Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is spoIIE [H]

Identifier: 218231970

GI number: 218231970

Start: 64730

End: 67201

Strand: Direct

Name: spoIIE [H]

Synonym: BCB4264_A0069

Alternate gene names: 218231970

Gene position: 64730-67201 (Clockwise)

Preceding gene: 218231669

Following gene: 218235253

Centisome position: 1.19

GC content: 36.17

Gene sequence:

>2472_bases
ATGCCTAAAGCAGGAAGGAATACTATGAATACAAGTGCATTGGCAATGAATGAGAGTCAGCTTGGTGGAATAAAGTGGAC
GAGTAAGTTGCGAATGAAATTTGAGCAAGTTTTCTTTAGATGGGGATTTATTATTGTTGTTATTGGTTTTCTTTTGGGAC
GAGCATATATATTAACAAATATTTTACCGTTTGCACTGCCATTTTTTGCTGCTGTTTATGTTATGAAGCGGGATAAGATG
CCGCTAGCATTTTTAGCTCTAATGGGAGGAGCTCTTTCAGTATCGATAGATAATTTGTTTTTTACCTTTGCATCTATCTT
TACCTTCTTCATTTATAATATCTTCTTTAGTCGATTTACACGTAAAACTGTTGGACTTGTTCCATTTCAAGTATTTATCT
CCGCATTAACCGCACACTTAGTTGTTGTATATTTTGCGCAACAAACTGTCACCATGTACGATTTACTCGTTAGTACCATT
GAGGCTGGACTTAGTTTTGTATTAACTATGATATTTTTACAAAGTGTCCCGCTTTTAGTGGAAAGGAAAGGAAAACAACA
GGCATTAGAGACGGAAGAAATTGTTTGTTTGATTATATTACTAGCATCTGTTTTAACGGGTACAACAGATTGGTTTGTAT
ATGATGCTTCTATTCAACATATTTTTACAAGGTATTTAGTGCTAGTATTTGCATTTATTGCGGGTGCTGCCACAGGGTCT
ACAGTGGGGGTTGTAACAGGACTAATATTAAGTTTAGCAAATGTGTCTAGCTTGTCTCAGCTTAGCCTTCTTGCTTTTTC
TGGATTGCTTGGTGGATTGTTAAAAGAAGGAAAGCGTTTAGGTGTTAGTTTAGGTTTATTAATTGGGACAAGCTTAATTA
CATTATATGTAGACAAACAGACAAATATTGTAACAACTTTAATTGAGTCAGGTGTAGCGATTGTTATCTTCTTATTAACA
CCGAAGCTTGTTTTGGATCGTATTGCTAAATTTATGCCAGGTACACAAGAGCATTCGCAAGATCAACAACAATATTTAAG
AAGGATGCGTGATGTTACAGCAAATAAAATCAACCAATTTGCAAATGTATTTGCTGCTTTATCTAATAGCTTTTCTGTAT
ATGGGTATGTAGAGGAAGAAGATAAAGAGACAGAAGCAGATTTGTTTTTGAGTACAATTACTGCGAAAACATGTCAAACA
TGCTTTAAAAAGGATCAATGCTGGGTAGTGAATTTTGATAAAACGTACGATTATATGAAACAAATAATGAATGAAACGGA
AGAAGGAACCCTGCAACATAATCGTAAATTAGTTCGTGAGTGGGACAAGCATTGTGTGAGAGGGAAAAAAGTGACGGATT
TAGTAGCCGGTGAATTAGATCACTTCTATGAGGGACAAAAATTACGAAAACAAATGAAGGAAAATCGTAGAATAGTAGCG
GAGCAACTATTAGGTGTATCAAAGGTTATGGAGGATTTTGCTAAGGAGATACAACGAGAGCGTGAAAATCATCAAGTGCA
GGAAGAACAGATTATGCAAGCGTTCCGAGATTTTGGTGTCGAAGTAGAGCATGTTGATATTTATTGTTTAGATAGAGGAA
GTATTGATATTGAAATGTTAATTCCAGTTGCATCTAATGAACATGGTGAGTGTGAAAAGTTAGTTGCACCGATGCTTTCA
GATATCCTTAAAGAAAATATTGTCGTTAAACATGAAGAAAAGTCTTCTTATCCAAATGGCCACAGTTTAATATCATTTGG
TTCGGCGAAGACGTATTCTCTTGATACAGGATTGGCTACAGCTGCAAAAGGCGGTGGATTTGTTTCGGGTGACTCTTATG
CGATGATGGATTTAAGTGTTGGTAAATATGCACTTGCGATTAGTGATGGTATGGGTAATGGGCAAAGAGCTCATATGGAA
AGTAAGGAAACGGTGAAATTATTACAAAAAATACTCCAATCAGGCATTGATGAAGAAATAGCAATTAAGTCTATCAATTC
AATTCTTTCTTTGAGAACGACAGAAGAAATGTTTACGACATTAGATTTAGCTATGGTAGATTTGCGGGATGCGAGTGCAA
GGTTTTTAAAGATTGGATCGACGCCGAGTTTTGTTAAACGCGCAAATAATATTTTGAAAATTGAAGCAAGTAATTTGCCG
ATGGGAATCATCGAAGATGTTGAAGTTGATGTGGTGGGTGAACAATTAAAAACGGGCGATATTCTTATTATGATGAGCGA
TGGGATTTTTGAAGGAGCACAGCATGTGGAGAATCATGAATTGTGGATGAAACGAAAAATTAAAGAATTGCAAACCGAAG
ACCCGCAAGAAATTGCTGATATCATTATGGAAGAAGTGATTCGCTCTTGTGATGGTTATATAAATGATGATATGACTATT
GTAGTGGCAAAAGTGAAGAAAAATATGCCGAAGTGGGCTACGATTCCGATTGTAGGAATGCAGGCGCAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTCGAACGATTATAAAAGTGAAAACTGTTGTTTTGACAAAAAAACCAACAATCATCTTTTATAATGACAGTAATTAAACT
ATGCAGGTGGTGTTAAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGTAAGTGGAATGTTTATCTATAATTTGATTTTAAAAACCTAGGTGAATACCTAGGTTTTTTTGTGGGAAAAGGTAAT
GTTATTAATTTTGTGAATAT

Product: stage II sporulation protein E

Products: NA

Alternate protein names: Stage II sporulation protein H [H]

Number of amino acids: Translated: 823; Mature: 822

Protein sequence:

>823_residues
MPKAGRNTMNTSALAMNESQLGGIKWTSKLRMKFEQVFFRWGFIIVVIGFLLGRAYILTNILPFALPFFAAVYVMKRDKM
PLAFLALMGGALSVSIDNLFFTFASIFTFFIYNIFFSRFTRKTVGLVPFQVFISALTAHLVVVYFAQQTVTMYDLLVSTI
EAGLSFVLTMIFLQSVPLLVERKGKQQALETEEIVCLIILLASVLTGTTDWFVYDASIQHIFTRYLVLVFAFIAGAATGS
TVGVVTGLILSLANVSSLSQLSLLAFSGLLGGLLKEGKRLGVSLGLLIGTSLITLYVDKQTNIVTTLIESGVAIVIFLLT
PKLVLDRIAKFMPGTQEHSQDQQQYLRRMRDVTANKINQFANVFAALSNSFSVYGYVEEEDKETEADLFLSTITAKTCQT
CFKKDQCWVVNFDKTYDYMKQIMNETEEGTLQHNRKLVREWDKHCVRGKKVTDLVAGELDHFYEGQKLRKQMKENRRIVA
EQLLGVSKVMEDFAKEIQRERENHQVQEEQIMQAFRDFGVEVEHVDIYCLDRGSIDIEMLIPVASNEHGECEKLVAPMLS
DILKENIVVKHEEKSSYPNGHSLISFGSAKTYSLDTGLATAAKGGGFVSGDSYAMMDLSVGKYALAISDGMGNGQRAHME
SKETVKLLQKILQSGIDEEIAIKSINSILSLRTTEEMFTTLDLAMVDLRDASARFLKIGSTPSFVKRANNILKIEASNLP
MGIIEDVEVDVVGEQLKTGDILIMMSDGIFEGAQHVENHELWMKRKIKELQTEDPQEIADIIMEEVIRSCDGYINDDMTI
VVAKVKKNMPKWATIPIVGMQAQ

Sequences:

>Translated_823_residues
MPKAGRNTMNTSALAMNESQLGGIKWTSKLRMKFEQVFFRWGFIIVVIGFLLGRAYILTNILPFALPFFAAVYVMKRDKM
PLAFLALMGGALSVSIDNLFFTFASIFTFFIYNIFFSRFTRKTVGLVPFQVFISALTAHLVVVYFAQQTVTMYDLLVSTI
EAGLSFVLTMIFLQSVPLLVERKGKQQALETEEIVCLIILLASVLTGTTDWFVYDASIQHIFTRYLVLVFAFIAGAATGS
TVGVVTGLILSLANVSSLSQLSLLAFSGLLGGLLKEGKRLGVSLGLLIGTSLITLYVDKQTNIVTTLIESGVAIVIFLLT
PKLVLDRIAKFMPGTQEHSQDQQQYLRRMRDVTANKINQFANVFAALSNSFSVYGYVEEEDKETEADLFLSTITAKTCQT
CFKKDQCWVVNFDKTYDYMKQIMNETEEGTLQHNRKLVREWDKHCVRGKKVTDLVAGELDHFYEGQKLRKQMKENRRIVA
EQLLGVSKVMEDFAKEIQRERENHQVQEEQIMQAFRDFGVEVEHVDIYCLDRGSIDIEMLIPVASNEHGECEKLVAPMLS
DILKENIVVKHEEKSSYPNGHSLISFGSAKTYSLDTGLATAAKGGGFVSGDSYAMMDLSVGKYALAISDGMGNGQRAHME
SKETVKLLQKILQSGIDEEIAIKSINSILSLRTTEEMFTTLDLAMVDLRDASARFLKIGSTPSFVKRANNILKIEASNLP
MGIIEDVEVDVVGEQLKTGDILIMMSDGIFEGAQHVENHELWMKRKIKELQTEDPQEIADIIMEEVIRSCDGYINDDMTI
VVAKVKKNMPKWATIPIVGMQAQ
>Mature_822_residues
PKAGRNTMNTSALAMNESQLGGIKWTSKLRMKFEQVFFRWGFIIVVIGFLLGRAYILTNILPFALPFFAAVYVMKRDKMP
LAFLALMGGALSVSIDNLFFTFASIFTFFIYNIFFSRFTRKTVGLVPFQVFISALTAHLVVVYFAQQTVTMYDLLVSTIE
AGLSFVLTMIFLQSVPLLVERKGKQQALETEEIVCLIILLASVLTGTTDWFVYDASIQHIFTRYLVLVFAFIAGAATGST
VGVVTGLILSLANVSSLSQLSLLAFSGLLGGLLKEGKRLGVSLGLLIGTSLITLYVDKQTNIVTTLIESGVAIVIFLLTP
KLVLDRIAKFMPGTQEHSQDQQQYLRRMRDVTANKINQFANVFAALSNSFSVYGYVEEEDKETEADLFLSTITAKTCQTC
FKKDQCWVVNFDKTYDYMKQIMNETEEGTLQHNRKLVREWDKHCVRGKKVTDLVAGELDHFYEGQKLRKQMKENRRIVAE
QLLGVSKVMEDFAKEIQRERENHQVQEEQIMQAFRDFGVEVEHVDIYCLDRGSIDIEMLIPVASNEHGECEKLVAPMLSD
ILKENIVVKHEEKSSYPNGHSLISFGSAKTYSLDTGLATAAKGGGFVSGDSYAMMDLSVGKYALAISDGMGNGQRAHMES
KETVKLLQKILQSGIDEEIAIKSINSILSLRTTEEMFTTLDLAMVDLRDASARFLKIGSTPSFVKRANNILKIEASNLPM
GIIEDVEVDVVGEQLKTGDILIMMSDGIFEGAQHVENHELWMKRKIKELQTEDPQEIADIIMEEVIRSCDGYINDDMTIV
VAKVKKNMPKWATIPIVGMQAQ

Specific function: Normally needed for pro-sigma E processing during sporulation but can be bypassed in vegetative cells. Activates spoIIAA by dephosphorylation [H]

COG id: COG2208

COG function: function code TK; Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein. Note=Polar septum [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 PP2C-like domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001932
- InterPro:   IPR014221
- InterPro:   IPR010822 [H]

Pfam domain/function: PF07228 SpoIIE [H]

EC number: =3.1.3.16 [H]

Molecular weight: Translated: 92103; Mature: 91972

Theoretical pI: Translated: 5.83; Mature: 5.83

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHCCCCCEEEEEEEECCCC
>Mature Secondary Structure 
PKAGRNTMNTSALAMNESQLGGIKWTSKLRMKFEQVFFRWGFIIVVIGFLLGRAYILTN
CCCCCCCCCCHHEEECCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILPFALPFFAAVYVMKRDKMPLAFLALMGGALSVSIDNLFFTFASIFTFFIYNIFFSRFT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKTVGLVPFQVFISALTAHLVVVYFAQQTVTMYDLLVSTIEAGLSFVLTMIFLQSVPLLV
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
ERKGKQQALETEEIVCLIILLASVLTGTTDWFVYDASIQHIFTRYLVLVFAFIAGAATGS
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
TVGVVTGLILSLANVSSLSQLSLLAFSGLLGGLLKEGKRLGVSLGLLIGTSLITLYVDKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHHHHHEEEEEECCC
TNIVTTLIESGVAIVIFLLTPKLVLDRIAKFMPGTQEHSQDQQQYLRRMRDVTANKINQF
CHHHHHHHHCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANVFAALSNSFSVYGYVEEEDKETEADLFLSTITAKTCQTCFKKDQCWVVNFDKTYDYMK
HHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHH
QIMNETEEGTLQHNRKLVREWDKHCVRGKKVTDLVAGELDHFYEGQKLRKQMKENRRIVA
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
EQLLGVSKVMEDFAKEIQRERENHQVQEEQIMQAFRDFGVEVEHVDIYCLDRGSIDIEML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCCEEEEEE
IPVASNEHGECEKLVAPMLSDILKENIVVKHEEKSSYPNGHSLISFGSAKTYSLDTGLAT
EEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCHH
AAKGGGFVSGDSYAMMDLSVGKYALAISDGMGNGQRAHMESKETVKLLQKILQSGIDEEI
HCCCCCEECCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
AIKSINSILSLRTTEEMFTTLDLAMVDLRDASARFLKIGSTPSFVKRANNILKIEASNLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHCCCEEEEEECCCC
MGIIEDVEVDVVGEQLKTGDILIMMSDGIFEGAQHVENHELWMKRKIKELQTEDPQEIAD
CCCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
IIMEEVIRSCDGYINDDMTIVVAKVKKNMPKWATIPIVGMQAQ
HHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHCCCCCEEEEEEEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 8830262; 9384377; 2832371; 8113187; 7570023 [H]