| Definition | Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010718 |
| Length | 3,165,557 |
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The map label for this gene is 188586457
Identifier: 188586457
GI number: 188586457
Start: 1919290
End: 1920474
Strand: Direct
Name: 188586457
Synonym: Nther_1842
Alternate gene names: NA
Gene position: 1919290-1920474 (Clockwise)
Preceding gene: 188586446
Following gene: 188586463
Centisome position: 60.63
GC content: 36.54
Gene sequence:
>1185_bases ATGCTAGCCTTTATAATTATGGGATTTATAGTCGGTTTTGAACACAGTTTGTTAGTTGATTTGTACGAAATAGTTAAAGC CCCTTCTGTTTTAATTACTGATTACTTTGTAGTTGGTGGTTTAGGAGCTGCAATGGTTAATGCTGGGCTTGTAGGTTTGA TAGGGATTTTACTGACCAAAGTTTCTAAAGTTAAAGTAAAAGGACCAATTATTGCAGCTATTTTTACAATGGCGGGATTT TCATTTTTGGGAAAAAATATAATAAATATTTGGCCCGTGTTTTTGGGTGTCTATTTATACTCTTTAACTCAAAAAGAAGG GTTAAATAACTATATTTTAAATGCTTTATTTGGAACTGCTTTAGCTCCTTTGGTTTCTAGTATTTCAATTACTTCAGATT TAGGTGTCACCGGAGGAATCATTGGAGGTGTGATAGCAGGATTTATAGTTCCGCCCTTAGCAGGACATCTCTTAGCAACC CATCAGGGGTTGAATCTCTATAATATTGGCTTTACTGCAGGTTTTATCGGAACTCTTTTCACTGGAATTTTCAGGGGTAT TGGAAATGCAAAAGAACTAGTCACATACTGGGGCGAAGGCTATAATGACATTGTCTTTCCATTTTTGATGGTTTATTTAG GATCTATGATTATTCTCGGTTTATTTTTAACAAGAGGTAAACTCAAAAATTACATTGAAATTCATGAGTTGAGTGGCGCC TTAGTTACAGATACGGTCACTCATAAGGGATTAGGTTCTTCTTTGATAAATATGGGAGTTGTAGGATTTTTGGGAATGAG TTATGTATTACTAATTGGTGGAGAACTGAATGGTGGTGCCTTAACTGGAATATTTACCATAGTTGGCTTCGGAGCCTTTG GAAAGCATATAAAAAATATGCTCCCATTAATGTTAGGAGCTTATCTATCTTTATACTTATTCCAGTGGAATCCGACAGAA CCCGGACCAGTCTTAGGAGTATTATTCGCTACCACACTAGCTCCCATCTCTGGGACTCTTGGTCCACTCCTTGGAATGTT AGCAGGGTTTTTGCACATGTCAATGGTTATGAACACAGGATATTTGCACGGTGGACTTAACCTTTATAACAACGGTTTTG CTGGTGGTATAGTAGCAACTATGATGATCGGTGTTATTAAAAATTACCAGAATGACTTTGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAAATCGCTTGTATTTAAAATCACATAGGGGAGGGAATTAAAATCAAAGTTCTTGGAATAATTAAAGAAGATGTTTCGG CAGTAATTCTATCACTTTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGATTGATTTAAAAGTCTAATTTCAAGCCGTGATTTTTTAACCATTGCCGCCTCCACTTATAATCAGGAAGAATATTGC CAACATACTTCCAAAATTGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 394; Mature: 394
Protein sequence:
>394_residues MLAFIIMGFIVGFEHSLLVDLYEIVKAPSVLITDYFVVGGLGAAMVNAGLVGLIGILLTKVSKVKVKGPIIAAIFTMAGF SFLGKNIINIWPVFLGVYLYSLTQKEGLNNYILNALFGTALAPLVSSISITSDLGVTGGIIGGVIAGFIVPPLAGHLLAT HQGLNLYNIGFTAGFIGTLFTGIFRGIGNAKELVTYWGEGYNDIVFPFLMVYLGSMIILGLFLTRGKLKNYIEIHELSGA LVTDTVTHKGLGSSLINMGVVGFLGMSYVLLIGGELNGGALTGIFTIVGFGAFGKHIKNMLPLMLGAYLSLYLFQWNPTE PGPVLGVLFATTLAPISGTLGPLLGMLAGFLHMSMVMNTGYLHGGLNLYNNGFAGGIVATMMIGVIKNYQNDFE
Sequences:
>Translated_394_residues MLAFIIMGFIVGFEHSLLVDLYEIVKAPSVLITDYFVVGGLGAAMVNAGLVGLIGILLTKVSKVKVKGPIIAAIFTMAGF SFLGKNIINIWPVFLGVYLYSLTQKEGLNNYILNALFGTALAPLVSSISITSDLGVTGGIIGGVIAGFIVPPLAGHLLAT HQGLNLYNIGFTAGFIGTLFTGIFRGIGNAKELVTYWGEGYNDIVFPFLMVYLGSMIILGLFLTRGKLKNYIEIHELSGA LVTDTVTHKGLGSSLINMGVVGFLGMSYVLLIGGELNGGALTGIFTIVGFGAFGKHIKNMLPLMLGAYLSLYLFQWNPTE PGPVLGVLFATTLAPISGTLGPLLGMLAGFLHMSMVMNTGYLHGGLNLYNNGFAGGIVATMMIGVIKNYQNDFE >Mature_394_residues MLAFIIMGFIVGFEHSLLVDLYEIVKAPSVLITDYFVVGGLGAAMVNAGLVGLIGILLTKVSKVKVKGPIIAAIFTMAGF SFLGKNIINIWPVFLGVYLYSLTQKEGLNNYILNALFGTALAPLVSSISITSDLGVTGGIIGGVIAGFIVPPLAGHLLAT HQGLNLYNIGFTAGFIGTLFTGIFRGIGNAKELVTYWGEGYNDIVFPFLMVYLGSMIILGLFLTRGKLKNYIEIHELSGA LVTDTVTHKGLGSSLINMGVVGFLGMSYVLLIGGELNGGALTGIFTIVGFGAFGKHIKNMLPLMLGAYLSLYLFQWNPTE PGPVLGVLFATTLAPISGTLGPLLGMLAGFLHMSMVMNTGYLHGGLNLYNNGFAGGIVATMMIGVIKNYQNDFE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 41684; Mature: 41684
Theoretical pI: Translated: 7.92; Mature: 7.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 4.1 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 4.1 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLAFIIMGFIVGFEHSLLVDLYEIVKAPSVLITDYFVVGGLGAAMVNAGLVGLIGILLTK CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VSKVKVKGPIIAAIFTMAGFSFLGKNIINIWPVFLGVYLYSLTQKEGLNNYILNALFGTA HHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH LAPLVSSISITSDLGVTGGIIGGVIAGFIVPPLAGHLLATHQGLNLYNIGFTAGFIGTLF HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHH TGIFRGIGNAKELVTYWGEGYNDIVFPFLMVYLGSMIILGLFLTRGKLKNYIEIHELSGA HHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LVTDTVTHKGLGSSLINMGVVGFLGMSYVLLIGGELNGGALTGIFTIVGFGAFGKHIKNM HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LPLMLGAYLSLYLFQWNPTEPGPVLGVLFATTLAPISGTLGPLLGMLAGFLHMSMVMNTG HHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC YLHGGLNLYNNGFAGGIVATMMIGVIKNYQNDFE CEECCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MLAFIIMGFIVGFEHSLLVDLYEIVKAPSVLITDYFVVGGLGAAMVNAGLVGLIGILLTK CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VSKVKVKGPIIAAIFTMAGFSFLGKNIINIWPVFLGVYLYSLTQKEGLNNYILNALFGTA HHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH LAPLVSSISITSDLGVTGGIIGGVIAGFIVPPLAGHLLATHQGLNLYNIGFTAGFIGTLF HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHH TGIFRGIGNAKELVTYWGEGYNDIVFPFLMVYLGSMIILGLFLTRGKLKNYIEIHELSGA HHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LVTDTVTHKGLGSSLINMGVVGFLGMSYVLLIGGELNGGALTGIFTIVGFGAFGKHIKNM HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LPLMLGAYLSLYLFQWNPTEPGPVLGVLFATTLAPISGTLGPLLGMLAGFLHMSMVMNTG HHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC YLHGGLNLYNNGFAGGIVATMMIGVIKNYQNDFE CEECCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA