| Definition | Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011312 |
| Length | 3,325,165 |
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The map label for this gene is glnE [H]
Identifier: 209696085
GI number: 209696085
Start: 2896686
End: 2899526
Strand: Reverse
Name: glnE [H]
Synonym: VSAL_I2677
Alternate gene names: 209696085
Gene position: 2899526-2896686 (Counterclockwise)
Preceding gene: 209696086
Following gene: 209696084
Centisome position: 87.2
GC content: 40.37
Gene sequence:
>2841_bases ATGTCTTTGCCTTCATCATTAGTGTCTCTTGCTCAGCAACGTGTAGACGAACTAACCTATCTTTCTCATGTAAAAATGTG GCCTGAAGAATTTCAACAACAGTTACTGGTTTCTTTCGGTTGCAGTGATTTTTTGTATGACGCATTTCAACAAGATGAGT TTCTATGCGAACACTTTCCCTCATTTTTTGAGAATACGCCTCGAGCAGAATCATATCGTTCTCGATTAGAGATCCAGCTT CAGTTGTGTCTTGATGAAAATGCATTAATGAGAGAACTGCGTTATTTTCGTCGCAGAGAAATGAGTTACATTGCGTGGCG CGACTTTAACCGTTCGTGGTCATTAGAAGAAAGCCTGTCACACCTTTCTTTACTTGCAGAGGCGTTAATTGTTGAGTCTT ACCAATGGATATACAAGCAAGCGTGTATCGATTGGGGCACCCCTAAAAATGAGCAAGGGGAAGAACAACCCATGCTTATT ATTGGAATGGGTAAACTTGGTGGTGGAGAACTTAACTTTTCTTCGGATATCGATTTGATTTTTACCTACCCAGAAAATGG AGAGACAGAAGGAGCACGTCGAAGCATCGCTAATGCACAATTTTTTACACGTTTAGGGCAAAAACTGATTAAAGCTCTTG ATCAAACCACCTTCGATGGGTTTTGTTATCGAGTGGATTTACGTTTGCGCCCATTTGGGGACAGCGGCCCGTTAGTCATG AGTTATGCGGCATTAGAAGATTATTACCAAGAACAAGGTCGTGATTGGGAACGCTATGCCATGATAAAAGCCCGAGTGAT GGGCAAAGAAACATATAGCCATTATCAAGAATTGCGTCAAATGCTTCGCCCTTTTGTTTTTCGTCGTTATATCGATTTTG GTGCAATTCAAGCATTACGCCGTATGAAATCAATGATAAGTACAGAAGTTCGCCGTCGTGGATTAAGCAATAATATTAAA TTAGGGGCTGGCGGGATCCGTGAAATTGAATTTATCGCTCAAGTGTTTCAATTAATTCGAGGAGGCAGAGAGCCTTCATT GCGAGGGCGTGGCTTATTAGAAACATTAGAGGCAATTAAAGTGTTAGGACAATTGCCCCCACAAGATGTTGATGATCTTG TCGATTCTTATTGTTTTTTACGTCGTTTAGAAAACTGCCTTCAGGCGATTAATGATAAACAAACTCAAACTCTGCCTGAT GATGAAAGAGATCAACATCGTTTAGCTTTTGCGATGGGTGAAAATAATTGGGATGATTTATTCGTTACAATCCAACAACG AATGAATACCGTCCATACCGTTTTTGAAGAGCTTATTGGTCATGATGACGATGAATCAGAAAGCAATATTGATAAATCGT ACAGTGAACTTTGGGATATGGCTCATAACCAAGATGTTTTAGAGCACATTCTGGAAGAGTTAAACCCAGAGCAAGCAGAA ATTCTTGTCTTACAAATCATTAGATTTAAAGGGGAACTGAAAAAGAAAACTTTAGGTCCAAGAGGACGAGAAGCCATCAC GCATCTAATGCCCAAACTATTTAGTATTGTGATTAGTCGAGAAGATGCGAAAGATACGTTACCGAGATTAACAAACCTGA TTCAAGCAATCGCTACACGTACGACGTATTTAGAATTACTTGATGAGAACTCAGGGGCATTGCAACATCTTGTCCGTTTG TGTGCGGCAAGCCCGATGGTTGCCGAGCAACTTACTCGTTACCCAATCTTGTTAGATGAATTACTGGATATTAACCAACT CTATAATCCAATTGAATTAAGCCAATACAAAATTGAGCTGCATGAGTTTCTTGCTCGTATTCCTGAAGATGATATGGAAC AACAGATGGAAGCATTACGCCAATTTAAGCAAGTTGGCTTATTGCGTATCGCTGCGTCTGATATTTCTGGTGGCTTATCA TTAATGAAAGTGAGCGACCACTTAACGTACTTATCTGAAGCGATTGTTGAAGCTGCATTAAACCAAGCTTGGTTACAAGT GACTGAAAAGTTTGGAGTCCCCACACATCTTGAAGGTCGAGACAGTAAAGGGTTTGCAGTTATAGGTTATGGCAAAGTGG GCGGTTGGGAGCTTGGCTATAATTCTGATCTTGATATTGTGTTTATGCATGATTGTGATGCCAATACATATACGAATGGC AAAAAAGAGATTGATGGACGTCAGTTCTATTTGCGTTTAGCACAGCGAATTATCCATATTTTCTCGGTACGAACCGCGTC AGGTATTTTGTATGAAGTTGATACACGCTTACGTCCATCAGGAGCATCAGGGTTACTTGTTAGTACCAGTGACGCTTTTG ATGAATACCAAAGAAAAGAGGCGTGGACATGGGAGCATCAAGCGTTAGTTCGTTCTCGTATGATTTATGGTGATCCTATT TTACAGGATGCATTTAATACAACACGCCATGAGATTTTATGCTTGAGACGTGAGAGTGCAAAATTACGACAAGATGTAGT CGAAATGCGTGAAAAAATGCGCGACCATCTGGGAAGTAAAAAACAAGGTCGGTTTATGTTGAAACAAGATGCCGGGGGCA TTACCGACATTGAATTTCTCGCTCAATATCTTGTGTTAAACAACAGTCACGATAATCCTAAATTAACGCGTTGGTCTGAT AATGTTAGGATATTTGAAAGTCTTGCTGAACAAGGCGTGATATCTGAAAGTCTTTCATCAACGCTGATTGATGCGTATTG TGTCATGAGAAATGAGATACATCATCGCAATTTATTAGGGTTTGATGCCGATGTGGCGGATGATTGTTTTCTTGATGAGA AGAGTGCGGTAATGACTGCATGGAAAGATTGGCTTGAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases ACGCCCGCACTCAGTTGTGGGCGTTTTTGTTTGCGACAAAATACAAAGTTTGGCACAGTGTTAGCATTACCTTTGTATGG AATTTTCGATAAGGAATATC
Downstream 100 bases:
>100_bases TCGTTTATTTACCTAATGATTGGGGGTGATTAGGGTTATTTAACCATGAGTTCAGTAATCCTAAGTTGGCGCAGAACTTG CGTAAATGCTACCATTTATA
Product: bifunctional glutamine-synthetase adenylyltransferase/deadenyltransferase
Products: NA
Alternate protein names: Glutamine-synthetase adenylyltransferase; ATase; [Glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase [H]
Number of amino acids: Translated: 946; Mature: 945
Protein sequence:
>946_residues MSLPSSLVSLAQQRVDELTYLSHVKMWPEEFQQQLLVSFGCSDFLYDAFQQDEFLCEHFPSFFENTPRAESYRSRLEIQL QLCLDENALMRELRYFRRREMSYIAWRDFNRSWSLEESLSHLSLLAEALIVESYQWIYKQACIDWGTPKNEQGEEQPMLI IGMGKLGGGELNFSSDIDLIFTYPENGETEGARRSIANAQFFTRLGQKLIKALDQTTFDGFCYRVDLRLRPFGDSGPLVM SYAALEDYYQEQGRDWERYAMIKARVMGKETYSHYQELRQMLRPFVFRRYIDFGAIQALRRMKSMISTEVRRRGLSNNIK LGAGGIREIEFIAQVFQLIRGGREPSLRGRGLLETLEAIKVLGQLPPQDVDDLVDSYCFLRRLENCLQAINDKQTQTLPD DERDQHRLAFAMGENNWDDLFVTIQQRMNTVHTVFEELIGHDDDESESNIDKSYSELWDMAHNQDVLEHILEELNPEQAE ILVLQIIRFKGELKKKTLGPRGREAITHLMPKLFSIVISREDAKDTLPRLTNLIQAIATRTTYLELLDENSGALQHLVRL CAASPMVAEQLTRYPILLDELLDINQLYNPIELSQYKIELHEFLARIPEDDMEQQMEALRQFKQVGLLRIAASDISGGLS LMKVSDHLTYLSEAIVEAALNQAWLQVTEKFGVPTHLEGRDSKGFAVIGYGKVGGWELGYNSDLDIVFMHDCDANTYTNG KKEIDGRQFYLRLAQRIIHIFSVRTASGILYEVDTRLRPSGASGLLVSTSDAFDEYQRKEAWTWEHQALVRSRMIYGDPI LQDAFNTTRHEILCLRRESAKLRQDVVEMREKMRDHLGSKKQGRFMLKQDAGGITDIEFLAQYLVLNNSHDNPKLTRWSD NVRIFESLAEQGVISESLSSTLIDAYCVMRNEIHHRNLLGFDADVADDCFLDEKSAVMTAWKDWLE
Sequences:
>Translated_946_residues MSLPSSLVSLAQQRVDELTYLSHVKMWPEEFQQQLLVSFGCSDFLYDAFQQDEFLCEHFPSFFENTPRAESYRSRLEIQL QLCLDENALMRELRYFRRREMSYIAWRDFNRSWSLEESLSHLSLLAEALIVESYQWIYKQACIDWGTPKNEQGEEQPMLI IGMGKLGGGELNFSSDIDLIFTYPENGETEGARRSIANAQFFTRLGQKLIKALDQTTFDGFCYRVDLRLRPFGDSGPLVM SYAALEDYYQEQGRDWERYAMIKARVMGKETYSHYQELRQMLRPFVFRRYIDFGAIQALRRMKSMISTEVRRRGLSNNIK LGAGGIREIEFIAQVFQLIRGGREPSLRGRGLLETLEAIKVLGQLPPQDVDDLVDSYCFLRRLENCLQAINDKQTQTLPD DERDQHRLAFAMGENNWDDLFVTIQQRMNTVHTVFEELIGHDDDESESNIDKSYSELWDMAHNQDVLEHILEELNPEQAE ILVLQIIRFKGELKKKTLGPRGREAITHLMPKLFSIVISREDAKDTLPRLTNLIQAIATRTTYLELLDENSGALQHLVRL CAASPMVAEQLTRYPILLDELLDINQLYNPIELSQYKIELHEFLARIPEDDMEQQMEALRQFKQVGLLRIAASDISGGLS LMKVSDHLTYLSEAIVEAALNQAWLQVTEKFGVPTHLEGRDSKGFAVIGYGKVGGWELGYNSDLDIVFMHDCDANTYTNG KKEIDGRQFYLRLAQRIIHIFSVRTASGILYEVDTRLRPSGASGLLVSTSDAFDEYQRKEAWTWEHQALVRSRMIYGDPI LQDAFNTTRHEILCLRRESAKLRQDVVEMREKMRDHLGSKKQGRFMLKQDAGGITDIEFLAQYLVLNNSHDNPKLTRWSD NVRIFESLAEQGVISESLSSTLIDAYCVMRNEIHHRNLLGFDADVADDCFLDEKSAVMTAWKDWLE >Mature_945_residues SLPSSLVSLAQQRVDELTYLSHVKMWPEEFQQQLLVSFGCSDFLYDAFQQDEFLCEHFPSFFENTPRAESYRSRLEIQLQ LCLDENALMRELRYFRRREMSYIAWRDFNRSWSLEESLSHLSLLAEALIVESYQWIYKQACIDWGTPKNEQGEEQPMLII GMGKLGGGELNFSSDIDLIFTYPENGETEGARRSIANAQFFTRLGQKLIKALDQTTFDGFCYRVDLRLRPFGDSGPLVMS YAALEDYYQEQGRDWERYAMIKARVMGKETYSHYQELRQMLRPFVFRRYIDFGAIQALRRMKSMISTEVRRRGLSNNIKL GAGGIREIEFIAQVFQLIRGGREPSLRGRGLLETLEAIKVLGQLPPQDVDDLVDSYCFLRRLENCLQAINDKQTQTLPDD ERDQHRLAFAMGENNWDDLFVTIQQRMNTVHTVFEELIGHDDDESESNIDKSYSELWDMAHNQDVLEHILEELNPEQAEI LVLQIIRFKGELKKKTLGPRGREAITHLMPKLFSIVISREDAKDTLPRLTNLIQAIATRTTYLELLDENSGALQHLVRLC AASPMVAEQLTRYPILLDELLDINQLYNPIELSQYKIELHEFLARIPEDDMEQQMEALRQFKQVGLLRIAASDISGGLSL MKVSDHLTYLSEAIVEAALNQAWLQVTEKFGVPTHLEGRDSKGFAVIGYGKVGGWELGYNSDLDIVFMHDCDANTYTNGK KEIDGRQFYLRLAQRIIHIFSVRTASGILYEVDTRLRPSGASGLLVSTSDAFDEYQRKEAWTWEHQALVRSRMIYGDPIL QDAFNTTRHEILCLRRESAKLRQDVVEMREKMRDHLGSKKQGRFMLKQDAGGITDIEFLAQYLVLNNSHDNPKLTRWSDN VRIFESLAEQGVISESLSSTLIDAYCVMRNEIHHRNLLGFDADVADDCFLDEKSAVMTAWKDWLE
Specific function: Adenylation and deadenylation of glutamate--ammonia ligase [H]
COG id: COG1391
COG function: function code OT; Glutamine synthetase adenylyltransferase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the glnE family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789433, Length=928, Percent_Identity=57.2198275862069, Blast_Score=1051, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR023057 - InterPro: IPR005190 - InterPro: IPR013546 [H]
Pfam domain/function: PF08335 GlnD_UR_UTase; PF03710 GlnE [H]
EC number: =2.7.7.42 [H]
Molecular weight: Translated: 109261; Mature: 109129
Theoretical pI: Translated: 4.91; Mature: 4.91
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSLPSSLVSLAQQRVDELTYLSHVKMWPEEFQQQLLVSFGCSDFLYDAFQQDEFLCEHFP CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHCH SFFENTPRAESYRSRLEIQLQLCLDENALMRELRYFRRREMSYIAWRDFNRSWSLEESLS HHHCCCCCHHHHHHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCCCCCHHHHHH HLSLLAEALIVESYQWIYKQACIDWGTPKNEQGEEQPMLIIGMGKLGGGELNFSSDIDLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEE FTYPENGETEGARRSIANAQFFTRLGQKLIKALDQTTFDGFCYRVDLRLRPFGDSGPLVM EECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCHHH SYAALEDYYQEQGRDWERYAMIKARVMGKETYSHYQELRQMLRPFVFRRYIDFGAIQALR HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RMKSMISTEVRRRGLSNNIKLGAGGIREIEFIAQVFQLIRGGREPSLRGRGLLETLEAIK HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH VLGQLPPQDVDDLVDSYCFLRRLENCLQAINDKQTQTLPDDERDQHRLAFAMGENNWDDL HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHEEEEECCCCHHHH FVTIQQRMNTVHTVFEELIGHDDDESESNIDKSYSELWDMAHNQDVLEHILEELNPEQAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHH ILVLQIIRFKGELKKKTLGPRGREAITHLMPKLFSIVISREDAKDTLPRLTNLIQAIATR HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTYLELLDENSGALQHLVRLCAASPMVAEQLTRYPILLDELLDINQLYNPIELSQYKIEL HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH HEFLARIPEDDMEQQMEALRQFKQVGLLRIAASDISGGLSLMKVSDHLTYLSEAIVEAAL HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NQAWLQVTEKFGVPTHLEGRDSKGFAVIGYGKVGGWELGYNSDLDIVFMHDCDANTYTNG HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCC KKEIDGRQFYLRLAQRIIHIFSVRTASGILYEVDTRLRPSGASGLLVSTSDAFDEYQRKE CHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHH AWTWEHQALVRSRMIYGDPILQDAFNTTRHEILCLRRESAKLRQDVVEMREKMRDHLGSK CCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC KQGRFMLKQDAGGITDIEFLAQYLVLNNSHDNPKLTRWSDNVRIFESLAEQGVISESLSS CCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH TLIDAYCVMRNEIHHRNLLGFDADVADDCFLDEKSAVMTAWKDWLE HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SLPSSLVSLAQQRVDELTYLSHVKMWPEEFQQQLLVSFGCSDFLYDAFQQDEFLCEHFP CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHCH SFFENTPRAESYRSRLEIQLQLCLDENALMRELRYFRRREMSYIAWRDFNRSWSLEESLS HHHCCCCCHHHHHHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCCCCCHHHHHH HLSLLAEALIVESYQWIYKQACIDWGTPKNEQGEEQPMLIIGMGKLGGGELNFSSDIDLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEE FTYPENGETEGARRSIANAQFFTRLGQKLIKALDQTTFDGFCYRVDLRLRPFGDSGPLVM EECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCHHH SYAALEDYYQEQGRDWERYAMIKARVMGKETYSHYQELRQMLRPFVFRRYIDFGAIQALR HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RMKSMISTEVRRRGLSNNIKLGAGGIREIEFIAQVFQLIRGGREPSLRGRGLLETLEAIK HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH VLGQLPPQDVDDLVDSYCFLRRLENCLQAINDKQTQTLPDDERDQHRLAFAMGENNWDDL HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHEEEEECCCCHHHH FVTIQQRMNTVHTVFEELIGHDDDESESNIDKSYSELWDMAHNQDVLEHILEELNPEQAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHH ILVLQIIRFKGELKKKTLGPRGREAITHLMPKLFSIVISREDAKDTLPRLTNLIQAIATR HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTYLELLDENSGALQHLVRLCAASPMVAEQLTRYPILLDELLDINQLYNPIELSQYKIEL HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH HEFLARIPEDDMEQQMEALRQFKQVGLLRIAASDISGGLSLMKVSDHLTYLSEAIVEAAL HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NQAWLQVTEKFGVPTHLEGRDSKGFAVIGYGKVGGWELGYNSDLDIVFMHDCDANTYTNG HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCC KKEIDGRQFYLRLAQRIIHIFSVRTASGILYEVDTRLRPSGASGLLVSTSDAFDEYQRKE CHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHH AWTWEHQALVRSRMIYGDPILQDAFNTTRHEILCLRRESAKLRQDVVEMREKMRDHLGSK CCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC KQGRFMLKQDAGGITDIEFLAQYLVLNNSHDNPKLTRWSDNVRIFESLAEQGVISESLSS CCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH TLIDAYCVMRNEIHHRNLLGFDADVADDCFLDEKSAVMTAWKDWLE HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12620739 [H]