Definition Borrelia duttonii Ly, complete genome.
Accession NC_011229
Length 931,674

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The map label for this gene is 203284245

Identifier: 203284245

GI number: 203284245

Start: 346616

End: 349471

Strand: Reverse

Name: 203284245

Synonym: BDU_327

Alternate gene names: NA

Gene position: 349471-346616 (Counterclockwise)

Preceding gene: 203284246

Following gene: 203284244

Centisome position: 37.51

GC content: 27.31

Gene sequence:

>2856_bases
ATGCCTGATATAGAAAAAATAAATAAGTTTAAGAAGGAAATAATAGATAATATTGCTGATGAGAAAGCTAGAAAAGATAG
TTTTGGCATTACAATGGATATTGACCCTCCAAAGGATGGTGAGTCTATTCTTCCTTGGGAAGAACAAGAAGAAGTTGTTG
ATTTTGATGAAGAACATGATGAAGGCCCAGATTTAGATGCTATTCTTGGTGTTCTTGATAATGAGGAAGGACAAAAGAGT
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TGATGATTTTGATCTTGAGTATATGATTAGTAAAATCAAGGAAGCAGATGATGAAATTTCTTCTAATAAGTTTGATTCTA
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ATGTATTATAAGGCAGAAGAATTTAGCAAACTGGAGAAGCAATTTAGTTATAGACTTTCTAAAGCCTTAACACCAATATT
AAAAATTGCCTCTTTTTTTATTGTATTAACCTTTTTGTCGTTTTATTTTTTAGTAGATATTATGTTTTTTTATATTGCAT
CTGATAAAAAATATAAAGAAGGAATTTCATATATATATGAAAATAAAAGAGAACTTGCTAAAGCTACTTTTAAGGATGCA
TATTATATGCGTCCTAATAGAAAGTGGTTTTTAACTTATGCTAAGGCTTTTGAGAGTATAAAGGATTTTGATAGTGCTGA
GGAAAAATATGAAGAATTGTTTACTGTTGACCCATTTTCTGAGGGTGCTTCTAAGAGAAGACGAAAAATTTTTGATAAAG
ATGGGTATATATCTTATGCTTTTATGAAGATGAGGCTTGGTGAATATTCTGATGCTAATTCGATTTTGGATGAAGTTATA
TCTTACGATATTTATGATTATGAGGCATTAATGGCTAAGGGTGAGAATTATTTTCAGTGGGCTCAAGTGGATCCTATGTA
TTATAGAAATAGTATAAATGATTATACCATTTTACTTTCAAAGTATGGACATCATAAGAAGGAAGTTTTATTTAAGCTTT
TTGATGCTTATATTGAAGCTGGTGCTGAGAGAGAGGCTGACAATGTAAATGCTTTTATTAAAACAAATCAGGAATTAGAT
ATTGATGAGGTAGTTTATACTAAGTATGTTAAGAAATTGATAGATAAATATGTAGAATTTACAGTTTATAATAAGCGAAT
AAATGCTCTCTCTAGAAATTTAAAATATTTAAATGCTCAAATGAATTTACTTAATAAAGAGTTTTCTAATTTTAAAATAA
ATAGTGGCAAGAGTGTTTCTGATATTTTAAATGATGTTAATCTTAATTCGGAGATTGAATATATTCTTAGGAGAATTTTA
TTAAAAAATCCTGATTATAATAAGGCATTATTTGAAAGTGGTAGATATTTTTATTATATGGGAGATTTGAAAAAGTCAGA
AGGATATTTATTAACGGCTATAAACGGTTTTAGACAAGAAGATTTAATTAATAATGCTAGTGACAAGATTATTGCTTATA
GGATTTTATCAGATATTTATGAGAAGGGAAATGATACACTTAAAGCAAGTAATATTGTCAGTTTGGCTTTAAATGAATAT
GATTTTTATAAAAGAAATGGCCTTATTAAAGCTTCGAGAGAACTTGCTTTAATTTATGAAAAGCAAGGAGATATATTTAA
AACTTTAAATGGTTTTCAATCAGCCATATCTTCTTATAAAATGGCAATAAATGAAGGGATTAATTCACCAGATGTTTACT
ATAAATTAGCATTACTTAGTTATAAGGAAAATAATTATAAGGATGCATTAACTTCGCTATTCAAAGTTGAAAATATGTCT
GGATTTGCAAATAGTAATAAAGTTTTAAATTCAATAGCATCTGTTCTTTATAAAATGGGTGATTTTGAAGCTTCTAGGAG
TTATTATTTAAGAGTATTGCAAAATTTGGAATCAGAGAAATCCAGTATTTTAAGTTTGAGACCTAAAGGAAATGATCATC
ATAAAGCTTTGTTGCTAAGAGAAATTGAAGTTTATAATAATCTTGGAGTTGTTGAGATAATAGCATCTCTTGGCAATAAG
GTTAAGTCTGGTGTTATTATAGATCATGATCTTTTTGATTCAGGAATTGCAAATTTAACAGAATCTTCTAGAATATTTGA
TCTCTTAAATCGTGATGAGGATATGATGAAAAATGTTAAAAGAGATCTTGCTAGTTTAAATCTTAGAAGCGTATTTAAAA
ATGATTTTACAGGTTTAAAGATTTTATTTTATGATAATTTAGCTGATAATCTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGGTTCCAAAATTGCTGATGATTTAGAAAAACGTTTTGAGATTCTTCATAAGGATGGAGCTAAAATATATAATGATTTA
ATTTAGGATTTTATTGTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCTTTATAATTTATCAGCTTAAGGACATTGTAGAATTGTCCGATTAATGTGTAAGGGTTTATATGAGAAAAGCTTGCTT
TATTATTTTCTTGTTTATTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 951; Mature: 950

Protein sequence:

>951_residues
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Sequences:

>Translated_951_residues
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>Mature_950_residues
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KSGVIIDHDLFDSGIANLTESSRIFDLLNRDEDMMKNVKRDLASLNLRSVFKNDFTGLKILFYDNLADNL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 109863; Mature: 109732

Theoretical pI: Translated: 4.42; Mature: 4.42

Prosite motif: PS50293 TPR_REGION L=RR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPDIEKINKFKKEIIDNIADEKARKDSFGITMDIDPPKDGESILPWEEQEEVVDFDEEHD
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCC
EGPDLDAILGVLDNEEGQKSEASENDINLLKNSENVEIDSEFDNLNEDFDVLGSHFEETL
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>Mature Secondary Structure 
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ESSRIFDLLNRDEDMMKNVKRDLASLNLRSVFKNDFTGLKILFYDNLADNL
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA