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The map label for this gene is 20808611

Identifier: 20808611

GI number: 20808611

Start: 2140498

End: 2141259

Strand: Reverse

Name: 20808611

Synonym: TTE2236

Alternate gene names: NA

Gene position: 2141259-2140498 (Counterclockwise)

Preceding gene: 20808612

Following gene: 20808610

Centisome position: 79.62

GC content: 30.18

Gene sequence:

>762_bases
ATGCTAATAGAATCTATAAGATTTTCAATTAAAAAAGCAATTCAATATAGAGCAAATTTGGTAAGCTGGTTTTTGGCAGA
CTTATCTTTATACACTGCAACATTTTTAGGCTATTACCTGCTTACTCAAAAAATTGACGTTTTTGGTGATTATAATAGAG
AAGAAATTCTTTTTTATATAACCTGTTTCTTTTTAGTAAACAACCTATATGCAATTTTCTTTGCAGAAGCTGTTTCTAAG
TTTGGACAATCAGTTTTAACAGGGTATTTTGATTTTGATTTACTAAAACCACAGCCTCTCATAAAATACATTGTACTAAA
AAACCTAAATTTTCCTGCAGCTCTTTCAACCCCCTTGTTAATATTTCTAAATATATGGTGTATGAAAATATGTGGAATTA
AATTGACAATAGCTTATATCATTTCAATTTTCAGTGCTTCTATTTTAATGGGACTTTTATTTTTCATAGTATACAGTTTT
ACTCTTTTTGGTTTAAGGTCTGAAGCAATTTCAGCGATAGTCTTGCAGCTTTTAACAATGGCAGAAAAACCTGATACGGT
TTTCCCAAAAATCTTCCGTAATCTTCTCATATATGCAATTCCCATTTTCTTATTTAGTGCAATTCCTGCAAGGATTGCCC
TTGGTAAGAGCAGTATATATGAGAATATATGGTGTTATTCATCTTCCTTATTATATTATTTGGTTTTAAAAATTATCCTT
TACCAAGGGCTGAAAAAATACCAGTCGACAGGAGAATTGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTTTATTTCGCTAGTCTGGGTGTTAATACTTGGTTTCATTGTTTTTTTACTTATGAAAAATGGATTAAAAAAATACAC
CTCTCATGGGGCGTGAAAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGATTATAAATTGCGTGACAGATAAAGCCTATAAAATTTGATGCTTTTGAAAATAAATTGGATTGAATTTTTCTAAT
CTTATGATATAATAGAAGCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 253; Mature: 253

Protein sequence:

>253_residues
MLIESIRFSIKKAIQYRANLVSWFLADLSLYTATFLGYYLLTQKIDVFGDYNREEILFYITCFFLVNNLYAIFFAEAVSK
FGQSVLTGYFDFDLLKPQPLIKYIVLKNLNFPAALSTPLLIFLNIWCMKICGIKLTIAYIISIFSASILMGLLFFIVYSF
TLFGLRSEAISAIVLQLLTMAEKPDTVFPKIFRNLLIYAIPIFLFSAIPARIALGKSSIYENIWCYSSSLLYYLVLKIIL
YQGLKKYQSTGEL

Sequences:

>Translated_253_residues
MLIESIRFSIKKAIQYRANLVSWFLADLSLYTATFLGYYLLTQKIDVFGDYNREEILFYITCFFLVNNLYAIFFAEAVSK
FGQSVLTGYFDFDLLKPQPLIKYIVLKNLNFPAALSTPLLIFLNIWCMKICGIKLTIAYIISIFSASILMGLLFFIVYSF
TLFGLRSEAISAIVLQLLTMAEKPDTVFPKIFRNLLIYAIPIFLFSAIPARIALGKSSIYENIWCYSSSLLYYLVLKIIL
YQGLKKYQSTGEL
>Mature_253_residues
MLIESIRFSIKKAIQYRANLVSWFLADLSLYTATFLGYYLLTQKIDVFGDYNREEILFYITCFFLVNNLYAIFFAEAVSK
FGQSVLTGYFDFDLLKPQPLIKYIVLKNLNFPAALSTPLLIFLNIWCMKICGIKLTIAYIISIFSASILMGLLFFIVYSF
TLFGLRSEAISAIVLQLLTMAEKPDTVFPKIFRNLLIYAIPIFLFSAIPARIALGKSSIYENIWCYSSSLLYYLVLKIIL
YQGLKKYQSTGEL

Specific function: Unknown

COG id: COG3694

COG function: function code R; ABC-type uncharacterized transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 29076; Mature: 29076

Theoretical pI: Translated: 9.27; Mature: 9.27

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA