| Definition | Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011593 |
| Length | 2,832,748 |
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The map label for this gene is 213692962
Identifier: 213692962
GI number: 213692962
Start: 2328313
End: 2329482
Strand: Reverse
Name: 213692962
Synonym: Blon_2108
Alternate gene names: NA
Gene position: 2329482-2328313 (Counterclockwise)
Preceding gene: 213692963
Following gene: 213692961
Centisome position: 82.23
GC content: 33.42
Gene sequence:
>1170_bases TTGATTTATATGTTTCAAATATTATTTTATCCGCTTGTATTCGCTATCTCGCTTGTTTTTTTCTGGATTTCAGACAGATC GGCGCATTTCTGGGGCGGTGAACAATATAGATATTTATTATGTAAAATCTTTTCTGCATCTGGAATTCTCTTTCTTGCAT CAATCGCCGGTGTGCGTGATGTGACTATTGGTACTGATGTCAAGGTATATGTGATTGACACATTCGAAAAAGTCAGTCAG CTGCGTTTTACGGATATATTTATTAGTTATTTTGGAATTGATAAGCCTATTCCTCTTGGTTTTGCACTACTTGCTTGGCT ATGTGCTCACGTAGTCTCAGATGTCCATTTTTTCTTATTTGCAATAGAATTATTAATCATATTCATGCTCTATGTTTCTG CTGCAAGATTCTGTAAGGGAAGGACTTGGCTATGCATGGCCGCATATATGCTATTCTTCTATGCTGAATCTATGAATACT ATGAAGCAGTACTTAGCTGTCGCAATTTGCTTATATTCTCTAAGATATTGCTTTGACAAAAAAATCGTAAAATTTATTTG TGTAATTTTTATTGCAACACAGTTTCATTTCACTGCATTAACTGCTCTGGTATATTATCCGTGTGTTTTATTGATAAAAG GAGAAAACACTGGAAATATTGTAAGCACCGAAAAAACAAGAAGGACGTTTCTTGTATTAATTACATTATTTATATTTGTT TTAGGGTATTATAGTGGATCTACTCTAGTAAGATTTGTTGCGGAATATCATCCCACTGTTAATTGGAGTGTAGCTCGACT TGGTACGGGTGGCACGTCTATCCTGCCAATCATTTCTGCTGTTCTGATTTCCTGTATTTTTTTAGTAGTCAAAAACCAAG ATAAAGACATTATTTACAACCAGAATTTAAATGTATATGTATATTTTGCAATTATAGGTTGGCTTGGTACTGAATTTACA GTGATTAGTCCAAATATCGATAGAGTTTTCCTTTACGAGAAAATTTTTACTATATTATTAATACCTAATATTTTTTCCAG TAATAAGCTGTTAGAGAAAACGCTACAATTATTATTCTTATTGTGGGGCGTAGTGTGTTTTTTGTATCTGGTCATATATG GTGGCTGGTATGAAGTATACCCTTACACTTCAGAAATACTTGGTATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTGGTTTAGGCACACGCAGATTCGTCTAGGAAGGAAGCGGTGGGCGTGACGTTATTAGCAGTAGTGTTTCTAGATTGATC CCTTAAAATAGATGAATTAG
Downstream 100 bases:
>100_bases TTGACAGTTTCGAGTATTAAATAAGGAGTATGTATGACCATAAAAGTTTTATATTATTCTGAAGGTTGGGGCTTAGGTGG TATTGAACGTTTCATAGTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 389; Mature: 389
Protein sequence:
>389_residues MIYMFQILFYPLVFAISLVFFWISDRSAHFWGGEQYRYLLCKIFSASGILFLASIAGVRDVTIGTDVKVYVIDTFEKVSQ LRFTDIFISYFGIDKPIPLGFALLAWLCAHVVSDVHFFLFAIELLIIFMLYVSAARFCKGRTWLCMAAYMLFFYAESMNT MKQYLAVAICLYSLRYCFDKKIVKFICVIFIATQFHFTALTALVYYPCVLLIKGENTGNIVSTEKTRRTFLVLITLFIFV LGYYSGSTLVRFVAEYHPTVNWSVARLGTGGTSILPIISAVLISCIFLVVKNQDKDIIYNQNLNVYVYFAIIGWLGTEFT VISPNIDRVFLYEKIFTILLIPNIFSSNKLLEKTLQLLFLLWGVVCFLYLVIYGGWYEVYPYTSEILGI
Sequences:
>Translated_389_residues MIYMFQILFYPLVFAISLVFFWISDRSAHFWGGEQYRYLLCKIFSASGILFLASIAGVRDVTIGTDVKVYVIDTFEKVSQ LRFTDIFISYFGIDKPIPLGFALLAWLCAHVVSDVHFFLFAIELLIIFMLYVSAARFCKGRTWLCMAAYMLFFYAESMNT MKQYLAVAICLYSLRYCFDKKIVKFICVIFIATQFHFTALTALVYYPCVLLIKGENTGNIVSTEKTRRTFLVLITLFIFV LGYYSGSTLVRFVAEYHPTVNWSVARLGTGGTSILPIISAVLISCIFLVVKNQDKDIIYNQNLNVYVYFAIIGWLGTEFT VISPNIDRVFLYEKIFTILLIPNIFSSNKLLEKTLQLLFLLWGVVCFLYLVIYGGWYEVYPYTSEILGI >Mature_389_residues MIYMFQILFYPLVFAISLVFFWISDRSAHFWGGEQYRYLLCKIFSASGILFLASIAGVRDVTIGTDVKVYVIDTFEKVSQ LRFTDIFISYFGIDKPIPLGFALLAWLCAHVVSDVHFFLFAIELLIIFMLYVSAARFCKGRTWLCMAAYMLFFYAESMNT MKQYLAVAICLYSLRYCFDKKIVKFICVIFIATQFHFTALTALVYYPCVLLIKGENTGNIVSTEKTRRTFLVLITLFIFV LGYYSGSTLVRFVAEYHPTVNWSVARLGTGGTSILPIISAVLISCIFLVVKNQDKDIIYNQNLNVYVYFAIIGWLGTEFT VISPNIDRVFLYEKIFTILLIPNIFSSNKLLEKTLQLLFLLWGVVCFLYLVIYGGWYEVYPYTSEILGI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 44768; Mature: 44768
Theoretical pI: Translated: 8.36; Mature: 8.36
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.6 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 4.4 %Cys+Met (Translated Protein) 2.6 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 4.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIYMFQILFYPLVFAISLVFFWISDRSAHFWGGEQYRYLLCKIFSASGILFLASIAGVRD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCE VTIGTDVKVYVIDTFEKVSQLRFTDIFISYFGIDKPIPLGFALLAWLCAHVVSDVHFFLF EEECCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIELLIIFMLYVSAARFCKGRTWLCMAAYMLFFYAESMNTMKQYLAVAICLYSLRYCFDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIVKFICVIFIATQFHFTALTALVYYPCVLLIKGENTGNIVSTEKTRRTFLVLITLFIFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH LGYYSGSTLVRFVAEYHPTVNWSVARLGTGGTSILPIISAVLISCIFLVVKNQDKDIIYN HHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE QNLNVYVYFAIIGWLGTEFTVISPNIDRVFLYEKIFTILLIPNIFSSNKLLEKTLQLLFL CCCCEEEHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH LWGVVCFLYLVIYGGWYEVYPYTSEILGI HHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHCCC >Mature Secondary Structure MIYMFQILFYPLVFAISLVFFWISDRSAHFWGGEQYRYLLCKIFSASGILFLASIAGVRD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCE VTIGTDVKVYVIDTFEKVSQLRFTDIFISYFGIDKPIPLGFALLAWLCAHVVSDVHFFLF EEECCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIELLIIFMLYVSAARFCKGRTWLCMAAYMLFFYAESMNTMKQYLAVAICLYSLRYCFDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIVKFICVIFIATQFHFTALTALVYYPCVLLIKGENTGNIVSTEKTRRTFLVLITLFIFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH LGYYSGSTLVRFVAEYHPTVNWSVARLGTGGTSILPIISAVLISCIFLVVKNQDKDIIYN HHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE QNLNVYVYFAIIGWLGTEFTVISPNIDRVFLYEKIFTILLIPNIFSSNKLLEKTLQLLFL CCCCEEEHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH LWGVVCFLYLVIYGGWYEVYPYTSEILGI HHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA