| Definition | Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011134 |
| Length | 2,024,171 |
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The map label for this gene is yqeW [H]
Identifier: 195977617
GI number: 195977617
Start: 496435
End: 498066
Strand: Direct
Name: yqeW [H]
Synonym: Sez_0476
Alternate gene names: 195977617
Gene position: 496435-498066 (Clockwise)
Preceding gene: 195977615
Following gene: 195977618
Centisome position: 24.53
GC content: 44.61
Gene sequence:
>1632_bases GTGTCGGTAAATTGGCAAGACATTGCGTTTCATTTTTTTGGGGGTCTAGGTCTTTTTCTTTTCAGTATCAAATACATGGG AGACGGCTTGCAGCAGGCCGCAGGTGATAAGCTTAGGTATTACATTGATAAATACACAAGCAACCCCTTCTTTGGTATCT TAGTTGGAATAGCTATGTCTGCTTTGATTCAGTCTAGCTCGGGTGTGACGGTGATTACAGTTGGCCTAGTATCTGCAGGC CTTTTAACCCTACAGCAGGCGATTGGTATTGTCATGGGGGCCAATATTGGAACAACAGTGACCTCCTTTTTGATTGGCTT TAAGCTGGGAGATTACGCCCTGCCCATGATTTTTATTGGAGCAGCCTGTCTCTTTTTCACGTCAAATAAAAAGCTCAATA ATCTAGGTCGTGTCATCTTTGGTGTGGGAGGGATTTTCTTCTCCCTCAACCTAATGGGCGATGCGATGGATCCTTTAAAA TCAGTCTCAGCCTTTCAGCATTATCTAGCAACACTTGGAGACAAGCCCTTTCAGGGTGTTTTTATCGGGACAGCATTGAC CATGCTGATTCAATCCTCAGCGGCCATCATTGGTATTTTACAGGGGCTTTTTTCGGGCGGTCTATTGACCCTGCAGGGTG CGATTCCTATTTTGCTTGGCTCTAACATTGGTACCTGTATCACAGCGGTTTTGGCAGCTATTGGCTCTAATATTGCAGCT AAGCGTGTTGCTGCTGCTCATATTCTTTTTAATGTTATTGGAACAATCATCTTTATGATTTTGCTGATGCCATTTACCTC CTTTATGCTATGGCTTCAGTCTGTTTTAGCCCTGTCACCTGAGATGACCATTGCCTTTTCACATGGGACCTTTAACATCA CAAATACCCTGTTGCTGCTTCCTTTTATCAGCACTCTGGCAAAGCTTGTGACAACCTTAATTCCAGGTGAAGACGAAATC GTCAAATACGAAGCCTTGTATCTGGATCGCTTATTGATCACTCAGGCTCCTTCTATTGCCTTGGGAAATGCCCATAAGGA ATTGGTACATCTGGCTTCCTATGCTATTCAGGCCTTTGAGGCCTCTTATAGCTACATTATGACAGCCGAGGACAGGTTTG GCGAAAAGGTGAGGCGATATGAGAAGGCGGTCAATACGATTGATGAGGAGCTCACCACTTACCTTGTTGATATTTCCAAT GAGGCCCTTAGTCCTAGTGAAAATGAGGTTTTAGCAGGTCTGTTGGATTCGTCTCGTGATTTGGAGCGAATTGGTGACCA CTCTGAGTCGTTGGCGACTCTCATTGAGGGGATTACAGCAAAGCAGATTGGCTTTTCAGCAGCTGCGCGTGGTGAATTAA CAGAGATGTATCACCTGACTCACTGTTTAACCTTAGATGCGATTAGGGTGATTGTGGATAGTGACAAGGCTCTAGCCCAG TCTATTGTTGAGCGTCATAGGACGATTGAGCAAAAAGAGCGTCAATTGCGTAAAACGCATATCGAACGCCTCAATCGTGG CGAATGCACAGCACAGGCAGGGATTAATTTTATTGACATTATATCTCATTACACACGTATCACTGACCACGCCCTAAATC TAGCTGAGAAAGTACTTTCAGGACAGCTCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCTAAATGAGCACTATTTAAAAGGATTAAAAAACCCTTGTGATAACTGAATAAATACATTAAAATAGAAGAGAATAAAT AAGCGAGTGAGGACAATATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAAAGGGAAAACTTGAAATAGTATTCAGGTTTTTCTTTTTAACAGAAGGACTGGTATATACCATTTACAAAATAAGAAT TAAGGCGTATAATAAACGAA
Product: Na/Pi-cotransporter family protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 543; Mature: 542
Protein sequence:
>543_residues MSVNWQDIAFHFFGGLGLFLFSIKYMGDGLQQAAGDKLRYYIDKYTSNPFFGILVGIAMSALIQSSSGVTVITVGLVSAG LLTLQQAIGIVMGANIGTTVTSFLIGFKLGDYALPMIFIGAACLFFTSNKKLNNLGRVIFGVGGIFFSLNLMGDAMDPLK SVSAFQHYLATLGDKPFQGVFIGTALTMLIQSSAAIIGILQGLFSGGLLTLQGAIPILLGSNIGTCITAVLAAIGSNIAA KRVAAAHILFNVIGTIIFMILLMPFTSFMLWLQSVLALSPEMTIAFSHGTFNITNTLLLLPFISTLAKLVTTLIPGEDEI VKYEALYLDRLLITQAPSIALGNAHKELVHLASYAIQAFEASYSYIMTAEDRFGEKVRRYEKAVNTIDEELTTYLVDISN EALSPSENEVLAGLLDSSRDLERIGDHSESLATLIEGITAKQIGFSAAARGELTEMYHLTHCLTLDAIRVIVDSDKALAQ SIVERHRTIEQKERQLRKTHIERLNRGECTAQAGINFIDIISHYTRITDHALNLAEKVLSGQL
Sequences:
>Translated_543_residues MSVNWQDIAFHFFGGLGLFLFSIKYMGDGLQQAAGDKLRYYIDKYTSNPFFGILVGIAMSALIQSSSGVTVITVGLVSAG LLTLQQAIGIVMGANIGTTVTSFLIGFKLGDYALPMIFIGAACLFFTSNKKLNNLGRVIFGVGGIFFSLNLMGDAMDPLK SVSAFQHYLATLGDKPFQGVFIGTALTMLIQSSAAIIGILQGLFSGGLLTLQGAIPILLGSNIGTCITAVLAAIGSNIAA KRVAAAHILFNVIGTIIFMILLMPFTSFMLWLQSVLALSPEMTIAFSHGTFNITNTLLLLPFISTLAKLVTTLIPGEDEI VKYEALYLDRLLITQAPSIALGNAHKELVHLASYAIQAFEASYSYIMTAEDRFGEKVRRYEKAVNTIDEELTTYLVDISN EALSPSENEVLAGLLDSSRDLERIGDHSESLATLIEGITAKQIGFSAAARGELTEMYHLTHCLTLDAIRVIVDSDKALAQ SIVERHRTIEQKERQLRKTHIERLNRGECTAQAGINFIDIISHYTRITDHALNLAEKVLSGQL >Mature_542_residues SVNWQDIAFHFFGGLGLFLFSIKYMGDGLQQAAGDKLRYYIDKYTSNPFFGILVGIAMSALIQSSSGVTVITVGLVSAGL LTLQQAIGIVMGANIGTTVTSFLIGFKLGDYALPMIFIGAACLFFTSNKKLNNLGRVIFGVGGIFFSLNLMGDAMDPLKS VSAFQHYLATLGDKPFQGVFIGTALTMLIQSSAAIIGILQGLFSGGLLTLQGAIPILLGSNIGTCITAVLAAIGSNIAAK RVAAAHILFNVIGTIIFMILLMPFTSFMLWLQSVLALSPEMTIAFSHGTFNITNTLLLLPFISTLAKLVTTLIPGEDEIV KYEALYLDRLLITQAPSIALGNAHKELVHLASYAIQAFEASYSYIMTAEDRFGEKVRRYEKAVNTIDEELTTYLVDISNE ALSPSENEVLAGLLDSSRDLERIGDHSESLATLIEGITAKQIGFSAAARGELTEMYHLTHCLTLDAIRVIVDSDKALAQS IVERHRTIEQKERQLRKTHIERLNRGECTAQAGINFIDIISHYTRITDHALNLAEKVLSGQL
Specific function: Unknown
COG id: COG1283
COG function: function code P; Na+/phosphate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To E.coli yjbB [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=502, Percent_Identity=25.6972111553785, Blast_Score=150, Evalue=1e-37,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003841 - InterPro: IPR004633 [H]
Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58880; Mature: 58749
Theoretical pI: Translated: 6.19; Mature: 6.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSVNWQDIAFHFFGGLGLFLFSIKYMGDGLQQAAGDKLRYYIDKYTSNPFFGILVGIAMS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH ALIQSSSGVTVITVGLVSAGLLTLQQAIGIVMGANIGTTVTSFLIGFKLGDYALPMIFIG HHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH AACLFFTSNKKLNNLGRVIFGVGGIFFSLNLMGDAMDPLKSVSAFQHYLATLGDKPFQGV HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH FIGTALTMLIQSSAAIIGILQGLFSGGLLTLQGAIPILLGSNIGTCITAVLAAIGSNIAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHH KRVAAAHILFNVIGTIIFMILLMPFTSFMLWLQSVLALSPEMTIAFSHGTFNITNTLLLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH PFISTLAKLVTTLIPGEDEIVKYEALYLDRLLITQAPSIALGNAHKELVHLASYAIQAFE HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH ASYSYIMTAEDRFGEKVRRYEKAVNTIDEELTTYLVDISNEALSPSENEVLAGLLDSSRD CCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCH LERIGDHSESLATLIEGITAKQIGFSAAARGELTEMYHLTHCLTLDAIRVIVDSDKALAQ HHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH SIVERHRTIEQKERQLRKTHIERLNRGECTAQAGINFIDIISHYTRITDHALNLAEKVLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GQL CCC >Mature Secondary Structure SVNWQDIAFHFFGGLGLFLFSIKYMGDGLQQAAGDKLRYYIDKYTSNPFFGILVGIAMS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH ALIQSSSGVTVITVGLVSAGLLTLQQAIGIVMGANIGTTVTSFLIGFKLGDYALPMIFIG HHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH AACLFFTSNKKLNNLGRVIFGVGGIFFSLNLMGDAMDPLKSVSAFQHYLATLGDKPFQGV HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH FIGTALTMLIQSSAAIIGILQGLFSGGLLTLQGAIPILLGSNIGTCITAVLAAIGSNIAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHH KRVAAAHILFNVIGTIIFMILLMPFTSFMLWLQSVLALSPEMTIAFSHGTFNITNTLLLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH PFISTLAKLVTTLIPGEDEIVKYEALYLDRLLITQAPSIALGNAHKELVHLASYAIQAFE HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH ASYSYIMTAEDRFGEKVRRYEKAVNTIDEELTTYLVDISNEALSPSENEVLAGLLDSSRD CCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCH LERIGDHSESLATLIEGITAKQIGFSAAARGELTEMYHLTHCLTLDAIRVIVDSDKALAQ HHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH SIVERHRTIEQKERQLRKTHIERLNRGECTAQAGINFIDIISHYTRITDHALNLAEKVLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GQL CCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8969508; 9023197; 9384377 [H]