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The map label for this gene is 188585045

Identifier: 188585045

GI number: 188585045

Start: 423454

End: 425721

Strand: Direct

Name: 188585045

Synonym: Nther_0406

Alternate gene names: NA

Gene position: 423454-425721 (Clockwise)

Preceding gene: 188585044

Following gene: 188585047

Centisome position: 13.38

GC content: 37.26

Gene sequence:

>2268_bases
ATGTTAGGGTTTAACATCCACTTCATTAAAACTAAATCATTATATGTGAGAGGAAAGTGTTTTGGAATTTTGTTATTGAC
ACTATTATTAGTGTCCTTTGTTAATATAAGTCATGGTGAAGCAAGTGAACAAAATGTCTATCCAAAGGCCCTTGATCCTG
AACGTGATCTCATAATTTTTATGGTACCTTCATTTTCTATGGAAAAGGCACTGGAATTACAACTTCCAGAGTTAGAGAAA
ATGGCTTCCCAAGGGGCTATGGGTTTAATCAATACTGGTGTTGCTGAAAGTTATCATCCTTCGGCGGCATATCTCACCTT
AGGTACAGGGGCAAGATCTACATGTGATGATGAACTGGCCCTAGCTTTAGAATCACAGGAAAAATACCAGCAAGCAACGG
GAAAAGAGTTGTATCGTAGAAATCTAGGCGCTTCACCAGCTGTAAAAAATGGGGATCTAGCACTAATACCTCGAATACCA
AAACTGACAGAAGAAAACGATGATTTAATGCACCCTGTGAAAACAGGAGGATTAGGTACTAAGCTACGGGATGAAGGAAT
TGAGCTAAAACTATGGGGGAATTCTGATACGGACCATCCCAGGCGGTATAGTGCTCTGGTCTTTATGGATCAGAAGGGCA
TTATCGAAAATGCCGATATCTCCCAGGAACAAACTTTACAGCAAGATAGTGCTCATCCTTTTGGTGTGAAGTCTGATATT
TCTAGCTATGAAGAAACTTTAGAACAAAGCATTCAACAGGGTTATGAAATTCAGGCTTATGAATTTGGAGATCTGGAAAG
ATTAACTTATTACGGGGATTACATGTCTCAGGAGAGAAAACAGGAATTACGACTTAAATATTATAATCAAATTAACAAGG
CTTTGAAAAGCGCCAATGAACACTTAGAAACTCATCAGATTGTACTGTTAAATCCTGCACCTACTAGAGAAAACTATTTT
GAAGGAAAACGCCTTACCTATATGTTAATTCATCCTGTTTCACAACAAGGTACAAACTTATTGACTTCTGATACAACTCA
AAGAGATGGTATCATAGCTAATATGGATTTTGCTCCTTCTATTTTAAGAAAGACAGGTCTGGAAACTTCGTCCCAATTTT
TAGGGGCTCCCATGGAGATAATTCCGGAAAACGTCTCAACAAATTATCTTGAGGATAAATATCAATCCATGTTGAGCACG
TATCAGAAAAGACCAGCCTTGGTACAAGGGTTTATTTTTATAAAAATCTTTTTAATGGTGCTGGGGATTATAGCTATATT
CTTCTCTAAAAACACGATTCCGAAAATGGATATTTGGTTGTTGGCAATAATTATAAGCCCGTTGTTATTTTTGATTTTGG
GGGGACTGTCGCCCATTGATTTATTTCCAGCTGCACTGATTTTAATCCTGGGTTCTGTGGGAATAGTTTATCTCATGAGG
ACTAAATTGGGGATTATCGAAACTATGGGATTAGCTTCATTACTAGTGAGTGGGGCTGTAATTTTAGATACATTTTTAGG
TAATTCCTTATTACATGCCTCTGTATTAGGGCATGACCCTATTTCAGGAGCCCGGTATTATGGACTCGGGAATGAGTATA
TGGGGATATTAATTGGTTCAACGGTACTGGCAATATTCAGTTTGGGCTCTGCTCCCAAGAGAACATTTAGTGTATTTGTT
CTAGCCCTAATATTAATGTTATTTATATTTAGCCATCCACAATTAGGTGCGAACCTGGGTGGTGTTATAACTACTCTAGG
AGTTTTAATTACTATATCATTTATCCACTATAATGAGATTAATCTTGATAAAAACAAAGTGAACAAGTTGATTATTGTTG
TCCTTGGTTTGTTGATTATATTTGGGGCGATTTTTGTAGTGATTAATCTTAGAGGTGACACAGTCAGTCATATAGGGAGA
ACTATTGATTTAGTAAGGGGGCAAGGAATCGGAGAGTTGTACATGGTGATTGTTAGGAAAATTAGCATGAACATATCCTT
AATTCGTTATTCTGTTTGGAGTAAGGTATTACTCTCCTTTGTTGGTGTGTTAATTTTTATTTTGTTATATAAACCAGGGC
GACAGTTTGACAAGTTACAGCATAAAAATTTACAAGTTATTAGAGCTTTACAGGGAAATGTCATGGGAAGTATTGTAGCT
TTTGTTGTCAATGATTCGGGTGTAGTTGCGGCGGCAACTTTATTAATATTCGCAGTTCCCCCATTACTACTGATAAATTT
ACCGCTCCCGCAAGGCGAAGTTGATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGCAATTAATTTTTAAAGCTTATTACAAAGCGTTGAAAAACTTTAGTGACAAAAAGATGACTTCAGAAATAGTTGAAAC
ATACAATGAGGTGGCTAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAGTGGATCGAAAGAATTCTGATCAATACTAGAGATTTTTACTAGGGTTTCTGGAAATTTACGTCTAAAAATCCAGTTC
ATCTAATTCTTTATACTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 755; Mature: 755

Protein sequence:

>755_residues
MLGFNIHFIKTKSLYVRGKCFGILLLTLLLVSFVNISHGEASEQNVYPKALDPERDLIIFMVPSFSMEKALELQLPELEK
MASQGAMGLINTGVAESYHPSAAYLTLGTGARSTCDDELALALESQEKYQQATGKELYRRNLGASPAVKNGDLALIPRIP
KLTEENDDLMHPVKTGGLGTKLRDEGIELKLWGNSDTDHPRRYSALVFMDQKGIIENADISQEQTLQQDSAHPFGVKSDI
SSYEETLEQSIQQGYEIQAYEFGDLERLTYYGDYMSQERKQELRLKYYNQINKALKSANEHLETHQIVLLNPAPTRENYF
EGKRLTYMLIHPVSQQGTNLLTSDTTQRDGIIANMDFAPSILRKTGLETSSQFLGAPMEIIPENVSTNYLEDKYQSMLST
YQKRPALVQGFIFIKIFLMVLGIIAIFFSKNTIPKMDIWLLAIIISPLLFLILGGLSPIDLFPAALILILGSVGIVYLMR
TKLGIIETMGLASLLVSGAVILDTFLGNSLLHASVLGHDPISGARYYGLGNEYMGILIGSTVLAIFSLGSAPKRTFSVFV
LALILMLFIFSHPQLGANLGGVITTLGVLITISFIHYNEINLDKNKVNKLIIVVLGLLIIFGAIFVVINLRGDTVSHIGR
TIDLVRGQGIGELYMVIVRKISMNISLIRYSVWSKVLLSFVGVLIFILLYKPGRQFDKLQHKNLQVIRALQGNVMGSIVA
FVVNDSGVVAAATLLIFAVPPLLLINLPLPQGEVD

Sequences:

>Translated_755_residues
MLGFNIHFIKTKSLYVRGKCFGILLLTLLLVSFVNISHGEASEQNVYPKALDPERDLIIFMVPSFSMEKALELQLPELEK
MASQGAMGLINTGVAESYHPSAAYLTLGTGARSTCDDELALALESQEKYQQATGKELYRRNLGASPAVKNGDLALIPRIP
KLTEENDDLMHPVKTGGLGTKLRDEGIELKLWGNSDTDHPRRYSALVFMDQKGIIENADISQEQTLQQDSAHPFGVKSDI
SSYEETLEQSIQQGYEIQAYEFGDLERLTYYGDYMSQERKQELRLKYYNQINKALKSANEHLETHQIVLLNPAPTRENYF
EGKRLTYMLIHPVSQQGTNLLTSDTTQRDGIIANMDFAPSILRKTGLETSSQFLGAPMEIIPENVSTNYLEDKYQSMLST
YQKRPALVQGFIFIKIFLMVLGIIAIFFSKNTIPKMDIWLLAIIISPLLFLILGGLSPIDLFPAALILILGSVGIVYLMR
TKLGIIETMGLASLLVSGAVILDTFLGNSLLHASVLGHDPISGARYYGLGNEYMGILIGSTVLAIFSLGSAPKRTFSVFV
LALILMLFIFSHPQLGANLGGVITTLGVLITISFIHYNEINLDKNKVNKLIIVVLGLLIIFGAIFVVINLRGDTVSHIGR
TIDLVRGQGIGELYMVIVRKISMNISLIRYSVWSKVLLSFVGVLIFILLYKPGRQFDKLQHKNLQVIRALQGNVMGSIVA
FVVNDSGVVAAATLLIFAVPPLLLINLPLPQGEVD
>Mature_755_residues
MLGFNIHFIKTKSLYVRGKCFGILLLTLLLVSFVNISHGEASEQNVYPKALDPERDLIIFMVPSFSMEKALELQLPELEK
MASQGAMGLINTGVAESYHPSAAYLTLGTGARSTCDDELALALESQEKYQQATGKELYRRNLGASPAVKNGDLALIPRIP
KLTEENDDLMHPVKTGGLGTKLRDEGIELKLWGNSDTDHPRRYSALVFMDQKGIIENADISQEQTLQQDSAHPFGVKSDI
SSYEETLEQSIQQGYEIQAYEFGDLERLTYYGDYMSQERKQELRLKYYNQINKALKSANEHLETHQIVLLNPAPTRENYF
EGKRLTYMLIHPVSQQGTNLLTSDTTQRDGIIANMDFAPSILRKTGLETSSQFLGAPMEIIPENVSTNYLEDKYQSMLST
YQKRPALVQGFIFIKIFLMVLGIIAIFFSKNTIPKMDIWLLAIIISPLLFLILGGLSPIDLFPAALILILGSVGIVYLMR
TKLGIIETMGLASLLVSGAVILDTFLGNSLLHASVLGHDPISGARYYGLGNEYMGILIGSTVLAIFSLGSAPKRTFSVFV
LALILMLFIFSHPQLGANLGGVITTLGVLITISFIHYNEINLDKNKVNKLIIVVLGLLIIFGAIFVVINLRGDTVSHIGR
TIDLVRGQGIGELYMVIVRKISMNISLIRYSVWSKVLLSFVGVLIFILLYKPGRQFDKLQHKNLQVIRALQGNVMGSIVA
FVVNDSGVVAAATLLIFAVPPLLLINLPLPQGEVD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83537; Mature: 83537

Theoretical pI: Translated: 6.69; Mature: 6.69

Prosite motif: PS00178 AA_TRNA_LIGASE_I

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLGFNIHFIKTKSLYVRGKCFGILLLTLLLVSFVNISHGEASEQNVYPKALDPERDLIIF
CCCEEEEEEEECCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEE
MVPSFSMEKALELQLPELEKMASQGAMGLINTGVAESYHPSAAYLTLGTGARSTCDDELA
ECCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHH
LALESQEKYQQATGKELYRRNLGASPAVKNGDLALIPRIPKLTEENDDLMHPVKTGGLGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCC
KLRDEGIELKLWGNSDTDHPRRYSALVFMDQKGIIENADISQEQTLQQDSAHPFGVKSDI
CCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
SSYEETLEQSIQQGYEIQAYEFGDLERLTYYGDYMSQERKQELRLKYYNQINKALKSANE
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HLETHQIVLLNPAPTRENYFEGKRLTYMLIHPVSQQGTNLLTSDTTQRDGIIANMDFAPS
HCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHH
ILRKTGLETSSQFLGAPMEIIPENVSTNYLEDKYQSMLSTYQKRPALVQGFIFIKIFLMV
HHHHCCCCCCHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH
LGIIAIFFSKNTIPKMDIWLLAIIISPLLFLILGGLSPIDLFPAALILILGSVGIVYLMR
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TKLGIIETMGLASLLVSGAVILDTFLGNSLLHASVLGHDPISGARYYGLGNEYMGILIGS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHH
TVLAIFSLGSAPKRTFSVFVLALILMLFIFSHPQLGANLGGVITTLGVLITISFIHYNEI
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC
NLDKNKVNKLIIVVLGLLIIFGAIFVVINLRGDTVSHIGRTIDLVRGQGIGELYMVIVRK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
ISMNISLIRYSVWSKVLLSFVGVLIFILLYKPGRQFDKLQHKNLQVIRALQGNVMGSIVA
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEE
FVVNDSGVVAAATLLIFAVPPLLLINLPLPQGEVD
EEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLGFNIHFIKTKSLYVRGKCFGILLLTLLLVSFVNISHGEASEQNVYPKALDPERDLIIF
CCCEEEEEEEECCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEE
MVPSFSMEKALELQLPELEKMASQGAMGLINTGVAESYHPSAAYLTLGTGARSTCDDELA
ECCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHH
LALESQEKYQQATGKELYRRNLGASPAVKNGDLALIPRIPKLTEENDDLMHPVKTGGLGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCC
KLRDEGIELKLWGNSDTDHPRRYSALVFMDQKGIIENADISQEQTLQQDSAHPFGVKSDI
CCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
SSYEETLEQSIQQGYEIQAYEFGDLERLTYYGDYMSQERKQELRLKYYNQINKALKSANE
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HLETHQIVLLNPAPTRENYFEGKRLTYMLIHPVSQQGTNLLTSDTTQRDGIIANMDFAPS
HCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHH
ILRKTGLETSSQFLGAPMEIIPENVSTNYLEDKYQSMLSTYQKRPALVQGFIFIKIFLMV
HHHHCCCCCCHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH
LGIIAIFFSKNTIPKMDIWLLAIIISPLLFLILGGLSPIDLFPAALILILGSVGIVYLMR
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TKLGIIETMGLASLLVSGAVILDTFLGNSLLHASVLGHDPISGARYYGLGNEYMGILIGS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHH
TVLAIFSLGSAPKRTFSVFVLALILMLFIFSHPQLGANLGGVITTLGVLITISFIHYNEI
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC
NLDKNKVNKLIIVVLGLLIIFGAIFVVINLRGDTVSHIGRTIDLVRGQGIGELYMVIVRK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
ISMNISLIRYSVWSKVLLSFVGVLIFILLYKPGRQFDKLQHKNLQVIRALQGNVMGSIVA
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEE
FVVNDSGVVAAATLLIFAVPPLLLINLPLPQGEVD
EEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA