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The map label for this gene is norM

Identifier: 197294247

GI number: 197294247

Start: 118738

End: 120204

Strand: Direct

Name: norM

Synonym: PAa_0110

Alternate gene names: NA

Gene position: 118738-120204 (Clockwise)

Preceding gene: 197294246

Following gene: 197294248

Centisome position: 13.49

GC content: 25.43

Gene sequence:

>1467_bases
ATGGTTAAAACGGAAGGAATGAATAAAATTTTTGCCGCTGAAAAAAGAAATAGAAAATTTTTGTTAGAAGGAAACTTGTG
GAAAGTAATTTTTTATTTTACTTTCCCTATTGTTATTTATTGGGTTTTCCAAAGTATCTCTGATTCCATTGATCTTTTAA
TTTTACAAAGAAACCAATTTACTTCACCGAAAATAACTTTTATCAGCCGAGTTCATTTATTAAAAGGTGTTCTTATTCCT
TTTGGTATATCTATCGCTACAGGCGGCGTTATTTTAGTTGGCCGTGCTTATGGAAAAAATAATTTAGATAAAATGCAACT
TTATTTAACTAAAACTTTTATTTTATCAATTTTAATAGGCTTACTTATTTCATTTTTGTGTATTTTCGTGTTTCAAACTC
CTATTTTAGAAAAAATTTTACAAATTAGTTCAGAAAATAAAGTAAATAGCGATCAAAGGCAATATTATAATCTTATTATA
ATGTCTTTTGTTTGTGTTGTGATTAATACAGTTTTTTTAGCCTTAGAGAGAGCCAAGGGCAACAATAAAATATCTTTGAT
TTTAAATTTATTAAATGTTTTTATCAAAATCATTTTATCTTTTGTTTTGTTTTATTCTTTCGACAAACAATCAAGATCTT
TGGCGTGGGCAACTTTTATTTCTAACGCTTTAGTTACTTTATTTGCCCTTTGGTTTTTATTTTTTGATCGCAATAATCCT
TTTAAAATTATTTTAAAGAAGTTTCGCTTTGATAAAGTTTTTTTGAAAAAAATCGCTAAACTAGCAATACCTGTTTGTGC
AAGTATTAGTGCTTATAATTTGGGAAAACTAATTGTAAGCATTATTGTGAGAGATTTTTATAATGATGGACCTGATCATC
TCGATAGTTCTCAAATTGGAGCTAATTTAGTTTTAGCAGTTACTATTAATAATATTTTTTATAATTTATTAAATTCTTTT
TCAGACTCCCAAAACGTTATTATTTCTCAAAATTTAGGACATAATAATCTTAATCGAGTTTTTGAAGCTTTTAAAAAAAT
TATTTTTTGTATGTGTGTTCTGGCAACGATAGGTACTTTAATTAATCTTTTTGGTTATAAATTATTTTTACCTTTGTTTC
ATAACAAAACTTGGGAAGAAATTTCTATTTTCGAAAAAGCAGCCTTTCGTAAATTATTATTTTTTGAAACAACTAGTTTA
TGGTTATCTTGTGGCTCTATTATTTTATTTAATTTTTTACTATCTTTTAAAAAAGTTGCTCCTTCTTTTTATATGAATTT
TTTAAGAAGTTTAATACGTATCTTTTTTATTACCTTATTTTCTCATAATTGCTTAAATTGGGGCGTTCTCGGCGTTGGTT
TAAGTATTTTTTTAAGCAATTTAATTTGTTTTATTATTACTTTTGGGATTTTTATCACTTTTTATCTTAAATTAAAACGA
GACAAAGTATTTGAACAAGACTTGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTCAAAATGCTTGCATTTTTTGATAAAATATTTATTGTCCACCCGTTTTTGTTTACAAAAATTGTTAACCACAAAAAA
TCATTAGATGGAGGTTTAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATACTTAAAACAAATAATTTAAAAAAGAGGCCTGCAAAAGTCTCTTTTTTAAAGTTTTTCAAAACTTTTAATTTTTTT
CTTCAACCCCCTCAAAACAA

Product: Na+ driven multidrug efflux pump

Products: NA

Alternate protein names: MATE Efflux Family Protein; Na+ Driven Multidrug Efflux Pump; Multi Anti Extrusion Protein MatE

Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488

Protein sequence:

>488_residues
MVKTEGMNKIFAAEKRNRKFLLEGNLWKVIFYFTFPIVIYWVFQSISDSIDLLILQRNQFTSPKITFISRVHLLKGVLIP
FGISIATGGVILVGRAYGKNNLDKMQLYLTKTFILSILIGLLISFLCIFVFQTPILEKILQISSENKVNSDQRQYYNLII
MSFVCVVINTVFLALERAKGNNKISLILNLLNVFIKIILSFVLFYSFDKQSRSLAWATFISNALVTLFALWFLFFDRNNP
FKIILKKFRFDKVFLKKIAKLAIPVCASISAYNLGKLIVSIIVRDFYNDGPDHLDSSQIGANLVLAVTINNIFYNLLNSF
SDSQNVIISQNLGHNNLNRVFEAFKKIIFCMCVLATIGTLINLFGYKLFLPLFHNKTWEEISIFEKAAFRKLLFFETTSL
WLSCGSIILFNFLLSFKKVAPSFYMNFLRSLIRIFFITLFSHNCLNWGVLGVGLSIFLSNLICFIITFGIFITFYLKLKR
DKVFEQDL

Sequences:

>Translated_488_residues
MVKTEGMNKIFAAEKRNRKFLLEGNLWKVIFYFTFPIVIYWVFQSISDSIDLLILQRNQFTSPKITFISRVHLLKGVLIP
FGISIATGGVILVGRAYGKNNLDKMQLYLTKTFILSILIGLLISFLCIFVFQTPILEKILQISSENKVNSDQRQYYNLII
MSFVCVVINTVFLALERAKGNNKISLILNLLNVFIKIILSFVLFYSFDKQSRSLAWATFISNALVTLFALWFLFFDRNNP
FKIILKKFRFDKVFLKKIAKLAIPVCASISAYNLGKLIVSIIVRDFYNDGPDHLDSSQIGANLVLAVTINNIFYNLLNSF
SDSQNVIISQNLGHNNLNRVFEAFKKIIFCMCVLATIGTLINLFGYKLFLPLFHNKTWEEISIFEKAAFRKLLFFETTSL
WLSCGSIILFNFLLSFKKVAPSFYMNFLRSLIRIFFITLFSHNCLNWGVLGVGLSIFLSNLICFIITFGIFITFYLKLKR
DKVFEQDL
>Mature_488_residues
MVKTEGMNKIFAAEKRNRKFLLEGNLWKVIFYFTFPIVIYWVFQSISDSIDLLILQRNQFTSPKITFISRVHLLKGVLIP
FGISIATGGVILVGRAYGKNNLDKMQLYLTKTFILSILIGLLISFLCIFVFQTPILEKILQISSENKVNSDQRQYYNLII
MSFVCVVINTVFLALERAKGNNKISLILNLLNVFIKIILSFVLFYSFDKQSRSLAWATFISNALVTLFALWFLFFDRNNP
FKIILKKFRFDKVFLKKIAKLAIPVCASISAYNLGKLIVSIIVRDFYNDGPDHLDSSQIGANLVLAVTINNIFYNLLNSF
SDSQNVIISQNLGHNNLNRVFEAFKKIIFCMCVLATIGTLINLFGYKLFLPLFHNKTWEEISIFEKAAFRKLLFFETTSL
WLSCGSIILFNFLLSFKKVAPSFYMNFLRSLIRIFFITLFSHNCLNWGVLGVGLSIFLSNLICFIITFGIFITFYLKLKR
DKVFEQDL

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56249; Mature: 56249

Theoretical pI: Translated: 10.28; Mature: 10.28

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVKTEGMNKIFAAEKRNRKFLLEGNLWKVIFYFTFPIVIYWVFQSISDSIDLLILQRNQF
CCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCC
TSPKITFISRVHLLKGVLIPFGISIATGGVILVGRAYGKNNLDKMQLYLTKTFILSILIG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLISFLCIFVFQTPILEKILQISSENKVNSDQRQYYNLIIMSFVCVVINTVFLALERAKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NNKISLILNLLNVFIKIILSFVLFYSFDKQSRSLAWATFISNALVTLFALWFLFFDRNNP
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
FKIILKKFRFDKVFLKKIAKLAIPVCASISAYNLGKLIVSIIVRDFYNDGPDHLDSSQIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
ANLVLAVTINNIFYNLLNSFSDSQNVIISQNLGHNNLNRVFEAFKKIIFCMCVLATIGTL
CCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INLFGYKLFLPLFHNKTWEEISIFEKAAFRKLLFFETTSLWLSCGSIILFNFLLSFKKVA
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PSFYMNFLRSLIRIFFITLFSHNCLNWGVLGVGLSIFLSNLICFIITFGIFITFYLKLKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DKVFEQDL
HHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MVKTEGMNKIFAAEKRNRKFLLEGNLWKVIFYFTFPIVIYWVFQSISDSIDLLILQRNQF
CCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCC
TSPKITFISRVHLLKGVLIPFGISIATGGVILVGRAYGKNNLDKMQLYLTKTFILSILIG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLISFLCIFVFQTPILEKILQISSENKVNSDQRQYYNLIIMSFVCVVINTVFLALERAKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NNKISLILNLLNVFIKIILSFVLFYSFDKQSRSLAWATFISNALVTLFALWFLFFDRNNP
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
FKIILKKFRFDKVFLKKIAKLAIPVCASISAYNLGKLIVSIIVRDFYNDGPDHLDSSQIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
ANLVLAVTINNIFYNLLNSFSDSQNVIISQNLGHNNLNRVFEAFKKIIFCMCVLATIGTL
CCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INLFGYKLFLPLFHNKTWEEISIFEKAAFRKLLFFETTSLWLSCGSIILFNFLLSFKKVA
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PSFYMNFLRSLIRIFFITLFSHNCLNWGVLGVGLSIFLSNLICFIITFGIFITFYLKLKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DKVFEQDL
HHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA