Definition Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome.
Accession NC_010718
Length 3,165,557

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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 188586963

GI number: 188586963

Start: 2506780

End: 2508324

Strand: Reverse

Name: mviN [H]

Synonym: Nther_2355

Alternate gene names: 188586963

Gene position: 2508324-2506780 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188586964

Following gene: 188586962

Centisome position: 79.24

GC content: 39.61

Gene sequence:

>1545_bases
TTGACATTAAATCGAGGCCAAGCTATAAAAGCAGCCGGTGCTATGACTATAGTATCATTACTGAGTAAGGTGTTTGGATT
TCTCAGGGAAATGGCCCTGGCCAGAGAATTTGGAGCCACTTTTGAAACTGATGCTTTTTTAATTGCCATTATGATACCGC
AGATACTATTTGCTTCCCTGGGAGCATCCATTGCTACGACATTTATACCACTCTATACTGAAGCCAGGTTAGACAACAAA
CATGAAGTGAACTCCTTTGTCAGTACTTTTTTCAAAATTATGGTGGGTTTAAGCAGTATCATTGTAACTGTGGCCCTGCT
TTTTACTCCTCAGCTAATTTCCGTAATCAGTCCTGGTTTTACAGGGGAAGTGCGTGAATTATCTATTCTGCTAACTAGAA
TCATGCTTCCTGTAATAGTCTTTTTAGCTGCTGGTGGTGTCTTAAAGGGGATTTTACATTCACATAATGAATTCTTGATT
CCCGTGTCCGTAGGTGTATTTCAAAATGTGATTATTATAGCCTTTATCTTGATATTAGGTCCAACTTACGGGATAGAAAT
GGTAACAGTGGGCAGTTTAATCGGTTTTTCCATGAACTTTTTTATCTTGTATCCGAAAGCTCGCAAATTAAAAGTGCCTT
TAATTGATAAACTGAAACCTTTTCATCCCCTGGTTAAGCGAAGTTTTTACTTAATGCTTCCCATCCTTTTTGGTAATATG
GTTCTTCAGTTAAATAAGTTGGTAGATAGAATGCTGGCTTCTAACTTGGAAGAGGGTAGTATATCTGCTTTAAACTATGC
ATCTAAGATATTTACATTACCTCACGGAATTTTTGTCATGGCAGTGGCAACTGTACTGTATCCATCTTTCAGCCAGTTTG
CTGCCAAGGGTAATGTAAACAGGGTTAAAGAAACCATGGTAAGCGGTTTATCCAGTCTTGTCTTTTTAATTCTACCTATG
ATGATAGGTGCCCTGGTTTTAAGAGAGCCAATTATCAGGGTGTTATTTGAACGGGGAGAATTTGATGCAACAGCGACGGA
GCGCACAGCCTTTGCTTTGTTTTTTTACTCTCTGGGAATGCTTTCAATATCATTAAGGGAAATTATCAATCGGGTGTTTT
ACTCTTATCAAGATACAAAAACTCCTATCAGGATTGCTACTATCTCGGTTTTTATCAATATCGGATTGAATTTTCTCTTA
GTCGGCCCTTTGGGGCACGGAGGACTGGCCTTTGCTACCAGTATATCCATGACCATCGGAGTAGTTTTATTATTTATTAG
TGTCCGGCGCTTCCTAGGACCCTTTGGTTTAAGGTCATTTACAGTAAATGGGCTCAAAATGTTACTGGCCGCGGGAACCA
TGGGAACTATTCTCTACGGAGTCAATTTAATTTTACCGGAAGGTACAGCAGCTATCTGGAGGCTTGTGATACCGACTATC
TTTGGTGGCTCTGCTTATTTAGCGATCTGTAGGGCATTGCAAGTCGAAGAAATGGATATAGCCAAAGATATGTTGATAAA
AGCTCTCAACCGATTCCGAAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGTTTTATAATAAATTTTATGGCTAATTTCTGTTAACTGAGCAGTTAATATGGTAAGCTATAAGTGTTGCAGTTTA
ATCGGGGAGAGTGAGATGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATTGATAAACATGATGGACATAATTAGAAATAAATGAACATAATTAGACAACACCGATGAATGATTCGAATAAGATAAG
GACTTTTAATTTATAGAAAA

Product: integral membrane protein MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 514; Mature: 513

Protein sequence:

>514_residues
MTLNRGQAIKAAGAMTIVSLLSKVFGFLREMALAREFGATFETDAFLIAIMIPQILFASLGASIATTFIPLYTEARLDNK
HEVNSFVSTFFKIMVGLSSIIVTVALLFTPQLISVISPGFTGEVRELSILLTRIMLPVIVFLAAGGVLKGILHSHNEFLI
PVSVGVFQNVIIIAFILILGPTYGIEMVTVGSLIGFSMNFFILYPKARKLKVPLIDKLKPFHPLVKRSFYLMLPILFGNM
VLQLNKLVDRMLASNLEEGSISALNYASKIFTLPHGIFVMAVATVLYPSFSQFAAKGNVNRVKETMVSGLSSLVFLILPM
MIGALVLREPIIRVLFERGEFDATATERTAFALFFYSLGMLSISLREIINRVFYSYQDTKTPIRIATISVFINIGLNFLL
VGPLGHGGLAFATSISMTIGVVLLFISVRRFLGPFGLRSFTVNGLKMLLAAGTMGTILYGVNLILPEGTAAIWRLVIPTI
FGGSAYLAICRALQVEEMDIAKDMLIKALNRFRK

Sequences:

>Translated_514_residues
MTLNRGQAIKAAGAMTIVSLLSKVFGFLREMALAREFGATFETDAFLIAIMIPQILFASLGASIATTFIPLYTEARLDNK
HEVNSFVSTFFKIMVGLSSIIVTVALLFTPQLISVISPGFTGEVRELSILLTRIMLPVIVFLAAGGVLKGILHSHNEFLI
PVSVGVFQNVIIIAFILILGPTYGIEMVTVGSLIGFSMNFFILYPKARKLKVPLIDKLKPFHPLVKRSFYLMLPILFGNM
VLQLNKLVDRMLASNLEEGSISALNYASKIFTLPHGIFVMAVATVLYPSFSQFAAKGNVNRVKETMVSGLSSLVFLILPM
MIGALVLREPIIRVLFERGEFDATATERTAFALFFYSLGMLSISLREIINRVFYSYQDTKTPIRIATISVFINIGLNFLL
VGPLGHGGLAFATSISMTIGVVLLFISVRRFLGPFGLRSFTVNGLKMLLAAGTMGTILYGVNLILPEGTAAIWRLVIPTI
FGGSAYLAICRALQVEEMDIAKDMLIKALNRFRK
>Mature_513_residues
TLNRGQAIKAAGAMTIVSLLSKVFGFLREMALAREFGATFETDAFLIAIMIPQILFASLGASIATTFIPLYTEARLDNKH
EVNSFVSTFFKIMVGLSSIIVTVALLFTPQLISVISPGFTGEVRELSILLTRIMLPVIVFLAAGGVLKGILHSHNEFLIP
VSVGVFQNVIIIAFILILGPTYGIEMVTVGSLIGFSMNFFILYPKARKLKVPLIDKLKPFHPLVKRSFYLMLPILFGNMV
LQLNKLVDRMLASNLEEGSISALNYASKIFTLPHGIFVMAVATVLYPSFSQFAAKGNVNRVKETMVSGLSSLVFLILPMM
IGALVLREPIIRVLFERGEFDATATERTAFALFFYSLGMLSISLREIINRVFYSYQDTKTPIRIATISVFINIGLNFLLV
GPLGHGGLAFATSISMTIGVVLLFISVRRFLGPFGLRSFTVNGLKMLLAAGTMGTILYGVNLILPEGTAAIWRLVIPTIF
GGSAYLAICRALQVEEMDIAKDMLIKALNRFRK

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=514, Percent_Identity=27.6264591439689, Blast_Score=181, Evalue=1e-46,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56410; Mature: 56279

Theoretical pI: Translated: 10.45; Mature: 10.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTLNRGQAIKAAGAMTIVSLLSKVFGFLREMALAREFGATFETDAFLIAIMIPQILFASL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GASIATTFIPLYTEARLDNKHEVNSFVSTFFKIMVGLSSIIVTVALLFTPQLISVISPGF
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
TGEVRELSILLTRIMLPVIVFLAAGGVLKGILHSHNEFLIPVSVGVFQNVIIIAFILILG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PTYGIEMVTVGSLIGFSMNFFILYPKARKLKVPLIDKLKPFHPLVKRSFYLMLPILFGNM
CCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLQLNKLVDRMLASNLEEGSISALNYASKIFTLPHGIFVMAVATVLYPSFSQFAAKGNVN
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHH
RVKETMVSGLSSLVFLILPMMIGALVLREPIIRVLFERGEFDATATERTAFALFFYSLGM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LSISLREIINRVFYSYQDTKTPIRIATISVFINIGLNFLLVGPLGHGGLAFATSISMTIG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
VVLLFISVRRFLGPFGLRSFTVNGLKMLLAAGTMGTILYGVNLILPEGTAAIWRLVIPTI
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHH
FGGSAYLAICRALQVEEMDIAKDMLIKALNRFRK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TLNRGQAIKAAGAMTIVSLLSKVFGFLREMALAREFGATFETDAFLIAIMIPQILFASL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GASIATTFIPLYTEARLDNKHEVNSFVSTFFKIMVGLSSIIVTVALLFTPQLISVISPGF
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
TGEVRELSILLTRIMLPVIVFLAAGGVLKGILHSHNEFLIPVSVGVFQNVIIIAFILILG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PTYGIEMVTVGSLIGFSMNFFILYPKARKLKVPLIDKLKPFHPLVKRSFYLMLPILFGNM
CCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLQLNKLVDRMLASNLEEGSISALNYASKIFTLPHGIFVMAVATVLYPSFSQFAAKGNVN
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHH
RVKETMVSGLSSLVFLILPMMIGALVLREPIIRVLFERGEFDATATERTAFALFFYSLGM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LSISLREIINRVFYSYQDTKTPIRIATISVFINIGLNFLLVGPLGHGGLAFATSISMTIG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
VVLLFISVRRFLGPFGLRSFTVNGLKMLLAAGTMGTILYGVNLILPEGTAAIWRLVIPTI
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHH
FGGSAYLAICRALQVEEMDIAKDMLIKALNRFRK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8200538; 11677609 [H]