| Definition | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011374 |
| Length | 874,478 |
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The map label for this gene is 209554603
Identifier: 209554603
GI number: 209554603
Start: 728878
End: 730680
Strand: Reverse
Name: 209554603
Synonym: UUR10_0609
Alternate gene names: NA
Gene position: 730680-728878 (Counterclockwise)
Preceding gene: 209554097
Following gene: 209554547
Centisome position: 83.56
GC content: 26.84
Gene sequence:
>1803_bases TTGGTAGAACATAAACAAAAAAAGACATTAAAAAGATGTAGTTCCCACTTTAGGAAAAATCTTACCATTTTTAGAACACT TATAGAACTTATAAAAGAAAGTTCGCCTTTTATTGCAGCAAGTGTTTTCACAGGACTATCATTAATTTTAATTGTTGTAA TTGTTGCACATCATAAAGATATTGGTGCTTATGCGGCAACTAGTGTAAGTTATTTAACAATTTTTCAATTAAGTTTTTTA CAATTGGGAACAACATTTGGAATTGTTTTCTCGGTTTGATCGAAACGATCGTTTAAGGATGGAAAATATAAATTTGAACC AACCAATGATACAGCAAATGCTGCTAGCTTTTATTCATTTATTTTTGGATTGGTTGTTTTGTTAATTTATTTCACAACGT CATATATTTACAATCATTTTGCTAATGATCATCAAAATACATTAATAAACCAAAATATTGGTAGCGCTTATATTATTTCA GGATTAGCTGTTGTTGGTTTAGCACCACTACGTAATTATTTATTAATGTTAATTCGATCAAACAAATCAATTAATATTTT ATTAGCAATTGTTTTAGATTTTTGCACTTGAACAACAGCTTTAATTGCTGCTTTTTTATTGGGAAGTTATAGTTCTTTAG GTTATTGGGGCTATGGACTTGGAATGTCAATTGGTTTTATTTTTTGAACTATTATTATAGGGATGACAGCAATTGAAAAA GCGCAGATTGTCTTACGTCCGTTGTATATATCAAAAAAACTATTTGTTTTAAGTATTAAATTATTATGAATTCAAACAAT TTTATCATCACTAAAATCTGTTGGTAAAATGTTTATTTTGTTAATTACATTCGTTGTAATTAACGAACGTGTTGTTGGTT CTTCTTTATTAGATTTTCAATCATCACGGATTTTGATGTATCAATCAATGATTTTTATACAAATGTTAAATTTAGGTTTG TCAGATTTTTTGTTTTATTTATATCAAAAACAAGAAGTCAGGGATCGCAGATACCACTCACGCCAATTATTTGCTTGAAT TTTCATATTTGGAATTTTATTTGCCTTAGTTGGTTCAATTATTTTTGGTTTTTCTATAAAACAATTAGTAGAATTGTATA CAAGAGAACAAAGTCCATCATATATCTTTTTAGAAAAACAAGTTCCTGAACATTTTTATCAATCATTAAGAAAAATTTTA ATAAATGATGACGAATTATTAAATATTATCGTTAATCACACAAATATAAACAAAGACGAAATTATTAATGCACTATCATC AAATGATAAAAATATTTGATTACCTATGGCAAAAAAAGTTATTGATCCAATTTGAAAATTAGGTGATAAATTTGAAACAA TATATCATATGAAAAATCCTTTTACTCATAGATATGTAGATATTTCAGAAAATAATGTGTATAAATATTTGATTAAAAAT AATGCTTATATTTTGTTAACATTTTTTTGCACTTTCTTCTCGTTTTCATCTATTTTAGGCCGTTATGGCGGATTAATCGC TCGACGTCAACGCGTACCTTATGTGATGATAGTTATTCAATTAGTGATGGTGGCGTTTACTTCGGGATTTGGATTAACAC ACCAAACAGACCCACATTTTATTGGTTTAATGGCTTGATCATTTCCATTATTTATTTCAAGTATTTTTATTTTAGGATAT AGTGCTTACAAGATTTTACGTGGTTATTTAAATTACTTAAAAAAACATAGATATAATGATCAAAAAACATCAATTATGTC AGAAAAACCACAAGAACAACAAATCAAAGTACGTCAAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAATTAATAAACTATTGAATAAATAAAAAATATAATTTTTATTATATTTTATGTTATAATTTATAAGGGTATTTTTATAC GCAAAAGGGGGAGATTGGAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTTATAACGAATGTGTTCAATGTGATCAACACTAGTTTTATATTAATGGTATAATACTTAAATATAATTATTAAATTT AAAAAAGGGAGAAACTTATG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 600; Mature: 600
Protein sequence:
>600_residues MVEHKQKKTLKRCSSHFRKNLTIFRTLIELIKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSVSYLTIFQLSFL QLGTTFGIVFSVWSKRSFKDGKYKFEPTNDTANAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTLINQNIGSAYIIS GLAVVGLAPLRNYLLMLIRSNKSINILLAIVLDFCTWTTALIAAFLLGSYSSLGYWGYGLGMSIGFIFWTIIIGMTAIEK AQIVLRPLYISKKLFVLSIKLLWIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINERVVGSSLLDFQSSRILMYQSMIFIQMLNLGL SDFLFYLYQKQEVRDRRYHSRQLFAWIFIFGILFALVGSIIFGFSIKQLVELYTREQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKIL INDDELLNIIVNHTNINKDEIINALSSNDKNIWLPMAKKVIDPIWKLGDKFETIYHMKNPFTHRYVDISENNVYKYLIKN NAYILLTFFCTFFSFSSILGRYGGLIARRQRVPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQTDPHFIGLMAWSFPLFISSIFILGY SAYKILRGYLNYLKKHRYNDQKTSIMSEKPQEQQIKVRQN
Sequences:
>Translated_600_residues MVEHKQKKTLKRCSSHFRKNLTIFRTLIELIKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSVSYLTIFQLSFL QLGTTFGIVFSV*SKRSFKDGKYKFEPTNDTANAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTLINQNIGSAYIIS GLAVVGLAPLRNYLLMLIRSNKSINILLAIVLDFCT*TTALIAAFLLGSYSSLGYWGYGLGMSIGFIF*TIIIGMTAIEK AQIVLRPLYISKKLFVLSIKLL*IQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINERVVGSSLLDFQSSRILMYQSMIFIQMLNLGL SDFLFYLYQKQEVRDRRYHSRQLFA*IFIFGILFALVGSIIFGFSIKQLVELYTREQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKIL INDDELLNIIVNHTNINKDEIINALSSNDKNI*LPMAKKVIDPI*KLGDKFETIYHMKNPFTHRYVDISENNVYKYLIKN NAYILLTFFCTFFSFSSILGRYGGLIARRQRVPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQTDPHFIGLMA*SFPLFISSIFILGY SAYKILRGYLNYLKKHRYNDQKTSIMSEKPQEQQIKVRQN >Mature_600_residues MVEHKQKKTLKRCSSHFRKNLTIFRTLIELIKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSVSYLTIFQLSFL QLGTTFGIVFSV*SKRSFKDGKYKFEPTNDTANAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTLINQNIGSAYIIS GLAVVGLAPLRNYLLMLIRSNKSINILLAIVLDFCT*TTALIAAFLLGSYSSLGYWGYGLGMSIGFIF*TIIIGMTAIEK AQIVLRPLYISKKLFVLSIKLL*IQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINERVVGSSLLDFQSSRILMYQSMIFIQMLNLGL SDFLFYLYQKQEVRDRRYHSRQLFA*IFIFGILFALVGSIIFGFSIKQLVELYTREQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKIL INDDELLNIIVNHTNINKDEIINALSSNDKNI*LPMAKKVIDPI*KLGDKFETIYHMKNPFTHRYVDISENNVYKYLIKN NAYILLTFFCTFFSFSSILGRYGGLIARRQRVPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQTDPHFIGLMA*SFPLFISSIFILGY SAYKILRGYLNYLKKHRYNDQKTSIMSEKPQEQQIKVRQN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 67600; Mature: 67600
Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVEHKQKKTLKRCSSHFRKNLTIFRTLIELIKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKD CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC IGAYAATSVSYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFSVSKRSFKDGKYKFEPTNDTANAASFYSFI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHH FGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTLINQNIGSAYIISGLAVVGLAPLRNYLLMLIRSN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KSINILLAIVLDFCTTTALIAAFLLGSYSSLGYWGYGLGMSIGFIFTIIIGMTAIEKAQI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLRPLYISKKLFVLSIKLLIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINERVVGSSLLDFQSSRI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH LMYQSMIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDRRYHSRQLFAIFIFGILFALVGSIIFGFS HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKQLVELYTREQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKILINDDELLNIIVNHTNINKDEIINAL HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHH SSNDKNILPMAKKVIDPIKLGDKFETIYHMKNPFTHRYVDISENNVYKYLIKNNAYILLT HCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEHHH FFCTFFSFSSILGRYGGLIARRQRVPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQTDPHFIGLMASF HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH PLFISSIFILGYSAYKILRGYLNYLKKHRYNDQKTSIMSEKPQEQQIKVRQN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MVEHKQKKTLKRCSSHFRKNLTIFRTLIELIKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKD CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC IGAYAATSVSYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFSVSKRSFKDGKYKFEPTNDTANAASFYSFI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHH FGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTLINQNIGSAYIISGLAVVGLAPLRNYLLMLIRSN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KSINILLAIVLDFCTTTALIAAFLLGSYSSLGYWGYGLGMSIGFIFTIIIGMTAIEKAQI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLRPLYISKKLFVLSIKLLIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINERVVGSSLLDFQSSRI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH LMYQSMIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDRRYHSRQLFAIFIFGILFALVGSIIFGFS HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKQLVELYTREQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKILINDDELLNIIVNHTNINKDEIINAL HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHH SSNDKNILPMAKKVIDPIKLGDKFETIYHMKNPFTHRYVDISENNVYKYLIKNNAYILLT HCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEHHH FFCTFFSFSSILGRYGGLIARRQRVPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQTDPHFIGLMASF HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH PLFISSIFILGYSAYKILRGYLNYLKKHRYNDQKTSIMSEKPQEQQIKVRQN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA