Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 209554345

Identifier: 209554345

GI number: 209554345

Start: 749140

End: 750456

Strand: Reverse

Name: 209554345

Synonym: UUR10_0629

Alternate gene names: NA

Gene position: 750456-749140 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209554224

Following gene: 209554225

Centisome position: 85.82

GC content: 28.7

Gene sequence:

>1317_bases
ATGAGTGCTAATGCTTATGTATTCCGGCGTTCGCCAATTCATCGTTTAAATCCAGCGATTAAATTTATCTCTTTTATTTT
ATTAATTGCTATGATCTTTTTACCACTTGGTTTTTTTGCACAAATGATTATTGGAGTTTTTATTTTAATTATCTTCTTTG
TTGCTAAATTACCTAAAAAAACATTATGAAATGTTTTTAAGTCGGTTATTATGTTGTTTGTCATTTTATTACTTATTAAT
TGAATGACCTATAAAGATCCAATTGCGATTTATAATATTACAGATCAAGCGAAAGTAATTTTAGGTGATAAAGATTGAAT
TAATGGTCCAATTAATAAAAACTTATCATTTAGTTTAATTTATAATGATATTTCATCAACGCATGTGCAAAATTTAGTTT
CAAATATTTGGGGTGGGGAAATTAAAAACTACATTAGTCCCGAAATCATTAAAAAACTTATTGACAAACCAGATTATAAT
GTTGCTAAATTTTTAAGCGAAAACAATATAACTGTTAAAAAACTAGCAAGTACTTTTAATGCGTTAAATCAAGATGTTCG
TTTAAATAATTATTATCCAATATATGGCGATGCTGTTTTAAGATCAGGTAAAGTTGAAGTTCCGTTAAGCCATTTATCAT
ATTATATGTCAACTAATTTATGAAAAATTGAAGGCGTAAAATATCAAGGATTAATTTTATCTGGCGTTGGTGATCAATTA
GGTAAAGCAGAAACAGCCTTATTTTATACAAGAAGTCCATTTGCTTTAAGCCCAGTGGCTATTCAATTAGCTATATATAT
TTCAATTAAAATTTTTTTAATGATAACTTTATCATCAATTTTAACTGCAACAACATCATCAATTGAGTTAACAAACGGTT
TAGAAGATTTATTAAGCCCTTTTAAAATTCTACGATTACCAGTTGCTGAAGCTTCAATGATGATTTCAATTGCATTACGT
TTTATTCCTTCTTTATTAGATGAATCAAAACGAATTTTAAATGCCCAAGCTTCGCGGGGAGTTGATTTTAATAATGGAGG
AATGCTTCAAAAATTAAAATCATTAATCTCATTAGTTGTGCCATTATTCTCAATTGCTTTTAAAAAAGCTGAAGATTTAG
CCAATGCTATGGAAGCACGTTCTTACAATCCACGTTATGCAAGAACTCGTTATCGTGCCTTCCCACTAAACTTAACTGAC
TATGTTTTATTTGGTATTTTGTGTATTCTCGTTGGTTTTTTAATATCATTAGCAGTGATTAAATTTTATTTTACTCCATT
CGGCGCTTTTGAAGCGAGTGCGCTATTTGCTAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAAGATTCTAAATATGAAGTTTTAAAACAAAAGCAACCACGCACAATTGAAGAGTTGGCTGATGCTATTGTTGAGT
TTAAAAAGGGAGGTAAATAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTGATAAAATAACTTGTTGAGCAAGTTATTTTTTTATTATTAGATAAGGATTAATAGTCATGAATTATAAAATTAGTA
TTCGTTATGATGGAAGTTTA

Product: cobalt transport protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 438; Mature: 437

Protein sequence:

>438_residues
MSANAYVFRRSPIHRLNPAIKFISFILLIAMIFLPLGFFAQMIIGVFILIIFFVAKLPKKTLWNVFKSVIMLFVILLLIN
WMTYKDPIAIYNITDQAKVILGDKDWINGPINKNLSFSLIYNDISSTHVQNLVSNIWGGEIKNYISPEIIKKLIDKPDYN
VAKFLSENNITVKKLASTFNALNQDVRLNNYYPIYGDAVLRSGKVEVPLSHLSYYMSTNLWKIEGVKYQGLILSGVGDQL
GKAETALFYTRSPFALSPVAIQLAIYISIKIFLMITLSSILTATTSSIELTNGLEDLLSPFKILRLPVAEASMMISIALR
FIPSLLDESKRILNAQASRGVDFNNGGMLQKLKSLISLVVPLFSIAFKKAEDLANAMEARSYNPRYARTRYRAFPLNLTD
YVLFGILCILVGFLISLAVIKFYFTPFGAFEASALFAK

Sequences:

>Translated_438_residues
MSANAYVFRRSPIHRLNPAIKFISFILLIAMIFLPLGFFAQMIIGVFILIIFFVAKLPKKTL*NVFKSVIMLFVILLLIN
*MTYKDPIAIYNITDQAKVILGDKD*INGPINKNLSFSLIYNDISSTHVQNLVSNIWGGEIKNYISPEIIKKLIDKPDYN
VAKFLSENNITVKKLASTFNALNQDVRLNNYYPIYGDAVLRSGKVEVPLSHLSYYMSTNL*KIEGVKYQGLILSGVGDQL
GKAETALFYTRSPFALSPVAIQLAIYISIKIFLMITLSSILTATTSSIELTNGLEDLLSPFKILRLPVAEASMMISIALR
FIPSLLDESKRILNAQASRGVDFNNGGMLQKLKSLISLVVPLFSIAFKKAEDLANAMEARSYNPRYARTRYRAFPLNLTD
YVLFGILCILVGFLISLAVIKFYFTPFGAFEASALFAK
>Mature_437_residues
SANAYVFRRSPIHRLNPAIKFISFILLIAMIFLPLGFFAQMIIGVFILIIFFVAKLPKKTL*NVFKSVIMLFVILLLIN*
MTYKDPIAIYNITDQAKVILGDKD*INGPINKNLSFSLIYNDISSTHVQNLVSNIWGGEIKNYISPEIIKKLIDKPDYNV
AKFLSENNITVKKLASTFNALNQDVRLNNYYPIYGDAVLRSGKVEVPLSHLSYYMSTNL*KIEGVKYQGLILSGVGDQLG
KAETALFYTRSPFALSPVAIQLAIYISIKIFLMITLSSILTATTSSIELTNGLEDLLSPFKILRLPVAEASMMISIALRF
IPSLLDESKRILNAQASRGVDFNNGGMLQKLKSLISLVVPLFSIAFKKAEDLANAMEARSYNPRYARTRYRAFPLNLTDY
VLFGILCILVGFLISLAVIKFYFTPFGAFEASALFAK

Specific function: Unknown

COG id: COG0619

COG function: function code P; ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CbiQ family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003339 [H]

Pfam domain/function: PF02361 CbiQ [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48445; Mature: 48314

Theoretical pI: Translated: 10.08; Mature: 10.08

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSANAYVFRRSPIHRLNPAIKFISFILLIAMIFLPLGFFAQMIIGVFILIIFFVAKLPKK
CCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
TLNVFKSVIMLFVILLLINMTYKDPIAIYNITDQAKVILGDKDINGPINKNLSFSLIYND
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECC
ISSTHVQNLVSNIWGGEIKNYISPEIIKKLIDKPDYNVAKFLSENNITVKKLASTFNALN
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHC
QDVRLNNYYPIYGDAVLRSGKVEVPLSHLSYYMSTNLKIEGVKYQGLILSGVGDQLGKAE
CCCEECCCCCEECHHHHCCCCCEECHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCEEEECCCCHHCCCH
TALFYTRSPFALSPVAIQLAIYISIKIFLMITLSSILTATTSSIELTNGLEDLLSPFKIL
HEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHCCHHHHHHHHHHH
RLPVAEASMMISIALRFIPSLLDESKRILNAQASRGVDFNNGGMLQKLKSLISLVVPLFS
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAFKKAEDLANAMEARSYNPRYARTRYRAFPLNLTDYVLFGILCILVGFLISLAVIKFYF
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TPFGAFEASALFAK
CCCCCHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SANAYVFRRSPIHRLNPAIKFISFILLIAMIFLPLGFFAQMIIGVFILIIFFVAKLPKK
CCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
TLNVFKSVIMLFVILLLINMTYKDPIAIYNITDQAKVILGDKDINGPINKNLSFSLIYND
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECC
ISSTHVQNLVSNIWGGEIKNYISPEIIKKLIDKPDYNVAKFLSENNITVKKLASTFNALN
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHC
QDVRLNNYYPIYGDAVLRSGKVEVPLSHLSYYMSTNLKIEGVKYQGLILSGVGDQLGKAE
CCCEECCCCCEECHHHHCCCCCEECHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCEEEECCCCHHCCCH
TALFYTRSPFALSPVAIQLAIYISIKIFLMITLSSILTATTSSIELTNGLEDLLSPFKIL
HEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHCCHHHHHHHHHHH
RLPVAEASMMISIALRFIPSLLDESKRILNAQASRGVDFNNGGMLQKLKSLISLVVPLFS
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAFKKAEDLANAMEARSYNPRYARTRYRAFPLNLTDYVLFGILCILVGFLISLAVIKFYF
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TPFGAFEASALFAK
CCCCCHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8604303; 8948633 [H]