Definition Candidatus Phytoplasma australiense, complete genome.
Accession NC_010544
Length 879,959

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The map label for this gene is 197294315

Identifier: 197294315

GI number: 197294315

Start: 215350

End: 216015

Strand: Reverse

Name: 197294315

Synonym: PAa_0178

Alternate gene names: NA

Gene position: 216015-215350 (Counterclockwise)

Preceding gene: 197294319

Following gene: 197294314

Centisome position: 24.55

GC content: 25.38

Gene sequence:

>666_bases
ATGTTCAAAAATAATAATACAAAAACTATTGTTTTCAATTCTCCTTTGCAAAAATACGTTATCGCTTCGGTTTTATTTGG
CTTAACTATTGTTTTAGAATTTATAGGAAGCGCCAAATTTAGCAGTGGAATTGGCTCCCTGTTTAAAATGGCACTTGTAC
CTTTAATTTTAATTGGTTTTTTGTTAGGATTAAAATACAGCCTCATTTTTGCTACGTTATATGCTTGTTTTCATATTTTA
AAAGCGTTTTTTTATAGCAATTTAATGGGCTATATGGAAATCAACGGTTTAACGTTGCCTGAAAAATTGAGTGTCTTGCT
ATTAGATTATTTTTTGGTAGATATGGCTTATGGTTTATCAGGATTATTATATCTACCTAATTTTTCCTATTTTAATAAAT
ATAAAAAAATTTGGAGTAATTTATTCATAATTTTTTCTTTGGTCTTGTTTTTCAAATTTATAGCTTCGCGTTTTATTTGG
TTAAAAATTTTGTTAGAAACAATCCAAAATAACAACGATTATTCTTATCCTCCTGCTTTATTAAAATATCCAAATATTTT
ATGTTTATTTTATAATATTATTCCTGTCTTAAATAATTTTTTAATCACGGGGTTTATATTCTCTTTTTTAAATCCTAGGC
TCAAAATGTATTTACAAAATAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTAAAATAAAAACTAATCAAATCAAAAAATGGAAAATAAATATGGCACAATGACATTTTTTATAAAAAGAATGTTAAT
TTTTTTAGAAAAACAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATATATAAATAAATTAATATGGATACATCATCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAATTATGGTACAACAAAATATTTATAAT
AAAAACAAAATTTTAAGACA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 221; Mature: 221

Protein sequence:

>221_residues
MFKNNNTKTIVFNSPLQKYVIASVLFGLTIVLEFIGSAKFSSGIGSLFKMALVPLILIGFLLGLKYSLIFATLYACFHIL
KAFFYSNLMGYMEINGLTLPEKLSVLLLDYFLVDMAYGLSGLLYLPNFSYFNKYKKIWSNLFIIFSLVLFFKFIASRFIW
LKILLETIQNNNDYSYPPALLKYPNILCLFYNIIPVLNNFLITGFIFSFLNPRLKMYLQNK

Sequences:

>Translated_221_residues
MFKNNNTKTIVFNSPLQKYVIASVLFGLTIVLEFIGSAKFSSGIGSLFKMALVPLILIGFLLGLKYSLIFATLYACFHIL
KAFFYSNLMGYMEINGLTLPEKLSVLLLDYFLVDMAYGLSGLLYLPNFSYFNKYKKIWSNLFIIFSLVLFFKFIASRFIW
LKILLETIQNNNDYSYPPALLKYPNILCLFYNIIPVLNNFLITGFIFSFLNPRLKMYLQNK
>Mature_221_residues
MFKNNNTKTIVFNSPLQKYVIASVLFGLTIVLEFIGSAKFSSGIGSLFKMALVPLILIGFLLGLKYSLIFATLYACFHIL
KAFFYSNLMGYMEINGLTLPEKLSVLLLDYFLVDMAYGLSGLLYLPNFSYFNKYKKIWSNLFIIFSLVLFFKFIASRFIW
LKILLETIQNNNDYSYPPALLKYPNILCLFYNIIPVLNNFLITGFIFSFLNPRLKMYLQNK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 25575; Mature: 25575

Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFKNNNTKTIVFNSPLQKYVIASVLFGLTIVLEFIGSAKFSSGIGSLFKMALVPLILIGF
CCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLGLKYSLIFATLYACFHILKAFFYSNLMGYMEINGLTLPEKLSVLLLDYFLVDMAYGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLLYLPNFSYFNKYKKIWSNLFIIFSLVLFFKFIASRFIWLKILLETIQNNNDYSYPPAL
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
LKYPNILCLFYNIIPVLNNFLITGFIFSFLNPRLKMYLQNK
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MFKNNNTKTIVFNSPLQKYVIASVLFGLTIVLEFIGSAKFSSGIGSLFKMALVPLILIGF
CCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLGLKYSLIFATLYACFHILKAFFYSNLMGYMEINGLTLPEKLSVLLLDYFLVDMAYGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLLYLPNFSYFNKYKKIWSNLFIIFSLVLFFKFIASRFIWLKILLETIQNNNDYSYPPAL
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
LKYPNILCLFYNIIPVLNNFLITGFIFSFLNPRLKMYLQNK
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA