| Definition | Candidatus Phytoplasma australiense, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010544 |
| Length | 879,959 |
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The map label for this gene is 197294315
Identifier: 197294315
GI number: 197294315
Start: 215350
End: 216015
Strand: Reverse
Name: 197294315
Synonym: PAa_0178
Alternate gene names: NA
Gene position: 216015-215350 (Counterclockwise)
Preceding gene: 197294319
Following gene: 197294314
Centisome position: 24.55
GC content: 25.38
Gene sequence:
>666_bases ATGTTCAAAAATAATAATACAAAAACTATTGTTTTCAATTCTCCTTTGCAAAAATACGTTATCGCTTCGGTTTTATTTGG CTTAACTATTGTTTTAGAATTTATAGGAAGCGCCAAATTTAGCAGTGGAATTGGCTCCCTGTTTAAAATGGCACTTGTAC CTTTAATTTTAATTGGTTTTTTGTTAGGATTAAAATACAGCCTCATTTTTGCTACGTTATATGCTTGTTTTCATATTTTA AAAGCGTTTTTTTATAGCAATTTAATGGGCTATATGGAAATCAACGGTTTAACGTTGCCTGAAAAATTGAGTGTCTTGCT ATTAGATTATTTTTTGGTAGATATGGCTTATGGTTTATCAGGATTATTATATCTACCTAATTTTTCCTATTTTAATAAAT ATAAAAAAATTTGGAGTAATTTATTCATAATTTTTTCTTTGGTCTTGTTTTTCAAATTTATAGCTTCGCGTTTTATTTGG TTAAAAATTTTGTTAGAAACAATCCAAAATAACAACGATTATTCTTATCCTCCTGCTTTATTAAAATATCCAAATATTTT ATGTTTATTTTATAATATTATTCCTGTCTTAAATAATTTTTTAATCACGGGGTTTATATTCTCTTTTTTAAATCCTAGGC TCAAAATGTATTTACAAAATAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATTAAAATAAAAACTAATCAAATCAAAAAATGGAAAATAAATATGGCACAATGACATTTTTTATAAAAAGAATGTTAAT TTTTTTAGAAAAACAAAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAATATATAAATAAATTAATATGGATACATCATCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAATTATGGTACAACAAAATATTTATAAT AAAAACAAAATTTTAAGACA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 221; Mature: 221
Protein sequence:
>221_residues MFKNNNTKTIVFNSPLQKYVIASVLFGLTIVLEFIGSAKFSSGIGSLFKMALVPLILIGFLLGLKYSLIFATLYACFHIL KAFFYSNLMGYMEINGLTLPEKLSVLLLDYFLVDMAYGLSGLLYLPNFSYFNKYKKIWSNLFIIFSLVLFFKFIASRFIW LKILLETIQNNNDYSYPPALLKYPNILCLFYNIIPVLNNFLITGFIFSFLNPRLKMYLQNK
Sequences:
>Translated_221_residues MFKNNNTKTIVFNSPLQKYVIASVLFGLTIVLEFIGSAKFSSGIGSLFKMALVPLILIGFLLGLKYSLIFATLYACFHIL KAFFYSNLMGYMEINGLTLPEKLSVLLLDYFLVDMAYGLSGLLYLPNFSYFNKYKKIWSNLFIIFSLVLFFKFIASRFIW LKILLETIQNNNDYSYPPALLKYPNILCLFYNIIPVLNNFLITGFIFSFLNPRLKMYLQNK >Mature_221_residues MFKNNNTKTIVFNSPLQKYVIASVLFGLTIVLEFIGSAKFSSGIGSLFKMALVPLILIGFLLGLKYSLIFATLYACFHIL KAFFYSNLMGYMEINGLTLPEKLSVLLLDYFLVDMAYGLSGLLYLPNFSYFNKYKKIWSNLFIIFSLVLFFKFIASRFIW LKILLETIQNNNDYSYPPALLKYPNILCLFYNIIPVLNNFLITGFIFSFLNPRLKMYLQNK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 25575; Mature: 25575
Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFKNNNTKTIVFNSPLQKYVIASVLFGLTIVLEFIGSAKFSSGIGSLFKMALVPLILIGF CCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLGLKYSLIFATLYACFHILKAFFYSNLMGYMEINGLTLPEKLSVLLLDYFLVDMAYGLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLLYLPNFSYFNKYKKIWSNLFIIFSLVLFFKFIASRFIWLKILLETIQNNNDYSYPPAL HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH LKYPNILCLFYNIIPVLNNFLITGFIFSFLNPRLKMYLQNK HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MFKNNNTKTIVFNSPLQKYVIASVLFGLTIVLEFIGSAKFSSGIGSLFKMALVPLILIGF CCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLGLKYSLIFATLYACFHILKAFFYSNLMGYMEINGLTLPEKLSVLLLDYFLVDMAYGLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLLYLPNFSYFNKYKKIWSNLFIIFSLVLFFKFIASRFIWLKILLETIQNNNDYSYPPAL HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH LKYPNILCLFYNIIPVLNNFLITGFIFSFLNPRLKMYLQNK HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA