| Definition | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010793 |
| Length | 2,008,987 |
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The map label for this gene is nuoN3
Identifier: 189184254
GI number: 189184254
Start: 1372929
End: 1374602
Strand: Reverse
Name: nuoN3
Synonym: OTT_1347
Alternate gene names: NA
Gene position: 1374602-1372929 (Counterclockwise)
Preceding gene: 189184255
Following gene: 189184247
Centisome position: 68.42
GC content: 26.22
Gene sequence:
>1674_bases ATGAGCGGAATGATGGAAAAAGCTAGCTTTCAAGAAATATTGTTACATCCAGGTATTTTTTTAATATTATCGTCTGCAAT ATTATATATCTTTAGATACTTTAAAATCTTCAATATGTTAGCTGTCTTTTTACCAGTTATAGCAGCTATCATATGCATTA TGCAACCATACAATGTGTACTATAATTTTTATGAAATATGGCAGTTTTCCTTTCAATATAACTACTATAATAAAATAGCA TGTTTATGTATTTTGTTATGTTCTAGCTGTATTAATTTATCAGCTTGGAAAAACCAACATTGTAGCAACTTTAGCGTAAT TATAGCTATGTTATATACTGGAATTAGTATTATTTCAATGCTGTCAGTAGATTTTTCAACTATGGTTTATAGCTTAGAAT TTGCATCTTTAGCAGCAGTTTTAATGATATATAATAAAACGAATGAATCTCAAATTGAAACAGCTTACCAGTACTTAATA GTACATTCATTAAGTATTATGTTAATATTAGCAGGTAGCAGCATTATAATTAGTTCATATGGGTTACCAATTACTAATTT AGCCAAGTTGATAGAAAATTTTGAATATAACTACCTAACTTTAGCTGCAATAGTTATATTACTAGGGTTACTGATAAATA TTGCTTGCCCGATATTTTCATATTGGTTAGTAGATAGCTATTCTATAAGTAAAACAACAGCAAGTGTTTATTTATCAATG CTAACTACTACAATAAATTTAATATGGATATTCAAATTATTCCTAGGATTAAAAATATTAATAATAATTGGTACATTTAT AACTTTATTTGGTATTATTTATTCTATACTAGAAAATGAAATTAAAAGATCTTTCTCATACTCTTCTATTGCCAAAACTG GCATTATACTTGTAATGCTTGGAATATATGAACATAACACTGATTACAATGCATTAAGTAATTATAATCAAGAAGCAGTC CTAATGCTTTTATGCATAAGCTATATTCCGTGCCAATGCGTTATTATGTTAATATGTGGTTGGTTAAAAGATAAATATAC CTTAACTTCCTTTACTGATTTTAGTAATAAGATGGTTACTATAGATCCAGTTCTACTAATTGCTATTAGTTATAGTTTAG CATTATTTTTTGCTACCCCTTTTACAACCTTTTACTATACTAATGTATTAGCATTAAAAAATAATAATATTATTTATTTC CTCAATATTATTATGGCAACACAGCTATTATGTATTCCTTTGACGTCGATCTGCAAAAATGTCAGAATAATAAAATTTTC TCAAGTATATGGAATAGATGGTACAAAATATATTAATATAGCAGAATACATTGCAATTATATGCTTCATTACTATTAATT TAATACTATATTTCTATATCGCAGATTTTACCTACCTATTGCAACAACTAACAATAATTACTGCTGGACTTATTGCTAGC TATGTTAGCTGTCCTACAAAAATTTCAGGAAAAATACTACTGCCAGAAAATATCCTATATAATAAAGCTTGTAATTTTAT TGATTTATGCAGCAATAAATTCTTTTCTTGGCAATCAAAATTACAATTTCCTAAAATTCTAAGATTAAGTAATAACTTAG ATCTAAGTAACAGCTTAAGTATAGTAGCAACCATCTTAATCTTATTAACCATTATTATTATTGATATTATATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAACAATGTATAATTTATTACATAATCTCTAAATATTGAATTTAAAATTTAATAACTAAAATATTTTTTAGTAGTTTTTT GAGACAAAACTACTCCTATA
Downstream 100 bases:
>100_bases CAATGAAGTCTATAACAAAAACTTTTTACAAGATGTAAGTTAGTATCAGCAGTAAAACAAATGATATTTCTTTCCAGAGA ATGATATGAATCCTGATCTG
Product: NADH dehydrogenase I chain N
Products: NAD+; ubiquinol
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 557; Mature: 556
Protein sequence:
>557_residues MSGMMEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVYYNFYEIWQFSFQYNYYNKIA CLCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISMLSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLI VHSLSIMLILAGSSIIISSYGLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSM LTTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVMLGIYEHNTDYNALSNYNQEAV LMLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVTIDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYF LNIIMATQLLCIPLTSICKNVRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIAS YVSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLDLSNSLSIVATILILLTIIIIDII
Sequences:
>Translated_557_residues MSGMMEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVYYNFYEIWQFSFQYNYYNKIA CLCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISMLSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLI VHSLSIMLILAGSSIIISSYGLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSM LTTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVMLGIYEHNTDYNALSNYNQEAV LMLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVTIDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYF LNIIMATQLLCIPLTSICKNVRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIAS YVSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLDLSNSLSIVATILILLTIIIIDII >Mature_556_residues SGMMEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVYYNFYEIWQFSFQYNYYNKIAC LCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISMLSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLIV HSLSIMLILAGSSIIISSYGLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSML TTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVMLGIYEHNTDYNALSNYNQEAVL MLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVTIDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYFL NIIMATQLLCIPLTSICKNVRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIASY VSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLDLSNSLSIVATILILLTIIIIDII
Specific function: Unknown
COG id: COG0651
COG function: function code CP; Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: 1.6.5.3
Molecular weight: Translated: 63316; Mature: 63185
Theoretical pI: Translated: 7.80; Mature: 7.80
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
3.1 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 5.9 %Cys+Met (Translated Protein) 3.1 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 5.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSGMMEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVY CCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH YNFYEIWQFSFQYNYYNKIACLCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISM HHHHHHHEEHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLIVHSLSIMLILAGSSIIISSY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECC GLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSM CCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LTTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEE GIYEHNTDYNALSNYNQEAVLMLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVT HHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCEEE IDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYFLNIIMATQLLCIPLTSICKN ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC VRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIAS CEEEEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YVSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLDLSNSLS HHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHCCCHHHHHCCCHHCHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHH IVATILILLTIIIIDII HHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SGMMEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVY CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH YNFYEIWQFSFQYNYYNKIACLCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISM HHHHHHHEEHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLIVHSLSIMLILAGSSIIISSY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECC GLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSM CCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LTTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEE GIYEHNTDYNALSNYNQEAVLMLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVT HHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCEEE IDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYFLNIIMATQLLCIPLTSICKN ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC VRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIAS CEEEEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YVSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLDLSNSLS HHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHCCCHHHHHCCCHHCHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHH IVATILILLTIIIIDII HHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NADH; H+; ubiquinone
Specific reaction: NADH + H+ + ubiquinone = NAD+ + ubiquinol
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA