Definition Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome.
Accession NC_010793
Length 2,008,987

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The map label for this gene is nuoN3

Identifier: 189184254

GI number: 189184254

Start: 1372929

End: 1374602

Strand: Reverse

Name: nuoN3

Synonym: OTT_1347

Alternate gene names: NA

Gene position: 1374602-1372929 (Counterclockwise)

Preceding gene: 189184255

Following gene: 189184247

Centisome position: 68.42

GC content: 26.22

Gene sequence:

>1674_bases
ATGAGCGGAATGATGGAAAAAGCTAGCTTTCAAGAAATATTGTTACATCCAGGTATTTTTTTAATATTATCGTCTGCAAT
ATTATATATCTTTAGATACTTTAAAATCTTCAATATGTTAGCTGTCTTTTTACCAGTTATAGCAGCTATCATATGCATTA
TGCAACCATACAATGTGTACTATAATTTTTATGAAATATGGCAGTTTTCCTTTCAATATAACTACTATAATAAAATAGCA
TGTTTATGTATTTTGTTATGTTCTAGCTGTATTAATTTATCAGCTTGGAAAAACCAACATTGTAGCAACTTTAGCGTAAT
TATAGCTATGTTATATACTGGAATTAGTATTATTTCAATGCTGTCAGTAGATTTTTCAACTATGGTTTATAGCTTAGAAT
TTGCATCTTTAGCAGCAGTTTTAATGATATATAATAAAACGAATGAATCTCAAATTGAAACAGCTTACCAGTACTTAATA
GTACATTCATTAAGTATTATGTTAATATTAGCAGGTAGCAGCATTATAATTAGTTCATATGGGTTACCAATTACTAATTT
AGCCAAGTTGATAGAAAATTTTGAATATAACTACCTAACTTTAGCTGCAATAGTTATATTACTAGGGTTACTGATAAATA
TTGCTTGCCCGATATTTTCATATTGGTTAGTAGATAGCTATTCTATAAGTAAAACAACAGCAAGTGTTTATTTATCAATG
CTAACTACTACAATAAATTTAATATGGATATTCAAATTATTCCTAGGATTAAAAATATTAATAATAATTGGTACATTTAT
AACTTTATTTGGTATTATTTATTCTATACTAGAAAATGAAATTAAAAGATCTTTCTCATACTCTTCTATTGCCAAAACTG
GCATTATACTTGTAATGCTTGGAATATATGAACATAACACTGATTACAATGCATTAAGTAATTATAATCAAGAAGCAGTC
CTAATGCTTTTATGCATAAGCTATATTCCGTGCCAATGCGTTATTATGTTAATATGTGGTTGGTTAAAAGATAAATATAC
CTTAACTTCCTTTACTGATTTTAGTAATAAGATGGTTACTATAGATCCAGTTCTACTAATTGCTATTAGTTATAGTTTAG
CATTATTTTTTGCTACCCCTTTTACAACCTTTTACTATACTAATGTATTAGCATTAAAAAATAATAATATTATTTATTTC
CTCAATATTATTATGGCAACACAGCTATTATGTATTCCTTTGACGTCGATCTGCAAAAATGTCAGAATAATAAAATTTTC
TCAAGTATATGGAATAGATGGTACAAAATATATTAATATAGCAGAATACATTGCAATTATATGCTTCATTACTATTAATT
TAATACTATATTTCTATATCGCAGATTTTACCTACCTATTGCAACAACTAACAATAATTACTGCTGGACTTATTGCTAGC
TATGTTAGCTGTCCTACAAAAATTTCAGGAAAAATACTACTGCCAGAAAATATCCTATATAATAAAGCTTGTAATTTTAT
TGATTTATGCAGCAATAAATTCTTTTCTTGGCAATCAAAATTACAATTTCCTAAAATTCTAAGATTAAGTAATAACTTAG
ATCTAAGTAACAGCTTAAGTATAGTAGCAACCATCTTAATCTTATTAACCATTATTATTATTGATATTATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAACAATGTATAATTTATTACATAATCTCTAAATATTGAATTTAAAATTTAATAACTAAAATATTTTTTAGTAGTTTTTT
GAGACAAAACTACTCCTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATGAAGTCTATAACAAAAACTTTTTACAAGATGTAAGTTAGTATCAGCAGTAAAACAAATGATATTTCTTTCCAGAGA
ATGATATGAATCCTGATCTG

Product: NADH dehydrogenase I chain N

Products: NAD+; ubiquinol

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 557; Mature: 556

Protein sequence:

>557_residues
MSGMMEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVYYNFYEIWQFSFQYNYYNKIA
CLCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISMLSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLI
VHSLSIMLILAGSSIIISSYGLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSM
LTTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVMLGIYEHNTDYNALSNYNQEAV
LMLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVTIDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYF
LNIIMATQLLCIPLTSICKNVRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIAS
YVSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLDLSNSLSIVATILILLTIIIIDII

Sequences:

>Translated_557_residues
MSGMMEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVYYNFYEIWQFSFQYNYYNKIA
CLCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISMLSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLI
VHSLSIMLILAGSSIIISSYGLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSM
LTTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVMLGIYEHNTDYNALSNYNQEAV
LMLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVTIDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYF
LNIIMATQLLCIPLTSICKNVRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIAS
YVSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLDLSNSLSIVATILILLTIIIIDII
>Mature_556_residues
SGMMEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVYYNFYEIWQFSFQYNYYNKIAC
LCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISMLSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLIV
HSLSIMLILAGSSIIISSYGLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSML
TTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVMLGIYEHNTDYNALSNYNQEAVL
MLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVTIDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYFL
NIIMATQLLCIPLTSICKNVRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIASY
VSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLDLSNSLSIVATILILLTIIIIDII

Specific function: Unknown

COG id: COG0651

COG function: function code CP; Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: 1.6.5.3

Molecular weight: Translated: 63316; Mature: 63185

Theoretical pI: Translated: 7.80; Mature: 7.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

3.1 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
5.9 %Cys+Met (Translated Protein)
3.1 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
5.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSGMMEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVY
CCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
YNFYEIWQFSFQYNYYNKIACLCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISM
HHHHHHHEEHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLIVHSLSIMLILAGSSIIISSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECC
GLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSM
CCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
LTTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEE
GIYEHNTDYNALSNYNQEAVLMLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVT
HHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCEEE
IDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYFLNIIMATQLLCIPLTSICKN
ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIAS
CEEEEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YVSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLDLSNSLS
HHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHCCCHHHHHCCCHHCHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHH
IVATILILLTIIIIDII
HHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SGMMEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVY
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
YNFYEIWQFSFQYNYYNKIACLCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISM
HHHHHHHEEHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLIVHSLSIMLILAGSSIIISSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECC
GLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSM
CCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
LTTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEE
GIYEHNTDYNALSNYNQEAVLMLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVT
HHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCEEE
IDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYFLNIIMATQLLCIPLTSICKN
ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIAS
CEEEEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YVSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLDLSNSLS
HHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHCCCHHHHHCCCHHCHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHH
IVATILILLTIIIIDII
HHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NADH; H+; ubiquinone

Specific reaction: NADH + H+ + ubiquinone = NAD+ + ubiquinol

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA