| Definition | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010793 |
| Length | 2,008,987 |
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The map label for this gene is 189183089
Identifier: 189183089
GI number: 189183089
Start: 179469
End: 181364
Strand: Direct
Name: 189183089
Synonym: OTT_0182
Alternate gene names: NA
Gene position: 179469-181364 (Clockwise)
Preceding gene: 189183088
Following gene: 189183092
Centisome position: 8.93
GC content: 32.23
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases AGAATGGCATGATATATATTACTCGATTAATGTATATTATACTTTTTGTCAAAAGACGTATTTAGTATTACAAAGTCAAA CTATATAAGGAACTTCGAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases CCTTTTTTACAAAAACTTAGCAAGCTTTTGATGCGAATGTGTGCTAGAAAAATATGAGTTCTATATATAGCGGAAGGCAT AACTATAGCTACATCACAAT
Product: repeat-containing protein A_01
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 631; Mature: 631
Protein sequence:
>631_residues MHSRSNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIYNRALFLLQTEDTRYNRLQFDARGLATILYQFAKLNYVIGSEF IDAWTNKAINLMDEFNSQGLTNSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHAIKTIDHFTTQDLSNSIWGLGRLEIHPQAKFIEAW IHHAIKTIDHFTTQGLANSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGRLEIHPQAEFIEAWIRHA TKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAEFIEAWIRHATKTI DHFTTQDLSNSLWALGQLEIHPQAEFIEAWIHHATKTIDHFTTQGLANSIYGIFILNVLCDSKIKVPQQFISAVNKNIEL FDENIEGISQILKAHYYFGKQGVGILTSQNRQFLEKKFKTKLTPCHTSNLQLNVLKVVKKVLAQHLVKSEHYIKQITSSV DIFIKDKNTVIQVDGPCHFDDNNAPNISTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLRTNTDKEKYICELICTDKSVSQSEML EEIFYDAQEHIPEQSTSEILPHSESQVSDDDVFYDAYEYIPQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDFETRSL
Sequences:
>Translated_631_residues MHSRSNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIYNRALFLLQTEDTRYNRLQFDARGLATILYQFAKLNYVIGSEF IDAWTNKAINLMDEFNSQGLTNSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHAIKTIDHFTTQDLSNSIWGLGRLEIHPQAKFIEAW IHHAIKTIDHFTTQGLANSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGRLEIHPQAEFIEAWIRHA TKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAEFIEAWIRHATKTI DHFTTQDLSNSLWALGQLEIHPQAEFIEAWIHHATKTIDHFTTQGLANSIYGIFILNVLCDSKIKVPQQFISAVNKNIEL FDENIEGISQILKAHYYFGKQGVGILTSQNRQFLEKKFKTKLTPCHTSNLQLNVLKVVKKVLAQHLVKSEHYIKQITSSV DIFIKDKNTVIQVDGPCHFDDNNAPNISTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLRTNTDKEKYICELICTDKSVSQSEML EEIFYDAQEHIPEQSTSEILPHSESQVSDDDVFYDAYEYIPQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDFETRSL >Mature_631_residues MHSRSNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIYNRALFLLQTEDTRYNRLQFDARGLATILYQFAKLNYVIGSEF IDAWTNKAINLMDEFNSQGLTNSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHAIKTIDHFTTQDLSNSIWGLGRLEIHPQAKFIEAW IHHAIKTIDHFTTQGLANSLWALGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGRLEIHPQAEFIEAWIRHA TKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAEFIEAWIRHATKTI DHFTTQDLSNSLWALGQLEIHPQAEFIEAWIHHATKTIDHFTTQGLANSIYGIFILNVLCDSKIKVPQQFISAVNKNIEL FDENIEGISQILKAHYYFGKQGVGILTSQNRQFLEKKFKTKLTPCHTSNLQLNVLKVVKKVLAQHLVKSEHYIKQITSSV DIFIKDKNTVIQVDGPCHFDDNNAPNISTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLRTNTDKEKYICELICTDKSVSQSEML EEIFYDAQEHIPEQSTSEILPHSESQVSDDDVFYDAYEYIPQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDFETRSL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 72796; Mature: 72796
Theoretical pI: Translated: 6.48; Mature: 6.48
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MHSRSNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIYNRALFLLQTEDTRYNRLQFDAR CCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCEEEECHH GLATILYQFAKLNYVIGSEFIDAWTNKAINLMDEFNSQGLTNSLWALGRLEIHPQAKFIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCEEECCHHHHHH AWIHHAIKTIDHFTTQDLSNSIWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHAIKTIDHFTTQGLANSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WALGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGRLEIHPQAEFIEAWIRHA HHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCHHHHHHHHHHH TKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE EIHPQAEFIEAWIRHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGQLEIHPQAEFIEAWIHHATKTIDH EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FTTQGLANSIYGIFILNVLCDSKIKVPQQFISAVNKNIELFDENIEGISQILKAHYYFGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC QGVGILTSQNRQFLEKKFKTKLTPCHTSNLQLNVLKVVKKVLAQHLVKSEHYIKQITSSV CCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DIFIKDKNTVIQVDGPCHFDDNNAPNISTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLRTNTDK EEEEECCCEEEEECCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH EKYICELICTDKSVSQSEMLEEIFYDAQEHIPEQSTSEILPHSESQVSDDDVFYDAYEYI HHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC PQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDFETRSL CCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MHSRSNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIYNRALFLLQTEDTRYNRLQFDAR CCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCEEEECHH GLATILYQFAKLNYVIGSEFIDAWTNKAINLMDEFNSQGLTNSLWALGRLEIHPQAKFIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCEEECCHHHHHH AWIHHAIKTIDHFTTQDLSNSIWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHAIKTIDHFTTQGLANSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WALGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGRLEIHPQAEFIEAWIRHA HHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCHHHHHHHHHHH TKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRLEIHPQAKFIEAWIHHATKTIDHFTTQDLSNSLWGLGRL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE EIHPQAEFIEAWIRHATKTIDHFTTQDLSNSLWALGQLEIHPQAEFIEAWIHHATKTIDH EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FTTQGLANSIYGIFILNVLCDSKIKVPQQFISAVNKNIELFDENIEGISQILKAHYYFGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC QGVGILTSQNRQFLEKKFKTKLTPCHTSNLQLNVLKVVKKVLAQHLVKSEHYIKQITSSV CCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DIFIKDKNTVIQVDGPCHFDDNNAPNISTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLRTNTDK EEEEECCCEEEEECCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH EKYICELICTDKSVSQSEMLEEIFYDAQEHIPEQSTSEILPHSESQVSDDDVFYDAYEYI HHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC PQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDFETRSL CCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA