| Definition | Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010981 |
| Length | 1,482,455 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 190571213
Identifier: 190571213
GI number: 190571213
Start: 891372
End: 892832
Strand: Direct
Name: 190571213
Synonym: WPa_0812
Alternate gene names: NA
Gene position: 891372-892832 (Clockwise)
Preceding gene: 190571212
Following gene: 190571214
Centisome position: 60.13
GC content: 29.16
Gene sequence:
>1461_bases ATGAGTATACACTTTGTTAATATGTTTGGGTCAAAACCCAAAAGTAAGTTTATGCTTTCTATAGGAAAAGAAGGCACAAT GTTACTATATTTTAAAAATGATACTTTAAATAAAAGATATTTTGCTAAGGACAAAAATAATAAAGCTGTTTCTGACTTAA TTTCATGTCTTTCATCAGATAAAAAAGCACCCTTATATCTGGTTCTCAATCACACTGATCAGAACTATTTGCTACAGTCT ATCCCAAGAGTAAATAGGATTAGTGCTTATCTATCAGCAAAAACAAAAGTAGAGCATTTTGCTCATAATAACGATATAAA TTCTATTCTCTTGGTCGAAAAGCCGAATAAATTTAATCAAAACTGGTGGTATCTATTTGTTTCATCAAAAGCAAATCATT TAATAGAATATTGGTTGGACGTGTTTGTTGAAATAGGCTCTAACTTTAAAGGAATATTAATGTTTCCTATAGAACTAGTC AGTATAGCAAAAAAGATTCTACACAAAGATCCTAGTAACTGGAAAATTATAGTTGCTGCAACTAAAACAGGTGGCTATAG ACAAGTGGTTCTTAAAGAGAACAAAATGATATTTACACGTTTAATACCATTTACTAATGATAATTTACCAGGAATCATTG CTGGTGAAATATATCAGGAAGTGAAAAATACAATTCAATCTTTAACTAAGTTTGGATTTGAAAAAAATGACCCTGTCGAC CTCTGCATTATAGTATCAGAAGCTATTAAATCTAGTTTATCAGTTATAAATTTTTCAGAGAATAGTGTGAACATATTGAC TCCATATGAGCTGGGTAAACTATTGGGGGCAGAATTAGCTATAAGCGAAAAAGATAGCTTTTGTGATACTACAATTTTGT TTCACAGCTTTAAGAATAAGCCAACAGATGTTTTTAATACAAAAGAAACTAAAGAATTTTATCTATTCAATTACCTTTAT TTAAACTCTCCTCGGATTTTTCTATACCTCCTTTTGACTTTAATTGTAATTAACACCTTTTGTTTGCGGAATTTGTATTC GAATTTTAATATTGCTGATAATTTATCTGCAAAGCGGAGTGCTTTAAATAACAAACTAATAAAACTTAGCCAAAGCTATA ATGTAAAAAAGATAGATGAAGTTTACGATTTTATTAATATCAATAATATTTTATCAAAAATAGAGTACTCTCCTCTCACA CAAGTTAAGTATGTAGAAAAGCTAAAAGTACCAGATGTAGAGCTTCAATTATTTGAGTGGAATTATAATGAGGCAAAAAG TTATATTACCACAACTTTAAGGTTTAATTTTCAATCTGGTAAAGACATTTCTTATCAATACGAGAAACTACAGAAAAATT TAAACGATAATTTCCGTACTCATGATATTAGTATTTCTAGCTTACCTACTACTAAAGAGAAAAATCTATCTATTGATGTT GAAATAGGAGAGGCAATGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AGGGTTAATATTACTACTAATTTTATCAAAAACTTATAATATAAGTAATATTGTCATCTAATGTTTAATGAATTTCAATA AATTACCTTTTTAATTCTAG
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTGATGACTATCTCTCAACTAAAAAGAAAAGCTACAATTCAGTGCATATATTACTTATTGTTATCTGTTGTATTAATAG GGTTATCAACGTGTTTTATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 486; Mature: 485
Protein sequence:
>486_residues MSIHFVNMFGSKPKSKFMLSIGKEGTMLLYFKNDTLNKRYFAKDKNNKAVSDLISCLSSDKKAPLYLVLNHTDQNYLLQS IPRVNRISAYLSAKTKVEHFAHNNDINSILLVEKPNKFNQNWWYLFVSSKANHLIEYWLDVFVEIGSNFKGILMFPIELV SIAKKILHKDPSNWKIIVAATKTGGYRQVVLKENKMIFTRLIPFTNDNLPGIIAGEIYQEVKNTIQSLTKFGFEKNDPVD LCIIVSEAIKSSLSVINFSENSVNILTPYELGKLLGAELAISEKDSFCDTTILFHSFKNKPTDVFNTKETKEFYLFNYLY LNSPRIFLYLLLTLIVINTFCLRNLYSNFNIADNLSAKRSALNNKLIKLSQSYNVKKIDEVYDFININNILSKIEYSPLT QVKYVEKLKVPDVELQLFEWNYNEAKSYITTTLRFNFQSGKDISYQYEKLQKNLNDNFRTHDISISSLPTTKEKNLSIDV EIGEAM
Sequences:
>Translated_486_residues MSIHFVNMFGSKPKSKFMLSIGKEGTMLLYFKNDTLNKRYFAKDKNNKAVSDLISCLSSDKKAPLYLVLNHTDQNYLLQS IPRVNRISAYLSAKTKVEHFAHNNDINSILLVEKPNKFNQNWWYLFVSSKANHLIEYWLDVFVEIGSNFKGILMFPIELV SIAKKILHKDPSNWKIIVAATKTGGYRQVVLKENKMIFTRLIPFTNDNLPGIIAGEIYQEVKNTIQSLTKFGFEKNDPVD LCIIVSEAIKSSLSVINFSENSVNILTPYELGKLLGAELAISEKDSFCDTTILFHSFKNKPTDVFNTKETKEFYLFNYLY LNSPRIFLYLLLTLIVINTFCLRNLYSNFNIADNLSAKRSALNNKLIKLSQSYNVKKIDEVYDFININNILSKIEYSPLT QVKYVEKLKVPDVELQLFEWNYNEAKSYITTTLRFNFQSGKDISYQYEKLQKNLNDNFRTHDISISSLPTTKEKNLSIDV EIGEAM >Mature_485_residues SIHFVNMFGSKPKSKFMLSIGKEGTMLLYFKNDTLNKRYFAKDKNNKAVSDLISCLSSDKKAPLYLVLNHTDQNYLLQSI PRVNRISAYLSAKTKVEHFAHNNDINSILLVEKPNKFNQNWWYLFVSSKANHLIEYWLDVFVEIGSNFKGILMFPIELVS IAKKILHKDPSNWKIIVAATKTGGYRQVVLKENKMIFTRLIPFTNDNLPGIIAGEIYQEVKNTIQSLTKFGFEKNDPVDL CIIVSEAIKSSLSVINFSENSVNILTPYELGKLLGAELAISEKDSFCDTTILFHSFKNKPTDVFNTKETKEFYLFNYLYL NSPRIFLYLLLTLIVINTFCLRNLYSNFNIADNLSAKRSALNNKLIKLSQSYNVKKIDEVYDFININNILSKIEYSPLTQ VKYVEKLKVPDVELQLFEWNYNEAKSYITTTLRFNFQSGKDISYQYEKLQKNLNDNFRTHDISISSLPTTKEKNLSIDVE IGEAM
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56090; Mature: 55959
Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSIHFVNMFGSKPKSKFMLSIGKEGTMLLYFKNDTLNKRYFAKDKNNKAVSDLISCLSSD CEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCC KKAPLYLVLNHTDQNYLLQSIPRVNRISAYLSAKTKVEHFAHNNDINSILLVEKPNKFNQ CCCCEEEEEECCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCC NWWYLFVSSKANHLIEYWLDVFVEIGSNFKGILMFPIELVSIAKKILHKDPSNWKIIVAA CEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE TKTGGYRQVVLKENKMIFTRLIPFTNDNLPGIIAGEIYQEVKNTIQSLTKFGFEKNDPVD ECCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCE LCIIVSEAIKSSLSVINFSENSVNILTPYELGKLLGAELAISEKDSFCDTTILFHSFKNK EEEEEHHHHHCCCEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCC PTDVFNTKETKEFYLFNYLYLNSPRIFLYLLLTLIVINTFCLRNLYSNFNIADNLSAKRS CCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH ALNNKLIKLSQSYNVKKIDEVYDFININNILSKIEYSPLTQVKYVEKLKVPDVELQLFEW HHCCHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEC NYNEAKSYITTTLRFNFQSGKDISYQYEKLQKNLNDNFRTHDISISSLPTTKEKNLSIDV CCHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEE EIGEAM EECCCC >Mature Secondary Structure SIHFVNMFGSKPKSKFMLSIGKEGTMLLYFKNDTLNKRYFAKDKNNKAVSDLISCLSSD EEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCC KKAPLYLVLNHTDQNYLLQSIPRVNRISAYLSAKTKVEHFAHNNDINSILLVEKPNKFNQ CCCCEEEEEECCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCC NWWYLFVSSKANHLIEYWLDVFVEIGSNFKGILMFPIELVSIAKKILHKDPSNWKIIVAA CEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE TKTGGYRQVVLKENKMIFTRLIPFTNDNLPGIIAGEIYQEVKNTIQSLTKFGFEKNDPVD ECCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCE LCIIVSEAIKSSLSVINFSENSVNILTPYELGKLLGAELAISEKDSFCDTTILFHSFKNK EEEEEHHHHHCCCEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCC PTDVFNTKETKEFYLFNYLYLNSPRIFLYLLLTLIVINTFCLRNLYSNFNIADNLSAKRS CCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH ALNNKLIKLSQSYNVKKIDEVYDFININNILSKIEYSPLTQVKYVEKLKVPDVELQLFEW HHCCHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEC NYNEAKSYITTTLRFNFQSGKDISYQYEKLQKNLNDNFRTHDISISSLPTTKEKNLSIDV CCHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEE EIGEAM EECCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA