| Definition | Thermoanaerobacter tengcongensis MB4, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003869 |
| Length | 2,689,445 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is ProP13
Identifier: 20808881
GI number: 20808881
Start: 2418128
End: 2419369
Strand: Reverse
Name: ProP13
Synonym: TTE2527
Alternate gene names: NA
Gene position: 2419369-2418128 (Counterclockwise)
Preceding gene: 20808882
Following gene: 20808875
Centisome position: 89.96
GC content: 37.52
Gene sequence:
>1242_bases ATGGGGCTTTTTGACCAGATAAAATTTCTGCCAAGGGAAGTAAAAATTTTTGTGGCAACAGAGGCATTTTTAGGGATAGG AATGGGTATTTTAGGGTTTGTGCTAAATTTCCACTTTTTAGCTTTGAATATTTCACCTGAAGAGATTGGCGCTTTAAACT CTATAGGCACTTTTGTCATGGGGCTTTTTTCACTGCCAGCAGGATTTATGGCAAGGCATTTTGGGAGGAAAAGGGTATTT ATAACGGGGATTGTACTGATAGGATTGGGCTATTTGATGTTTGGAATTGGGACCACCCTTTATGCCTTTTATCCGGCCCA AATAATACAGTTTATAGGGGTTTCACTTTTGGTTTCTACAGAGATACAGCTTCTCTTTTCTTATGCCGGGACAAGTGAAG CAGAGACTTTAAGCTACAGTCTTCTCTTTGCAGTTTTTACCCTCTTCAGCGGGATAGGGACTCTTATGGGGGGATTTATC CCGCAGTTTCTCAAGTATGGTACCACTAAATATCAGTGGTCGATATACATATCTGCCTTGTCTATCTTTTTAGTGGCAAT TTTGAGGGGATTATTTTTGCCCTGCCGCAATAACAATAAGCTTAATAGTGCAGAAAAGATTGAGACAAAAAATTTAACAG AGAATTTTAAAGAGCATTTGAACAGCAAAATAATAATTTTGACATTATATCTCTTTTTAATGGGAATGGTATTTTCAGTC GTTATACCTTTTCAGAATGTCATAATAAAATTTACCACAGGGTGGCATGATGAGGCTGTCTCTTACGTTTTGACTGCCAA TGGTATAATTCTGTTCTTTGCCTCTATAATAATGCCTTGGCTTATAAATGAGCTGGGAGTAATTAGGTCTTATTACTACG TGTACGCTATAAATATAGGGCTGGCTTTCATTCTTTACTTTAAGATGCTTCCCATTGCTTTTGTGTTAATTTTCCTTTTA AGGAGTGGTAGCTTTACACTTTTTCTCAATATGGTGGACAGCCAAACGATGTCTGCTGTAGAGGAAGATAAGAGAGATTT TTTTGGAGGTGCCAGAACTTTTTTGAGGAGCATAGGAGGGGCTATTGGAAGCTTTATAGCAGGGTATGTAATTCAAAGAG GTAAGAGTACTCTTCCTTTTCTGATTACTTCTTTGGTTCTTTTGATTAGCTTTGTGTACTTCGAATTTTTGGTGAAACCC ATTTTTATAAAAGAACTTGAAAAAAAGGAGGAGGGCATGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAAGGCAAAGCCTGACTATATAGCCTGATTAAATTTAAAAGATCAGACGGAAGGAACCGTCCCCTTTGTCTGATTGTCT GGGAAGAAAGGAGAAAGTGT
Downstream 100 bases:
>100_bases CTATACTAAGTGGCAAGCTACATAATGCCCTCCTCCTACATCTCTAAACTCAGGAACTTGTTCTTTACATATGTCCTTTG CAAAAGGACACCTTGTGTGG
Product: major facilitator superfamily permease
Products: NA
Alternate protein names: Transporter Facilitator Family
Number of amino acids: Translated: 413; Mature: 412
Protein sequence:
>413_residues MGLFDQIKFLPREVKIFVATEAFLGIGMGILGFVLNFHFLALNISPEEIGALNSIGTFVMGLFSLPAGFMARHFGRKRVF ITGIVLIGLGYLMFGIGTTLYAFYPAQIIQFIGVSLLVSTEIQLLFSYAGTSEAETLSYSLLFAVFTLFSGIGTLMGGFI PQFLKYGTTKYQWSIYISALSIFLVAILRGLFLPCRNNNKLNSAEKIETKNLTENFKEHLNSKIIILTLYLFLMGMVFSV VIPFQNVIIKFTTGWHDEAVSYVLTANGIILFFASIIMPWLINELGVIRSYYYVYAINIGLAFILYFKMLPIAFVLIFLL RSGSFTLFLNMVDSQTMSAVEEDKRDFFGGARTFLRSIGGAIGSFIAGYVIQRGKSTLPFLITSLVLLISFVYFEFLVKP IFIKELEKKEEGM
Sequences:
>Translated_413_residues MGLFDQIKFLPREVKIFVATEAFLGIGMGILGFVLNFHFLALNISPEEIGALNSIGTFVMGLFSLPAGFMARHFGRKRVF ITGIVLIGLGYLMFGIGTTLYAFYPAQIIQFIGVSLLVSTEIQLLFSYAGTSEAETLSYSLLFAVFTLFSGIGTLMGGFI PQFLKYGTTKYQWSIYISALSIFLVAILRGLFLPCRNNNKLNSAEKIETKNLTENFKEHLNSKIIILTLYLFLMGMVFSV VIPFQNVIIKFTTGWHDEAVSYVLTANGIILFFASIIMPWLINELGVIRSYYYVYAINIGLAFILYFKMLPIAFVLIFLL RSGSFTLFLNMVDSQTMSAVEEDKRDFFGGARTFLRSIGGAIGSFIAGYVIQRGKSTLPFLITSLVLLISFVYFEFLVKP IFIKELEKKEEGM >Mature_412_residues GLFDQIKFLPREVKIFVATEAFLGIGMGILGFVLNFHFLALNISPEEIGALNSIGTFVMGLFSLPAGFMARHFGRKRVFI TGIVLIGLGYLMFGIGTTLYAFYPAQIIQFIGVSLLVSTEIQLLFSYAGTSEAETLSYSLLFAVFTLFSGIGTLMGGFIP QFLKYGTTKYQWSIYISALSIFLVAILRGLFLPCRNNNKLNSAEKIETKNLTENFKEHLNSKIIILTLYLFLMGMVFSVV IPFQNVIIKFTTGWHDEAVSYVLTANGIILFFASIIMPWLINELGVIRSYYYVYAINIGLAFILYFKMLPIAFVLIFLLR SGSFTLFLNMVDSQTMSAVEEDKRDFFGGARTFLRSIGGAIGSFIAGYVIQRGKSTLPFLITSLVLLISFVYFEFLVKPI FIKELEKKEEGM
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46318; Mature: 46187
Theoretical pI: Translated: 9.36; Mature: 9.36
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.9 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGLFDQIKFLPREVKIFVATEAFLGIGMGILGFVLNFHFLALNISPEEIGALNSIGTFVM CCCHHHHHHCHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHH GLFSLPAGFMARHFGRKRVFITGIVLIGLGYLMFGIGTTLYAFYPAQIIQFIGVSLLVST HHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIQLLFSYAGTSEAETLSYSLLFAVFTLFSGIGTLMGGFIPQFLKYGTTKYQWSIYISAL HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHH SIFLVAILRGLFLPCRNNNKLNSAEKIETKNLTENFKEHLNSKIIILTLYLFLMGMVFSV HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VIPFQNVIIKFTTGWHDEAVSYVLTANGIILFFASIIMPWLINELGVIRSYYYVYAINIG HHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAFILYFKMLPIAFVLIFLLRSGSFTLFLNMVDSQTMSAVEEDKRDFFGGARTFLRSIGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIGSFIAGYVIQRGKSTLPFLITSLVLLISFVYFEFLVKPIFIKELEKKEEGM HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure GLFDQIKFLPREVKIFVATEAFLGIGMGILGFVLNFHFLALNISPEEIGALNSIGTFVM CCHHHHHHCHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHH GLFSLPAGFMARHFGRKRVFITGIVLIGLGYLMFGIGTTLYAFYPAQIIQFIGVSLLVST HHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIQLLFSYAGTSEAETLSYSLLFAVFTLFSGIGTLMGGFIPQFLKYGTTKYQWSIYISAL HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHH SIFLVAILRGLFLPCRNNNKLNSAEKIETKNLTENFKEHLNSKIIILTLYLFLMGMVFSV HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VIPFQNVIIKFTTGWHDEAVSYVLTANGIILFFASIIMPWLINELGVIRSYYYVYAINIG HHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAFILYFKMLPIAFVLIFLLRSGSFTLFLNMVDSQTMSAVEEDKRDFFGGARTFLRSIGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIGSFIAGYVIQRGKSTLPFLITSLVLLISFVYFEFLVKPIFIKELEKKEEGM HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA