| Definition | Escherichia fergusonii ATCC 35469 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011740 |
| Length | 4,588,711 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 218549453
Identifier: 218549453
GI number: 218549453
Start: 2150311
End: 2151474
Strand: Reverse
Name: 218549453
Synonym: EFER_2122
Alternate gene names: NA
Gene position: 2151474-2150311 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218549454
Following gene: 218549452
Centisome position: 46.89
GC content: 28.44
Gene sequence:
>1164_bases ATGCAAACAGTGAATAATCATTTTTATAAAACTTTACTTCTATTAAGTTTTTTCTCTGCAGGGTTTAGTCTGTATTACGT ATTTATACCGTTATTAATAATTTCATTAATTCTATCAATGATTAAAAATAGAACATTATACGCAGGATGTACTGCTGCAA GTTATAATGTGTTATTTATTGTTTTATTTGTATTTAGTGTGTTTTCTATAGGTTCAGAACTATTAATACTTGAATCCCCT GTCAAGTATGCAATGTATATGATATTTTTGATAGTATGTTTACCATTACTCTTAATTAATAATTTTGAATATGCTTGGTA CATGCTTTTCTTTTTTATATTAGGTGTCTTTTTTAGAGCTGAATCCATAGTTGTTTATAGCTTCCTAGATCCTTCCGGCG TTTATGGATATGGTAAATTGCTAGATCCATTTAATCACGAGGAAATAAATTCTCCAGGCATTAGTAACTCACTCGCAATT GTTTTTATGTTTTTCTTCGTTGCATATAAAAATACATTGAGCTTGAAGTACTTACTTATATTTATATATCCATTAATTTT ATTATCATCAATATTTTTGGGGGGGCGAGCATTCTTTATTATTGCATTAGTATGTATAACTTATAAATATAGTCGTAACT TTAAAATAAAAACGCTCATAGGATTAACTATATTAATATGCCTTGGTTGCATTTTTTCTTTATTAGTTAAAGAAATTCCT TTTTTTGATAAATATTTTGATTTAATATTTGAGCGATTTGGAAGTGAAGGATTGAAATCGGCTAGATTTGAACTTATACA GGATGGTATTACAAAATTTCTAATTCATCCACTGGGGGGGTTTACTCCAAATGCAAGCGAATATAGTGGGTATTGGTATC ATAATATTTATCTTGATAGCGCCAGAGTCGCTGGGGTTATATCGCTTATCCCATTTATACTTTCAAATTTAATTGTGTTA ATTAGCTATTTAGGATATAGGAATTATAGAAAAAGAATAAAAAATCCATATTTTTTTATATCACTTATAACTTTAATTAT CATGTGTCAGGATGTTGTACTTGAAGGTAATATGATGTTACTAATCAGCTATGCCTTATTTACAACAATGGCTATTCAAT CCAGGAGGTATAAAAAGAGTGAAACTCTTCTACAGAGTAAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AACAAGACCTAAAAAAAAATTCATTCCTATTTCGAGAGGATTTTAATGAAAGTATCTGTGAGTTAGCTAAATTATATAAT AAAGTTAAAAGGCTAGATTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATCATCCTTTTGACATAAAGGATAGTTCTGCAGCTAGTTCAGTTCGACACAGAGTCGACCGAGTTTGCAGATGTCTTC CGGATGCCACCAAATCAATA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 387; Mature: 387
Protein sequence:
>387_residues MQTVNNHFYKTLLLLSFFSAGFSLYYVFIPLLIISLILSMIKNRTLYAGCTAASYNVLFIVLFVFSVFSIGSELLILESP VKYAMYMIFLIVCLPLLLINNFEYAWYMLFFFILGVFFRAESIVVYSFLDPSGVYGYGKLLDPFNHEEINSPGISNSLAI VFMFFFVAYKNTLSLKYLLIFIYPLILLSSIFLGGRAFFIIALVCITYKYSRNFKIKTLIGLTILICLGCIFSLLVKEIP FFDKYFDLIFERFGSEGLKSARFELIQDGITKFLIHPLGGFTPNASEYSGYWYHNIYLDSARVAGVISLIPFILSNLIVL ISYLGYRNYRKRIKNPYFFISLITLIIMCQDVVLEGNMMLLISYALFTTMAIQSRRYKKSETLLQSK
Sequences:
>Translated_387_residues MQTVNNHFYKTLLLLSFFSAGFSLYYVFIPLLIISLILSMIKNRTLYAGCTAASYNVLFIVLFVFSVFSIGSELLILESP VKYAMYMIFLIVCLPLLLINNFEYAWYMLFFFILGVFFRAESIVVYSFLDPSGVYGYGKLLDPFNHEEINSPGISNSLAI VFMFFFVAYKNTLSLKYLLIFIYPLILLSSIFLGGRAFFIIALVCITYKYSRNFKIKTLIGLTILICLGCIFSLLVKEIP FFDKYFDLIFERFGSEGLKSARFELIQDGITKFLIHPLGGFTPNASEYSGYWYHNIYLDSARVAGVISLIPFILSNLIVL ISYLGYRNYRKRIKNPYFFISLITLIIMCQDVVLEGNMMLLISYALFTTMAIQSRRYKKSETLLQSK >Mature_387_residues MQTVNNHFYKTLLLLSFFSAGFSLYYVFIPLLIISLILSMIKNRTLYAGCTAASYNVLFIVLFVFSVFSIGSELLILESP VKYAMYMIFLIVCLPLLLINNFEYAWYMLFFFILGVFFRAESIVVYSFLDPSGVYGYGKLLDPFNHEEINSPGISNSLAI VFMFFFVAYKNTLSLKYLLIFIYPLILLSSIFLGGRAFFIIALVCITYKYSRNFKIKTLIGLTILICLGCIFSLLVKEIP FFDKYFDLIFERFGSEGLKSARFELIQDGITKFLIHPLGGFTPNASEYSGYWYHNIYLDSARVAGVISLIPFILSNLIVL ISYLGYRNYRKRIKNPYFFISLITLIIMCQDVVLEGNMMLLISYALFTTMAIQSRRYKKSETLLQSK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 44597; Mature: 44597
Theoretical pI: Translated: 9.26; Mature: 9.26
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQTVNNHFYKTLLLLSFFSAGFSLYYVFIPLLIISLILSMIKNRTLYAGCTAASYNVLFI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHH VLFVFSVFSIGSELLILESPVKYAMYMIFLIVCLPLLLINNFEYAWYMLFFFILGVFFRA HHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESIVVYSFLDPSGVYGYGKLLDPFNHEEINSPGISNSLAIVFMFFFVAYKNTLSLKYLLI CCEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIYPLILLSSIFLGGRAFFIIALVCITYKYSRNFKIKTLIGLTILICLGCIFSLLVKEIP HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC FFDKYFDLIFERFGSEGLKSARFELIQDGITKFLIHPLGGFTPNASEYSGYWYHNIYLDS CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECC ARVAGVISLIPFILSNLIVLISYLGYRNYRKRIKNPYFFISLITLIIMCQDVVLEGNMML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH LISYALFTTMAIQSRRYKKSETLLQSK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MQTVNNHFYKTLLLLSFFSAGFSLYYVFIPLLIISLILSMIKNRTLYAGCTAASYNVLFI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHH VLFVFSVFSIGSELLILESPVKYAMYMIFLIVCLPLLLINNFEYAWYMLFFFILGVFFRA HHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESIVVYSFLDPSGVYGYGKLLDPFNHEEINSPGISNSLAIVFMFFFVAYKNTLSLKYLLI CCEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIYPLILLSSIFLGGRAFFIIALVCITYKYSRNFKIKTLIGLTILICLGCIFSLLVKEIP HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC FFDKYFDLIFERFGSEGLKSARFELIQDGITKFLIHPLGGFTPNASEYSGYWYHNIYLDS CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECC ARVAGVISLIPFILSNLIVLISYLGYRNYRKRIKNPYFFISLITLIIMCQDVVLEGNMML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH LISYALFTTMAIQSRRYKKSETLLQSK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA