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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 188527711

GI number: 188527711

Start: 918239

End: 919699

Strand: Direct

Name: mviN [H]

Synonym: HPSH_04665

Alternate gene names: 188527711

Gene position: 918239-919699 (Clockwise)

Preceding gene: 188527708

Following gene: 188527712

Centisome position: 57.08

GC content: 38.12

Gene sequence:

>1461_bases
ATGCTAAAAAAAATATTTTTAACCAACAGCTTAGGGATTTTATGTTCTAGGATTTTTGGCTTTTTACGGGATTTGATGAT
GGCTAATATTCTAGGGGCTGGGGTGTATAGCGATATTTTCTTTGTGGCTTTCAAATTGCCTAATTTGTTCAGGCGTATTT
TTGCGGAGGGCTCTTTTTCACAAAGCTTTTTACCAAGCTTCATACGAAGTTCCATTAAAGGGAGCTTTGCGAGTTTGGTG
GGGCTTATTTTTTGTGGCGTTTTATTGATATGGTGCTTATTGGTGGCATTAAATCCCTTGTGGCTAGCTAAACTCCTCGC
TTATGGCTTTGATGAAGAAAAACTCAAACTATGCGCCCCTATTGTAGCGATCAATTTTTGGTATCTTTTATTGGTGTTTA
TCACCACCTTTTTAGGCGCGCTTCTGCAATACAAACACAGCTTTTTTGCCAGCGCTTATAGCGCAAGCTTACTCAATTTA
TGCATGATTTTAGCCCTTTTTGTTTCTAAAGAAAAAACGCATTTAGAAGCGTTGTATTATTTGAGCTATGGCGTGCTTTT
AGGGGGCGTGGCTCAAATTTTATTGCACTTTTATCCTTTAGTCAAATTGGGCTTATGGGCTTTATTGTTTAAAGGGTTGT
TGGGTTTTAAGACTAAAAACGCGCTCAAAAAAAAATACCGCTCTCAAAGAATTAAAAGGGATTTGAAAGGGTTTTTCAAG
CAATTCCTCCCCAGCGTCTTCGGCAATTCTACCACTCAGATCGCTTCTTTTTTAGACACCACGATAGCCTCTTTTCTGGC
GAGCGGGAGCGTGTCTTATTTGTATTACGCTAATAGAGTCTTCCAGCTCCCTTTAGCTTTATTTGCCATAGCCATATCCA
CAGCCCTTTTCCCTAGCATTGCGATCGCCATTAAAAACCATCAGCAGGATTTGATCTTAGAACGCTTGCAAAAGGCGTGG
TTTTTTTTGGTGGGGGTTTTGCTTCTTTGCAGCATTGGGGGGATAATGTTAAGTAAAGAAATCACAGAGCTTTTATTTGA
AAGGGGGCAATTTAGCCCTAAAGACACCCTAATCACTTCGCAAGTCTTTTCGCTCTATCTTTTAGGCTTGCTCCCTTTTG
GGCTAACCAAACTCTTTTCTTTATGGCTTTATGCGAAATTGGAGCAAAAAAAAGCGGCTAAAATCTCTTTAATTTCGCTT
TTTTTAGGTTTAGTGGCTTCTTTGAGTTTAATGCCTTTGTTAGGGGTTTTAGGTTTGGCTTTAGCGAATAGTTTGAGCGG
GTTATTTTTATTCGTTTTAACGATAAAAGCGTTTGGCTTTCAACCATTCTTGGGTATAATTAAAAATTTAAAATTATGGC
TTGTAATTCTTTTCCTCGCTTGCGTGGAAATCTTATTACTCTTAGCGTTCAAATCGTGGGTTACACATTTATATTTATTT
TATTATTTTCAAGGTTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGCTCATTTTTTAATCCTTAAATGGTATAATATAAGAATTTGAAAAAAGGAATATGCTAACAAAAAAACGCTAAAAATT
AGGTAATAAATACAACTAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGTTTATTTATGATACCAAATTAAAACAAAAAGTCCCTTTTGAGCCTTTAGTTGAAAAAAAGGCGAATATTTATGTGTG
CGGGCCTACGGTGTATGATG

Product: virulence factor MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 486; Mature: 486

Protein sequence:

>486_residues
MLKKIFLTNSLGILCSRIFGFLRDLMMANILGAGVYSDIFFVAFKLPNLFRRIFAEGSFSQSFLPSFIRSSIKGSFASLV
GLIFCGVLLIWCLLVALNPLWLAKLLAYGFDEEKLKLCAPIVAINFWYLLLVFITTFLGALLQYKHSFFASAYSASLLNL
CMILALFVSKEKTHLEALYYLSYGVLLGGVAQILLHFYPLVKLGLWALLFKGLLGFKTKNALKKKYRSQRIKRDLKGFFK
QFLPSVFGNSTTQIASFLDTTIASFLASGSVSYLYYANRVFQLPLALFAIAISTALFPSIAIAIKNHQQDLILERLQKAW
FFLVGVLLLCSIGGIMLSKEITELLFERGQFSPKDTLITSQVFSLYLLGLLPFGLTKLFSLWLYAKLEQKKAAKISLISL
FLGLVASLSLMPLLGVLGLALANSLSGLFLFVLTIKAFGFQPFLGIIKNLKLWLVILFLACVEILLLLAFKSWVTHLYLF
YYFQGF

Sequences:

>Translated_486_residues
MLKKIFLTNSLGILCSRIFGFLRDLMMANILGAGVYSDIFFVAFKLPNLFRRIFAEGSFSQSFLPSFIRSSIKGSFASLV
GLIFCGVLLIWCLLVALNPLWLAKLLAYGFDEEKLKLCAPIVAINFWYLLLVFITTFLGALLQYKHSFFASAYSASLLNL
CMILALFVSKEKTHLEALYYLSYGVLLGGVAQILLHFYPLVKLGLWALLFKGLLGFKTKNALKKKYRSQRIKRDLKGFFK
QFLPSVFGNSTTQIASFLDTTIASFLASGSVSYLYYANRVFQLPLALFAIAISTALFPSIAIAIKNHQQDLILERLQKAW
FFLVGVLLLCSIGGIMLSKEITELLFERGQFSPKDTLITSQVFSLYLLGLLPFGLTKLFSLWLYAKLEQKKAAKISLISL
FLGLVASLSLMPLLGVLGLALANSLSGLFLFVLTIKAFGFQPFLGIIKNLKLWLVILFLACVEILLLLAFKSWVTHLYLF
YYFQGF
>Mature_486_residues
MLKKIFLTNSLGILCSRIFGFLRDLMMANILGAGVYSDIFFVAFKLPNLFRRIFAEGSFSQSFLPSFIRSSIKGSFASLV
GLIFCGVLLIWCLLVALNPLWLAKLLAYGFDEEKLKLCAPIVAINFWYLLLVFITTFLGALLQYKHSFFASAYSASLLNL
CMILALFVSKEKTHLEALYYLSYGVLLGGVAQILLHFYPLVKLGLWALLFKGLLGFKTKNALKKKYRSQRIKRDLKGFFK
QFLPSVFGNSTTQIASFLDTTIASFLASGSVSYLYYANRVFQLPLALFAIAISTALFPSIAIAIKNHQQDLILERLQKAW
FFLVGVLLLCSIGGIMLSKEITELLFERGQFSPKDTLITSQVFSLYLLGLLPFGLTKLFSLWLYAKLEQKKAAKISLISL
FLGLVASLSLMPLLGVLGLALANSLSGLFLFVLTIKAFGFQPFLGIIKNLKLWLVILFLACVEILLLLAFKSWVTHLYLF
YYFQGF

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=424, Percent_Identity=33.4905660377358, Blast_Score=186, Evalue=4e-48,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54564; Mature: 54564

Theoretical pI: Translated: 10.26; Mature: 10.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKKIFLTNSLGILCSRIFGFLRDLMMANILGAGVYSDIFFVAFKLPNLFRRIFAEGSFS
CCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
QSFLPSFIRSSIKGSFASLVGLIFCGVLLIWCLLVALNPLWLAKLLAYGFDEEKLKLCAP
HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
IVAINFWYLLLVFITTFLGALLQYKHSFFASAYSASLLNLCMILALFVSKEKTHLEALYY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
LSYGVLLGGVAQILLHFYPLVKLGLWALLFKGLLGFKTKNALKKKYRSQRIKRDLKGFFK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFLPSVFGNSTTQIASFLDTTIASFLASGSVSYLYYANRVFQLPLALFAIAISTALFPSI
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIAIKNHQQDLILERLQKAWFFLVGVLLLCSIGGIMLSKEITELLFERGQFSPKDTLITS
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
QVFSLYLLGLLPFGLTKLFSLWLYAKLEQKKAAKISLISLFLGLVASLSLMPLLGVLGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LANSLSGLFLFVLTIKAFGFQPFLGIIKNLKLWLVILFLACVEILLLLAFKSWVTHLYLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YYFQGF
HHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLKKIFLTNSLGILCSRIFGFLRDLMMANILGAGVYSDIFFVAFKLPNLFRRIFAEGSFS
CCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
QSFLPSFIRSSIKGSFASLVGLIFCGVLLIWCLLVALNPLWLAKLLAYGFDEEKLKLCAP
HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
IVAINFWYLLLVFITTFLGALLQYKHSFFASAYSASLLNLCMILALFVSKEKTHLEALYY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
LSYGVLLGGVAQILLHFYPLVKLGLWALLFKGLLGFKTKNALKKKYRSQRIKRDLKGFFK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFLPSVFGNSTTQIASFLDTTIASFLASGSVSYLYYANRVFQLPLALFAIAISTALFPSI
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIAIKNHQQDLILERLQKAWFFLVGVLLLCSIGGIMLSKEITELLFERGQFSPKDTLITS
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
QVFSLYLLGLLPFGLTKLFSLWLYAKLEQKKAAKISLISLFLGLVASLSLMPLLGVLGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LANSLSGLFLFVLTIKAFGFQPFLGIIKNLKLWLVILFLACVEILLLLAFKSWVTHLYLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YYFQGF
HHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9252185 [H]