| Definition | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011374 |
| Length | 874,478 |
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The map label for this gene is 209554547
Identifier: 209554547
GI number: 209554547
Start: 726993
End: 728780
Strand: Reverse
Name: 209554547
Synonym: UUR10_0608
Alternate gene names: NA
Gene position: 728780-726993 (Counterclockwise)
Preceding gene: 209554603
Following gene: 209554545
Centisome position: 83.34
GC content: 27.29
Gene sequence:
>1788_bases ATGGCAACGTTAATTGAAAAATCGCCTTTTATTGTAAGGCGTTATATTTTCAAAAAACGGTATTGCGTTTTTACTACACT ATGAGAAGTTATAAAAGATAGTTCATCATTTATAACTTCAAGTTTGTTTTCGTCACTTGCTTTATTACTAATAACAGTGA TTATTGCGCTACATAAATTTAATGGTGCATTTGCAGCTACAAGTATTAGTTATATTACAATTTTCCAATTTAGTTTTATT CAATTAGGCGGAAATTTAGGTGTAGTTTTAGCTTTATGAGCAAAAAGATTGTATGATGGAAGTAAACATAAATTTGTTCC AGCTCATCAAACAGTAAATTTAGCGAGCTTCTATGCTTTTACTTTTGGTTTAGTAATGTCAGGTGTTTATTTAGCATCTG CTTATACATACAACCTTTATGCTAATATTCACCAAAATACATTATTTGCACAATTGTTTGGTGAACAATATTTATGATCA AGTTTAGCACTTGTTGTTTTAGCACCAGTTCATAATTACTTTTTAATTTCAATTTGATCAAATGATCGTCGTAAAATCTT ATTTACTATTATTTTAGATTTTGCCACATGGACAACTTGTTTAGTTACAAGTTTCTTATTAGGAAAATATAGTGTATTAG CTTATAATGGATATGGTCTTGGACTATCAATCGGTTATATTGCTTGAACTATTATCATTAGTTTTATTAAATTCCATAAA GAATGAAAAATAAATAATTTTGGTTTATCTTTAAATTTATTAAAAATTACAATTAAACAAATTTGAAGTCAAACTGTACT TTCAGTTTTTGCATCAGTTGCAAAAATGTTTGTTTTATTAGCTTTATATCATTTAATTAATCAAAAAATGGTTGGTTCAG TACCATTAAACTTACAAAGTAGTCGAATTCTATGATATCAATCAATGCTATTTATTCAAGGTTTTGGCTTTGGTTTTGCT GATTACTTATTCTACGTTTTCCAAAAACAAATGATTCGTGATCGTCGTTATCATTCACGTCAATTATTTATTTGCATTTT TTCATTGTTATTTATTTATTCAATGATTGCAGCTATTATCTTTGGTTTTTCAATTAAACCACTTTCAGCTGTTTATGCAA AAGAACAAAACCAGGCTTATATTCATTTAGAATCAAAAATTCCAGAACATTTTTATGCATCAATTCGTTTAAAAATGTTA GAAAATCCTAAACTAGTTTACTTACTAGGTCAAAAAGCACACATTAATCCTAAACTGATTTTGGCTCATTTAGCAAGTAA TGATCCTAAAGTATGAAAAATTGTAATTGAACAACTTATAACACCAATTTGAAGAGCGGGTCCCAACTTCCAATATTTAT ATGGTATTCCAAACCCAATCACAAAATCATTTGTATCAATTTCTGCAGAAGGTATTGAAAAATTATTAACAGGTGATAAT ACTTATATTCATTTAGCTATTTTTGGAATTTTCTATTCATTATCTTCATCACTAATGCGTTATTACAATTTAATTACTCG AAGATTAGATTTACCATTTGTATCTTTAATATTCCAAATTCTAGTAATTGCTTTCGTTGTTGGTTTTGGGGTTGATTACC AAAGTGGTACTAAATTTGCAGGGTTATTAGCATGATCTATGCCAATGTCAATTTCTAGTGCTGTAATCTTAATCTTCTCT TTATTTATATTTACAACAACATATTCTAAATTCTTAAGCACATATAGTTATAAAGATAATAATTTTGAGAATCCTTACCC ATTTAAATGGATTCGTCATATTTTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAATTTTTATAACGAATGTGTTCAATGTGATCAACACTAGTTTTATATTAATGGTATAATACTTAAATATAATTATTAAA TTTAAAAAAGGGAGAAACTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGAAGAATTAATCATTTAATTATTAGAATCTATTAGTTGCATTTAATGATGTTGCTAATAGATTTTTTATTGTTATAAAG ATTAGATAAATAAATATAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 595; Mature: 594
Protein sequence:
>595_residues MATLIEKSPFIVRRYIFKKRYCVFTTLWEVIKDSSSFITSSLFSSLALLLITVIIALHKFNGAFAATSISYITIFQFSFI QLGGNLGVVLALWAKRLYDGSKHKFVPAHQTVNLASFYAFTFGLVMSGVYLASAYTYNLYANIHQNTLFAQLFGEQYLWS SLALVVLAPVHNYFLISIWSNDRRKILFTIILDFATWTTCLVTSFLLGKYSVLAYNGYGLGLSIGYIAWTIIISFIKFHK EWKINNFGLSLNLLKITIKQIWSQTVLSVFASVAKMFVLLALYHLINQKMVGSVPLNLQSSRILWYQSMLFIQGFGFGFA DYLFYVFQKQMIRDRRYHSRQLFICIFSLLFIYSMIAAIIFGFSIKPLSAVYAKEQNQAYIHLESKIPEHFYASIRLKML ENPKLVYLLGQKAHINPKLILAHLASNDPKVWKIVIEQLITPIWRAGPNFQYLYGIPNPITKSFVSISAEGIEKLLTGDN TYIHLAIFGIFYSLSSSLMRYYNLITRRLDLPFVSLIFQILVIAFVVGFGVDYQSGTKFAGLLAWSMPMSISSAVILIFS LFIFTTTYSKFLSTYSYKDNNFENPYPFKWIRHIL
Sequences:
>Translated_595_residues MATLIEKSPFIVRRYIFKKRYCVFTTL*EVIKDSSSFITSSLFSSLALLLITVIIALHKFNGAFAATSISYITIFQFSFI QLGGNLGVVLAL*AKRLYDGSKHKFVPAHQTVNLASFYAFTFGLVMSGVYLASAYTYNLYANIHQNTLFAQLFGEQYL*S SLALVVLAPVHNYFLISI*SNDRRKILFTIILDFATWTTCLVTSFLLGKYSVLAYNGYGLGLSIGYIA*TIIISFIKFHK E*KINNFGLSLNLLKITIKQI*SQTVLSVFASVAKMFVLLALYHLINQKMVGSVPLNLQSSRIL*YQSMLFIQGFGFGFA DYLFYVFQKQMIRDRRYHSRQLFICIFSLLFIYSMIAAIIFGFSIKPLSAVYAKEQNQAYIHLESKIPEHFYASIRLKML ENPKLVYLLGQKAHINPKLILAHLASNDPKV*KIVIEQLITPI*RAGPNFQYLYGIPNPITKSFVSISAEGIEKLLTGDN TYIHLAIFGIFYSLSSSLMRYYNLITRRLDLPFVSLIFQILVIAFVVGFGVDYQSGTKFAGLLA*SMPMSISSAVILIFS LFIFTTTYSKFLSTYSYKDNNFENPYPFKWIRHIL >Mature_594_residues ATLIEKSPFIVRRYIFKKRYCVFTTL*EVIKDSSSFITSSLFSSLALLLITVIIALHKFNGAFAATSISYITIFQFSFIQ LGGNLGVVLAL*AKRLYDGSKHKFVPAHQTVNLASFYAFTFGLVMSGVYLASAYTYNLYANIHQNTLFAQLFGEQYL*SS LALVVLAPVHNYFLISI*SNDRRKILFTIILDFATWTTCLVTSFLLGKYSVLAYNGYGLGLSIGYIA*TIIISFIKFHKE *KINNFGLSLNLLKITIKQI*SQTVLSVFASVAKMFVLLALYHLINQKMVGSVPLNLQSSRIL*YQSMLFIQGFGFGFAD YLFYVFQKQMIRDRRYHSRQLFICIFSLLFIYSMIAAIIFGFSIKPLSAVYAKEQNQAYIHLESKIPEHFYASIRLKMLE NPKLVYLLGQKAHINPKLILAHLASNDPKV*KIVIEQLITPI*RAGPNFQYLYGIPNPITKSFVSISAEGIEKLLTGDNT YIHLAIFGIFYSLSSSLMRYYNLITRRLDLPFVSLIFQILVIAFVVGFGVDYQSGTKFAGLLA*SMPMSISSAVILIFSL FIFTTTYSKFLSTYSYKDNNFENPYPFKWIRHIL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 66062; Mature: 65931
Theoretical pI: Translated: 10.09; Mature: 10.09
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MATLIEKSPFIVRRYIFKKRYCVFTTLEVIKDSSSFITSSLFSSLALLLITVIIALHKFN CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GAFAATSISYITIFQFSFIQLGGNLGVVLALAKRLYDGSKHKFVPAHQTVNLASFYAFTF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHH GLVMSGVYLASAYTYNLYANIHQNTLFAQLFGEQYLSSLALVVLAPVHNYFLISISNDRR HHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCH KILFTIILDFATWTTCLVTSFLLGKYSVLAYNGYGLGLSIGYIATIIISFIKFHKEKINN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGLSLNLLKITIKQISQTVLSVFASVAKMFVLLALYHLINQKMVGSVPLNLQSSRILYQS CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHH MLFIQGFGFGFADYLFYVFQKQMIRDRRYHSRQLFICIFSLLFIYSMIAAIIFGFSIKPL HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH SAVYAKEQNQAYIHLESKIPEHFYASIRLKMLENPKLVYLLGQKAHINPKLILAHLASND HHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHEEEECCCCEEEEECCCCCCCHHHEEEECCCCC PKVKIVIEQLITPIRAGPNFQYLYGIPNPITKSFVSISAEGIEKLLTGDNTYIHLAIFGI CEEEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHH FYSLSSSLMRYYNLITRRLDLPFVSLIFQILVIAFVVGFGVDYQSGTKFAGLLASMPMSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHH SSAVILIFSLFIFTTTYSKFLSTYSYKDNNFENPYPFKWIRHIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCC >Mature Secondary Structure ATLIEKSPFIVRRYIFKKRYCVFTTLEVIKDSSSFITSSLFSSLALLLITVIIALHKFN CCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GAFAATSISYITIFQFSFIQLGGNLGVVLALAKRLYDGSKHKFVPAHQTVNLASFYAFTF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHH GLVMSGVYLASAYTYNLYANIHQNTLFAQLFGEQYLSSLALVVLAPVHNYFLISISNDRR HHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCH KILFTIILDFATWTTCLVTSFLLGKYSVLAYNGYGLGLSIGYIATIIISFIKFHKEKINN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGLSLNLLKITIKQISQTVLSVFASVAKMFVLLALYHLINQKMVGSVPLNLQSSRILYQS CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHH MLFIQGFGFGFADYLFYVFQKQMIRDRRYHSRQLFICIFSLLFIYSMIAAIIFGFSIKPL HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH SAVYAKEQNQAYIHLESKIPEHFYASIRLKMLENPKLVYLLGQKAHINPKLILAHLASND HHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHEEEECCCCEEEEECCCCCCCHHHEEEECCCCC PKVKIVIEQLITPIRAGPNFQYLYGIPNPITKSFVSISAEGIEKLLTGDNTYIHLAIFGI CEEEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHH FYSLSSSLMRYYNLITRRLDLPFVSLIFQILVIAFVVGFGVDYQSGTKFAGLLASMPMSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHH SSAVILIFSLFIFTTTYSKFLSTYSYKDNNFENPYPFKWIRHIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA