| Definition | Candidatus Phytoplasma australiense, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010544 |
| Length | 879,959 |
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The map label for this gene is 197294457
Identifier: 197294457
GI number: 197294457
Start: 390537
End: 394031
Strand: Direct
Name: 197294457
Synonym: PAa_0382
Alternate gene names: NA
Gene position: 390537-394031 (Clockwise)
Preceding gene: 197294456
Following gene: 197294458
Centisome position: 44.38
GC content: 28.15
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGCAATTTTTTTGCATTACCAGATTAGATTATGATACAATGATGATAAGTTATAAAAATAAAAAAGGAAGTTAATTATAG GATGGAGTTATTTAAAGTAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1164; Mature: 1163
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_1164_residues MAKKIIKTKKMKQKQPIKKTIKQVKTKIPTKKTKKTITIPKKVISKNNKIKKPSKTIIKKNLQPTKIVVETKKDNCFVKL IKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVVDTCWQFIKHICHNLDDKTKKALENVGIDPKYSAIASKVLG LVGGCLLAATCCLIPGIGTFLGGAVLISTITYVGTITLTEKTNQEPPKNTSPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE TLETQKKKKTTKSTELNSETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDIQKQFEELLHHETVKNEQLLQERNYFEANL QAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKEN LEQKTKQLEEQKNLSDTEKQQLTKQIEDINTNLASKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEAKLEDKEKELAEQKNLSDAEK QQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTESDLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAE LEEETQKLKDQIAKNNENAKQLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKTKNRTDWGVRSS SKEIQFPRFWNDKPFTYKIVPKIDFYETGFTENATGYQAYRGEMNKNTIQGESIELSPDKYYCEPSINMRNIPYSTNGAN LIFSEPTSQTEPPQNLIKLNEAKENLKNTSQELANYGTNLKNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKTLKNEMQK LEIKEQGFRSEIDTLKLENKNLKEKYTNDLTKIKQELDVSKTENKQLEKEMQEIQAELIKNGNADDALVKQLNHKEAQIK ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLQETIQEQAEQIIKLTAEIENNIEIFKQQAMKIQQLEGAISGLEDASGAMG GNNKELLHEINKLKAQLKAEQEAHVATKKRLEEEIVELNDDKLKLSNYVKLLKTKKNNWMEDVENVGAAINIGVSTKAGV MVGATLGSAAGPIGTFLGGAAGGVISAAVAVASKWDVVKTWFGR >Mature_1163_residues AKKIIKTKKMKQKQPIKKTIKQVKTKIPTKKTKKTITIPKKVISKNNKIKKPSKTIIKKNLQPTKIVVETKKDNCFVKLI KSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVVDTCWQFIKHICHNLDDKTKKALENVGIDPKYSAIASKVLGL VGGCLLAATCCLIPGIGTFLGGAVLISTITYVGTITLTEKTNQEPPKNTSPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSET LETQKKKKTTKSTELNSETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDIQKQFEELLHHETVKNEQLLQERNYFEANLQ AQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKENL EQKTKQLEEQKNLSDTEKQQLTKQIEDINTNLASKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQE LNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEAKLEDKEKELAEQKNLSDAEKQ QLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTESDLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAEL EEETQKLKDQIAKNNENAKQLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKTKNRTDWGVRSSS KEIQFPRFWNDKPFTYKIVPKIDFYETGFTENATGYQAYRGEMNKNTIQGESIELSPDKYYCEPSINMRNIPYSTNGANL IFSEPTSQTEPPQNLIKLNEAKENLKNTSQELANYGTNLKNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKTLKNEMQKL EIKEQGFRSEIDTLKLENKNLKEKYTNDLTKIKQELDVSKTENKQLEKEMQEIQAELIKNGNADDALVKQLNHKEAQIKE LKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLQETIQEQAEQIIKLTAEIENNIEIFKQQAMKIQQLEGAISGLEDASGAMGG NNKELLHEINKLKAQLKAEQEAHVATKKRLEEEIVELNDDKLKLSNYVKLLKTKKNNWMEDVENVGAAINIGVSTKAGVM VGATLGSAAGPIGTFLGGAAGGVISAAVAVASKWDVVKTWFGR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 132978; Mature: 132847
Theoretical pI: Translated: 8.60; Mature: 8.60
Prosite motif: PS50010 DH_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAKKIIKTKKMKQKQPIKKTIKQVKTKIPTKKTKKTITIPKKVISKNNKIKKPSKTIIKK CCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCEECCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHC NLQPTKIVVETKKDNCFVKLIKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVV CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH DTCWQFIKHICHNLDDKTKKALENVGIDPKYSAIASKVLGLVGGCLLAATCCLIPGIGTF HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH LGGAVLISTITYVGTITLTEKTNQEPPKNTSPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE HHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCCCCHH TLETQKKKKTTKSTELNSETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDIQKQFEELLH HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH HETVKNEQLLQERNYFEANLQAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIE HHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH DINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKENLEQKTKQLEEQKNLSDTEKQ HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH QLTKQIEDINTNLASKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHH KLEDKEKELAEQKNLSDAEKQQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTES CCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHH DLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAELEEETQKLKDQIAKNNENAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH QLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKTKNRTDWGVRSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCC SKEIQFPRFWNDKPFTYKIVPKIDFYETGFTENATGYQAYRGEMNKNTIQGESIELSPDK CCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCC YYCEPSINMRNIPYSTNGANLIFSEPTSQTEPPQNLIKLNEAKENLKNTSQELANYGTNL EEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC KNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKTLKNEMQKLEIKEQGFRSEIDTLKLENK CCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NLKEKYTNDLTKIKQELDVSKTENKQLEKEMQEIQAELIKNGNADDALVKQLNHKEAQIK CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLQETIQEQAEQIIKLTAEIENNIEIFKQQAM HHHCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIQQLEGAISGLEDASGAMGGNNKELLHEINKLKAQLKAEQEAHVATKKRLEEEIVELND HHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DKLKLSNYVKLLKTKKNNWMEDVENVGAAINIGVSTKAGVMVGATLGSAAGPIGTFLGGA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEECHHCCCCCHHHHHHHHH AGGVISAAVAVASKWDVVKTWFGR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure AKKIIKTKKMKQKQPIKKTIKQVKTKIPTKKTKKTITIPKKVISKNNKIKKPSKTIIKK CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCEECCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHC NLQPTKIVVETKKDNCFVKLIKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVV CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH DTCWQFIKHICHNLDDKTKKALENVGIDPKYSAIASKVLGLVGGCLLAATCCLIPGIGTF HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH LGGAVLISTITYVGTITLTEKTNQEPPKNTSPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE HHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCCCCHH TLETQKKKKTTKSTELNSETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDIQKQFEELLH HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH HETVKNEQLLQERNYFEANLQAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIE HHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH DINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKENLEQKTKQLEEQKNLSDTEKQ HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH QLTKQIEDINTNLASKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHH KLEDKEKELAEQKNLSDAEKQQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTES CCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHH DLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAELEEETQKLKDQIAKNNENAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH QLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKTKNRTDWGVRSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCC SKEIQFPRFWNDKPFTYKIVPKIDFYETGFTENATGYQAYRGEMNKNTIQGESIELSPDK CCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCC YYCEPSINMRNIPYSTNGANLIFSEPTSQTEPPQNLIKLNEAKENLKNTSQELANYGTNL EEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC KNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKTLKNEMQKLEIKEQGFRSEIDTLKLENK CCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NLKEKYTNDLTKIKQELDVSKTENKQLEKEMQEIQAELIKNGNADDALVKQLNHKEAQIK CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLQETIQEQAEQIIKLTAEIENNIEIFKQQAM HHHCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIQQLEGAISGLEDASGAMGGNNKELLHEINKLKAQLKAEQEAHVATKKRLEEEIVELND HHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DKLKLSNYVKLLKTKKNNWMEDVENVGAAINIGVSTKAGVMVGATLGSAAGPIGTFLGGA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEECHHCCCCCHHHHHHHHH AGGVISAAVAVASKWDVVKTWFGR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA