| Definition | Borrelia duttonii Ly, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011229 |
| Length | 931,674 |
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The map label for this gene is secA [H]
Identifier: 203284077
GI number: 203284077
Start: 165413
End: 168121
Strand: Reverse
Name: secA [H]
Synonym: BDU_155
Alternate gene names: 203284077
Gene position: 168121-165413 (Counterclockwise)
Preceding gene: 203284082
Following gene: 203284076
Centisome position: 18.05
GC content: 31.64
Gene sequence:
>2709_bases TTGATACCTAATATGTTAAGAGCAATATTTGAGGCGACTGTTGGCTCAAAGAGTAAAAGGGATTTAAAAAGTTATCTTCC TGTTTTAAGAAATATTAATAAACTTGAATCTTGGGCACTATCTTTGTTGGATGAGGATTTTTCAAGGGAAACAGAAAAAT TCAAAAATGAACTTCAGAGTGGTAAGACTTTAGAAGATATTTTAGAGAGAGCATTTGCACTCTCTAGAGAAGCTGCAAGA AGGCGACTTAAAGAGAGACCTTATGATGTTCAACTTATTGCTGGTCTTGCGCTTCATCAAGGTAAAATAATAGAAATGAA GACAGGAGAAGGTAAAACTTTGTCTTCTGTTCAGGCTGCTTATCTTAATAGTTTAACAGGTGATGGTGTTATTATTGTTA CGGTTAATGATTATCTTGCAGAACGTGATTCAAATTGGATGAAACCTGTTTTTGATCTTTTGGGAGTGAGTGTTGGTGTT GTACTCTCTAATATGGATTCTTCTAGACGAAAGATAGAATATGGTAAAGATATTACCTATGTTACGAATAATGAGCTTGG ATTTGATTATTTAAGAGATAATATGTGTTTTGATTTGTCTCAGAAATCTTTAAGAAATTTTAATTATTGCATTATTGATG AAATTGATTCTATTTTAATAGATGAAGCTAGAACACCTTTAATTATTTCAGGTTCAACTGAAGGTGATACTAGTGCTTAT CTTACTGTTAATTCTCTTGTTCCTTTTCTAAAAGAGTGTTCTAAAGATCTAAAAACAGGAGATTATCCTTTAGAGATTGA TGATCTTGATGGAGATTATACAATTGATGAAAAGGCTAAAAGAATATCTTTTACCGTTAATGGATTAAATAATCTTGAAC GAATTTTAGTTTCGAAGGGCATAATTCAAGGGTCTATGTATGTTGATTCTAATTTTAATTATGTTCATTATATGACTCAG GCATTAAAGGCACATTTGTTGTTTTTAAAGGATAGGGAATACATTGTTGGAGATTTTGGTGTTGAAATTGTTGATGAATT TACAGGTCGTGTTTTAAAAGGACGAAGATATTCAGATGGTCTACATCAAGCTATTGAAGCTAAGGAAGGTGTTAGAGTTG CAAGTGAAAATAAGACTATGGCAACAATTACATTTCAAAATTTATTTAGGATGTTTAATAAGATTTCTGGTATGACTGGT ACTGCAGATACAGAAGCGAAAGAGTTTCATAGAATATATGATCTTGATGTTGTAGTAGTTCCTACTAATAAATTGGTTGC AAGAATAGATGAAGATGATATCATTTATTATACTGAGGACTTTAAGTTTAGAGCAATTACGGATGAAGTTTTTGAGGCTT ATAAGAGAGGACAACCTGTTCTTGTTGGGACAGTTTCTATTGAAAAGTCTGAAATTTTATCTAATATGTTTAAAAATAGA GGGATTAAACATGAAGTTTTAAATGCTAAAAATCATTTTCGTGAAGCATTAATTATTGCTGAAGCAGGGGCAAAATATTC TGTTACAATTGCAACTAATATGGCTGGCCGTGGTACTGATATTAAGCTTGGAGGTAATCTTGAACATAGAGTTCGTAAAA AATTTGGGACAGAAATAAGTTTTGATGATTTACAGAAAGCTATGCAAAGCGAGAGAGAGCAGTATCTTAAAGATTATGAA GAAGTTAAATCGCTTGGTGGGCTTTATGTTATTGGTAGTGAGCGTCATGAATCGCGAAGAATAGACAATCAGCTTAGAGG ACGTGGGGGAAGACAGGGAGATCCTGGCAGATCAAGGTTTTATGTATCTCTTGAGGATGATTTGATGAGGCTTTTTGCAG GGGACAATTTAAGAGCTCTTATGGGGAAACTTGGAATGGCTACAGGTGAACCCATTGCGCATTCTTTATTAACAAAATCT TTGGTTAATGCACAAAGGCGTGTAGAGGATCGAAATTTTGAGATTAGAAAACATCTCTTAGAGTATGATGATGTCATAAC GAAACATAGAGAATTTATTTATTCTCAGAGAAATTTAATTCTTGCTGATAATAATATTAAGGAACGTATTCTTCTCTCTT TAAGAGAATATCTTGATTTTTTATTCGATCAAGTGAAAGGAGATGTGGTCACAAGTTCTGTTTTAAATGAAATAAATTCA GTTTTTGCTTATATGATGGAAAGTGTTGGTTCTGTTGAGAAAATGAGTATTGCTGATTTAAAAGATAAGTTAATGGAAGT TGCTAGGTCTAATCTAGATATAAAAGAAGAATTAATTGGTTCTGAACTTTTAAATGAATTTTTAAAATATGAATATTTGA AAAATATTGATTCTAAATTTCAGGAGCATCTTGCAAATCTTGATTCTTTAAGAGAATCAGTTTATCTTAGATCTTATGCT AATAAAAATCCAATTACTGAATATAAAGAAGAGGGTTTTGCAATTTTTAGTGAACTTATTAAAGATATTAAGATCGAAAC TTTAAGACGAACTTTGCAGGTAAAGATTGATGTTGATTCTAGTAATTATAAAAATAAAAAACCTAAAGATGTTCATGCTA CTCATAAGGAGTTTTCAGGTATTGTTTCTAGGGAAAGAGATGATTCGGTGGGGGTGCAAATAGTTAGAAATACTCCCAAG ATTGGAAGAAATGAACCTTGTTATTGTGGAAGTAAAAAAAAATATAAAAATTGTCATGGAAAAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATATAATTATAAAAAATATATTTAAATGAATTTTATAAAACTTTTTCATGTTTTAGATGTTATTATTTTAAATAGTTAAA AGTCAATTATTTTAGGAGTA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAGGGGGTGTTGTTATGTTTAAATTACCAGAACTTGGCTATTCTTATGATGCTTTGGAGCCTTATATTGATGCTAAGAC AATGGAAATTCATCATAGTA
Product: preprotein translocase subunit SecA
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 902; Mature: 902
Protein sequence:
>902_residues MIPNMLRAIFEATVGSKSKRDLKSYLPVLRNINKLESWALSLLDEDFSRETEKFKNELQSGKTLEDILERAFALSREAAR RRLKERPYDVQLIAGLALHQGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGV VLSNMDSSRRKIEYGKDITYVTNNELGFDYLRDNMCFDLSQKSLRNFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGSTEGDTSAY LTVNSLVPFLKECSKDLKTGDYPLEIDDLDGDYTIDEKAKRISFTVNGLNNLERILVSKGIIQGSMYVDSNFNYVHYMTQ ALKAHLLFLKDREYIVGDFGVEIVDEFTGRVLKGRRYSDGLHQAIEAKEGVRVASENKTMATITFQNLFRMFNKISGMTG TADTEAKEFHRIYDLDVVVVPTNKLVARIDEDDIIYYTEDFKFRAITDEVFEAYKRGQPVLVGTVSIEKSEILSNMFKNR GIKHEVLNAKNHFREALIIAEAGAKYSVTIATNMAGRGTDIKLGGNLEHRVRKKFGTEISFDDLQKAMQSEREQYLKDYE EVKSLGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRGGRQGDPGRSRFYVSLEDDLMRLFAGDNLRALMGKLGMATGEPIAHSLLTKS LVNAQRRVEDRNFEIRKHLLEYDDVITKHREFIYSQRNLILADNNIKERILLSLREYLDFLFDQVKGDVVTSSVLNEINS VFAYMMESVGSVEKMSIADLKDKLMEVARSNLDIKEELIGSELLNEFLKYEYLKNIDSKFQEHLANLDSLRESVYLRSYA NKNPITEYKEEGFAIFSELIKDIKIETLRRTLQVKIDVDSSNYKNKKPKDVHATHKEFSGIVSRERDDSVGVQIVRNTPK IGRNEPCYCGSKKKYKNCHGKN
Sequences:
>Translated_902_residues MIPNMLRAIFEATVGSKSKRDLKSYLPVLRNINKLESWALSLLDEDFSRETEKFKNELQSGKTLEDILERAFALSREAAR RRLKERPYDVQLIAGLALHQGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGV VLSNMDSSRRKIEYGKDITYVTNNELGFDYLRDNMCFDLSQKSLRNFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGSTEGDTSAY LTVNSLVPFLKECSKDLKTGDYPLEIDDLDGDYTIDEKAKRISFTVNGLNNLERILVSKGIIQGSMYVDSNFNYVHYMTQ ALKAHLLFLKDREYIVGDFGVEIVDEFTGRVLKGRRYSDGLHQAIEAKEGVRVASENKTMATITFQNLFRMFNKISGMTG TADTEAKEFHRIYDLDVVVVPTNKLVARIDEDDIIYYTEDFKFRAITDEVFEAYKRGQPVLVGTVSIEKSEILSNMFKNR GIKHEVLNAKNHFREALIIAEAGAKYSVTIATNMAGRGTDIKLGGNLEHRVRKKFGTEISFDDLQKAMQSEREQYLKDYE EVKSLGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRGGRQGDPGRSRFYVSLEDDLMRLFAGDNLRALMGKLGMATGEPIAHSLLTKS LVNAQRRVEDRNFEIRKHLLEYDDVITKHREFIYSQRNLILADNNIKERILLSLREYLDFLFDQVKGDVVTSSVLNEINS VFAYMMESVGSVEKMSIADLKDKLMEVARSNLDIKEELIGSELLNEFLKYEYLKNIDSKFQEHLANLDSLRESVYLRSYA NKNPITEYKEEGFAIFSELIKDIKIETLRRTLQVKIDVDSSNYKNKKPKDVHATHKEFSGIVSRERDDSVGVQIVRNTPK IGRNEPCYCGSKKKYKNCHGKN >Mature_902_residues MIPNMLRAIFEATVGSKSKRDLKSYLPVLRNINKLESWALSLLDEDFSRETEKFKNELQSGKTLEDILERAFALSREAAR RRLKERPYDVQLIAGLALHQGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGV VLSNMDSSRRKIEYGKDITYVTNNELGFDYLRDNMCFDLSQKSLRNFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGSTEGDTSAY LTVNSLVPFLKECSKDLKTGDYPLEIDDLDGDYTIDEKAKRISFTVNGLNNLERILVSKGIIQGSMYVDSNFNYVHYMTQ ALKAHLLFLKDREYIVGDFGVEIVDEFTGRVLKGRRYSDGLHQAIEAKEGVRVASENKTMATITFQNLFRMFNKISGMTG TADTEAKEFHRIYDLDVVVVPTNKLVARIDEDDIIYYTEDFKFRAITDEVFEAYKRGQPVLVGTVSIEKSEILSNMFKNR GIKHEVLNAKNHFREALIIAEAGAKYSVTIATNMAGRGTDIKLGGNLEHRVRKKFGTEISFDDLQKAMQSEREQYLKDYE EVKSLGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRGGRQGDPGRSRFYVSLEDDLMRLFAGDNLRALMGKLGMATGEPIAHSLLTKS LVNAQRRVEDRNFEIRKHLLEYDDVITKHREFIYSQRNLILADNNIKERILLSLREYLDFLFDQVKGDVVTSSVLNEINS VFAYMMESVGSVEKMSIADLKDKLMEVARSNLDIKEELIGSELLNEFLKYEYLKNIDSKFQEHLANLDSLRESVYLRSYA NKNPITEYKEEGFAIFSELIKDIKIETLRRTLQVKIDVDSSNYKNKKPKDVHATHKEFSGIVSRERDDSVGVQIVRNTPK IGRNEPCYCGSKKKYKNCHGKN
Specific function: Part of the Sec protein translocase complex. Interacts with the secYEG preprotein conducting channel. Has a central role in coupling the hydrolysis of ATP to the transfer of proteins into and across the cell membrane, serving as an ATP-driven molecular mo
COG id: COG0653
COG function: function code U; Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Cytoplasm (By similarity). Note=Distribution is 50-50 (By similarity) [H]
Metaboloic importance: Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the secA family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786287, Length=929, Percent_Identity=44.2411194833154, Blast_Score=762, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004027 - InterPro: IPR000185 - InterPro: IPR020937 - InterPro: IPR011115 - InterPro: IPR014018 - InterPro: IPR011130 - InterPro: IPR011116 [H]
Pfam domain/function: PF02810 SEC-C; PF07517 SecA_DEAD; PF01043 SecA_PP_bind; PF07516 SecA_SW [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 102972; Mature: 102972
Theoretical pI: Translated: 6.63; Mature: 6.63
Prosite motif: PS01312 SECA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIPNMLRAIFEATVGSKSKRDLKSYLPVLRNINKLESWALSLLDEDFSRETEKFKNELQS CCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GKTLEDILERAFALSREAARRRLKERPYDVQLIAGLALHQGKIIEMKTGEGKTLSSVQAA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHH YLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSNMDSSRRKIEYGKDITY HHHCCCCCCEEEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCEEE VTNNELGFDYLRDNMCFDLSQKSLRNFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGSTEGDTSAY EECCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCEEE LTVNSLVPFLKECSKDLKTGDYPLEIDDLDGDYTIDEKAKRISFTVNGLNNLERILVSKG EEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCEEECCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHH IIQGSMYVDSNFNYVHYMTQALKAHLLFLKDREYIVGDFGVEIVDEFTGRVLKGRRYSDG HEECEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH LHQAIEAKEGVRVASENKTMATITFQNLFRMFNKISGMTGTADTEAKEFHRIYDLDVVVV HHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHEECEEEEE PTNKLVARIDEDDIIYYTEDFKFRAITDEVFEAYKRGQPVLVGTVSIEKSEILSNMFKNR CCCHHEEEECCCCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHCC GIKHEVLNAKNHFREALIIAEAGAKYSVTIATNMAGRGTDIKLGGNLEHRVRKKFGTEIS CCHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCC FDDLQKAMQSEREQYLKDYEEVKSLGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRGGRQGDPGRSRF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEE YVSLEDDLMRLFAGDNLRALMGKLGMATGEPIAHSLLTKSLVNAQRRVEDRNFEIRKHLL EEEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH EYDDVITKHREFIYSQRNLILADNNIKERILLSLREYLDFLFDQVKGDVVTSSVLNEINS HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH VFAYMMESVGSVEKMSIADLKDKLMEVARSNLDIKEELIGSELLNEFLKYEYLKNIDSKF HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QEHLANLDSLRESVYLRSYANKNPITEYKEEGFAIFSELIKDIKIETLRRTLQVKIDVDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECC SNYKNKKPKDVHATHKEFSGIVSRERDDSVGVQIVRNTPKIGRNEPCYCGSKKKYKNCHG CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCC KN CC >Mature Secondary Structure MIPNMLRAIFEATVGSKSKRDLKSYLPVLRNINKLESWALSLLDEDFSRETEKFKNELQS CCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GKTLEDILERAFALSREAARRRLKERPYDVQLIAGLALHQGKIIEMKTGEGKTLSSVQAA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHH YLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSNMDSSRRKIEYGKDITY HHHCCCCCCEEEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCEEE VTNNELGFDYLRDNMCFDLSQKSLRNFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGSTEGDTSAY EECCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCEEE LTVNSLVPFLKECSKDLKTGDYPLEIDDLDGDYTIDEKAKRISFTVNGLNNLERILVSKG EEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCEEECCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHH IIQGSMYVDSNFNYVHYMTQALKAHLLFLKDREYIVGDFGVEIVDEFTGRVLKGRRYSDG HEECEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH LHQAIEAKEGVRVASENKTMATITFQNLFRMFNKISGMTGTADTEAKEFHRIYDLDVVVV HHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHEECEEEEE PTNKLVARIDEDDIIYYTEDFKFRAITDEVFEAYKRGQPVLVGTVSIEKSEILSNMFKNR CCCHHEEEECCCCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHCC GIKHEVLNAKNHFREALIIAEAGAKYSVTIATNMAGRGTDIKLGGNLEHRVRKKFGTEIS CCHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCC FDDLQKAMQSEREQYLKDYEEVKSLGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRGGRQGDPGRSRF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEE YVSLEDDLMRLFAGDNLRALMGKLGMATGEPIAHSLLTKSLVNAQRRVEDRNFEIRKHLL EEEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH EYDDVITKHREFIYSQRNLILADNNIKERILLSLREYLDFLFDQVKGDVVTSSVLNEINS HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH VFAYMMESVGSVEKMSIADLKDKLMEVARSNLDIKEELIGSELLNEFLKYEYLKNIDSKF HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QEHLANLDSLRESVYLRSYANKNPITEYKEEGFAIFSELIKDIKIETLRRTLQVKIDVDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECC SNYKNKKPKDVHATHKEFSGIVSRERDDSVGVQIVRNTPKIGRNEPCYCGSKKKYKNCHG CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCC KN CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA