| Definition | Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010718 |
| Length | 3,165,557 |
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The map label for this gene is 188585363
Identifier: 188585363
GI number: 188585363
Start: 757593
End: 759587
Strand: Reverse
Name: 188585363
Synonym: Nther_0730
Alternate gene names: NA
Gene position: 759587-757593 (Counterclockwise)
Preceding gene: 188585364
Following gene: 188585359
Centisome position: 24.0
GC content: 35.94
Gene sequence:
>1995_bases ATGAAATCGATACTACCATTATTTAATAAAGGGCTGGTATTCAGTAACTTAAAAAGGTTTTGGTGGGTAAGTGCCCTATA TAGTTTATTGCTTTTTTTCATAGTACCTTTTCAGATGATAATTCAGTTAGATGAAGTGACCCAGTCTAGCTTTATGCAAG ATCGATTACTTAATCTATTAGATCTAACTACAAATCCCGGGCAAACTCAGTTCTTGCTTGTTTTCGTCCTACCCGTAGTC GTAGCTATTCTGGTATTTCGTTATTTACAATTAGGTAGCGCAGCTTCTATGTTTCACAGTTTACCCGTCACCAGAAAGCA ACTATATCTCAACAATCTAATCTCAGGTTTAATCATTTTAGTAATTCCAGTCTTATTTAACGGTTTCTTACTTACTTTAT TCCATGCCACTACCGAACTTTCTTGGGTTTACAACATGGGGCATGTATTTAACTGGGGAGGTTACACTCTACTATTCATC TTGATAATGTACAGTTTTGCCGTTTTCGTAGGAATGTTTACTGGAAACTCCGTGGCACAGTTGGTGTTTAACTATATTTT GCATATCCTTCCCCTGGGATTATTTTATCTTATTCAAACGAATTTGCCCCATTTAATTCACGGATACAGTAGAAATATTA TCACTGAACCGGCATTTTTGGAGAAACTACCACTAATGGTAATTGGAAATGCAGAGATAACTGAAGTGATTATTTGGTAT CTAGTGTTTTCTGCTATTTTCTTTATTAGTGCATATTATGCTTACAAGTTGAGACACATTGAAGTGGCTGGTGACCTGAT TTCATTTAGTGTAATTCAACCTATATTTAAATACGGAGTTACCTTTTGTACCATGTTATTAGGTGGTGCCTATTCGGCTA GTATTTCCCATGGCAGTCTCGGAGCTATTGTCTTTGGATATTTGATTAGTTCACTGGTAGGATACTTTATAGCAGAAATG TTAATTCAAAAAACTTATAAAGTGTTTAATGCTTATAAGGGGTATTTAATCTATCTAGGAATAATTATCTTACTATTCGT TGGAATTCAGGCCGATGTTACAGGATATCAAAGTCGAGTTCCAGATAGTGAAGAGGTTGAGTCAGTGTTTTTTGGACGAG GTGCTTATCAGTTCCGGCAGATTCAAGAAGGACACATTGAGCCCTCTAAAGTTTCCGGTTTTTATCAAGAACATGAAAAT ATTGAAAATGTCATCAAACTCCATGAAAAACTGATAAAAACTGATAAAAATACTCAAGGATCACATTACAGTCTCATATA CACTTTGAAAGATGGAAGTGTCATTGCTAGAGATTACACAATAAATCAAGAACACTACACATCATTACTGAAGCCGATCT ATGAATCTTTAGAATATAAAGAGGCCGAATATCCGATACTGCAGCAAGATGCCAGTAAAATTGACAGCATTACCCTGGGA GATGATCGCAATCCAGAAAACCAAATCACCTTGACTGACGAGCAAGAAATTCAAACATTTTCTGAAATAATCAGTTCAGA AATAATGGAACTAGAATATGAAGAGTTACATCAACAAAATAGAAATTACTTGTTCGCCTCCATAGAAGACGAAGAAGGAA CAACTTATTATCAGTTAAAAGAAAGCTATGAGGAACTTAGAAACTGGCTAGTAGAAGAAGGGTATTATGAAGATTTTGCT TTATCCCACGAAGATATCAGGTATATTGAGATCGGTGAAGATGATTTTTCACATGGTGTTAGAGCTGGTGAATCCGAAGA GCAAACAATTGAAATTAGAGATCCTGAACTAATCAAAGAAGTTTTCCAACTTAGTAGTGCTGCTCCTAGAGGTAACCGAA GCGATTCCGATTATTTTTGGGCTACATTCCACTTCCAAGACAATATGGGAAGACAACAATTTGTCGATCAGCTGGCATTG AGTGATACTATGTGGGAAGATTTATCCTCTGAGTTACACAACAAACTGGAGCAAGTTTTACAGGAAAGTGATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GAAATCTTGTCTCAATTACAACAGGCCAATCCATTAATTCTCGATCTTTTGTCTTTAACATTGGAAGAAATTTTCATTTA CGAGCTAGGAGGTAAAGGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATAATGATGCTTACATTACTTGAATTTCTCAATTAAGATAAAAAGAGGTAGCTGATGCAGCTACCTCTTTTTATTTGC CCTTTTATCATTGCTTATCC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 664; Mature: 664
Protein sequence:
>664_residues MKSILPLFNKGLVFSNLKRFWWVSALYSLLLFFIVPFQMIIQLDEVTQSSFMQDRLLNLLDLTTNPGQTQFLLVFVLPVV VAILVFRYLQLGSAASMFHSLPVTRKQLYLNNLISGLIILVIPVLFNGFLLTLFHATTELSWVYNMGHVFNWGGYTLLFI LIMYSFAVFVGMFTGNSVAQLVFNYILHILPLGLFYLIQTNLPHLIHGYSRNIITEPAFLEKLPLMVIGNAEITEVIIWY LVFSAIFFISAYYAYKLRHIEVAGDLISFSVIQPIFKYGVTFCTMLLGGAYSASISHGSLGAIVFGYLISSLVGYFIAEM LIQKTYKVFNAYKGYLIYLGIIILLFVGIQADVTGYQSRVPDSEEVESVFFGRGAYQFRQIQEGHIEPSKVSGFYQEHEN IENVIKLHEKLIKTDKNTQGSHYSLIYTLKDGSVIARDYTINQEHYTSLLKPIYESLEYKEAEYPILQQDASKIDSITLG DDRNPENQITLTDEQEIQTFSEIISSEIMELEYEELHQQNRNYLFASIEDEEGTTYYQLKESYEELRNWLVEEGYYEDFA LSHEDIRYIEIGEDDFSHGVRAGESEEQTIEIRDPELIKEVFQLSSAAPRGNRSDSDYFWATFHFQDNMGRQQFVDQLAL SDTMWEDLSSELHNKLEQVLQESD
Sequences:
>Translated_664_residues MKSILPLFNKGLVFSNLKRFWWVSALYSLLLFFIVPFQMIIQLDEVTQSSFMQDRLLNLLDLTTNPGQTQFLLVFVLPVV VAILVFRYLQLGSAASMFHSLPVTRKQLYLNNLISGLIILVIPVLFNGFLLTLFHATTELSWVYNMGHVFNWGGYTLLFI LIMYSFAVFVGMFTGNSVAQLVFNYILHILPLGLFYLIQTNLPHLIHGYSRNIITEPAFLEKLPLMVIGNAEITEVIIWY LVFSAIFFISAYYAYKLRHIEVAGDLISFSVIQPIFKYGVTFCTMLLGGAYSASISHGSLGAIVFGYLISSLVGYFIAEM LIQKTYKVFNAYKGYLIYLGIIILLFVGIQADVTGYQSRVPDSEEVESVFFGRGAYQFRQIQEGHIEPSKVSGFYQEHEN IENVIKLHEKLIKTDKNTQGSHYSLIYTLKDGSVIARDYTINQEHYTSLLKPIYESLEYKEAEYPILQQDASKIDSITLG DDRNPENQITLTDEQEIQTFSEIISSEIMELEYEELHQQNRNYLFASIEDEEGTTYYQLKESYEELRNWLVEEGYYEDFA LSHEDIRYIEIGEDDFSHGVRAGESEEQTIEIRDPELIKEVFQLSSAAPRGNRSDSDYFWATFHFQDNMGRQQFVDQLAL SDTMWEDLSSELHNKLEQVLQESD >Mature_664_residues MKSILPLFNKGLVFSNLKRFWWVSALYSLLLFFIVPFQMIIQLDEVTQSSFMQDRLLNLLDLTTNPGQTQFLLVFVLPVV VAILVFRYLQLGSAASMFHSLPVTRKQLYLNNLISGLIILVIPVLFNGFLLTLFHATTELSWVYNMGHVFNWGGYTLLFI LIMYSFAVFVGMFTGNSVAQLVFNYILHILPLGLFYLIQTNLPHLIHGYSRNIITEPAFLEKLPLMVIGNAEITEVIIWY LVFSAIFFISAYYAYKLRHIEVAGDLISFSVIQPIFKYGVTFCTMLLGGAYSASISHGSLGAIVFGYLISSLVGYFIAEM LIQKTYKVFNAYKGYLIYLGIIILLFVGIQADVTGYQSRVPDSEEVESVFFGRGAYQFRQIQEGHIEPSKVSGFYQEHEN IENVIKLHEKLIKTDKNTQGSHYSLIYTLKDGSVIARDYTINQEHYTSLLKPIYESLEYKEAEYPILQQDASKIDSITLG DDRNPENQITLTDEQEIQTFSEIISSEIMELEYEELHQQNRNYLFASIEDEEGTTYYQLKESYEELRNWLVEEGYYEDFA LSHEDIRYIEIGEDDFSHGVRAGESEEQTIEIRDPELIKEVFQLSSAAPRGNRSDSDYFWATFHFQDNMGRQQFVDQLAL SDTMWEDLSSELHNKLEQVLQESD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76494; Mature: 76494
Theoretical pI: Translated: 4.48; Mature: 4.48
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKSILPLFNKGLVFSNLKRFWWVSALYSLLLFFIVPFQMIIQLDEVTQSSFMQDRLLNLL CCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLTTNPGQTQFLLVFVLPVVVAILVFRYLQLGSAASMFHSLPVTRKQLYLNNLISGLIIL HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VIPVLFNGFLLTLFHATTELSWVYNMGHVFNWGGYTLLFILIMYSFAVFVGMFTGNSVAQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH LVFNYILHILPLGLFYLIQTNLPHLIHGYSRNIITEPAFLEKLPLMVIGNAEITEVIIWY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHH LVFSAIFFISAYYAYKLRHIEVAGDLISFSVIQPIFKYGVTFCTMLLGGAYSASISHGSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCH GAIVFGYLISSLVGYFIAEMLIQKTYKVFNAYKGYLIYLGIIILLFVGIQADVTGYQSRV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCC PDSEEVESVFFGRGAYQFRQIQEGHIEPSKVSGFYQEHENIENVIKLHEKLIKTDKNTQG CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC SHYSLIYTLKDGSVIARDYTINQEHYTSLLKPIYESLEYKEAEYPILQQDASKIDSITLG CEEEEEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCEEECC DDRNPENQITLTDEQEIQTFSEIISSEIMELEYEELHQQNRNYLFASIEDEEGTTYYQLK CCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHH ESYEELRNWLVEEGYYEDFALSHEDIRYIEIGEDDFSHGVRAGESEEQTIEIRDPELIKE HHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHH VFQLSSAAPRGNRSDSDYFWATFHFQDNMGRQQFVDQLALSDTMWEDLSSELHNKLEQVL HHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QESD HCCC >Mature Secondary Structure MKSILPLFNKGLVFSNLKRFWWVSALYSLLLFFIVPFQMIIQLDEVTQSSFMQDRLLNLL CCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLTTNPGQTQFLLVFVLPVVVAILVFRYLQLGSAASMFHSLPVTRKQLYLNNLISGLIIL HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VIPVLFNGFLLTLFHATTELSWVYNMGHVFNWGGYTLLFILIMYSFAVFVGMFTGNSVAQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH LVFNYILHILPLGLFYLIQTNLPHLIHGYSRNIITEPAFLEKLPLMVIGNAEITEVIIWY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHH LVFSAIFFISAYYAYKLRHIEVAGDLISFSVIQPIFKYGVTFCTMLLGGAYSASISHGSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCH GAIVFGYLISSLVGYFIAEMLIQKTYKVFNAYKGYLIYLGIIILLFVGIQADVTGYQSRV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCC PDSEEVESVFFGRGAYQFRQIQEGHIEPSKVSGFYQEHENIENVIKLHEKLIKTDKNTQG CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC SHYSLIYTLKDGSVIARDYTINQEHYTSLLKPIYESLEYKEAEYPILQQDASKIDSITLG CEEEEEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCEEECC DDRNPENQITLTDEQEIQTFSEIISSEIMELEYEELHQQNRNYLFASIEDEEGTTYYQLK CCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHH ESYEELRNWLVEEGYYEDFALSHEDIRYIEIGEDDFSHGVRAGESEEQTIEIRDPELIKE HHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHH VFQLSSAAPRGNRSDSDYFWATFHFQDNMGRQQFVDQLALSDTMWEDLSSELHNKLEQVL HHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QESD HCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA