Definition Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome.
Accession NC_010793
Length 2,008,987

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The map label for this gene is 189183089

Identifier: 189183089

GI number: 189183089

Start: 179469

End: 181364

Strand: Direct

Name: 189183089

Synonym: OTT_0182

Alternate gene names: NA

Gene position: 179469-181364 (Clockwise)

Preceding gene: 189183088

Following gene: 189183092

Centisome position: 8.93

GC content: 32.23

Gene sequence:

>1896_bases
ATGCACAGTAGGAGCAATAGGCAATTTAATATCCAAGCAATGGGCAGCATTCAATTATGTCAGACCCTTAGAGATAGAGA
TGTATTGTCAGGAACTATTATAACAGAGATTTATAATAGAGCTTTGTTTTTACTGCAAACTGAAGATACAAGATACAATA
GATTGCAGTTTGATGCCAGAGGCTTAGCAACAATTTTATATCAATTTGCAAAATTAAACTATGTTATAGGTTCTGAGTTT
ATTGATGCTTGGACAAATAAGGCTATAAATCTAATGGATGAGTTTAACTCTCAAGGGTTGACTAATTCCCTATGGGCATT
AGGACGGTTAGAAATTCATCCACAAGCTAAATTCATTGAAGCTTGGATACATCATGCTATTAAAACTATTGATCATTTTA
CCACTCAAGATTTATCTAATTCCATATGGGGATTAGGACGGTTAGAAATTCATCCACAAGCTAAATTCATTGAAGCTTGG
ATACATCATGCTATTAAAACTATTGATCATTTTACTACTCAAGGGTTGGCTAATTCTCTATGGGCATTAGGACGGTTAGA
AATTCATCCACAAGCTAAATTCATTGAAGCTTGGATACATCATGCTACTAAAACTATTGATCATTTTACCACTCAAGATT
TATCTAATTCCCTATGGGCATTAGGACGGTTAGAAATTCATCCACAAGCTGAATTCATTGAAGCTTGGATACGTCATGCT
ACTAAAACTATTGATCATTTTACCACTCAAGATTTATCTAATTCCTTATGGGGATTAGGACGGTTAGAAATTCATCCACA
AGCTAAATTCATTGAAGCTTGGATACATCATGCTACTAAAACTATTGATCATTTTACCACTCAAGATTTATCTAATTCCT
TATGGGGATTAGGACGGTTAGAAATTCATCCACAAGCTGAATTCATTGAAGCTTGGATACGTCATGCTACTAAAACTATT
GATCATTTTACCACTCAAGATTTATCTAATTCTCTATGGGCATTAGGACAGTTAGAAATTCATCCACAAGCTGAATTCAT
TGAAGCTTGGATACATCATGCTACTAAAACTATTGATCATTTTACCACTCAAGGGTTGGCTAATTCTATTTATGGAATAT
TCATATTAAATGTTTTATGTGACTCTAAAATTAAAGTACCACAGCAATTTATTTCTGCTGTTAATAAAAATATTGAACTG
TTTGATGAAAATATTGAAGGTATTAGTCAAATTTTAAAAGCGCATTATTATTTTGGTAAACAAGGTGTAGGAATATTAAC
TTCACAAAATCGTCAATTTCTTGAAAAAAAGTTTAAAACCAAATTAACACCTTGTCATACTTCAAATTTACAACTAAATG
TTCTGAAAGTAGTCAAAAAAGTATTAGCACAACACCTTGTTAAAAGCGAGCATTATATTAAGCAGATTACTTCCAGTGTC
GATATCTTTATTAAAGATAAAAATACAGTAATTCAAGTAGATGGCCCATGCCATTTTGATGACAATAATGCTCCTAATAT
TTCAACTAGGCTTAATACTGAATTATTGAAAAGTTATGGATACATAGTACATAGAATTCCATATTGGGTTTGGAATAAGT
TAAGAACAAATACTGACAAAGAAAAATATATATGTGAATTGATATGCACTGATAAATCTGTTTCTCAGTCAGAGATGTTA
GAGGAGATATTCTATGATGCACAAGAGCATATACCAGAGCAATCAACAAGCGAAATTTTACCTCATTCTGAATCACAAGT
ATCAGATGATGATGTATTTTATGATGCATACGAATATATTCCACAAGATCCATTAACACATGAATCTTCATCCCATTATG
ACATGCAAGCATTAGGCAACATAGGTTCTTCTGATTTTGAGACACGTAGTTTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAATGGCATGATATATATTACTCGATTAATGTATATTATACTTTTTGTCAAAAGACGTATTTAGTATTACAAAGTCAAA
CTATATAAGGAACTTCGAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCTTTTTTACAAAAACTTAGCAAGCTTTTGATGCGAATGTGTGCTAGAAAAATATGAGTTCTATATATAGCGGAAGGCAT
AACTATAGCTACATCACAAT

Product: repeat-containing protein A_01

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 631; Mature: 631

Protein sequence:

>631_residues
MHSRSNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIYNRALFLLQTEDTRYNRLQFDARGLATILYQFAKLNYVIGSEF
IDAWTNKAINLMDEFNSQGLTNSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHAIKTIDHFTTQDLSNSIWGLGRLEIHPQAKFIEAW
IHHAIKTIDHFTTQGLANSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGRLEIHPQAEFIEAWIRHA
TKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAEFIEAWIRHATKTI
DHFTTQDLSNSLWALGQLEIHPQAEFIEAWIHHATKTIDHFTTQGLANSIYGIFILNVLCDSKIKVPQQFISAVNKNIEL
FDENIEGISQILKAHYYFGKQGVGILTSQNRQFLEKKFKTKLTPCHTSNLQLNVLKVVKKVLAQHLVKSEHYIKQITSSV
DIFIKDKNTVIQVDGPCHFDDNNAPNISTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLRTNTDKEKYICELICTDKSVSQSEML
EEIFYDAQEHIPEQSTSEILPHSESQVSDDDVFYDAYEYIPQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDFETRSL

Sequences:

>Translated_631_residues
MHSRSNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIYNRALFLLQTEDTRYNRLQFDARGLATILYQFAKLNYVIGSEF
IDAWTNKAINLMDEFNSQGLTNSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHAIKTIDHFTTQDLSNSIWGLGRLEIHPQAKFIEAW
IHHAIKTIDHFTTQGLANSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGRLEIHPQAEFIEAWIRHA
TKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAEFIEAWIRHATKTI
DHFTTQDLSNSLWALGQLEIHPQAEFIEAWIHHATKTIDHFTTQGLANSIYGIFILNVLCDSKIKVPQQFISAVNKNIEL
FDENIEGISQILKAHYYFGKQGVGILTSQNRQFLEKKFKTKLTPCHTSNLQLNVLKVVKKVLAQHLVKSEHYIKQITSSV
DIFIKDKNTVIQVDGPCHFDDNNAPNISTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLRTNTDKEKYICELICTDKSVSQSEML
EEIFYDAQEHIPEQSTSEILPHSESQVSDDDVFYDAYEYIPQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDFETRSL
>Mature_631_residues
MHSRSNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIYNRALFLLQTEDTRYNRLQFDARGLATILYQFAKLNYVIGSEF
IDAWTNKAINLMDEFNSQGLTNSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHAIKTIDHFTTQDLSNSIWGLGRLEIHPQAKFIEAW
IHHAIKTIDHFTTQGLANSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGRLEIHPQAEFIEAWIRHA
TKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAEFIEAWIRHATKTI
DHFTTQDLSNSLWALGQLEIHPQAEFIEAWIHHATKTIDHFTTQGLANSIYGIFILNVLCDSKIKVPQQFISAVNKNIEL
FDENIEGISQILKAHYYFGKQGVGILTSQNRQFLEKKFKTKLTPCHTSNLQLNVLKVVKKVLAQHLVKSEHYIKQITSSV
DIFIKDKNTVIQVDGPCHFDDNNAPNISTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLRTNTDKEKYICELICTDKSVSQSEML
EEIFYDAQEHIPEQSTSEILPHSESQVSDDDVFYDAYEYIPQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDFETRSL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 72796; Mature: 72796

Theoretical pI: Translated: 6.48; Mature: 6.48

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
0.8 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHSRSNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIYNRALFLLQTEDTRYNRLQFDAR
CCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCEEEECHH
GLATILYQFAKLNYVIGSEFIDAWTNKAINLMDEFNSQGLTNSLWALGRLEIHPQAKFIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCEEECCHHHHHH
AWIHHAIKTIDHFTTQDLSNSIWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHAIKTIDHFTTQGLANSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WALGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGRLEIHPQAEFIEAWIRHA
HHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCHHHHHHHHHHH
TKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
EIHPQAEFIEAWIRHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGQLEIHPQAEFIEAWIHHATKTIDH
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FTTQGLANSIYGIFILNVLCDSKIKVPQQFISAVNKNIELFDENIEGISQILKAHYYFGK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QGVGILTSQNRQFLEKKFKTKLTPCHTSNLQLNVLKVVKKVLAQHLVKSEHYIKQITSSV
CCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
DIFIKDKNTVIQVDGPCHFDDNNAPNISTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLRTNTDK
EEEEECCCEEEEECCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
EKYICELICTDKSVSQSEMLEEIFYDAQEHIPEQSTSEILPHSESQVSDDDVFYDAYEYI
HHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC
PQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDFETRSL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MHSRSNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIYNRALFLLQTEDTRYNRLQFDAR
CCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCEEEECHH
GLATILYQFAKLNYVIGSEFIDAWTNKAINLMDEFNSQGLTNSLWALGRLEIHPQAKFIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCEEECCHHHHHH
AWIHHAIKTIDHFTTQDLSNSIWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHAIKTIDHFTTQGLANSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WALGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGRLEIHPQAEFIEAWIRHA
HHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCHHHHHHHHHHH
TKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
EIHPQAEFIEAWIRHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGQLEIHPQAEFIEAWIHHATKTIDH
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FTTQGLANSIYGIFILNVLCDSKIKVPQQFISAVNKNIELFDENIEGISQILKAHYYFGK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
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CCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
DIFIKDKNTVIQVDGPCHFDDNNAPNISTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLRTNTDK
EEEEECCCEEEEECCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
EKYICELICTDKSVSQSEMLEEIFYDAQEHIPEQSTSEILPHSESQVSDDDVFYDAYEYI
HHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC
PQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDFETRSL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA