Definition Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome.
Accession NC_010718
Length 3,165,557

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The map label for this gene is 188586457

Identifier: 188586457

GI number: 188586457

Start: 1919290

End: 1920474

Strand: Direct

Name: 188586457

Synonym: Nther_1842

Alternate gene names: NA

Gene position: 1919290-1920474 (Clockwise)

Preceding gene: 188586446

Following gene: 188586463

Centisome position: 60.63

GC content: 36.54

Gene sequence:

>1185_bases
ATGCTAGCCTTTATAATTATGGGATTTATAGTCGGTTTTGAACACAGTTTGTTAGTTGATTTGTACGAAATAGTTAAAGC
CCCTTCTGTTTTAATTACTGATTACTTTGTAGTTGGTGGTTTAGGAGCTGCAATGGTTAATGCTGGGCTTGTAGGTTTGA
TAGGGATTTTACTGACCAAAGTTTCTAAAGTTAAAGTAAAAGGACCAATTATTGCAGCTATTTTTACAATGGCGGGATTT
TCATTTTTGGGAAAAAATATAATAAATATTTGGCCCGTGTTTTTGGGTGTCTATTTATACTCTTTAACTCAAAAAGAAGG
GTTAAATAACTATATTTTAAATGCTTTATTTGGAACTGCTTTAGCTCCTTTGGTTTCTAGTATTTCAATTACTTCAGATT
TAGGTGTCACCGGAGGAATCATTGGAGGTGTGATAGCAGGATTTATAGTTCCGCCCTTAGCAGGACATCTCTTAGCAACC
CATCAGGGGTTGAATCTCTATAATATTGGCTTTACTGCAGGTTTTATCGGAACTCTTTTCACTGGAATTTTCAGGGGTAT
TGGAAATGCAAAAGAACTAGTCACATACTGGGGCGAAGGCTATAATGACATTGTCTTTCCATTTTTGATGGTTTATTTAG
GATCTATGATTATTCTCGGTTTATTTTTAACAAGAGGTAAACTCAAAAATTACATTGAAATTCATGAGTTGAGTGGCGCC
TTAGTTACAGATACGGTCACTCATAAGGGATTAGGTTCTTCTTTGATAAATATGGGAGTTGTAGGATTTTTGGGAATGAG
TTATGTATTACTAATTGGTGGAGAACTGAATGGTGGTGCCTTAACTGGAATATTTACCATAGTTGGCTTCGGAGCCTTTG
GAAAGCATATAAAAAATATGCTCCCATTAATGTTAGGAGCTTATCTATCTTTATACTTATTCCAGTGGAATCCGACAGAA
CCCGGACCAGTCTTAGGAGTATTATTCGCTACCACACTAGCTCCCATCTCTGGGACTCTTGGTCCACTCCTTGGAATGTT
AGCAGGGTTTTTGCACATGTCAATGGTTATGAACACAGGATATTTGCACGGTGGACTTAACCTTTATAACAACGGTTTTG
CTGGTGGTATAGTAGCAACTATGATGATCGGTGTTATTAAAAATTACCAGAATGACTTTGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAATCGCTTGTATTTAAAATCACATAGGGGAGGGAATTAAAATCAAAGTTCTTGGAATAATTAAAGAAGATGTTTCGG
CAGTAATTCTATCACTTTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGATTGATTTAAAAGTCTAATTTCAAGCCGTGATTTTTTAACCATTGCCGCCTCCACTTATAATCAGGAAGAATATTGC
CAACATACTTCCAAAATTGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 394; Mature: 394

Protein sequence:

>394_residues
MLAFIIMGFIVGFEHSLLVDLYEIVKAPSVLITDYFVVGGLGAAMVNAGLVGLIGILLTKVSKVKVKGPIIAAIFTMAGF
SFLGKNIINIWPVFLGVYLYSLTQKEGLNNYILNALFGTALAPLVSSISITSDLGVTGGIIGGVIAGFIVPPLAGHLLAT
HQGLNLYNIGFTAGFIGTLFTGIFRGIGNAKELVTYWGEGYNDIVFPFLMVYLGSMIILGLFLTRGKLKNYIEIHELSGA
LVTDTVTHKGLGSSLINMGVVGFLGMSYVLLIGGELNGGALTGIFTIVGFGAFGKHIKNMLPLMLGAYLSLYLFQWNPTE
PGPVLGVLFATTLAPISGTLGPLLGMLAGFLHMSMVMNTGYLHGGLNLYNNGFAGGIVATMMIGVIKNYQNDFE

Sequences:

>Translated_394_residues
MLAFIIMGFIVGFEHSLLVDLYEIVKAPSVLITDYFVVGGLGAAMVNAGLVGLIGILLTKVSKVKVKGPIIAAIFTMAGF
SFLGKNIINIWPVFLGVYLYSLTQKEGLNNYILNALFGTALAPLVSSISITSDLGVTGGIIGGVIAGFIVPPLAGHLLAT
HQGLNLYNIGFTAGFIGTLFTGIFRGIGNAKELVTYWGEGYNDIVFPFLMVYLGSMIILGLFLTRGKLKNYIEIHELSGA
LVTDTVTHKGLGSSLINMGVVGFLGMSYVLLIGGELNGGALTGIFTIVGFGAFGKHIKNMLPLMLGAYLSLYLFQWNPTE
PGPVLGVLFATTLAPISGTLGPLLGMLAGFLHMSMVMNTGYLHGGLNLYNNGFAGGIVATMMIGVIKNYQNDFE
>Mature_394_residues
MLAFIIMGFIVGFEHSLLVDLYEIVKAPSVLITDYFVVGGLGAAMVNAGLVGLIGILLTKVSKVKVKGPIIAAIFTMAGF
SFLGKNIINIWPVFLGVYLYSLTQKEGLNNYILNALFGTALAPLVSSISITSDLGVTGGIIGGVIAGFIVPPLAGHLLAT
HQGLNLYNIGFTAGFIGTLFTGIFRGIGNAKELVTYWGEGYNDIVFPFLMVYLGSMIILGLFLTRGKLKNYIEIHELSGA
LVTDTVTHKGLGSSLINMGVVGFLGMSYVLLIGGELNGGALTGIFTIVGFGAFGKHIKNMLPLMLGAYLSLYLFQWNPTE
PGPVLGVLFATTLAPISGTLGPLLGMLAGFLHMSMVMNTGYLHGGLNLYNNGFAGGIVATMMIGVIKNYQNDFE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41684; Mature: 41684

Theoretical pI: Translated: 7.92; Mature: 7.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CEECCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure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CEECCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA