| Definition | Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011134 |
| Length | 2,024,171 |
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The map label for this gene is yfhO [H]
Identifier: 195979046
GI number: 195979046
Start: 2017748
End: 2020333
Strand: Direct
Name: yfhO [H]
Synonym: Sez_1958
Alternate gene names: 195979046
Gene position: 2017748-2020333 (Clockwise)
Preceding gene: 195979045
Following gene: 195979048
Centisome position: 99.68
GC content: 38.13
Gene sequence:
>2586_bases ATGACAAAACCTAAAGCATGGTATCTTGTTTATGACATTGCTAGCTTCCTCCTTCCCTTTTTGATAATGTTTTTTGTTCT TTTGTCAATGGGAATTTCATATGGCAGTGAGAAAACCATTTTAGCTAGTGATGGCTTTCATCAATATGTTATTTTTGCGC AAGCCCTAAGAAATATTCTTCATGGGGCTGATAGTATTTTTTACACCTTTACCAGTGGCCTAGGTGTAAACTTTTTTGCT CTGGCTAGCTATTATCTAGGCAGCCTTTTGTCTCCTCTTGTCTACTTTTTTAATCTGCAATCCATGCCAGATGCTATCTA TCTCTTGACACTTATTAAATTTGGTTTGATCGGGCTTGCCGCTTATTTCTCCTTTCATCGTATTTACCCTAAAATCAAAC CCTTTTTAGTCCTGACATTATCAGTCTCTTACTCCCTAATGAGCTTTCTGACAAGCCAGCTAGAGCTTAACAACTGGTTA GATGTTTTTATTCTTCTACCAATTGTCTTACTGGGGCTCTATCGGCTGATTACTCAAACCAAGCCCTTGCTTTATTATAG CTCACTTAGTCTTCTCTTTATCCAGCATTATTATTTTGGATATATGGTTGCTATCTTTATTTTTTTATTATTTCTAGTCA ACCTTATATCACTAGACACATGGAAAAGACGGTTAAGAGCCTGTTTAAGCTTTACATCAGTGTCAATCTTATCAGCCTTA ACAAGTGCTTTTATACTCATACCGGCCTATCTAGACCTAGCAGCCTACGGTGAAACACTCTCTCCAATCAATCAGATTAT CATTAAGCCTATAGGAGCCTTTGATTTATTAGCAAAGCTATCACTTGGTGCCTATGATACGACAAAGTTTAATGCGATTC CCATGATATTTATTGGTCTGTTGCCTTCATTGTTAAGTATCGTCTTTTTCACCTTAAAATCTATTAGCTGGCGCTTAAGA CTGGGCTATGGGCTGCTTTTAGGACTCATCATGGCTAGCTTTTATCTTCAGCCCTTAGATTTATTTTGGCAGGGCATGCA TGCACCCAATATGTTTTTGCACCGCTATTCGTGGTCATTTTCAATCATTATCATTATTTTAGCCTGCGAAGCCCTTTCTA GACAAAAAGACATTACTAACACTAGAATAATCTTTGCCTTTATATTATTAAGCTGCTTATTAACACTTCCTTATCTGACA ATGGATCAGTATAGCTTTTTACAGCCTAGCTTATTGATCTTAAGTCTTGCCTTTTTAGCGGCATATCTTATTTTATTGCT AAGCATGCTAAAAGCCTCTGTACCAATGCCATTTTTAATCTTTTTTACCCTACTGTTTAGCTGTTTAGAAACCAGTTTAA ATACCTACTATCAGCTTAATGGTATCCATCATGAATGGGTATTTCCATCACGTAAGGGCTATAGCAGAGCTTTACAGGAT GTTGACAAGCTTGTCAAGAAAGCAGCTACTAACAACGACCAGTTTTTCAGACTGGAGCAGCTCCTGCCACAAACAGGCAA CGACAGTATGAAATACAACTATAATGGCATTTCTCAATTTTCATCTATCCGAAATCGTCACTCCAGCTCCCTTCTGGATC GTCTAGGCTATCAGTCTGCTGGAACAAATTTAAACCTTCGCTATCAAAACAACACTCTCATCATGGATAGTCTTTTAGGG GTAAAATACAATCTTAGCTACCATCAGCTTCATAAATTTGGCTTTTCAAGGATAGCCTCCAGTCATCACACTACACTCTA TCAAAATCACTATAGCAGCAATCTAGCTATCTTAACAGATAACGTTTACAAAGATGTCAAGTTAACTGTCAACACACTTG ACAATCAAACCAAGCTGCTGAATCAGCTGAGTGGAAAAAGGCTCACCTATTTTCAGCTAGAGCCTTCTAAGCTAATATCA AATGCTCAGGCATTTAATGGGAGAATTTCAGGGAGGGCTGCTGAGAATACGTCAACAACCATTGTTCATTATCAGGTTAC TGTACCAGACCATAGGCAGCTCTACTTAAGCCTTCCAAATATTAGCTTTTCAAATCACAATACAACAGCTGTTAGGATCC GTATTGATGATCAGACCTACGAGTACACTACTGACAACGCTTTTTCATTCTTTGACTTAGGGTACTTTGAAAAAGGAAGA ACCTTAACCCTTGCTATTATGTTTCCGAAAAACAAAAATATTTCCTTTGCTACCCCACACTTCTACAGTCTAAATAGTGA CAACTATCTGGCAGCCATGAATGCGATTAACCAAAAAGAGGTTACTACTTACACCCGTAGCAATCAGGTCATCAGCCATT ACAAGGCCAAATCAGAAAGCTCTATGATTTTTACCCTTCCCTATGACAAAGGCTGGACAGCAAGACTAAATGGCCGACCA GTGGCTCTTAAAAAGGCTCAAGGTGGTTTTATTAGGATAGATGTTCCAAAAGGATCTGGTAAATTAGTACTCACCTTTGT TCCAAATGGCTTTACATTAGGCTTATTGCTCTCATTTATTGGTATCTTGCTTTACAGCTTCTTACATTACTACTTACTCA GGCAAACAGCCAAGCTAAAAGCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATATCATCATTAAAGTTATAGAGATGATCACTGATGACATCTGAGGGCTGGAAACTATTTCTAGCCCTTTTTTCAAAAA TATCATAGAAGGGCTTATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases ACAGCAATTTCCATATATAAGCAAAACGCTTGATTTTACAGCCCTTACAGGTATCAAAATCAAGCGTTTTTAGCTGGTCT ATTGGTTTAAGGATATTAAA
Product: ABC transporter permease protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 861; Mature: 860
Protein sequence:
>861_residues MTKPKAWYLVYDIASFLLPFLIMFFVLLSMGISYGSEKTILASDGFHQYVIFAQALRNILHGADSIFYTFTSGLGVNFFA LASYYLGSLLSPLVYFFNLQSMPDAIYLLTLIKFGLIGLAAYFSFHRIYPKIKPFLVLTLSVSYSLMSFLTSQLELNNWL DVFILLPIVLLGLYRLITQTKPLLYYSSLSLLFIQHYYFGYMVAIFIFLLFLVNLISLDTWKRRLRACLSFTSVSILSAL TSAFILIPAYLDLAAYGETLSPINQIIIKPIGAFDLLAKLSLGAYDTTKFNAIPMIFIGLLPSLLSIVFFTLKSISWRLR LGYGLLLGLIMASFYLQPLDLFWQGMHAPNMFLHRYSWSFSIIIIILACEALSRQKDITNTRIIFAFILLSCLLTLPYLT MDQYSFLQPSLLILSLAFLAAYLILLLSMLKASVPMPFLIFFTLLFSCLETSLNTYYQLNGIHHEWVFPSRKGYSRALQD VDKLVKKAATNNDQFFRLEQLLPQTGNDSMKYNYNGISQFSSIRNRHSSSLLDRLGYQSAGTNLNLRYQNNTLIMDSLLG VKYNLSYHQLHKFGFSRIASSHHTTLYQNHYSSNLAILTDNVYKDVKLTVNTLDNQTKLLNQLSGKRLTYFQLEPSKLIS NAQAFNGRISGRAAENTSTTIVHYQVTVPDHRQLYLSLPNISFSNHNTTAVRIRIDDQTYEYTTDNAFSFFDLGYFEKGR TLTLAIMFPKNKNISFATPHFYSLNSDNYLAAMNAINQKEVTTYTRSNQVISHYKAKSESSMIFTLPYDKGWTARLNGRP VALKKAQGGFIRIDVPKGSGKLVLTFVPNGFTLGLLLSFIGILLYSFLHYYLLRQTAKLKA
Sequences:
>Translated_861_residues MTKPKAWYLVYDIASFLLPFLIMFFVLLSMGISYGSEKTILASDGFHQYVIFAQALRNILHGADSIFYTFTSGLGVNFFA LASYYLGSLLSPLVYFFNLQSMPDAIYLLTLIKFGLIGLAAYFSFHRIYPKIKPFLVLTLSVSYSLMSFLTSQLELNNWL DVFILLPIVLLGLYRLITQTKPLLYYSSLSLLFIQHYYFGYMVAIFIFLLFLVNLISLDTWKRRLRACLSFTSVSILSAL TSAFILIPAYLDLAAYGETLSPINQIIIKPIGAFDLLAKLSLGAYDTTKFNAIPMIFIGLLPSLLSIVFFTLKSISWRLR LGYGLLLGLIMASFYLQPLDLFWQGMHAPNMFLHRYSWSFSIIIIILACEALSRQKDITNTRIIFAFILLSCLLTLPYLT MDQYSFLQPSLLILSLAFLAAYLILLLSMLKASVPMPFLIFFTLLFSCLETSLNTYYQLNGIHHEWVFPSRKGYSRALQD VDKLVKKAATNNDQFFRLEQLLPQTGNDSMKYNYNGISQFSSIRNRHSSSLLDRLGYQSAGTNLNLRYQNNTLIMDSLLG VKYNLSYHQLHKFGFSRIASSHHTTLYQNHYSSNLAILTDNVYKDVKLTVNTLDNQTKLLNQLSGKRLTYFQLEPSKLIS NAQAFNGRISGRAAENTSTTIVHYQVTVPDHRQLYLSLPNISFSNHNTTAVRIRIDDQTYEYTTDNAFSFFDLGYFEKGR TLTLAIMFPKNKNISFATPHFYSLNSDNYLAAMNAINQKEVTTYTRSNQVISHYKAKSESSMIFTLPYDKGWTARLNGRP VALKKAQGGFIRIDVPKGSGKLVLTFVPNGFTLGLLLSFIGILLYSFLHYYLLRQTAKLKA >Mature_860_residues TKPKAWYLVYDIASFLLPFLIMFFVLLSMGISYGSEKTILASDGFHQYVIFAQALRNILHGADSIFYTFTSGLGVNFFAL ASYYLGSLLSPLVYFFNLQSMPDAIYLLTLIKFGLIGLAAYFSFHRIYPKIKPFLVLTLSVSYSLMSFLTSQLELNNWLD VFILLPIVLLGLYRLITQTKPLLYYSSLSLLFIQHYYFGYMVAIFIFLLFLVNLISLDTWKRRLRACLSFTSVSILSALT SAFILIPAYLDLAAYGETLSPINQIIIKPIGAFDLLAKLSLGAYDTTKFNAIPMIFIGLLPSLLSIVFFTLKSISWRLRL GYGLLLGLIMASFYLQPLDLFWQGMHAPNMFLHRYSWSFSIIIIILACEALSRQKDITNTRIIFAFILLSCLLTLPYLTM DQYSFLQPSLLILSLAFLAAYLILLLSMLKASVPMPFLIFFTLLFSCLETSLNTYYQLNGIHHEWVFPSRKGYSRALQDV DKLVKKAATNNDQFFRLEQLLPQTGNDSMKYNYNGISQFSSIRNRHSSSLLDRLGYQSAGTNLNLRYQNNTLIMDSLLGV KYNLSYHQLHKFGFSRIASSHHTTLYQNHYSSNLAILTDNVYKDVKLTVNTLDNQTKLLNQLSGKRLTYFQLEPSKLISN AQAFNGRISGRAAENTSTTIVHYQVTVPDHRQLYLSLPNISFSNHNTTAVRIRIDDQTYEYTTDNAFSFFDLGYFEKGRT LTLAIMFPKNKNISFATPHFYSLNSDNYLAAMNAINQKEVTTYTRSNQVISHYKAKSESSMIFTLPYDKGWTARLNGRPV ALKKAQGGFIRIDVPKGSGKLVLTFVPNGFTLGLLLSFIGILLYSFLHYYLLRQTAKLKA
Specific function: Unknown
COG id: COG4485
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018580 [H]
Pfam domain/function: PF09586 YfhO [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 98067; Mature: 97936
Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTKPKAWYLVYDIASFLLPFLIMFFVLLSMGISYGSEKTILASDGFHQYVIFAQALRNIL CCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH HGADSIFYTFTSGLGVNFFALASYYLGSLLSPLVYFFNLQSMPDAIYLLTLIKFGLIGLA CCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH AYFSFHRIYPKIKPFLVLTLSVSYSLMSFLTSQLELNNWLDVFILLPIVLLGLYRLITQT HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KPLLYYSSLSLLFIQHYYFGYMVAIFIFLLFLVNLISLDTWKRRLRACLSFTSVSILSAL CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSAFILIPAYLDLAAYGETLSPINQIIIKPIGAFDLLAKLSLGAYDTTKFNAIPMIFIGL HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH LPSLLSIVFFTLKSISWRLRLGYGLLLGLIMASFYLQPLDLFWQGMHAPNMFLHRYSWSF HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHH SIIIIILACEALSRQKDITNTRIIFAFILLSCLLTLPYLTMDQYSFLQPSLLILSLAFLA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHH AYLILLLSMLKASVPMPFLIFFTLLFSCLETSLNTYYQLNGIHHEWVFPSRKGYSRALQD HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCEEECCCCCCCCHHHHHHH VDKLVKKAATNNDQFFRLEQLLPQTGNDSMKYNYNGISQFSSIRNRHSSSLLDRLGYQSA HHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC GTNLNLRYQNNTLIMDSLLGVKYNLSYHQLHKFGFSRIASSHHTTLYQNHYSSNLAILTD CCEEEEEECCCEEEEEHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEC NVYKDVKLTVNTLDNQTKLLNQLSGKRLTYFQLEPSKLISNAQAFNGRISGRAAENTSTT CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEE IVHYQVTVPDHRQLYLSLPNISFSNHNTTAVRIRIDDQTYEYTTDNAFSFFDLGYFEKGR EEEEEEECCCCCEEEEECCCCEECCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCCEEEEECCEECCCC TLTLAIMFPKNKNISFATPHFYSLNSDNYLAAMNAINQKEVTTYTRSNQVISHYKAKSES EEEEEEEECCCCCCCEECCCEEECCCCCEEHHHHCCCCHHHHEEECCCHHHHHHHCCCCC SMIFTLPYDKGWTARLNGRPVALKKAQGGFIRIDVPKGSGKLVLTFVPNGFTLGLLLSFI CEEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHH GILLYSFLHYYLLRQTAKLKA HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure TKPKAWYLVYDIASFLLPFLIMFFVLLSMGISYGSEKTILASDGFHQYVIFAQALRNIL CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH HGADSIFYTFTSGLGVNFFALASYYLGSLLSPLVYFFNLQSMPDAIYLLTLIKFGLIGLA CCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH AYFSFHRIYPKIKPFLVLTLSVSYSLMSFLTSQLELNNWLDVFILLPIVLLGLYRLITQT HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KPLLYYSSLSLLFIQHYYFGYMVAIFIFLLFLVNLISLDTWKRRLRACLSFTSVSILSAL CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSAFILIPAYLDLAAYGETLSPINQIIIKPIGAFDLLAKLSLGAYDTTKFNAIPMIFIGL HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH LPSLLSIVFFTLKSISWRLRLGYGLLLGLIMASFYLQPLDLFWQGMHAPNMFLHRYSWSF HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHH SIIIIILACEALSRQKDITNTRIIFAFILLSCLLTLPYLTMDQYSFLQPSLLILSLAFLA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHH AYLILLLSMLKASVPMPFLIFFTLLFSCLETSLNTYYQLNGIHHEWVFPSRKGYSRALQD HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCEEECCCCCCCCHHHHHHH VDKLVKKAATNNDQFFRLEQLLPQTGNDSMKYNYNGISQFSSIRNRHSSSLLDRLGYQSA HHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC GTNLNLRYQNNTLIMDSLLGVKYNLSYHQLHKFGFSRIASSHHTTLYQNHYSSNLAILTD CCEEEEEECCCEEEEEHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEC NVYKDVKLTVNTLDNQTKLLNQLSGKRLTYFQLEPSKLISNAQAFNGRISGRAAENTSTT CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEE IVHYQVTVPDHRQLYLSLPNISFSNHNTTAVRIRIDDQTYEYTTDNAFSFFDLGYFEKGR EEEEEEECCCCCEEEEECCCCEECCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCCEEEEECCEECCCC TLTLAIMFPKNKNISFATPHFYSLNSDNYLAAMNAINQKEVTTYTRSNQVISHYKAKSES EEEEEEEECCCCCCCEECCCEEECCCCCEEHHHHCCCCHHHHEEECCCHHHHHHHCCCCC SMIFTLPYDKGWTARLNGRPVALKKAQGGFIRIDVPKGSGKLVLTFVPNGFTLGLLLSFI CEEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHH GILLYSFLHYYLLRQTAKLKA HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8946165; 9384377 [H]