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The map label for this gene is 209695585

Identifier: 209695585

GI number: 209695585

Start: 2300762

End: 2302348

Strand: Reverse

Name: 209695585

Synonym: VSAL_I2144

Alternate gene names: NA

Gene position: 2302348-2300762 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209695587

Following gene: 209695584

Centisome position: 69.24

GC content: 38.94

Gene sequence:

>1587_bases
ATGAATTTAGCCGATTTTTCCAATTCTCCAATTTCAATATTGCCCCCATTAGTTGCACTGGGTTTAGCTATCATTACGCG
TCGAGTTTTATTATCTCTCGGTGTGGGTATCGTTTTAGGTGCTATCTTATTATCAAGTTATTCTATTTCTGGCACAAGCA
CGTATGTCTTTAATTCAGTTAAAGGTGTATTTATTGCTGACGGAGCAATAAATAGCTGGAATATGAGTATTGTTGCTTTT
TTAATCTTATTAGGAATGACAACAGCACTTTTAACCCTATCAGGCGGAACACGCGCTTTTGCTGAATGGGCACAAACACG
TATTAAAAGTAAACGTGGAGCAAAATTATTGGCAGCCTGCTTAGGTGTGTTTATTTTTGTTGATGATTATTTTAATAGCT
TAGCCGTTGGTTCAATATCCCGCCCTGTAACTGACCGTTTTTATGTATCACGTGCTAAGTTAGCTTATATTTTAGATTCA
ACAGCCGCTCCTATGTGTGTACTAATGCCTGCGTCTAGCTGGGGTGTATACATTATTACTATTATTGGTGGTATTTTAGT
TTCTCATGGAGTGACTGAATATTCAGCACTGGGCGCTTATGTTCGTCTCATTCCTATGAACTTCTATGCGGTATTTGCAT
TATTAATGGTATTTGCTGTCGTTTGGTTCCAATTAGATATTGGTCCGATGCGAGATCATGAAAATGAAGCTAATCGTGGT
AATGGCTTTGATGATCAAGCGGTTGATAAAGAATCGAAAGACTTAAATGAAGAGCTAAACATCACAGAAAGTGATACTGG
TAAAGTTTCTGATTTAATCTTTCCAATTATCGTACTAATTGTCGCGACTATTTTCTTCATGGTTTATACCGGTGCTCAAG
CGTTAATCGCTGATGGTAAAGAGTTCAATATTCTGGGTACCTTTGAGAATACCGATGTTGGAACCTCATTATGTTACGGT
GCTTTACTTGGTTTAGCGTCTGCATTAATTACGGTTTTCCGCCAAAATATAGAAATGAAAGACATTGCAATCACAATGTG
GATTGGTGCTAAGTCAATGTTTGGCGCAATACTAATTCTATTCTTTGCGTGGACAATTGGTTCTGTTATCGGTGATATGC
AAACCGGTTCATATTTGTCTAGCTTAGCTCAAGGCAGTATTGGTATTCATTGGATCCCAGTTATTTTGTTCTTATTGTCA
GGTTTGATGGCATTTAGTACAGGTACGTCATGGGGTACATTTGGTATTATGCTTCCTATCGCAGGAGACATGGCTGGTGC
AACAGATATCGCACTCATTTTACCAATGCTAGGTGCTGTGTTAGCTGGATCTGTGTTTGGTGATCACTGTTCTCCTATCT
CTGATACAACAATCTTGTCTTCAACAGGGGCTCGTTGTTGCCATATAGACCATGTATCGACACAATTACCTTATGCGTTA
TCTATTGCCGGTGTTTCAGCGGTTGGTTATATAGCACTTGGCTTTACTAACTCTGTATGGATGTCATTTTTAGCATCAAC
CGTTGCCTTTGTTCTTGTTTGTGGCGCAATGATGGTAATTTCAAAGAAGGGTCGCGTAACCGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGCGCTACTGTGGGGGAATGGTTTTATTACATTCACTTCCTTATAACGGTATATACCGTATCTACAGTAGATCTCCAAC
CAAACTGGTTGTTGTAGATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCCTCTCTTTTTTTAACTCTTAAAAAACCGGCTTTTATTGCCGGTTTTTTATTGCTATTTTTCTGTTTAATCGCGATCAT
GGCGCTTCATATATGCTTTT

Product: sodium/proton antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 528; Mature: 528

Protein sequence:

>528_residues
MNLADFSNSPISILPPLVALGLAIITRRVLLSLGVGIVLGAILLSSYSISGTSTYVFNSVKGVFIADGAINSWNMSIVAF
LILLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTRIKSKRGAKLLAACLGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDS
TAAPMCVLMPASSWGVYIITIIGGILVSHGVTEYSALGAYVRLIPMNFYAVFALLMVFAVVWFQLDIGPMRDHENEANRG
NGFDDQAVDKESKDLNEELNITESDTGKVSDLIFPIIVLIVATIFFMVYTGAQALIADGKEFNILGTFENTDVGTSLCYG
ALLGLASALITVFRQNIEMKDIAITMWIGAKSMFGAILILFFAWTIGSVIGDMQTGSYLSSLAQGSIGIHWIPVILFLLS
GLMAFSTGTSWGTFGIMLPIAGDMAGATDIALILPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCCHIDHVSTQLPYAL
SIAGVSAVGYIALGFTNSVWMSFLASTVAFVLVCGAMMVISKKGRVTA

Sequences:

>Translated_528_residues
MNLADFSNSPISILPPLVALGLAIITRRVLLSLGVGIVLGAILLSSYSISGTSTYVFNSVKGVFIADGAINSWNMSIVAF
LILLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTRIKSKRGAKLLAACLGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDS
TAAPMCVLMPASSWGVYIITIIGGILVSHGVTEYSALGAYVRLIPMNFYAVFALLMVFAVVWFQLDIGPMRDHENEANRG
NGFDDQAVDKESKDLNEELNITESDTGKVSDLIFPIIVLIVATIFFMVYTGAQALIADGKEFNILGTFENTDVGTSLCYG
ALLGLASALITVFRQNIEMKDIAITMWIGAKSMFGAILILFFAWTIGSVIGDMQTGSYLSSLAQGSIGIHWIPVILFLLS
GLMAFSTGTSWGTFGIMLPIAGDMAGATDIALILPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCCHIDHVSTQLPYAL
SIAGVSAVGYIALGFTNSVWMSFLASTVAFVLVCGAMMVISKKGRVTA
>Mature_528_residues
MNLADFSNSPISILPPLVALGLAIITRRVLLSLGVGIVLGAILLSSYSISGTSTYVFNSVKGVFIADGAINSWNMSIVAF
LILLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTRIKSKRGAKLLAACLGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDS
TAAPMCVLMPASSWGVYIITIIGGILVSHGVTEYSALGAYVRLIPMNFYAVFALLMVFAVVWFQLDIGPMRDHENEANRG
NGFDDQAVDKESKDLNEELNITESDTGKVSDLIFPIIVLIVATIFFMVYTGAQALIADGKEFNILGTFENTDVGTSLCYG
ALLGLASALITVFRQNIEMKDIAITMWIGAKSMFGAILILFFAWTIGSVIGDMQTGSYLSSLAQGSIGIHWIPVILFLLS
GLMAFSTGTSWGTFGIMLPIAGDMAGATDIALILPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCCHIDHVSTQLPYAL
SIAGVSAVGYIALGFTNSVWMSFLASTVAFVLVCGAMMVISKKGRVTA

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56111; Mature: 56111

Theoretical pI: Translated: 5.35; Mature: 5.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
5.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
5.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLADFSNSPISILPPLVALGLAIITRRVLLSLGVGIVLGAILLSSYSISGTSTYVFNSV
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCC
KGVFIADGAINSWNMSIVAFLILLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTRIKSKRGAKLLAAC
CEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDSTAAPMCVLMPASSWGVYIIT
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCEEHHH
IIGGILVSHGVTEYSALGAYVRLIPMNFYAVFALLMVFAVVWFQLDIGPMRDHENEANRG
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
NGFDDQAVDKESKDLNEELNITESDTGKVSDLIFPIIVLIVATIFFMVYTGAQALIADGK
CCCCCHHCCCHHHCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCC
EFNILGTFENTDVGTSLCYGALLGLASALITVFRQNIEMKDIAITMWIGAKSMFGAILIL
EEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHEEEEEEECHHHHHHHHHHH
FFAWTIGSVIGDMQTGSYLSSLAQGSIGIHWIPVILFLLSGLMAFSTGTSWGTFGIMLPI
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEE
AGDMAGATDIALILPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCCHIDHVSTQLPYAL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCE
SIAGVSAVGYIALGFTNSVWMSFLASTVAFVLVCGAMMVISKKGRVTA
EHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNLADFSNSPISILPPLVALGLAIITRRVLLSLGVGIVLGAILLSSYSISGTSTYVFNSV
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCC
KGVFIADGAINSWNMSIVAFLILLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTRIKSKRGAKLLAAC
CEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDSTAAPMCVLMPASSWGVYIIT
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCEEHHH
IIGGILVSHGVTEYSALGAYVRLIPMNFYAVFALLMVFAVVWFQLDIGPMRDHENEANRG
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
NGFDDQAVDKESKDLNEELNITESDTGKVSDLIFPIIVLIVATIFFMVYTGAQALIADGK
CCCCCHHCCCHHHCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCC
EFNILGTFENTDVGTSLCYGALLGLASALITVFRQNIEMKDIAITMWIGAKSMFGAILIL
EEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHEEEEEEECHHHHHHHHHHH
FFAWTIGSVIGDMQTGSYLSSLAQGSIGIHWIPVILFLLSGLMAFSTGTSWGTFGIMLPI
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEE
AGDMAGATDIALILPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCCHIDHVSTQLPYAL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCE
SIAGVSAVGYIALGFTNSVWMSFLASTVAFVLVCGAMMVISKKGRVTA
EHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]