKDPAMGDAHEQAMSELSKQSSQKPLIKLLARVTGFVRLLDNNWTYDENLLSNKAGSDDAPLAILTEPRGRQ GGLLTLDGFKLHPEGKALFAWVSNLIELNNLHTFAANHSHQNGRTPVLALTASAHLMEQYSRLDERNELRDAILLHYVNP SEADQLERIGLSLAACQLHGVNLTADSFTAKFKNKLHALTTFATDAIHKWRQRLQQRGLIAWPLKVDGKLSSNDRDLLFK GWYQLAIAHPELNGILDLQQQHGVPVNELSSLLDKLKVPGSYIAKGYTADEHAGLFTELNNVQRSQAQIPLFLARIAHPN KKHKWQFEGFKQQFYFAYVAETSITAKGVFNDWMWWCGELNLLTLTNPTEKQAIWEHYPRSRLENAIREAQNWFRGNDMG SYAANVEVMSRVYGYARINEMFAPLGKNKLGFVTVEAKEQLEKAQSLFNVLKQQEEQLADMAEANDTQVLAGLIHKRAEV LELVAKVKPLNSSRPMLKDAHILSLEDKTTSLYQRIEQACLFAEFVERSAERINNRLADLIIDVETECAPLTNFPKRLYT NTLRTIGHILDGALKDDTSSATGRKEQQADSDTLLHYLRKLDLGRAHDKLSALAQEVGLNLHNDQQLPIAEIQGHILSSY RNCKERFSKLVNNLTEQKLRAQQLQEWLSSATAEYQFTDDIAELPKLVMKLQLIEDATADLPNDAESKRQSMQNSLRNGQ FSSLRDLPEELLKPARGQLTPIQGQLLKIEERLNQVRRNSIAQVNSWLPLLKPLLASQKQAEPAALTLEDVSNLGVRELQ QVCESTQAKWQSQGEQILKNTGLTLADWQPIYQALSQNQEPVLTPEQQKGLVDKGILKMRLTFATGL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 161299; Mature: 161168
Theoretical pI: Translated: 6.19; Mature: 6.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSFELNEQMVDSLAKQHRWAATGVSDYPPRDPLVGQSRFFKRFQTFLHTVDHDDDRFAHV CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE FAVEAEWGRGKSRLGHELVAQINDCSRGWFVRDEQGQLHDKQLFNRDTQDKYLALYIRYS EEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEHH QVASDYQNSDNWFAFGLYQALLPLATQTFDGSIQSEIAKQAYERLMPFGFKSELLADALQ HHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH LNANHSEEDLYTDQTLVVSLVQAAYKVLKSFGVQYMLVVLDELETVAEAATFGLEDEQDK HCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH RLDGQAIRLIGKAIKEEDPRRKLPWLRYVALCSPLLGQQLREIQSVARRFELVELEHNAF CCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC ADVSDYVASLLKDGKLGFNYPAGLVEAAYAMSGANFGWFNVVMANVDAVLSQYQQAGRSI CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH KDVGDLFEAVLAGSGRVARHVLDKGAIEGIQTRDQALLTECRTLLYGQLPVRLTEVSHAT HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHH ELLALKNEDLEPIAAHYRKLSIDRLQCRQALEQAKFRRDKDEWYYPAVDQALNLDTLLDN 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA