Definition Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 1, complete genome.
Accession NC_011312
Length 3,325,165

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The map label for this gene is 209694533

Identifier: 209694533

GI number: 209694533

Start: 1066728

End: 1069151

Strand: Reverse

Name: 209694533

Synonym: VSAL_I0968

Alternate gene names: NA

Gene position: 1069151-1066728 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209694534

Following gene: 209694532

Centisome position: 32.15

GC content: 34.53

Gene sequence:

>2424_bases
ATGCTAAAACCTCATTTAAAGCTAATAGAAGATATAAAATCAGAAGAACGTACATTTTCCTCTCTTTCTAAATTCGAACT
TGAAGAAATGTATAAAATTTCAATTGCTAGTGGTGATTTCACAGCTTTAAGGATGTTAACAAATCACAATACCGGTATTT
ATAATTATAATGAACGAGAACCATCATGGCTTGATTCAGAATTTTGGGCTCCTATATGGACGCTAATGCTAACAAGTAAA
CCTAAAACTATTCGATGGGACTCTGTTTTCCTTAATGATGGTAAAAAGCTCACTGACCCCAAGCACATAAAACTACTTAA
TGCTTTTAAATACTGGATAACCGCAACGGATAACCCACTAGAGAACGGCGGTAATATTGAGTTCTCCAAAAAGACAATTT
ATATAAAAGTTACTTATATTATTAAATTAATCAATGCCATCTTATTACACAGTAAAGAATTGCAATTAGCTGAATATCAC
CTACTTCATGTTGATGATAGCTTTTGGTTATCTATTTTTAGTAATATGGCAACCTACGATCCATTTGAAGGGGTATATCG
GTTTAAAGATAGAATAAAAGCATTGATTGATAAGGAAGCAACTACCATTAGTGATGAAGAATGCGTAAATTTCGTTGCCA
AATATCCTCTATTACTATCAAAACTTCCAACTGATGACTTATCGATCTATCCAGAAAACAGACAAAAATCATGTGTGTGG
CTATTCAAACAGGGATACTACAAATCCTATAAAGGAAAACCAAAATATGATGGTAATAGCGCTGTTCTCACCCGCCTTAT
TTTAAATGGAAAATGTTTATTTGAAGATATCAATACCCCTAATTTTGTAGAGTTTCATTTAAAACAAAAAAAAACATCTA
CAGAGTACATACCAATTAACAATCATGATTCATCAATTGGTATGAATGCTCAGTCCTTGGGTCAATATATTTCATACCTA
AAGTTGATACATACCAATTTAGACCGCAATGATTCCTGCACACCTTCAATGATCACTGACACACTCACGATAAATTCCAT
TAATAATATAAAAGGAGTGCATCTAAAAAAGACTATGCGTACTCGGACGCAGCCTCCATCACTTATTTTTAACCTAATTG
AAAAATGCTTTCAATTCACGCAAGAGAACCAAGATGAATTGCTAAATCAATGTTTAACTGCGCTCAAAGAAGGTCGAAGT
AAACTAGGGAAATCAAATAGCAACAAGCTTAAACCTCAAGCAACATTCAAAGCATTTGATGAAGCAATTCATAGTGACAT
GTCTGGCTCTGAACGCGGACATTGGTTTGATACAGAAGCTATTAATTGCGTGACCAGCAAATGGAAAAAAAAAGGGATTA
AGCAAGTTGCTGCGTTTGATATCAAAACGCCCAACCGTCATCAGCGCATCAGAAATAATGAAAGTTTATTTGAATTATTT
CAAGCACTTGAAGGTTCAGTTCAGTTTTTAGTCGGTGCGATAATGGCTAGACGACAAGATGAACTGTCATCTCTAAAGCC
ATACGGCAATCTAATTCCTAACAAAAATCCTTTTTCTATTGATGATGAAGACTACTTTATCAAAAAAGGAAAAGACGGTT
CAGTTAAGGCTCAATATAATTTAAAATTCAAGCTAAAAAAATCAGGTTACAAAGGGAAAAACACACACCTTATTCGTCCA
ATCCCAGTATCGATTGCAAAACTCATTTGGCGTTTGGAAGAATTTAATCAAGAAACTGAAAAAGCAGGATTAACCACCGG
TAAGTTATCACTTTTTAATAGTTTAGAATCCAAAGCTTGTAATCTATCAGCAGCTAACACACATAGCTTCAATAACAATT
ACGATGCTATGTGCGATTACTTTGAAACGGACTTGGTGTTAATGGATAGTGGAGAGTATCGTCGCAACTATATCCGTCAG
CATCAGCTTAGACGCTTCTTTGCGTTAGTCTTTTTCTGGTCAAAGAAAAAAGAAAGCTTCGATGCTCTTCGTTGGATGCT
TGGTCATACTGATATGGAACATCTTTATCACTATATTTCAGAATCAGAAACAGGTGCAGTCTTAAATAGTGCTAAAGCTA
GTGTTCTCGCAAGTAGCGTACTCAATAAGGATATCAGCGATGTAGACGCCAAACAGCTGGATAAACTTCGAGAACTCCTT
GTAAAACGATTAGCTGGAAACGAAAGAGCTGAAGTGATCATTAATACTCTAAGTAATACCATTGATGATTATCACGAAAG
TGATTACGAAACTACTCCACACATAAGCGTAATCGAAAAAAATCAAATTATGGAGAATGAAGTTCTCCGATTATTAGATA
ATGAAGTGATCTCTCTTGAACCTAATTTTTTTATTGTAACAACCCCCAATGGAAGCACTGAAAGTACTTTTAATTTAACA
TTAACATTCAATGAGATAAATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGAAACAGACCAATACAATGAAGAAGATGATTATAAAAATATGCTAGAAAATGCTAGGGCGAACCCAATGGATAATAAT
AGAATCATGGGAGCGTTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGTCGGCAAAAGAAATTAATCAAATAAAGGTATTTAATACCATCGCATTTTTGAAGTGTATTATTACTACACCGCATAA
GTTTAAAAACGATGAAGTCC

Product: phage protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 807; Mature: 807

Protein sequence:

>807_residues
MLKPHLKLIEDIKSEERTFSSLSKFELEEMYKISIASGDFTALRMLTNHNTGIYNYNEREPSWLDSEFWAPIWTLMLTSK
PKTIRWDSVFLNDGKKLTDPKHIKLLNAFKYWITATDNPLENGGNIEFSKKTIYIKVTYIIKLINAILLHSKELQLAEYH
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LFKQGYYKSYKGKPKYDGNSAVLTRLILNGKCLFEDINTPNFVEFHLKQKKTSTEYIPINNHDSSIGMNAQSLGQYISYL
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HQLRRFFALVFFWSKKKESFDALRWMLGHTDMEHLYHYISESETGAVLNSAKASVLASSVLNKDISDVDAKQLDKLRELL
VKRLAGNERAEVIINTLSNTIDDYHESDYETTPHISVIEKNQIMENEVLRLLDNEVISLEPNFFIVTTPNGSTESTFNLT
LTFNEIN

Sequences:

>Translated_807_residues
MLKPHLKLIEDIKSEERTFSSLSKFELEEMYKISIASGDFTALRMLTNHNTGIYNYNEREPSWLDSEFWAPIWTLMLTSK
PKTIRWDSVFLNDGKKLTDPKHIKLLNAFKYWITATDNPLENGGNIEFSKKTIYIKVTYIIKLINAILLHSKELQLAEYH
LLHVDDSFWLSIFSNMATYDPFEGVYRFKDRIKALIDKEATTISDEECVNFVAKYPLLLSKLPTDDLSIYPENRQKSCVW
LFKQGYYKSYKGKPKYDGNSAVLTRLILNGKCLFEDINTPNFVEFHLKQKKTSTEYIPINNHDSSIGMNAQSLGQYISYL
KLIHTNLDRNDSCTPSMITDTLTINSINNIKGVHLKKTMRTRTQPPSLIFNLIEKCFQFTQENQDELLNQCLTALKEGRS
KLGKSNSNKLKPQATFKAFDEAIHSDMSGSERGHWFDTEAINCVTSKWKKKGIKQVAAFDIKTPNRHQRIRNNESLFELF
QALEGSVQFLVGAIMARRQDELSSLKPYGNLIPNKNPFSIDDEDYFIKKGKDGSVKAQYNLKFKLKKSGYKGKNTHLIRP
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HQLRRFFALVFFWSKKKESFDALRWMLGHTDMEHLYHYISESETGAVLNSAKASVLASSVLNKDISDVDAKQLDKLRELL
VKRLAGNERAEVIINTLSNTIDDYHESDYETTPHISVIEKNQIMENEVLRLLDNEVISLEPNFFIVTTPNGSTESTFNLT
LTFNEIN
>Mature_807_residues
MLKPHLKLIEDIKSEERTFSSLSKFELEEMYKISIASGDFTALRMLTNHNTGIYNYNEREPSWLDSEFWAPIWTLMLTSK
PKTIRWDSVFLNDGKKLTDPKHIKLLNAFKYWITATDNPLENGGNIEFSKKTIYIKVTYIIKLINAILLHSKELQLAEYH
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HQLRRFFALVFFWSKKKESFDALRWMLGHTDMEHLYHYISESETGAVLNSAKASVLASSVLNKDISDVDAKQLDKLRELL
VKRLAGNERAEVIINTLSNTIDDYHESDYETTPHISVIEKNQIMENEVLRLLDNEVISLEPNFFIVTTPNGSTESTFNLT
LTFNEIN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93017; Mature: 93017

Theoretical pI: Translated: 8.14; Mature: 8.14

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKPHLKLIEDIKSEERTFSSLSKFELEEMYKISIASGDFTALRMLTNHNTGIYNYNERE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHEEHEECCCCCCEEECCCCC
PSWLDSEFWAPIWTLMLTSKPKTIRWDSVFLNDGKKLTDPKHIKLLNAFKYWITATDNPL
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEEEECCCCC
ENGGNIEFSKKTIYIKVTYIIKLINAILLHSKELQLAEYHLLHVDDSFWLSIFSNMATYD
CCCCCEEEECEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCC
PFEGVYRFKDRIKALIDKEATTISDEECVNFVAKYPLLLSKLPTDDLSIYPENRQKSCVW
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCEEE
LFKQGYYKSYKGKPKYDGNSAVLTRLILNGKCLFEDINTPNFVEFHLKQKKTSTEYIPIN
EEHHCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEEEHHCCCCCCEEECC
NHDSSIGMNAQSLGQYISYLKLIHTNLDRNDSCTPSMITDTLTINSINNIKGVHLKKTMR
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHCCEEEECCCCCCCCCEEHHHHH
TRTQPPSLIFNLIEKCFQFTQENQDELLNQCLTALKEGRSKLGKSNSNKLKPQATFKAFD
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
EAIHSDMSGSERGHWFDTEAINCVTSKWKKKGIKQVAAFDIKTPNRHQRIRNNESLFELF
HHHHCCCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHH
QALEGSVQFLVGAIMARRQDELSSLKPYGNLIPNKNPFSIDDEDYFIKKGKDGSVKAQYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEEEEEE
LKFKLKKSGYKGKNTHLIRPIPVSIAKLIWRLEEFNQETEKAGLTTGKLSLFNSLESKAC
EEEEEECCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
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CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
DALRWMLGHTDMEHLYHYISESETGAVLNSAKASVLASSVLNKDISDVDAKQLDKLRELL
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHH
VKRLAGNERAEVIINTLSNTIDDYHESDYETTPHISVIEKNQIMENEVLRLLDNEVISLE
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEC
PNFFIVTTPNGSTESTFNLTLTFNEIN
CCEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCC
>Mature Secondary Structure
MLKPHLKLIEDIKSEERTFSSLSKFELEEMYKISIASGDFTALRMLTNHNTGIYNYNERE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHEEHEECCCCCCEEECCCCC
PSWLDSEFWAPIWTLMLTSKPKTIRWDSVFLNDGKKLTDPKHIKLLNAFKYWITATDNPL
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CCCCCEEEECEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCC
PFEGVYRFKDRIKALIDKEATTISDEECVNFVAKYPLLLSKLPTDDLSIYPENRQKSCVW
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCEEE
LFKQGYYKSYKGKPKYDGNSAVLTRLILNGKCLFEDINTPNFVEFHLKQKKTSTEYIPIN
EEHHCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEEEHHCCCCCCEEECC
NHDSSIGMNAQSLGQYISYLKLIHTNLDRNDSCTPSMITDTLTINSINNIKGVHLKKTMR
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHCCEEEECCCCCCCCCEEHHHHH
TRTQPPSLIFNLIEKCFQFTQENQDELLNQCLTALKEGRSKLGKSNSNKLKPQATFKAFD
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
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EEEEEECCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
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HHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHH
VKRLAGNERAEVIINTLSNTIDDYHESDYETTPHISVIEKNQIMENEVLRLLDNEVISLE
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEC
PNFFIVTTPNGSTESTFNLTLTFNEIN
CCEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA