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The map label for this gene is 188527633

Identifier: 188527633

GI number: 188527633

Start: 829423

End: 831030

Strand: Direct

Name: 188527633

Synonym: HPSH_04275

Alternate gene names: NA

Gene position: 829423-831030 (Clockwise)

Preceding gene: 188527632

Following gene: 188527634

Centisome position: 51.56

GC content: 36.07

Gene sequence:

>1608_bases
ATGTTTAATATCAAAAGGATTTTTTTAATAACGATCATAAGTTTTTTTCTCATTGTTCCTAATTGGTTGAAAGCTATTGA
TTTGCCCATTGTTTCAAATCTCAAAATTTACCAAACAGTTTATTGCATGCTGATACCGAGTTATGTTTTAACCAACAAAA
GTTTTGCAGATATTTTGACAGGTTATACATCTATTGGTGCGTCAGGGAGTGGAAAGAGTTCAGGGCAGGGTGTGATCGAA
GCGCTTAGTGCACCATTAGCTACAAGTTTAGCCGCTAGCAATCTAGTGAAATATTTGAATACTTTAGGTCCTTTATGGGG
ATCGGCGTGGGCAAGTGTTGCTACAGCTATACAAGGTTTTGCTCTAACCCCATCAAGTGGTTGCAATTTTGGTTGGAACG
CATTGATAAATAAAAACATAGATGTATCCACAGATAGCATGCTAGACAATTTGAGCAACAAGATTCGGAATTTTACCAAA
GGCGGTGTTGAGGACAATGTGAAAGGCAATGTTCTTTTACAAATAATTGGCTCAATAACCGCTCAAGTTTCTACGAATAT
TACAGCTAATAGTTTAATTTGGCTGATTGGCAAAGAATTCACTGCAAATAAACTGCAAAACAACACTACAGCCATGCTTG
CTTTTGCCGCACTAGAATCTATTGTCAAAGGAGCGGACGCTACTGTTCTTCCTGCATATAGTGTAGTCAATCTGCCTGAT
ATTATCATAGGGCAAGGGTCATATCTTGATTTTGTTTCTTACCTAATTTATATTGTTTTTGGGATTTTTGTTTTTATTTC
TTTTATGAAATTGAGAGATATTTCAAATGGCATTCAGATTAACATAGGTTTTGAATACATGCGATTTGTTGGGGGGACAT
TATTCAAAATGGCGATGGTATCTTTTATCGCCTATGCAGGTTTTGGTTATCTTTATAAAATCTCTTATTCCATTTATTTT
GGTTTAGCAGGCGCTTTTGGGCTGAATCAAACTCTTTTTTGGGCTTTAGATTTAGTGCTGAATTACACTGTTAATTCAAT
TTTACCTGCGGTAAGAGCTGTTTTTTCTAATGTTGGCAACAACGCTCCTAGTTTGTTACAAGGCTTGCAAGTTGCAGGTA
TTTCTTTATTCGCTATTTTTATGCAAGTAACTATCATTATGAGAATAAGCACTGTTGTTGTGAAACCTTTGATAGCGGGG
GCTTTTAGCGGTATTGTGTTCCCTATTGCGGTATGTTTGATCGTGCTAGATTGGTTCAAAGATTCTATGAAAAACATATT
GATATGGTTTATTAATAATTTGTTTATCTTGGTTCTAGCTATTCCTATTTTGCTCTTTGGTGTTTTGGCATTATTGGCAT
TCAATTTGACCATAACGCCCTCTGTTGCTATACAAAACATCAATCAAGGGGGACTGGGTATCGATTCGACTATTGCGAGT
TTGATCACTTTATTTATTTTAAAAGGTTTCATAGAGACGATTATTGAGAGTGTCAATGCGATCGTTAATACCATTTTCAG
TTCTGTCTCTATGGATGGTAGCAGAATGGATAGGGAACGAGATGCCTTAATGGTAGGAAAAGTTGGTGGATCTATGTTTA
AAGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTCAAATCACAGATTTACAAAACGAACAGACGGTAAGCGAAATTTTGAGAAAGATTAAAGAAGTGGAATCAAAAAATAA
GGCATTAAAGAAATAAGAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCCGCTTATTCTTGTGTTACAATTGCAAATATTTTTTAAGAGGAATTATTGATGGAGCAGGCATTTTTTAAAAAAATTGT
TGGCTGTTTCTGTCTTGGTT

Product: cag pathogenicity island protein (cagW, cag9)

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 535; Mature: 535

Protein sequence:

>535_residues
MFNIKRIFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILTGYTSIGASGSGKSSGQGVIE
ALSAPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGFALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSTDSMLDNLSNKIRNFTK
GGVEDNVKGNVLLQIIGSITAQVSTNITANSLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESIVKGADATVLPAYSVVNLPD
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMVSFIAYAGFGYLYKISYSIYF
GLAGAFGLNQTLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGNNAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAG
AFSGIVFPIAVCLIVLDWFKDSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGKVGGSMFKG

Sequences:

>Translated_535_residues
MFNIKRIFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILTGYTSIGASGSGKSSGQGVIE
ALSAPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGFALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSTDSMLDNLSNKIRNFTK
GGVEDNVKGNVLLQIIGSITAQVSTNITANSLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESIVKGADATVLPAYSVVNLPD
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMVSFIAYAGFGYLYKISYSIYF
GLAGAFGLNQTLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGNNAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAG
AFSGIVFPIAVCLIVLDWFKDSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGKVGGSMFKG
>Mature_535_residues
MFNIKRIFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILTGYTSIGASGSGKSSGQGVIE
ALSAPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGFALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSTDSMLDNLSNKIRNFTK
GGVEDNVKGNVLLQIIGSITAQVSTNITANSLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESIVKGADATVLPAYSVVNLPD
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMVSFIAYAGFGYLYKISYSIYF
GLAGAFGLNQTLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGNNAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAG
AFSGIVFPIAVCLIVLDWFKDSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGKVGGSMFKG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57814; Mature: 57814

Theoretical pI: Translated: 9.26; Mature: 9.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFNIKRIFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
GYTSIGASGSGKSSGQGVIEALSAPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGF
HHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSTDSMLDNLSNKIRNFTKGGVEDNVKGNVLLQIIGSIT
EECCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
AQVSTNITANSLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESIVKGADATVLPAYSVVNLPD
HHHHCCCCHHHEEEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHCCCCC
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMV
CEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFIAYAGFGYLYKISYSIYFGLAGAFGLNQTLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGN
HHHHHHCCHHHHEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAGAFSGIVFPIAVCLIVLDWFK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGKVGGSMFKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHEEEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFNIKRIFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
GYTSIGASGSGKSSGQGVIEALSAPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGF
HHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSTDSMLDNLSNKIRNFTKGGVEDNVKGNVLLQIIGSIT
EECCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
AQVSTNITANSLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESIVKGADATVLPAYSVVNLPD
HHHHCCCCHHHEEEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHCCCCC
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMV
CEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFIAYAGFGYLYKISYSIYFGLAGAFGLNQTLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGN
HHHHHHCCHHHHEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAGAFSGIVFPIAVCLIVLDWFK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGKVGGSMFKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHEEEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA