| Definition | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011374 |
| Length | 874,478 |
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The map label for this gene is 209554170
Identifier: 209554170
GI number: 209554170
Start: 772370
End: 774199
Strand: Reverse
Name: 209554170
Synonym: UUR10_0649
Alternate gene names: NA
Gene position: 774199-772370 (Counterclockwise)
Preceding gene: 209554294
Following gene: 209554099
Centisome position: 88.53
GC content: 20.98
Gene sequence:
>1830_bases ATGAATAAAAAAATAATAAAAATATCTTTACCTATTTTTGTGGGGTTGCTAAGTATTCCTTTAATCATAAGTTGTACAAA AACAACAAAATCAAAAACTTTAAATTTTATTGAAGACTACCAATTTAATAGCAGTAAAAAACAATTTATTTTTAAAATTA AAAATGAGTTTTTTGACGATAAAGCAATTAATATAAATCAAATTTATAAAACAAAAGGACCTAATACTAGCAGGCATTAT TTAAATAATATAGATTTAGCGTATTTATATAATTTTAAAACTAAGATTACAACAACGCATTATTCAAGTATTAACAAAAT TGATCATGTAGATACTAAAATTCAATCTCCAGATGATATGCATCGAAAAATTAAAATAAGAATCATTCAACCAAACAGCA ATAAAACCTTTTTTATTGATGGAAAACTTTATAAAAATGCCGTTGTCTTTAGTTGAAATGATTTTGAGAAAAATCAAAAT TATATTTTAAAAAATATTGTTGTTAATGGTGTTGATTCAAAAGATTTTAATTTTAAATTTTCAACAAATACACTTCCTTC ATTTGTTTATGATCAATCAAAAGTATTTACTAATAATCAATATAGTGATACCTTTGTTGATGAATTATTAAATTATCTTC AAAAAACTAAAGCTAAAGCATTTGATTTTAATTTCATTAAACAAAGCAAAAATAAAAAATTCTTTCCTTTATTAATTAAT TGATTGCTATATGAAAATTTAACTACACCAATTAGCTTGAATGCAAGTGAATGCCAACAAGATTTTTGAAATGCTTTTAG TATGCTTAAAAACTTTCAAAATTTTAATGCAATTAATTTAAAAAATGATGAGTGAAAAGATTTTTTAAAACAAGAATTTG ACAACCAAGCTAGCGTTGATGTTTTAACATTTCCATTTTATAATGCAAATAAAAATATGAACTTTAATGAATTTTTAAAA GCTTATAAAAAGCTAATAAAAAACCAAATGAAAATTCAAAAAATAGTACCTGGTAATGAAAAGATTCGAACTCATTTTGA TTATTACTTTAATTTTTCAAAACTTAGTCCTTATTTTTATCGACAAAATTATGCAAATAATTTTTTATTATTGCAAAAGA AATTAATGCAATTAAATCCAAAAGAACAACAAGCTATTTTCAATGCTTTAATTGCACCAGATGCTAAAGATGATTATTCA TTTAACAAATATTTTGCGCAAATTCCAACAAAATATAAAGATAGTGTTAACCAATATTTAATGAAATTTAATTTTGATTC TTTAAACCAAGATAAAGATATTATTAAACAAATTTATTTAGGTAATCAATATCTTTTAGAAGAAATTAATAATGAAGATC CATGATTGTTAGTTGATGATATTCAATATTTAATGAATTTAAATGATAAACAATTAAAAGCAAATAAGCATTATTTTAAA TTAGTTCAAATGATTTGAAATGGTGTAGATATGTTAGATTATCTAAAGGGTTATTCACGCAAAAAGAATGATAAAACTTA TCGAATCAACATTAATAATTTAAAACATGAATTAGCAATTAAGAATTTAAATCATGTAATTATTCAAGATTTAATTACTA AAAATCCACAAGATGATTCACTAAAATCAAGCTTAGTATCAATTCAAAAACAAATTGATGATTTAAAACAAAAAATTGAT TCATTACTTGAAAACTTTAAAAAAGACTTATTAGATTATGATCTTAATTTAGATTTAATACAATGAGATTCTTTTAAACA AAGAGTTATTGATAATCAATTATTCACTAAAGAAAGTATTAATAAATTAGCAAGAATATTTAATAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTTACAAAAATTCTGTCGATCAAAATCAATATGAAAAATTTAGCTATTCATATATTGTAAAAAATAGCAAACATTATTA AATCTTAGGAAAATCTAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTATAAAAACAAGGTAAAAATGTTTGCTAACACTAATAACCTTGTTTTTTATTTTTTAATGCTTTAAAATATTATTAAC TATAAATTACTTATAGTCAT
Product: putative lipoprotein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 609; Mature: 609
Protein sequence:
>609_residues MNKKIIKISLPIFVGLLSIPLIISCTKTTKSKTLNFIEDYQFNSSKKQFIFKIKNEFFDDKAININQIYKTKGPNTSRHY LNNIDLAYLYNFKTKITTTHYSSINKIDHVDTKIQSPDDMHRKIKIRIIQPNSNKTFFIDGKLYKNAVVFSWNDFEKNQN YILKNIVVNGVDSKDFNFKFSTNTLPSFVYDQSKVFTNNQYSDTFVDELLNYLQKTKAKAFDFNFIKQSKNKKFFPLLIN WLLYENLTTPISLNASECQQDFWNAFSMLKNFQNFNAINLKNDEWKDFLKQEFDNQASVDVLTFPFYNANKNMNFNEFLK AYKKLIKNQMKIQKIVPGNEKIRTHFDYYFNFSKLSPYFYRQNYANNFLLLQKKLMQLNPKEQQAIFNALIAPDAKDDYS FNKYFAQIPTKYKDSVNQYLMKFNFDSLNQDKDIIKQIYLGNQYLLEEINNEDPWLLVDDIQYLMNLNDKQLKANKHYFK LVQMIWNGVDMLDYLKGYSRKKNDKTYRININNLKHELAIKNLNHVIIQDLITKNPQDDSLKSSLVSIQKQIDDLKQKID SLLENFKKDLLDYDLNLDLIQWDSFKQRVIDNQLFTKESINKLARIFNK
Sequences:
>Translated_609_residues MNKKIIKISLPIFVGLLSIPLIISCTKTTKSKTLNFIEDYQFNSSKKQFIFKIKNEFFDDKAININQIYKTKGPNTSRHY LNNIDLAYLYNFKTKITTTHYSSINKIDHVDTKIQSPDDMHRKIKIRIIQPNSNKTFFIDGKLYKNAVVFS*NDFEKNQN YILKNIVVNGVDSKDFNFKFSTNTLPSFVYDQSKVFTNNQYSDTFVDELLNYLQKTKAKAFDFNFIKQSKNKKFFPLLIN *LLYENLTTPISLNASECQQDF*NAFSMLKNFQNFNAINLKNDE*KDFLKQEFDNQASVDVLTFPFYNANKNMNFNEFLK AYKKLIKNQMKIQKIVPGNEKIRTHFDYYFNFSKLSPYFYRQNYANNFLLLQKKLMQLNPKEQQAIFNALIAPDAKDDYS FNKYFAQIPTKYKDSVNQYLMKFNFDSLNQDKDIIKQIYLGNQYLLEEINNEDP*LLVDDIQYLMNLNDKQLKANKHYFK LVQMI*NGVDMLDYLKGYSRKKNDKTYRININNLKHELAIKNLNHVIIQDLITKNPQDDSLKSSLVSIQKQIDDLKQKID SLLENFKKDLLDYDLNLDLIQ*DSFKQRVIDNQLFTKESINKLARIFNK >Mature_609_residues MNKKIIKISLPIFVGLLSIPLIISCTKTTKSKTLNFIEDYQFNSSKKQFIFKIKNEFFDDKAININQIYKTKGPNTSRHY LNNIDLAYLYNFKTKITTTHYSSINKIDHVDTKIQSPDDMHRKIKIRIIQPNSNKTFFIDGKLYKNAVVFS*NDFEKNQN YILKNIVVNGVDSKDFNFKFSTNTLPSFVYDQSKVFTNNQYSDTFVDELLNYLQKTKAKAFDFNFIKQSKNKKFFPLLIN *LLYENLTTPISLNASECQQDF*NAFSMLKNFQNFNAINLKNDE*KDFLKQEFDNQASVDVLTFPFYNANKNMNFNEFLK AYKKLIKNQMKIQKIVPGNEKIRTHFDYYFNFSKLSPYFYRQNYANNFLLLQKKLMQLNPKEQQAIFNALIAPDAKDDYS FNKYFAQIPTKYKDSVNQYLMKFNFDSLNQDKDIIKQIYLGNQYLLEEINNEDP*LLVDDIQYLMNLNDKQLKANKHYFK LVQMI*NGVDMLDYLKGYSRKKNDKTYRININNLKHELAIKNLNHVIIQDLITKNPQDDSLKSSLVSIQKQIDDLKQKID SLLENFKKDLLDYDLNLDLIQ*DSFKQRVIDNQLFTKESINKLARIFNK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 71067; Mature: 71067
Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKKIIKISLPIFVGLLSIPLIISCTKTTKSKTLNFIEDYQFNSSKKQFIFKIKNEFFDD CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC KAININQIYKTKGPNTSRHYLNNIDLAYLYNFKTKITTTHYSSINKIDHVDTKIQSPDDM CCCCHHHEEECCCCCCHHHHHCCCCEEEEEECEEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC HRKIKIRIIQPNSNKTFFIDGKLYKNAVVFSNDFEKNQNYILKNIVVNGVDSKDFNFKFS CCEEEEEEECCCCCCEEEECCCEECCEEEECCCCCCCCCEEEEHHEEECCCCCCCEEEEE TNTLPSFVYDQSKVFTNNQYSDTFVDELLNYLQKTKAKAFDFNFIKQSKNKKFFPLLINL CCCCCHHHHCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHH LYENLTTPISLNASECQQDFNAFSMLKNFQNFNAINLKNDEKDFLKQEFDNQASVDVLTF HHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE PFYNANKNMNFNEFLKAYKKLIKNQMKIQKIVPGNEKIRTHFDYYFNFSKLSPYFYRQNY CEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEHEEEEHHHCCHHHHHHCC ANNFLLLQKKLMQLNPKEQQAIFNALIAPDAKDDYSFNKYFAQIPTKYKDSVNQYLMKFN CCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCC FDSLNQDKDIIKQIYLGNQYLLEEINNEDPLLVDDIQYLMNLNDKQLKANKHYFKLVQMI CCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH NGVDMLDYLKGYSRKKNDKTYRININNLKHELAIKNLNHVIIQDLITKNPQDDSLKSSLV CCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH SIQKQIDDLKQKIDSLLENFKKDLLDYDLNLDLIQDSFKQRVIDNQLFTKESINKLARIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NK CC >Mature Secondary Structure MNKKIIKISLPIFVGLLSIPLIISCTKTTKSKTLNFIEDYQFNSSKKQFIFKIKNEFFDD CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC KAININQIYKTKGPNTSRHYLNNIDLAYLYNFKTKITTTHYSSINKIDHVDTKIQSPDDM CCCCHHHEEECCCCCCHHHHHCCCCEEEEEECEEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC HRKIKIRIIQPNSNKTFFIDGKLYKNAVVFSNDFEKNQNYILKNIVVNGVDSKDFNFKFS CCEEEEEEECCCCCCEEEECCCEECCEEEECCCCCCCCCEEEEHHEEECCCCCCCEEEEE TNTLPSFVYDQSKVFTNNQYSDTFVDELLNYLQKTKAKAFDFNFIKQSKNKKFFPLLINL CCCCCHHHHCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHH LYENLTTPISLNASECQQDFNAFSMLKNFQNFNAINLKNDEKDFLKQEFDNQASVDVLTF HHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE PFYNANKNMNFNEFLKAYKKLIKNQMKIQKIVPGNEKIRTHFDYYFNFSKLSPYFYRQNY CEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEHEEEEHHHCCHHHHHHCC ANNFLLLQKKLMQLNPKEQQAIFNALIAPDAKDDYSFNKYFAQIPTKYKDSVNQYLMKFN CCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCC FDSLNQDKDIIKQIYLGNQYLLEEINNEDPLLVDDIQYLMNLNDKQLKANKHYFKLVQMI CCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH NGVDMLDYLKGYSRKKNDKTYRININNLKHELAIKNLNHVIIQDLITKNPQDDSLKSSLV CCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH SIQKQIDDLKQKIDSLLENFKKDLLDYDLNLDLIQDSFKQRVIDNQLFTKESINKLARIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NK CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA