Definition Borrelia duttonii Ly, complete genome.
Accession NC_011229
Length 931,674

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The map label for this gene is atpI [H]

Identifier: 203284016

GI number: 203284016

Start: 98353

End: 100188

Strand: Reverse

Name: atpI [H]

Synonym: BDU_94

Alternate gene names: 203284016

Gene position: 100188-98353 (Counterclockwise)

Preceding gene: 203284017

Following gene: 203284015

Centisome position: 10.75

GC content: 28.43

Gene sequence:

>1836_bases
GTGTTAATGATTGTTAAAATGAAGAAGGTTTTGCTTTTAACTTTATTAAAATATAAAAGAGACTCACTTGAGATCTTAAG
AGAATTGGGAGTTGTTCATATCAATTTTTGCAATAAAGTTTCAGAATCTTTACAAAAAGTTATTGAGGAGAGGAGTATTT
TAAATCATGCTTTGTCTTTGCTTGGTGATGATTCTGAAGTGCAAATTTTAAGTTCTTCAAATGAGAATTTTTTAGATATT
GCAAAACGTATCGTTGACTTAGGTTCTGAGATTAAAGATTTAAGAGAAATGCGTCAATCATTACTTCGTAATAGAGATAT
TATATCTTGTTGGGGATATTTTTCTGTTGATTTAGTCAATAAATTAAGGGGATGTAATATTCATGTGCAATTTTTTAAGT
CTGGAATGTCTGAATATAAAAAATTGTTGTTATTTTCGCAGGTTAAAGTTGCTCTTATTAATAATTATAAAGGTACAGCC
TATTTTGTAGCTATTAATGACTCTAAACAGAATATAGATGTAGCTGAAGAATATGAATTTGAATTTGATCTAGATTCTAT
TGAAACCAAGTTAAAAATGATTGATGAGGTTTTAGAGCAAAAATTAACTCAGTTGTCAGTTTTAAATAAATATAGAAATA
TTTTAAAAGATGCAATAAAAGAGTATGAACAAATTATTGAATTTGAACAGGTTATGGCTGATATGAATGTGGAGTGTGAT
GAGTTTGTATATATTACAGGATTTATTCCTGAAGATAAGCAAAAATATCTTCAAAATGCGACTCTTAATGGTAAGTTTGT
GGTGCAATTTGCGGAGCCAGATGATAATGATTTTATTCCTACTTATGTAAAAAGAAAAGGAATTGCTAAGCTTGCTAAAC
CTATTTTCGATGTTTTAGATACAATTCCTGGATATAAAGAGAGAGATGTTAGTTGTGTTTTTATGTTGTTTTTCTTTGTG
TTTTTTGGAATGATAATTGGTGATGCAGCTTATGGTGTTATATTTTTGTTAATAGGCATTATTATTAGTTTGATTAGTGT
TTTAAAAAATAAACCATTAACTTCTGCTCATGCTTTAATATTTTATTTAAGTACGTCAGCAATAATATATGGTTCTATGA
CTGGTACTTGGTTTGGTAGTGGTCATTTTGTTCTTGATTTATTTCCTATTTTGAAATCTCTTAAGGTTGAGTATTTGACA
GGAAATAATGGTATGCAAAATGTTATGTTTATATGTTTTACAATAGGGGTTTTACAGCTGTCTTTGGCTCATGTATGGAA
TTTTGTTCAAAAAGTGAAAGAAAAGCCACATATACATGCAATTGCTCAAATTGGTTGGCTTGTTTTAATGCCTGGGCTTT
ATTATTTTGTTCTTAATTTAATACTTGGAAGTGATAATTTTCCTATGCATAGTATGATTCTTAATATGATATATTTTGGA
GTTATGCTTATTTTTGTTTTTGACAAACAGGATGGTTCAAACTTTTTTGTGTGTGTGTTAAAAAGTTTTGGAGGACTTAT
AGAGCAATTTTTAGCTACTGTTTCAGGATTTGCAGATATAATATCTTATATTAGGCTTTTTGCTGTTGGACTTGCAGGAC
TTGCAATTTCTGATAGTTTTAATAGCATGTCAGTGTCTTTATTAAAATCATCTAATATTGGTCTTATAATAGGAGGTGTT
ATTGTGATACTTTTTGGACACATTTTAAATATAATGTTATCTTTATTATCTGTTGTTGTTCATGGAGTAAGACTTAATAT
GCTTGAGTTTTCAAATCATTTGGGTCAAGAATGGAATGGATATTCTTATAGACCTTTTAAAAAAATTAAAGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATATAAAAAAGATTAATGTTTATCTTGGAGATCAACAGACTGCAGCTGTTGTAAGAGGTAAAATGGCGAAAGCCAGCTT
AATTAAAAATAGATGAGGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAGGAGAGAATAAAATTATGGATATAGGTTTAGTAGGAGTTAATTCAGCTTTAACAGTTTCTGCGATAGGTTCAGCTT
TGGGAATGGGAGCTGCCGGG

Product: V-type ATP synthase subunit I

Products: ADP; phosphate; H+

Alternate protein names: V-ATPase subunit I [H]

Number of amino acids: Translated: 611; Mature: 611

Protein sequence:

>611_residues
MLMIVKMKKVLLLTLLKYKRDSLEILRELGVVHINFCNKVSESLQKVIEERSILNHALSLLGDDSEVQILSSSNENFLDI
AKRIVDLGSEIKDLREMRQSLLRNRDIISCWGYFSVDLVNKLRGCNIHVQFFKSGMSEYKKLLLFSQVKVALINNYKGTA
YFVAINDSKQNIDVAEEYEFEFDLDSIETKLKMIDEVLEQKLTQLSVLNKYRNILKDAIKEYEQIIEFEQVMADMNVECD
EFVYITGFIPEDKQKYLQNATLNGKFVVQFAEPDDNDFIPTYVKRKGIAKLAKPIFDVLDTIPGYKERDVSCVFMLFFFV
FFGMIIGDAAYGVIFLLIGIIISLISVLKNKPLTSAHALIFYLSTSAIIYGSMTGTWFGSGHFVLDLFPILKSLKVEYLT
GNNGMQNVMFICFTIGVLQLSLAHVWNFVQKVKEKPHIHAIAQIGWLVLMPGLYYFVLNLILGSDNFPMHSMILNMIYFG
VMLIFVFDKQDGSNFFVCVLKSFGGLIEQFLATVSGFADIISYIRLFAVGLAGLAISDSFNSMSVSLLKSSNIGLIIGGV
IVILFGHILNIMLSLLSVVVHGVRLNMLEFSNHLGQEWNGYSYRPFKKIKD

Sequences:

>Translated_611_residues
MLMIVKMKKVLLLTLLKYKRDSLEILRELGVVHINFCNKVSESLQKVIEERSILNHALSLLGDDSEVQILSSSNENFLDI
AKRIVDLGSEIKDLREMRQSLLRNRDIISCWGYFSVDLVNKLRGCNIHVQFFKSGMSEYKKLLLFSQVKVALINNYKGTA
YFVAINDSKQNIDVAEEYEFEFDLDSIETKLKMIDEVLEQKLTQLSVLNKYRNILKDAIKEYEQIIEFEQVMADMNVECD
EFVYITGFIPEDKQKYLQNATLNGKFVVQFAEPDDNDFIPTYVKRKGIAKLAKPIFDVLDTIPGYKERDVSCVFMLFFFV
FFGMIIGDAAYGVIFLLIGIIISLISVLKNKPLTSAHALIFYLSTSAIIYGSMTGTWFGSGHFVLDLFPILKSLKVEYLT
GNNGMQNVMFICFTIGVLQLSLAHVWNFVQKVKEKPHIHAIAQIGWLVLMPGLYYFVLNLILGSDNFPMHSMILNMIYFG
VMLIFVFDKQDGSNFFVCVLKSFGGLIEQFLATVSGFADIISYIRLFAVGLAGLAISDSFNSMSVSLLKSSNIGLIIGGV
IVILFGHILNIMLSLLSVVVHGVRLNMLEFSNHLGQEWNGYSYRPFKKIKD
>Mature_611_residues
MLMIVKMKKVLLLTLLKYKRDSLEILRELGVVHINFCNKVSESLQKVIEERSILNHALSLLGDDSEVQILSSSNENFLDI
AKRIVDLGSEIKDLREMRQSLLRNRDIISCWGYFSVDLVNKLRGCNIHVQFFKSGMSEYKKLLLFSQVKVALINNYKGTA
YFVAINDSKQNIDVAEEYEFEFDLDSIETKLKMIDEVLEQKLTQLSVLNKYRNILKDAIKEYEQIIEFEQVMADMNVECD
EFVYITGFIPEDKQKYLQNATLNGKFVVQFAEPDDNDFIPTYVKRKGIAKLAKPIFDVLDTIPGYKERDVSCVFMLFFFV
FFGMIIGDAAYGVIFLLIGIIISLISVLKNKPLTSAHALIFYLSTSAIIYGSMTGTWFGSGHFVLDLFPILKSLKVEYLT
GNNGMQNVMFICFTIGVLQLSLAHVWNFVQKVKEKPHIHAIAQIGWLVLMPGLYYFVLNLILGSDNFPMHSMILNMIYFG
VMLIFVFDKQDGSNFFVCVLKSFGGLIEQFLATVSGFADIISYIRLFAVGLAGLAISDSFNSMSVSLLKSSNIGLIIGGV
IVILFGHILNIMLSLLSVVVHGVRLNMLEFSNHLGQEWNGYSYRPFKKIKD

Specific function: Produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane [H]

COG id: COG1269

COG function: function code C; Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the V-ATPase 116 kDa subunit family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002490 [H]

Pfam domain/function: PF01496 V_ATPase_I [H]

EC number: 3.6.3.14

Molecular weight: Translated: 69416; Mature: 69416

Theoretical pI: Translated: 6.79; Mature: 6.79

Prosite motif: PS00639 THIOL_PROTEASE_HIS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLMIVKMKKVLLLTLLKYKRDSLEILRELGVVHINFCNKVSESLQKVIEERSILNHALSL
CEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGDDSEVQILSSSNENFLDIAKRIVDLGSEIKDLREMRQSLLRNRDIISCWGYFSVDLVN
HCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHH
KLRGCNIHVQFFKSGMSEYKKLLLFSQVKVALINNYKGTAYFVAINDSKQNIDVAEEYEF
HHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCC
EFDLDSIETKLKMIDEVLEQKLTQLSVLNKYRNILKDAIKEYEQIIEFEQVMADMNVECD
EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
EFVYITGFIPEDKQKYLQNATLNGKFVVQFAEPDDNDFIPTYVKRKGIAKLAKPIFDVLD
CEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIPGYKERDVSCVFMLFFFVFFGMIIGDAAYGVIFLLIGIIISLISVLKNKPLTSAHALI
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
FYLSTSAIIYGSMTGTWFGSGHFVLDLFPILKSLKVEYLTGNNGMQNVMFICFTIGVLQL
HEEECCCEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SLAHVWNFVQKVKEKPHIHAIAQIGWLVLMPGLYYFVLNLILGSDNFPMHSMILNMIYFG
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
VMLIFVFDKQDGSNFFVCVLKSFGGLIEQFLATVSGFADIISYIRLFAVGLAGLAISDSF
HHHHHEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC
NSMSVSLLKSSNIGLIIGGVIVILFGHILNIMLSLLSVVVHGVRLNMLEFSNHLGQEWNG
CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
YSYRPFKKIKD
CCCCCHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MLMIVKMKKVLLLTLLKYKRDSLEILRELGVVHINFCNKVSESLQKVIEERSILNHALSL
CEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGDDSEVQILSSSNENFLDIAKRIVDLGSEIKDLREMRQSLLRNRDIISCWGYFSVDLVN
HCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHH
KLRGCNIHVQFFKSGMSEYKKLLLFSQVKVALINNYKGTAYFVAINDSKQNIDVAEEYEF
HHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCC
EFDLDSIETKLKMIDEVLEQKLTQLSVLNKYRNILKDAIKEYEQIIEFEQVMADMNVECD
EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
EFVYITGFIPEDKQKYLQNATLNGKFVVQFAEPDDNDFIPTYVKRKGIAKLAKPIFDVLD
CEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIPGYKERDVSCVFMLFFFVFFGMIIGDAAYGVIFLLIGIIISLISVLKNKPLTSAHALI
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
FYLSTSAIIYGSMTGTWFGSGHFVLDLFPILKSLKVEYLTGNNGMQNVMFICFTIGVLQL
HEEECCCEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SLAHVWNFVQKVKEKPHIHAIAQIGWLVLMPGLYYFVLNLILGSDNFPMHSMILNMIYFG
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
VMLIFVFDKQDGSNFFVCVLKSFGGLIEQFLATVSGFADIISYIRLFAVGLAGLAISDSF
HHHHHEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC
NSMSVSLLKSSNIGLIIGGVIVILFGHILNIMLSLLSVVVHGVRLNMLEFSNHLGQEWNG
CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
YSYRPFKKIKD
CCCCCHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: ATP; H2O; H+

Specific reaction: ATP + H2O + H+(in) = ADP + phosphate + H+(out)

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9403685 [H]