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The map label for this gene is 195978028

Identifier: 195978028

GI number: 195978028

Start: 943028

End: 945667

Strand: Direct

Name: 195978028

Synonym: Sez_0901

Alternate gene names: NA

Gene position: 943028-945667 (Clockwise)

Preceding gene: 195978027

Following gene: 195978029

Centisome position: 46.59

GC content: 42.95

Gene sequence:

>2640_bases
ATGAAACAAAAAACCTTATGGAAGGATAGTTTTCGAGCAATAAAGGCTAGTAAGGGGCGTTTTTTGTCCTTGCTGTTTTT
AATGGCTCTAGGCTCCTTTGCCTTGGTTGGCTTAAAGGTGGCTGGTCCCAATATGGAAAAAACTGCTAGTCACTATCTAG
AGGAGCATCAGGTTATGGACCTTAGTATCCTAGCCTCGCATGGCTTTTCTGATAGGGATAAGCAAGAATTAGCCTCTCTT
AAAAATGCAAGGCTAGAGTATGCGAGCTTTGTTGATGGTGCTTTTGATCATCAGAGGAAGGCTATTAGGCTTTATTCTAT
GCCACAAAGCCTATCTCAAGCTATCCTGGTCAAGGGAGATTACCCTAGCAGGGCTAGCGATATTTTGCTATCTGAGGCCT
TATCAAGCCGCTATCGGCTTGGGCAAACAATCACGATAAGCCTAAAAACAAAGGGACTGCTAAAGCATCGGTCCTATCGT
GTTGTTGGCTTTGCTCATTCTCCAGAAATATGGTCCAAAACAAACTTAGGTGTTTCCTCAGCAGGGGATGGTAATCTCTA
TGCCTATGCCTACCTTCACCCTAGTGCCTTTCAGCAAGGGCACAATCTCTTACGCATTCGGTATGATGATTTAAGAGGGT
TGAATGCCTTTTCAACCCAATACAATGAACGATTGCTACAACACCAAGCTGAGCTTGATCAGCTTTTGCAGGACAATGGT
CAAGAGCGTTATGAAGAAATGCTCAATGACCTTAATCGCAGCTTGAAAGATAGTAAAGCTAAGCTCGAAGAGCAAAGGAC
TATTCTTAAGGCAAGTGAGGACCAGCTGGCTTTGTTAAGTGGTCATGCCTTAGAGCAAGCGCAGGATCAGCTAAAGCAAG
GCCGGGAAGAGTTAGCTAAGAAAGAGACTAGTTTGCTAGAGATGGCTGACAAGCAAAGGGCAGCGATGATCAAGCCAACC
TATGCTAGCTATAGCCGCTCAACGCTGCCGGGTGGTGAGGGCTATCAAGCCTATGCTACCTCAACACAGTCCATATCACA
TGTCGGAAATATCTTTCCTGTTGTTTTGTATTTGGTTGCGGCTCTAGTCACTTTTACAACAATGGCTCGCTATGTTGACG
AAGAAAGAACAAACTCTGGCTTACTAAAGGCAATAGGCTATTCTGATTGGGATATTACCAAGAAATTTCTGCTATATGGT
GTTTTAGCAGCCTTGTTGGGTACTGGATTAGGTGTTTTAGGAGGGACTTATTTTTTATCTCGACTCATCTCAGCTATTCT
AACAGATGCTTTGACTATCGGCTCTACTCAGCTTTATTTTTACTGGAGCTATAGTGTGGTTGCAGTGCTTTTAGCCTTGT
TATCTGCTGTTTTGCCAGCTTATATGGTGGTGAGACGTGAGCTTTTTCTCAGACCCTCACAATTGTTGCTGCCTAAGCCT
CCTAGTAGCGGGGCAAGGATTTGGCTGGAGCATGTCTCCTTTATCTGGCGGCGTTTATCCTTTACCTATAAGGTTACTTT
TCGAAATATCTTTCGATATAAGCAAAGAATGCTGATGACAGTAATTGGAGTAGCAGGTTCTGTTGCGCTCTTATTTTCCG
GCTTGGGCATTCAATCCTCACTTGCTAATAGCCTAAGCTATCAATTTGGCAAGCTGACAGCCTATGACATGCTCGTGGTA
GAGGCCCCAACAGCAGAAGCTCATGATAGGCAGGAGCTGGCACAATATTTGAAGGCAGATCAGATTGCTAGTAAGAAAGA
GATTTATTACGCTAACTTATCACTAAAGATAAAAGACTTAGACAACAAGCAAACAGTGTCGTTGATCTCTAGTGATCAAA
GCACCCTATCTCCTTATTTTAGCTTGATTGGTGCTGCTGACCGAAAAAAGCTAGACCTTCCAAGTACTGGAGTGCTTATC
TCTAAAAAGCTTGCTGACTATTATCAGGCTCATGCAGGAGATCAGCTTGAGCTTGAAGCTAGTAACGGCAAACGCTATCA
GTTAAGAGTTAGTCAGGTTATTGACATGACTGTTGGTCATTACTTATTTATGTCTAAATCTTATTATCAGCAGGTATTTC
AGGATATAGAGGCTTCGCCAGCCCATTTGGTAACAACAGCAAAGGCTAGTCCAGCTGCTGTAAAGGACGTGGCTAGTCAG
CTCTTAGCAATACCTGCGGTTCAGGCTGTGTCACAGCATAGTAGTATTGTTGCTACTGTGACCGAAATTGTGGCTTCTCT
GGATCAGGTTATGACGCTTTTGGTGCTTCTATCAGTTTTACTAGCCTTGGTCATCTTGTATCATTTGACTAATATCAATA
TTGCTGAGAGGATTAGGGAATTATCAACGATAAGGGTCCTGGGCTTTTATGATAAGGAGGTTACCTTATACATTTATCGG
GAAACTATGCTCCTATCCACTGTTGGTATTCTGATTGGTCTTTGGTGCGGCAACTATTTGCACGCCTATATCATGAAGAT
AATTGCTAATGATTCTATGAGCTTTGGTAGGACAGTTGATGCTTATGTTTACCTAGTACCTGTTGGGGCTATTGTGCTTT
TGTTGATTGTGCTTGGCTATATGGTTAGCTACCGGCTAAGAAAGATTGATATGCTAGAGGCTCTAAAGTCTGTTGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGATCGGGTCATCTATATGCATGACGGTCGTGTGACTAAGACAGTGCTTAATAAGCAGCCGCTTGATATTGATAGGATA
ACGTATTGAGAGGTGCCTAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGTAAAATAGCACTTGAAAATCGCTTAATAATATGATAGTATTAAAATACTATAATTTAATAGAAGGATACTTTTATGGA
AGCAATGATAGCTGCCTATT

Product: ABC transporter permease protein

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease; Peptide ABC Transporter Permease; Permease; ABC Transporter; Efflux ABC Transporter Permease Protein; Permease Domain Protein; Permease Domain-Containing Protein; Efflux ABC Transporter Permease; Antimicrobial Peptide ABC Transporter Permease; ABC-Type Antimicrobial Peptide Transport System Protein; Large Transmembrane Protein Possibly Involved In Transport; ABC-Type Transport System Permease; ABC-Type Transport System; ABC Transporter Permease Component

Number of amino acids: Translated: 879; Mature: 879

Protein sequence:

>879_residues
MKQKTLWKDSFRAIKASKGRFLSLLFLMALGSFALVGLKVAGPNMEKTASHYLEEHQVMDLSILASHGFSDRDKQELASL
KNARLEYASFVDGAFDHQRKAIRLYSMPQSLSQAILVKGDYPSRASDILLSEALSSRYRLGQTITISLKTKGLLKHRSYR
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VLAALLGTGLGVLGGTYFLSRLISAILTDALTIGSTQLYFYWSYSVVAVLLALLSAVLPAYMVVRRELFLRPSQLLLPKP
PSSGARIWLEHVSFIWRRLSFTYKVTFRNIFRYKQRMLMTVIGVAGSVALLFSGLGIQSSLANSLSYQFGKLTAYDMLVV
EAPTAEAHDRQELAQYLKADQIASKKEIYYANLSLKIKDLDNKQTVSLISSDQSTLSPYFSLIGAADRKKLDLPSTGVLI
SKKLADYYQAHAGDQLELEASNGKRYQLRVSQVIDMTVGHYLFMSKSYYQQVFQDIEASPAHLVTTAKASPAAVKDVASQ
LLAIPAVQAVSQHSSIVATVTEIVASLDQVMTLLVLLSVLLALVILYHLTNINIAERIRELSTIRVLGFYDKEVTLYIYR
ETMLLSTVGILIGLWCGNYLHAYIMKIIANDSMSFGRTVDAYVYLVPVGAIVLLLIVLGYMVSYRLRKIDMLEALKSVD

Sequences:

>Translated_879_residues
MKQKTLWKDSFRAIKASKGRFLSLLFLMALGSFALVGLKVAGPNMEKTASHYLEEHQVMDLSILASHGFSDRDKQELASL
KNARLEYASFVDGAFDHQRKAIRLYSMPQSLSQAILVKGDYPSRASDILLSEALSSRYRLGQTITISLKTKGLLKHRSYR
VVGFAHSPEIWSKTNLGVSSAGDGNLYAYAYLHPSAFQQGHNLLRIRYDDLRGLNAFSTQYNERLLQHQAELDQLLQDNG
QERYEEMLNDLNRSLKDSKAKLEEQRTILKASEDQLALLSGHALEQAQDQLKQGREELAKKETSLLEMADKQRAAMIKPT
YASYSRSTLPGGEGYQAYATSTQSISHVGNIFPVVLYLVAALVTFTTMARYVDEERTNSGLLKAIGYSDWDITKKFLLYG
VLAALLGTGLGVLGGTYFLSRLISAILTDALTIGSTQLYFYWSYSVVAVLLALLSAVLPAYMVVRRELFLRPSQLLLPKP
PSSGARIWLEHVSFIWRRLSFTYKVTFRNIFRYKQRMLMTVIGVAGSVALLFSGLGIQSSLANSLSYQFGKLTAYDMLVV
EAPTAEAHDRQELAQYLKADQIASKKEIYYANLSLKIKDLDNKQTVSLISSDQSTLSPYFSLIGAADRKKLDLPSTGVLI
SKKLADYYQAHAGDQLELEASNGKRYQLRVSQVIDMTVGHYLFMSKSYYQQVFQDIEASPAHLVTTAKASPAAVKDVASQ
LLAIPAVQAVSQHSSIVATVTEIVASLDQVMTLLVLLSVLLALVILYHLTNINIAERIRELSTIRVLGFYDKEVTLYIYR
ETMLLSTVGILIGLWCGNYLHAYIMKIIANDSMSFGRTVDAYVYLVPVGAIVLLLIVLGYMVSYRLRKIDMLEALKSVD
>Mature_879_residues
MKQKTLWKDSFRAIKASKGRFLSLLFLMALGSFALVGLKVAGPNMEKTASHYLEEHQVMDLSILASHGFSDRDKQELASL
KNARLEYASFVDGAFDHQRKAIRLYSMPQSLSQAILVKGDYPSRASDILLSEALSSRYRLGQTITISLKTKGLLKHRSYR
VVGFAHSPEIWSKTNLGVSSAGDGNLYAYAYLHPSAFQQGHNLLRIRYDDLRGLNAFSTQYNERLLQHQAELDQLLQDNG
QERYEEMLNDLNRSLKDSKAKLEEQRTILKASEDQLALLSGHALEQAQDQLKQGREELAKKETSLLEMADKQRAAMIKPT
YASYSRSTLPGGEGYQAYATSTQSISHVGNIFPVVLYLVAALVTFTTMARYVDEERTNSGLLKAIGYSDWDITKKFLLYG
VLAALLGTGLGVLGGTYFLSRLISAILTDALTIGSTQLYFYWSYSVVAVLLALLSAVLPAYMVVRRELFLRPSQLLLPKP
PSSGARIWLEHVSFIWRRLSFTYKVTFRNIFRYKQRMLMTVIGVAGSVALLFSGLGIQSSLANSLSYQFGKLTAYDMLVV
EAPTAEAHDRQELAQYLKADQIASKKEIYYANLSLKIKDLDNKQTVSLISSDQSTLSPYFSLIGAADRKKLDLPSTGVLI
SKKLADYYQAHAGDQLELEASNGKRYQLRVSQVIDMTVGHYLFMSKSYYQQVFQDIEASPAHLVTTAKASPAAVKDVASQ
LLAIPAVQAVSQHSSIVATVTEIVASLDQVMTLLVLLSVLLALVILYHLTNINIAERIRELSTIRVLGFYDKEVTLYIYR
ETMLLSTVGILIGLWCGNYLHAYIMKIIANDSMSFGRTVDAYVYLVPVGAIVLLLIVLGYMVSYRLRKIDMLEALKSVD

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 98114; Mature: 98114

Theoretical pI: Translated: 9.50; Mature: 9.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKQKTLWKDSFRAIKASKGRFLSLLFLMALGSFALVGLKVAGPNMEKTASHYLEEHQVMD
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LSILASHGFSDRDKQELASLKNARLEYASFVDGAFDHQRKAIRLYSMPQSLSQAILVKGD
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCEEEEECC
YPSRASDILLSEALSSRYRLGQTITISLKTKGLLKHRSYRVVGFAHSPEIWSKTNLGVSS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCC
AGDGNLYAYAYLHPSAFQQGHNLLRIRYDDLRGLNAFSTQYNERLLQHQAELDQLLQDNG
CCCCCEEEEEEECHHHHHCCCCEEEEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QERYEEMLNDLNRSLKDSKAKLEEQRTILKASEDQLALLSGHALEQAQDQLKQGREELAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KETSLLEMADKQRAAMIKPTYASYSRSTLPGGEGYQAYATSTQSISHVGNIFPVVLYLVA
HHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALVTFTTMARYVDEERTNSGLLKAIGYSDWDITKKFLLYGVLAALLGTGLGVLGGTYFLS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
RLISAILTDALTIGSTQLYFYWSYSVVAVLLALLSAVLPAYMVVRRELFLRPSQLLLPKP
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
PSSGARIWLEHVSFIWRRLSFTYKVTFRNIFRYKQRMLMTVIGVAGSVALLFSGLGIQSS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
LANSLSYQFGKLTAYDMLVVEAPTAEAHDRQELAQYLKADQIASKKEIYYANLSLKIKDL
HHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEC
DNKQTVSLISSDQSTLSPYFSLIGAADRKKLDLPSTGVLISKKLADYYQAHAGDQLELEA
CCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC
SNGKRYQLRVSQVIDMTVGHYLFMSKSYYQQVFQDIEASPAHLVTTAKASPAAVKDVASQ
CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHH
LLAIPAVQAVSQHSSIVATVTEIVASLDQVMTLLVLLSVLLALVILYHLTNINIAERIRE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
LSTIRVLGFYDKEVTLYIYRETMLLSTVGILIGLWCGNYLHAYIMKIIANDSMSFGRTVD
HHHEEEEEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
AYVYLVPVGAIVLLLIVLGYMVSYRLRKIDMLEALKSVD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKQKTLWKDSFRAIKASKGRFLSLLFLMALGSFALVGLKVAGPNMEKTASHYLEEHQVMD
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LSILASHGFSDRDKQELASLKNARLEYASFVDGAFDHQRKAIRLYSMPQSLSQAILVKGD
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YPSRASDILLSEALSSRYRLGQTITISLKTKGLLKHRSYRVVGFAHSPEIWSKTNLGVSS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCC
AGDGNLYAYAYLHPSAFQQGHNLLRIRYDDLRGLNAFSTQYNERLLQHQAELDQLLQDNG
CCCCCEEEEEEECHHHHHCCCCEEEEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QERYEEMLNDLNRSLKDSKAKLEEQRTILKASEDQLALLSGHALEQAQDQLKQGREELAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KETSLLEMADKQRAAMIKPTYASYSRSTLPGGEGYQAYATSTQSISHVGNIFPVVLYLVA
HHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEC
DNKQTVSLISSDQSTLSPYFSLIGAADRKKLDLPSTGVLISKKLADYYQAHAGDQLELEA
CCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC
SNGKRYQLRVSQVIDMTVGHYLFMSKSYYQQVFQDIEASPAHLVTTAKASPAAVKDVASQ
CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
LSTIRVLGFYDKEVTLYIYRETMLLSTVGILIGLWCGNYLHAYIMKIIANDSMSFGRTVD
HHHEEEEEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
AYVYLVPVGAIVLLLIVLGYMVSYRLRKIDMLEALKSVD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA