| Definition | Pyrococcus furiosus DSM 3638, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003413 |
| Length | 1,908,256 |
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The map label for this gene is 18976783
Identifier: 18976783
GI number: 18976783
Start: 417264
End: 419495
Strand: Direct
Name: 18976783
Synonym: PF0411
Alternate gene names: NA
Gene position: 417264-419495 (Clockwise)
Preceding gene: 18976782
Following gene: 18976786
Centisome position: 21.87
GC content: 39.34
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TATCCAAAGAGCAAAAAGAAAATATGAAGCCTCTAATTGAGATTCTTCTGGTGGCCTTTGTCATAATTGTTCTAAAAAAG GTCTATGAGGTGTTGAGTGG
Downstream 100 bases:
>100_bases TCTTTTTCAAGCTTCACTCTAAGTTCTTCGGCGAACCAATTTACCCTCTGTGGGAACGGGATTTCGATTCCTTCTCTGTC CAGGGCTTCTTTTATTTTCT
Product: protein-export membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: Transmembrane Oligosaccharyl Transferase; Protein-Export Membrane Protein
Number of amino acids: Translated: 743; Mature: 743
Protein sequence:
>743_residues MKIDKRLMVIVAIATLFRMIPFRLKYLVGSDPYFHLAYIEEALKAGEWFNFFTYAGGPWGLQVRLFHPLGLWATPAYIYK LFSFLGISLYTAFRVTPVIFGVLTVVFFYLSLKKLYNRDVAFIVGLFLGVNYGHIFRSMANYYRGDNYMLFWYSVALLGI ALGLKTRSKYRYLFYLLPGIATGFASAFWQAYYPIFVFVLAGGLLLGVYAYLKSPKLFLDSILIVLSTGLGVLIANILGD KVGYGMLGYTDWMGKKVAETFGLEFGFIKDAYLLIHVKYLLPLSLVFLGFLIITKKLNPKIKVGVLVGGSILAFIVMLVK FPALKDLSTGFGTFREVPISETLPPTLDDLWRAYNIAIFLAALYILRLRKIRSGDAILLGYVITSLWMLRYWTRFLFTAA PAVAFLSGIGVYELTRRIKENKIRITSLGVVILLSSAFSLGEVYSVKPFMNENWEKALIFIRENSNENDIVLTWWDWGHF VTYYARRSPVAQGSPNSGVAGYYLGLVDNGWAQSLGVDYVIVSLYDILKFEAIVDTAKLSRKWENISRADYGVDFLKLTE STGSILRFDSQYSTLIVKEGNIRVILSGKVVYPREAIIESNGRIKNLKYPARSGVYVYVNLDYGYAILANEKAWETNLLR LFTQRTGENYELVYSDGGFVKVFRFVHPNVVFRGNKFILTGNGTGLGLYGYLDNGTLVFKKWYSVKNMQEFELPNNLNGS VVVRYVYTQGKIVLDRGIVRVKN
Sequences:
>Translated_743_residues MKIDKRLMVIVAIATLFRMIPFRLKYLVGSDPYFHLAYIEEALKAGEWFNFFTYAGGPWGLQVRLFHPLGLWATPAYIYK LFSFLGISLYTAFRVTPVIFGVLTVVFFYLSLKKLYNRDVAFIVGLFLGVNYGHIFRSMANYYRGDNYMLFWYSVALLGI ALGLKTRSKYRYLFYLLPGIATGFASAFWQAYYPIFVFVLAGGLLLGVYAYLKSPKLFLDSILIVLSTGLGVLIANILGD KVGYGMLGYTDWMGKKVAETFGLEFGFIKDAYLLIHVKYLLPLSLVFLGFLIITKKLNPKIKVGVLVGGSILAFIVMLVK FPALKDLSTGFGTFREVPISETLPPTLDDLWRAYNIAIFLAALYILRLRKIRSGDAILLGYVITSLWMLRYWTRFLFTAA PAVAFLSGIGVYELTRRIKENKIRITSLGVVILLSSAFSLGEVYSVKPFMNENWEKALIFIRENSNENDIVLTWWDWGHF VTYYARRSPVAQGSPNSGVAGYYLGLVDNGWAQSLGVDYVIVSLYDILKFEAIVDTAKLSRKWENISRADYGVDFLKLTE STGSILRFDSQYSTLIVKEGNIRVILSGKVVYPREAIIESNGRIKNLKYPARSGVYVYVNLDYGYAILANEKAWETNLLR LFTQRTGENYELVYSDGGFVKVFRFVHPNVVFRGNKFILTGNGTGLGLYGYLDNGTLVFKKWYSVKNMQEFELPNNLNGS VVVRYVYTQGKIVLDRGIVRVKN >Mature_743_residues MKIDKRLMVIVAIATLFRMIPFRLKYLVGSDPYFHLAYIEEALKAGEWFNFFTYAGGPWGLQVRLFHPLGLWATPAYIYK LFSFLGISLYTAFRVTPVIFGVLTVVFFYLSLKKLYNRDVAFIVGLFLGVNYGHIFRSMANYYRGDNYMLFWYSVALLGI ALGLKTRSKYRYLFYLLPGIATGFASAFWQAYYPIFVFVLAGGLLLGVYAYLKSPKLFLDSILIVLSTGLGVLIANILGD KVGYGMLGYTDWMGKKVAETFGLEFGFIKDAYLLIHVKYLLPLSLVFLGFLIITKKLNPKIKVGVLVGGSILAFIVMLVK FPALKDLSTGFGTFREVPISETLPPTLDDLWRAYNIAIFLAALYILRLRKIRSGDAILLGYVITSLWMLRYWTRFLFTAA PAVAFLSGIGVYELTRRIKENKIRITSLGVVILLSSAFSLGEVYSVKPFMNENWEKALIFIRENSNENDIVLTWWDWGHF VTYYARRSPVAQGSPNSGVAGYYLGLVDNGWAQSLGVDYVIVSLYDILKFEAIVDTAKLSRKWENISRADYGVDFLKLTE STGSILRFDSQYSTLIVKEGNIRVILSGKVVYPREAIIESNGRIKNLKYPARSGVYVYVNLDYGYAILANEKAWETNLLR LFTQRTGENYELVYSDGGFVKVFRFVHPNVVFRGNKFILTGNGTGLGLYGYLDNGTLVFKKWYSVKNMQEFELPNNLNGS VVVRYVYTQGKIVLDRGIVRVKN
Specific function: Unknown
COG id: COG1287
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 84343; Mature: 84343
Theoretical pI: Translated: 9.98; Mature: 9.98
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKIDKRLMVIVAIATLFRMIPFRLKYLVGSDPYFHLAYIEEALKAGEWFNFFTYAGGPWG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCE LQVRLFHPLGLWATPAYIYKLFSFLGISLYTAFRVTPVIFGVLTVVFFYLSLKKLYNRDV EEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH AFIVGLFLGVNYGHIFRSMANYYRGDNYMLFWYSVALLGIALGLKTRSKYRYLFYLLPGI HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHH ATGFASAFWQAYYPIFVFVLAGGLLLGVYAYLKSPKLFLDSILIVLSTGLGVLIANILGD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH KVGYGMLGYTDWMGKKVAETFGLEFGFIKDAYLLIHVKYLLPLSLVFLGFLIITKKLNPK HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC IKVGVLVGGSILAFIVMLVKFPALKDLSTGFGTFREVPISETLPPTLDDLWRAYNIAIFL EEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH AALYILRLRKIRSGDAILLGYVITSLWMLRYWTRFLFTAAPAVAFLSGIGVYELTRRIKE HHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH NKIRITSLGVVILLSSAFSLGEVYSVKPFMNENWEKALIFIRENSNENDIVLTWWDWGHF CCEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEECCHHH VTYYARRSPVAQGSPNSGVAGYYLGLVDNGWAQSLGVDYVIVSLYDILKFEAIVDTAKLS HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKWENISRADYGVDFLKLTESTGSILRFDSQYSTLIVKEGNIRVILSGKVVYPREAIIES HHHHHCCHHHCCCEEEEEECCCCCEEEECCCCEEEEEECCCEEEEEECCEECCHHHHHCC NGRIKNLKYPARSGVYVYVNLDYGYAILANEKAWETNLLRLFTQRTGENYELVYSDGGFV CCCEEECCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCE KVFRFVHPNVVFRGNKFILTGNGTGLGLYGYLDNGTLVFKKWYSVKNMQEFELPNNLNGS EEEEECCCCEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEEEHHCCCCCHHHCCCCCCCCC VVVRYVYTQGKIVLDRGIVRVKN EEEEEEEECCEEEEECCEEEECC >Mature Secondary Structure MKIDKRLMVIVAIATLFRMIPFRLKYLVGSDPYFHLAYIEEALKAGEWFNFFTYAGGPWG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCE LQVRLFHPLGLWATPAYIYKLFSFLGISLYTAFRVTPVIFGVLTVVFFYLSLKKLYNRDV EEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH AFIVGLFLGVNYGHIFRSMANYYRGDNYMLFWYSVALLGIALGLKTRSKYRYLFYLLPGI HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHH ATGFASAFWQAYYPIFVFVLAGGLLLGVYAYLKSPKLFLDSILIVLSTGLGVLIANILGD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH KVGYGMLGYTDWMGKKVAETFGLEFGFIKDAYLLIHVKYLLPLSLVFLGFLIITKKLNPK HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC IKVGVLVGGSILAFIVMLVKFPALKDLSTGFGTFREVPISETLPPTLDDLWRAYNIAIFL EEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH AALYILRLRKIRSGDAILLGYVITSLWMLRYWTRFLFTAAPAVAFLSGIGVYELTRRIKE HHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH NKIRITSLGVVILLSSAFSLGEVYSVKPFMNENWEKALIFIRENSNENDIVLTWWDWGHF CCEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEECCHHH VTYYARRSPVAQGSPNSGVAGYYLGLVDNGWAQSLGVDYVIVSLYDILKFEAIVDTAKLS HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKWENISRADYGVDFLKLTESTGSILRFDSQYSTLIVKEGNIRVILSGKVVYPREAIIES HHHHHCCHHHCCCEEEEEECCCCCEEEECCCCEEEEEECCCEEEEEECCEECCHHHHHCC NGRIKNLKYPARSGVYVYVNLDYGYAILANEKAWETNLLRLFTQRTGENYELVYSDGGFV CCCEEECCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCE KVFRFVHPNVVFRGNKFILTGNGTGLGLYGYLDNGTLVFKKWYSVKNMQEFELPNNLNGS EEEEECCCCEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEEEHHCCCCCHHHCCCCCCCCC VVVRYVYTQGKIVLDRGIVRVKN EEEEEEEECCEEEEECCEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA