Definition Treponema pallidum subsp. pallidum SS14, complete genome.
Accession NC_010741
Length 1,139,457

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The map label for this gene is 189025641

Identifier: 189025641

GI number: 189025641

Start: 432893

End: 436147

Strand: Direct

Name: 189025641

Synonym: TPASS_0408

Alternate gene names: NA

Gene position: 432893-436147 (Clockwise)

Preceding gene: 189025640

Following gene: 189025642

Centisome position: 37.99

GC content: 50.35

Gene sequence:

>3255_bases
ATGGAGTACTTTCTGACGGTTGTCATTGCCTGCGCGATTTCCCTCGTGATGGTTGCGTTCTCCCGCCAGCTGGACAAGGG
TAACCGTTCTCTTGAAAAGGTCAAGCGCTACGCGGACTACATAAAGGAAGATCTTGAGTCATTCAGCGCAGAGAAGATTG
CGATGCTCAAGGATGCGGCCATCGAGTTAAATGTAAAGCAAGAGCAGGCGATTGCCTCAGTGAAAAAAATGGATCACCTC
TACGACCAGTTTATGAAGAAGTCTACTGCGCTTGCGGCTGCAAACATGGCGGTGGAGAAAATCCACAGGGAGGTTCAGGC
ATCAGAGAAGGACGTCTGTACACTCAGGGAACAGGTTGCCGTGGCGCAGGGTCTGATTGCTGAGGTTAATAAGGAGTCTT
CTTTCGTCGACTCGCTGAGTAAACGCGTTGCGGCTGCAAAGACGCAGCTGCAGCAAGTGTCCGCTGCGATTCCTGATATG
CAAAATGCATTTACGCGCGAGAATACCGCGCTTCTCCACCGGGTGCGAGATGGAGTACTTGCAGACGTACATAAGGAATT
AGCGGTGTTGCAAACAAGGCTGGAAAAAGCGCAGGGGGAAAGCCAGTCTCTTTTTGAAGTTTCTGCAGTTAAATTGCGTG
AGTTGTATGAAGGGGCATTTTCTGAAGCAACTGTGCGTGCACAGGTGCTGGAAGAAAATGGATTCGGTCAGTTGAAAGTA
CAGGCGGAAAATCGCCTTCTCCAGTTGCAGGAGGAGTTTGAAGGGAGCCTCCTTTCTTTGCAGCAGCACGTTATGCAGCG
TGTCGAACAAACGGACCAGCACATCCAGGATTGTGCATCCCAGTGGTCTGTTCGGGCGCAGACATGTGAGTCTGATTTGA
GTATACGTCTTGCGGACGTTACGGCGTGTGTGGATGAAAGCGTGGCGCAACTGAAGGAACAGATTACTACACAGGAGCGT
GAGGTGCGTGCGCACCTGGAAGGGATCGAACAGTCGCTTTCAGGAGCAGAATCCGGTTTACGCGAGCGCGTGCACAAGAG
TGTGACAAGTTTTCACGAAAACTTAAATAAGATTGCAGAGGCTTCTGATGCGCAGTTACAGCAGTACAGGAAGGAGATGG
ATGGACGCTGTAGCAAGTTTGACAGAGAGCTTGAGGGTATTGATGTCCTTGAGTCTCAGTTGCAGCTTGCGCGTGAGCGT
ACAGAACAGAAGGTGCGCGAAGAATTTGAAGCGTATGCGCAGGATCGTGAGCGGAAGCAGTTAGCGTTTGAGGCACAGTT
GCAGCACAGTATGGATACGGTTGAGCACCGTATGAAGCAGCTGAATGACGAGCTGCGTGAGCTGAAGGCAAGTGCGTATG
CAAATGCATCCGAGAAACTGCAGTCGGTGGAGGATAACTTTTTTGAGGTACTTACCAAGCGCAGCGACTCGTTGCACGCG
CGCTTTTCCGAGTGGAGTGAAGGGATTGAGGGTCGTTTGACGCAACTTGCTCTAGAGAGTGAGTCTGCGCGAAAGGATCT
TGAGGATACGTACCGCAAAGAGTTGCACACGCGGCTCAAGGATTTTGTGGAAGAATACAAGGGGCAGTGTACAAAACTGG
GAGAGCAAATCCTCGCGATTGAATCAAACGTGAAGCAGCACATGCGCGCAAACGATGACCTGTTTCAACGGCACACGGAG
AAATTTACCATAGATGTCGCGGCCTTGCACGATAAGGCGCATAATCTCATTGAGAGAGAATTGGAAGCAGTGCGGCAACG
CCTGCGTGACTCTTTGCATGTTCACTCAAGTATGATTGAAACCGAAGTTCGGGATATGAATGTGCTCGTGCAGGAGATAA
AGCAGGAGGCGCAGGGGGGCTGTGGGTCGGTCAAACGGGATATCGAGGCATGGAAGGCACACACCGACAAGCAGTTTGCG
GATGCAAAGCAGTTGTTTGAAGGAAAAATTGCGCATTTGGTGAATCTTTCTGAGCGGGCGATTGAAAACCTGAGTGCGCG
CTATGATATGCAGTATGAAGATTTTTCTCAGAAGAATGGTGAGTCTTTGCAAAGTCTGCGTGATGAAATAGGCAAGATGT
GTGACACGATGCGGACGGTCAAAGAGGAACTGGGTGGCTATGTAAATACTGTGACAGGACAGCTCCATGCAGATGGTCGG
CGCGAAAGTGAGGCACTGCACAAGACAGTAAAAGAAGCACGTGCTCAGGTGGACCGCACCTTGCAGGAGACACGAGACCT
TGTGCAGGATTTGCGCGCGGAGTTTGGGGAGGCGCAGGTAGGTCTTCTCACTAAATTACAGGGAGAAAGTGACCGCTTTT
CGCAAGTGCTGCAGGAGATTGAACGTAAACAGCATGAGTTTATCGGCCAGACTCGTATTTTTGATCGGGCGGACGAGTTG
CGGGAGAATCTTGAAAAGGATATCGAGCGGCTGACTGAGACGGTGACCCGTTTCGAAGTGTATCGAGAGGCGATGGATAA
GCTTAGTCTCCAGTATGAAAAAGTGAAACACTTTGGAGAGGAGGCGGAGCAGCGTGTTGAGAAGTTTATGCAGGAGCGAA
AGAATATTGATCTTTTGGAGGGAGAGTTTTCAAAGCTTGCTGCTCTTTCTGATGCTATGGACAAGAAGATTGTTGAGCTC
ACGTTAGCGAATGACGATCTGCAGCGCTATCAGGTGCAAATTCGAAAGGTCAAAGAAGGGCTTGGCGATATCAGTACGCG
TTATGAGCGTTTGGATAAGAAAGGTGCGGTGTTGGATCAGACGGTGCAGGACGTGGATAGAGCGTTTGAAAACTTGAAGG
AACTTGAAAAGACGCTTAAAAATTTTAGGGGAGAATTGGAGACAGTAGATCCTCAATTGCAGCGTGTGCGTGCAGAAATT
GCCGTATTGTTGGATAACCAGGAAAAGGCAGAGCGTGTGCGCTCGCGCATAGAGTGCGCAGATGCGCTGCTGGGAGAAAT
GGAAAGTCGTATTGAAAAGATGCAGCATGCGCGTGAGTGGCTTGCGGGTACTGAAACTCGTCTGCAAGAAATTTCTAAGG
TGTCTGAGGGGCAGTTGCGCTTGCTGGGTGATTTGATGCGTCAGGATCCAGCAAACAAAATACCCGGTGCGGGAGCGCCG
CCCCTGGCTACACGTCAGAATGTGGTGAAGCTGCACAAAAGTGGCTGGTCTGACGACGCTATTGCGCACGCACTGAAGAT
TTCTAAGGGTGAAGTCCAGCTGATTTTAGAGTTGCCCGATATGGATTCGTTTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATGAGCGCCGGCGCAGGGTAGTCTGCCGAACCCCACACGTCCAGCGTGGCGCCCGCGGGTACCCGCTGTGCGTCGCGTG
AAGACGAAGGTGAGTGGAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTAATGCAGCGCACGCGCGCGTTGGTAAAGAAGAGATGTGATTGACTGGATTGTCTTTTTTGCGCTAGCCTGGGGGCG
CGCTCGTGTGTCCTGCGCGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1084; Mature: 1084

Protein sequence:

>1084_residues
MEYFLTVVIACAISLVMVAFSRQLDKGNRSLEKVKRYADYIKEDLESFSAEKIAMLKDAAIELNVKQEQAIASVKKMDHL
YDQFMKKSTALAAANMAVEKIHREVQASEKDVCTLREQVAVAQGLIAEVNKESSFVDSLSKRVAAAKTQLQQVSAAIPDM
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TEQKVREEFEAYAQDRERKQLAFEAQLQHSMDTVEHRMKQLNDELRELKASAYANASEKLQSVEDNFFEVLTKRSDSLHA
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DAKQLFEGKIAHLVNLSERAIENLSARYDMQYEDFSQKNGESLQSLRDEIGKMCDTMRTVKEELGGYVNTVTGQLHADGR
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AVLLDNQEKAERVRSRIECADALLGEMESRIEKMQHAREWLAGTETRLQEISKVSEGQLRLLGDLMRQDPANKIPGAGAP
PLATRQNVVKLHKSGWSDDAIAHALKISKGEVQLILELPDMDSF

Sequences:

>Translated_1084_residues
MEYFLTVVIACAISLVMVAFSRQLDKGNRSLEKVKRYADYIKEDLESFSAEKIAMLKDAAIELNVKQEQAIASVKKMDHL
YDQFMKKSTALAAANMAVEKIHREVQASEKDVCTLREQVAVAQGLIAEVNKESSFVDSLSKRVAAAKTQLQQVSAAIPDM
QNAFTRENTALLHRVRDGVLADVHKELAVLQTRLEKAQGESQSLFEVSAVKLRELYEGAFSEATVRAQVLEENGFGQLKV
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TEQKVREEFEAYAQDRERKQLAFEAQLQHSMDTVEHRMKQLNDELRELKASAYANASEKLQSVEDNFFEVLTKRSDSLHA
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KFTIDVAALHDKAHNLIERELEAVRQRLRDSLHVHSSMIETEVRDMNVLVQEIKQEAQGGCGSVKRDIEAWKAHTDKQFA
DAKQLFEGKIAHLVNLSERAIENLSARYDMQYEDFSQKNGESLQSLRDEIGKMCDTMRTVKEELGGYVNTVTGQLHADGR
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RENLEKDIERLTETVTRFEVYREAMDKLSLQYEKVKHFGEEAEQRVEKFMQERKNIDLLEGEFSKLAALSDAMDKKIVEL
TLANDDLQRYQVQIRKVKEGLGDISTRYERLDKKGAVLDQTVQDVDRAFENLKELEKTLKNFRGELETVDPQLQRVRAEI
AVLLDNQEKAERVRSRIECADALLGEMESRIEKMQHAREWLAGTETRLQEISKVSEGQLRLLGDLMRQDPANKIPGAGAP
PLATRQNVVKLHKSGWSDDAIAHALKISKGEVQLILELPDMDSF
>Mature_1084_residues
MEYFLTVVIACAISLVMVAFSRQLDKGNRSLEKVKRYADYIKEDLESFSAEKIAMLKDAAIELNVKQEQAIASVKKMDHL
YDQFMKKSTALAAANMAVEKIHREVQASEKDVCTLREQVAVAQGLIAEVNKESSFVDSLSKRVAAAKTQLQQVSAAIPDM
QNAFTRENTALLHRVRDGVLADVHKELAVLQTRLEKAQGESQSLFEVSAVKLRELYEGAFSEATVRAQVLEENGFGQLKV
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TEQKVREEFEAYAQDRERKQLAFEAQLQHSMDTVEHRMKQLNDELRELKASAYANASEKLQSVEDNFFEVLTKRSDSLHA
RFSEWSEGIEGRLTQLALESESARKDLEDTYRKELHTRLKDFVEEYKGQCTKLGEQILAIESNVKQHMRANDDLFQRHTE
KFTIDVAALHDKAHNLIERELEAVRQRLRDSLHVHSSMIETEVRDMNVLVQEIKQEAQGGCGSVKRDIEAWKAHTDKQFA
DAKQLFEGKIAHLVNLSERAIENLSARYDMQYEDFSQKNGESLQSLRDEIGKMCDTMRTVKEELGGYVNTVTGQLHADGR
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RENLEKDIERLTETVTRFEVYREAMDKLSLQYEKVKHFGEEAEQRVEKFMQERKNIDLLEGEFSKLAALSDAMDKKIVEL
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PLATRQNVVKLHKSGWSDDAIAHALKISKGEVQLILELPDMDSF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 124034; Mature: 124034

Theoretical pI: Translated: 5.12; Mature: 5.12

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEYFLTVVIACAISLVMVAFSRQLDKGNRSLEKVKRYADYIKEDLESFSAEKIAMLKDAA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IELNVKQEQAIASVKKMDHLYDQFMKKSTALAAANMAVEKIHREVQASEKDVCTLREQVA
HEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
VAQGLIAEVNKESSFVDSLSKRVAAAKTQLQQVSAAIPDMQNAFTRENTALLHRVRDGVL
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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QAENRLLQLQEEFEGSLLSLQQHVMQRVEQTDQHIQDCASQWSVRAQTCESDLSIRLADV
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
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CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAFEAQLQHSMDTVEHRMKQLNDELRELKASAYANASEKLQSVEDNFFEVLTKRSDSLHA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
RFSEWSEGIEGRLTQLALESESARKDLEDTYRKELHTRLKDFVEEYKGQCTKLGEQILAI
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ESNVKQHMRANDDLFQRHTEKFTIDVAALHDKAHNLIERELEAVRQRLRDSLHVHSSMIE
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHH
LLGDLMRQDPANKIPGAGAPPLATRQNVVKLHKSGWSDDAIAHALKISKGEVQLILELPD
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCC
MDSF
CCCC
>Mature Secondary Structure
MEYFLTVVIACAISLVMVAFSRQLDKGNRSLEKVKRYADYIKEDLESFSAEKIAMLKDAA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IELNVKQEQAIASVKKMDHLYDQFMKKSTALAAANMAVEKIHREVQASEKDVCTLREQVA
HEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
VAQGLIAEVNKESSFVDSLSKRVAAAKTQLQQVSAAIPDMQNAFTRENTALLHRVRDGVL
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LAFEAQLQHSMDTVEHRMKQLNDELRELKASAYANASEKLQSVEDNFFEVLTKRSDSLHA
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HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ESNVKQHMRANDDLFQRHTEKFTIDVAALHDKAHNLIERELEAVRQRLRDSLHVHSSMIE
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
ERKQHEFIGQTRIFDRADELRENLEKDIERLTETVTRFEVYREAMDKLSLQYEKVKHFGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAEQRVEKFMQERKNIDLLEGEFSKLAALSDAMDKKIVELTLANDDLQRYQVQIRKVKEG
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHH
LLGDLMRQDPANKIPGAGAPPLATRQNVVKLHKSGWSDDAIAHALKISKGEVQLILELPD
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCC
MDSF
CCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA