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The map label for this gene is 188528250

Identifier: 188528250

GI number: 188528250

Start: 1471141

End: 1473675

Strand: Reverse

Name: 188528250

Synonym: HPSH_07580

Alternate gene names: NA

Gene position: 1473675-1471141 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188528251

Following gene: 188528249

Centisome position: 91.62

GC content: 39.41

Gene sequence:

>2535_bases
GTGCTGAATGAAGAGCAAAATTCTAAAGGATTAGAAGAAAAAGGGGGTGAAAACAGAAACGAAAAAGAAGCCCCTTTAAA
GGGCATTCATTCTAAAATCCCCTCTTTTAAGCAAGCTTTAGAGCAGACACTCAATAAAATCAAAAGCTCTAAAGAGTTTT
TTAAGCCATTCTTACACAATAAAAAAAAGCTTTATATCGCGCTTGGGGCATTGCTTTTACTTATTGCGCTCATTGTGGCT
TTGAGTTTGTTGCTAGGGCATAAAAAAGAAAGCCAGCCCGCTTCTTTACAAAGCGCTACCACTAATAGCGAAACGCCTAA
CGACACCAACAACGCTAACAACACAGAAGCTGAAGGGCAAATAGAGAATTTAGACTTACCCGATTTAATCGGCAAGGACT
CCCTCAAACGAAGCGATGAGAATCAAGTGGATGCGATGATGAAAAAAGCGAGTCTTTTGTATGAGCAAGGGCAAAAAGAT
GAAGCCTTACATTTGTTTGACAAAGCCGCTTCTTTTTCGCAAGGGATTGCGAGCCATAATTTAGGGGTGATTAAGTTTAA
GGAAAAGGATTTTAATGGGGCGTTGGATTTGTTTGATTCTAGCATCGCTTCTAAAGAAAATGCGAGCGTGAGCGCGATTG
ATGCGTTGGTGAGCGCTTATCATTTGCAAGATTCGGATTTGTATTATCATTATCTAAAAATTGCGAGAGACACTTTGTAT
AAAGACTATAAAAAGTCTTTTTATTCCTACGCTTACGCGCTCAAATCTTATTACGCCGGGGAGTATTTTGAAGCCCTTTC
GCCCTTAATGCACCCTAATTCCAACGCCTTTTTAAAACCTAACGCGCGCCTAGCGTCTAAATTGTTTTTGATGTTTAAAG
ATGAAACGAACGCTTATCAACAATTGCAAAAAAGCGCAAACGCCCAAGATGGGCTTGCTTTAGGGCTTTTACAGGCGCGT
TTGGGCCATTACAAGCAGGCTTTGGAGCATTTGCAACATTATTTGCACAACTACCCTAAAGATTTAAACGCTTTAATGGC
TTTGGAATTGGTGAGTTTGAAAAAGGGCGACACCCTTAAAGCGAGCGAAGCCTTAAAACTAGCCAGCCACACAAAAGAAG
ACACGCTATTAGCCAACTCTTTTTACCCCATCAAGCCCACTATAAACCCTATTTTTTTGGATAAAGAAAGGGCCAAAGAG
CGTTTTTGGAACACGCAATATTTTGAAGGCAAGAGGGATTTTATTTACCGCTTGCTCTTTTATTACGCCCCTTTTAAGGT
TTTAGACTCTAAAGAAACCTTAGGCGTGATTGAAGAGGGGCTGTTTCTTTTAGACTCTGATGCTAAAAAGGATTTAGAGG
GGGCAAGCCTTGCTTTTAAAAGAGGGCGTTTGATGGCGATAGCGGATAAAAACGCGCTTAAAGGGTTGAAAGCGTTGGAA
AACAAGCGCTTGAAAGAAGCCCTTTCTTTTTTTGATTTGTCTTTAAAAAACAGCCCCAATAACGCGCTTTTGCATTATAA
TACGGGCTTGATTTATGCGCAATTAGAAAATTACCACAAAGCCTATTTCCATTTTTTAAGGGCTTTTCATTTGAATTCTG
CGGATTATTTGAGTGCGATTTTTGCAATTTTAGCCTCGCATTTCACCCACGAAGACACCACGGAGCTTTTAAGAGAAATC
ACAGAGAATTTTTATAGTCAGGATTTTTCTAGCCCCACGCAAAAAGCTTTACTATCTTCGCTCATCGCTTATTTGAATTA
CCGCACCAATTGGGATATGGACTGGCTTAAAAACGCCCCTAAAAAGATCCCTTTTTATTACGCGCTAGAAGCGGTGTTCG
CTAAAGAGAGCAAGGATAAAAAATTGATGGTGCAATCTTTTGGGAATTTGAAAAAAATGCTCCCTAAAGATCTCATCTCC
AATATCTTTTATGAAATCGTTTCGTATTATGATGCGAGTATCCGGCACACTTTAAGCATTTACACCCTTTTAGATTCGCA
TAAAATCAGTTGGGATCAAACCATGCAAGGGCCTATTTTGGGGCGTCATTTCTACACTTACATGGGATTTATGGTCAATG
ATTTAGATCATCAAGAAAAATTATTGGAGCAAAAAATCGCCAGTTTAGAAGAGGGCCAAGCCCCTAACGATTGGTTAGAA
AATTTAGCGCTAGTGAGCTTGTTTCAAGGGCAGTATGAAAAAGCGAGCGCGCTGTATCAAAACTTAATTAGCGATCTTAA
GGACAATGAGGTGCGTTTAAAAATCCTAGCGGGTTTAACCTATATTGCGCAAAATAATTACAATAACGCCGCTTTATGGC
TAGAGCTTGGGAAACTAGACGAACCTAATAATGAAAATATCCGTTACGCTTTAGGGTTGTTGTATCAAAGAAAAGGGGAT
CTCAAATCAGCGCTAAACCATTTTTTAGCCATTAAAACCTCTGATTTTTCTTCGCCTTATTTTGATTTTGAAATTGACAC
CAACCTTTTAAAAGAGCGTTTGAACCAAGAAAAAAAGGGCGAGTTTTTAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTAGGCAGGACGATGGTCGCTTTAATGGAAAACCACCAGCAAGCGGATGGGAGCATCCATATTCCTAAGGCGTTAGAAA
AATACCTTTAAGGCTAGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGATTTTGAAAAAAGCATTTTAGACAATTTAAACGAAGCGCAAAAAATCGCCGCAAGCCACATTCAAGGGCCTTTGCTG
ATTTTAGCGGGAGCTGGGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 844; Mature: 844

Protein sequence:

>844_residues
MLNEEQNSKGLEEKGGENRNEKEAPLKGIHSKIPSFKQALEQTLNKIKSSKEFFKPFLHNKKKLYIALGALLLLIALIVA
LSLLLGHKKESQPASLQSATTNSETPNDTNNANNTEAEGQIENLDLPDLIGKDSLKRSDENQVDAMMKKASLLYEQGQKD
EALHLFDKAASFSQGIASHNLGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDSDLYYHYLKIARDTLY
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNARLASKLFLMFKDETNAYQQLQKSANAQDGLALGLLQAR
LGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLKASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPIFLDKERAKE
RFWNTQYFEGKRDFIYRLLFYYAPFKVLDSKETLGVIEEGLFLLDSDAKKDLEGASLAFKRGRLMAIADKNALKGLKALE
NKRLKEALSFFDLSLKNSPNNALLHYNTGLIYAQLENYHKAYFHFLRAFHLNSADYLSAIFAILASHFTHEDTTELLREI
TENFYSQDFSSPTQKALLSSLIAYLNYRTNWDMDWLKNAPKKIPFYYALEAVFAKESKDKKLMVQSFGNLKKMLPKDLIS
NIFYEIVSYYDASIRHTLSIYTLLDSHKISWDQTMQGPILGRHFYTYMGFMVNDLDHQEKLLEQKIASLEEGQAPNDWLE
NLALVSLFQGQYEKASALYQNLISDLKDNEVRLKILAGLTYIAQNNYNNAALWLELGKLDEPNNENIRYALGLLYQRKGD
LKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDTNLLKERLNQEKKGEFLE

Sequences:

>Translated_844_residues
MLNEEQNSKGLEEKGGENRNEKEAPLKGIHSKIPSFKQALEQTLNKIKSSKEFFKPFLHNKKKLYIALGALLLLIALIVA
LSLLLGHKKESQPASLQSATTNSETPNDTNNANNTEAEGQIENLDLPDLIGKDSLKRSDENQVDAMMKKASLLYEQGQKD
EALHLFDKAASFSQGIASHNLGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDSDLYYHYLKIARDTLY
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNARLASKLFLMFKDETNAYQQLQKSANAQDGLALGLLQAR
LGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLKASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPIFLDKERAKE
RFWNTQYFEGKRDFIYRLLFYYAPFKVLDSKETLGVIEEGLFLLDSDAKKDLEGASLAFKRGRLMAIADKNALKGLKALE
NKRLKEALSFFDLSLKNSPNNALLHYNTGLIYAQLENYHKAYFHFLRAFHLNSADYLSAIFAILASHFTHEDTTELLREI
TENFYSQDFSSPTQKALLSSLIAYLNYRTNWDMDWLKNAPKKIPFYYALEAVFAKESKDKKLMVQSFGNLKKMLPKDLIS
NIFYEIVSYYDASIRHTLSIYTLLDSHKISWDQTMQGPILGRHFYTYMGFMVNDLDHQEKLLEQKIASLEEGQAPNDWLE
NLALVSLFQGQYEKASALYQNLISDLKDNEVRLKILAGLTYIAQNNYNNAALWLELGKLDEPNNENIRYALGLLYQRKGD
LKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDTNLLKERLNQEKKGEFLE
>Mature_844_residues
MLNEEQNSKGLEEKGGENRNEKEAPLKGIHSKIPSFKQALEQTLNKIKSSKEFFKPFLHNKKKLYIALGALLLLIALIVA
LSLLLGHKKESQPASLQSATTNSETPNDTNNANNTEAEGQIENLDLPDLIGKDSLKRSDENQVDAMMKKASLLYEQGQKD
EALHLFDKAASFSQGIASHNLGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDSDLYYHYLKIARDTLY
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNARLASKLFLMFKDETNAYQQLQKSANAQDGLALGLLQAR
LGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLKASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPIFLDKERAKE
RFWNTQYFEGKRDFIYRLLFYYAPFKVLDSKETLGVIEEGLFLLDSDAKKDLEGASLAFKRGRLMAIADKNALKGLKALE
NKRLKEALSFFDLSLKNSPNNALLHYNTGLIYAQLENYHKAYFHFLRAFHLNSADYLSAIFAILASHFTHEDTTELLREI
TENFYSQDFSSPTQKALLSSLIAYLNYRTNWDMDWLKNAPKKIPFYYALEAVFAKESKDKKLMVQSFGNLKKMLPKDLIS
NIFYEIVSYYDASIRHTLSIYTLLDSHKISWDQTMQGPILGRHFYTYMGFMVNDLDHQEKLLEQKIASLEEGQAPNDWLE
NLALVSLFQGQYEKASALYQNLISDLKDNEVRLKILAGLTYIAQNNYNNAALWLELGKLDEPNNENIRYALGLLYQRKGD
LKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDTNLLKERLNQEKKGEFLE

Specific function: Unknown

COG id: COG0457

COG function: function code R; FOG: TPR repeat

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96413; Mature: 96413

Theoretical pI: Translated: 7.08; Mature: 7.08

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION L=RR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLNEEQNSKGLEEKGGENRNEKEAPLKGIHSKIPSFKQALEQTLNKIKSSKEFFKPFLHN
CCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KKKLYIALGALLLLIALIVALSLLLGHKKESQPASLQSATTNSETPNDTNNANNTEAEGQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
IENLDLPDLIGKDSLKRSDENQVDAMMKKASLLYEQGQKDEALHLFDKAASFSQGIASHN
CCCCCCCHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDSDLYYHYLKIARDTLY
CCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNARLASKLFLMFKDETNAYQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHEECCCCHHHH
QLQKSANAQDGLALGLLQARLGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLK
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
ASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPIFLDKERAKERFWNTQYFEGKRDFIYRLLF
HHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHH
YYAPFKVLDSKETLGVIEEGLFLLDSDAKKDLEGASLAFKRGRLMAIADKNALKGLKALE
HHCCHHHCCCCHHHHHHHHCCEEECCCCHHCCCCHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHH
NKRLKEALSFFDLSLKNSPNNALLHYNTGLIYAQLENYHKAYFHFLRAFHLNSADYLSAI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
FAILASHFTHEDTTELLREITENFYSQDFSSPTQKALLSSLIAYLNYRTNWDMDWLKNAP
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCC
KKIPFYYALEAVFAKESKDKKLMVQSFGNLKKMLPKDLISNIFYEIVSYYDASIRHTLSI
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTLLDSHKISWDQTMQGPILGRHFYTYMGFMVNDLDHQEKLLEQKIASLEEGQAPNDWLE
HHHHHCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
NLALVSLFQGQYEKASALYQNLISDLKDNEVRLKILAGLTYIAQNNYNNAALWLELGKLD
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCC
EPNNENIRYALGLLYQRKGDLKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDTNLLKERLNQEKKG
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCHHCCC
EFLE
CCCC
>Mature Secondary Structure
MLNEEQNSKGLEEKGGENRNEKEAPLKGIHSKIPSFKQALEQTLNKIKSSKEFFKPFLHN
CCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KKKLYIALGALLLLIALIVALSLLLGHKKESQPASLQSATTNSETPNDTNNANNTEAEGQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
IENLDLPDLIGKDSLKRSDENQVDAMMKKASLLYEQGQKDEALHLFDKAASFSQGIASHN
CCCCCCCHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
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CCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNARLASKLFLMFKDETNAYQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHEECCCCHHHH
QLQKSANAQDGLALGLLQARLGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLK
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ASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPIFLDKERAKERFWNTQYFEGKRDFIYRLLF
HHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHH
YYAPFKVLDSKETLGVIEEGLFLLDSDAKKDLEGASLAFKRGRLMAIADKNALKGLKALE
HHCCHHHCCCCHHHHHHHHCCEEECCCCHHCCCCHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHH
NKRLKEALSFFDLSLKNSPNNALLHYNTGLIYAQLENYHKAYFHFLRAFHLNSADYLSAI
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HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCC
KKIPFYYALEAVFAKESKDKKLMVQSFGNLKKMLPKDLISNIFYEIVSYYDASIRHTLSI
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
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HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCC
EPNNENIRYALGLLYQRKGDLKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDTNLLKERLNQEKKG
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCHHCCC
EFLE
CCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA