| Definition | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010674 |
| Length | 3,800,327 |
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The map label for this gene is yqgS [H]
Identifier: 187934728
GI number: 187934728
Start: 447503
End: 449353
Strand: Reverse
Name: yqgS [H]
Synonym: CLL_A0449
Alternate gene names: 187934728
Gene position: 449353-447503 (Counterclockwise)
Preceding gene: 187934743
Following gene: 187933607
Centisome position: 11.82
GC content: 25.34
Gene sequence:
>1851_bases ATGCATTCTTACAAAAATAAACTTATTAATATTTTTAATAAAAATACACTAAATCAATTAATATTATTCCTATTTCCGTT AATTGCTATAGTACTTAAATGTATATTTTTTCAAAGCTTTATTACTGGTAATAATCCTTACAGTTTTGATTTTAATGCTG GTTATGATTATGCTAAACCATTTTTAAATTATTATCTAGCTTTCGTCTTAATATTCATAAGTTTTTCATTTTTATTTAAA GGAAAAGCAAGGATAATATATCTTTTTATAATAAACATTTTATTAACTGCAATTATTATCTTAGATGTTTGTTATTTTAG AGGATTTTTAACTGTTCCTTCTGTTCTTATTGCTACACAAACAGCAAATTTAGATAATCTTTCTGGAGCAGTCTACTCTA TGTTTAGTCCTTTAGACTACATTTTTTTAATAGATTTAATTGTATTAGGAATTTATGTTTATTTTACTAGAAGATATATA TCTAAAATAAATAAAAGAGGAATAAAAATTTTCCTTATAACTTTTATTATGCCAATATTATTCATAGGTTATGTTCCTTT TAATATACATATTTTAAATAATAAAGATGTTAAAGATGCCTATTTATATGATAATTACGATCCAACAAATACAGCTAGAT ATTTTTCACCAATTGGATATCATATATTTGACTTATATACAGTTTATCGTGATTCAAAACCATATGAATTTACAGTTGAA GATGAAAATAATTTAAATAAATTATTTAATATGAAGAATGAAAACTTACCTAACAATGATTACTTTGGTATATCTAAAGG TAAAAATCTTATTTATATTCAAGTTGAATCGTTAGAAAATTTTGTTATAAATAAAACTATTAATGGAAAAGAAATTACTC CTGTATTAAACAATTTAACATCTAACGGTTTTTATTTTCCAAATATGTTTGAACAAGTTAATGAGGGTACAAGTTCCGAT TGTGACTTAATGGTTAATACATCTATGTTTCCATTAAGAAGAGGTAGTACTTTCTTTAGATATCCAAATAATACTTATAA TTCTTTACCTGATATATTAGAAAAAAATAGTTATAGCAGTATTGCTATACATCCTGATAAGGGCTCCTTCTGGAATTATT CTGCTGGACTTAAAGGAATAGGATTTGATAAATTTAATGATTACTATTCATTCAATGCAGATGAAACAATTGGAATGGGT ATAAGTGATGCAAGCTACTTTAAACAAGTGGTTCCAATGTTGAAAGAACAATCTAATCCATTTTATGCTCTTACAGTAAC ACTAACAAGTCATGGTCCATTTGATATACCAAAAGAGTATAGAGAATTAGGACTTGATCCAGAATTAGATGCTAGTGAGT TAGGTGGCTATTTTGAAAGCTTACACTATACAGATGCTCAAATAGGTAACTTCTTAAAACTATTAGATAGTGAAGGATTA TTAGAAAATAGTGTAATAGCTATTATGGGTGATCATACAGGAGTTCATAAATACTATAATAATGGGATTGAAAAATTATC TAATAAAGAAGATTGGTATTTAGATACTGGCAATCCTGTAGTTCCTCTTGTAATTTATGATACTTCTATAAAAACAGGTA AAACTTTTGATTTATATGGTGGACAAATTGATGTTATGCCAACCCTACTTTATATGCTTGGTATAGATAAAGAAAAATAT GAAGATACTGCTTTAGGAAGAAATCTTCTAAATACAAATAAATCATTTGCTATATTAACAGATGGTACTATAAAAGACCA AAATACCCTTTCTGATGAAGATAAAGAAACATACAAAAACATATTAGATTTATCAGATAAAATGATAAGGGCGAATTACT TTAAAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GATTTATGTATTTATGTATAATATAAGATGTTAACTATTTGATAACAATTACTATGTTAATTTTATCATTTTTTATTAAT TCGTAGATTGAGGTGAATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TACCTATATAATTAGGCTATCTTTTTGACACCTATTCAAAGCATAGCTAAATAAAAAATAGAAGGACTATAAAATTAGTC CTTCTATTTTTTATGTCTAT
Product: sulfatase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 616; Mature: 616
Protein sequence:
>616_residues MHSYKNKLINIFNKNTLNQLILFLFPLIAIVLKCIFFQSFITGNNPYSFDFNAGYDYAKPFLNYYLAFVLIFISFSFLFK GKARIIYLFIINILLTAIIILDVCYFRGFLTVPSVLIATQTANLDNLSGAVYSMFSPLDYIFLIDLIVLGIYVYFTRRYI SKINKRGIKIFLITFIMPILFIGYVPFNIHILNNKDVKDAYLYDNYDPTNTARYFSPIGYHIFDLYTVYRDSKPYEFTVE DENNLNKLFNMKNENLPNNDYFGISKGKNLIYIQVESLENFVINKTINGKEITPVLNNLTSNGFYFPNMFEQVNEGTSSD CDLMVNTSMFPLRRGSTFFRYPNNTYNSLPDILEKNSYSSIAIHPDKGSFWNYSAGLKGIGFDKFNDYYSFNADETIGMG ISDASYFKQVVPMLKEQSNPFYALTVTLTSHGPFDIPKEYRELGLDPELDASELGGYFESLHYTDAQIGNFLKLLDSEGL LENSVIAIMGDHTGVHKYYNNGIEKLSNKEDWYLDTGNPVVPLVIYDTSIKTGKTFDLYGGQIDVMPTLLYMLGIDKEKY EDTALGRNLLNTNKSFAILTDGTIKDQNTLSDEDKETYKNILDLSDKMIRANYFKK
Sequences:
>Translated_616_residues MHSYKNKLINIFNKNTLNQLILFLFPLIAIVLKCIFFQSFITGNNPYSFDFNAGYDYAKPFLNYYLAFVLIFISFSFLFK GKARIIYLFIINILLTAIIILDVCYFRGFLTVPSVLIATQTANLDNLSGAVYSMFSPLDYIFLIDLIVLGIYVYFTRRYI SKINKRGIKIFLITFIMPILFIGYVPFNIHILNNKDVKDAYLYDNYDPTNTARYFSPIGYHIFDLYTVYRDSKPYEFTVE DENNLNKLFNMKNENLPNNDYFGISKGKNLIYIQVESLENFVINKTINGKEITPVLNNLTSNGFYFPNMFEQVNEGTSSD CDLMVNTSMFPLRRGSTFFRYPNNTYNSLPDILEKNSYSSIAIHPDKGSFWNYSAGLKGIGFDKFNDYYSFNADETIGMG ISDASYFKQVVPMLKEQSNPFYALTVTLTSHGPFDIPKEYRELGLDPELDASELGGYFESLHYTDAQIGNFLKLLDSEGL LENSVIAIMGDHTGVHKYYNNGIEKLSNKEDWYLDTGNPVVPLVIYDTSIKTGKTFDLYGGQIDVMPTLLYMLGIDKEKY EDTALGRNLLNTNKSFAILTDGTIKDQNTLSDEDKETYKNILDLSDKMIRANYFKK >Mature_616_residues MHSYKNKLINIFNKNTLNQLILFLFPLIAIVLKCIFFQSFITGNNPYSFDFNAGYDYAKPFLNYYLAFVLIFISFSFLFK GKARIIYLFIINILLTAIIILDVCYFRGFLTVPSVLIATQTANLDNLSGAVYSMFSPLDYIFLIDLIVLGIYVYFTRRYI SKINKRGIKIFLITFIMPILFIGYVPFNIHILNNKDVKDAYLYDNYDPTNTARYFSPIGYHIFDLYTVYRDSKPYEFTVE DENNLNKLFNMKNENLPNNDYFGISKGKNLIYIQVESLENFVINKTINGKEITPVLNNLTSNGFYFPNMFEQVNEGTSSD CDLMVNTSMFPLRRGSTFFRYPNNTYNSLPDILEKNSYSSIAIHPDKGSFWNYSAGLKGIGFDKFNDYYSFNADETIGMG ISDASYFKQVVPMLKEQSNPFYALTVTLTSHGPFDIPKEYRELGLDPELDASELGGYFESLHYTDAQIGNFLKLLDSEGL LENSVIAIMGDHTGVHKYYNNGIEKLSNKEDWYLDTGNPVVPLVIYDTSIKTGKTFDLYGGQIDVMPTLLYMLGIDKEKY EDTALGRNLLNTNKSFAILTDGTIKDQNTLSDEDKETYKNILDLSDKMIRANYFKK
Specific function: Unknown
COG id: COG1368
COG function: function code M; Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily
Gene ontology:
Cell location: Processed uncharacterized protein yqgS:Secreted [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the LTA synthase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR017849 - InterPro: IPR017850 - InterPro: IPR012160 - InterPro: IPR000917 [H]
Pfam domain/function: PF00884 Sulfatase [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70788; Mature: 70788
Theoretical pI: Translated: 5.14; Mature: 5.14
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MHSYKNKLINIFNKNTLNQLILFLFPLIAIVLKCIFFQSFITGNNPYSFDFNAGYDYAKP CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHH FLNYYLAFVLIFISFSFLFKGKARIIYLFIINILLTAIIILDVCYFRGFLTVPSVLIATQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEC TANLDNLSGAVYSMFSPLDYIFLIDLIVLGIYVYFTRRYISKINKRGIKIFLITFIMPIL CCCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHH FIGYVPFNIHILNNKDVKDAYLYDNYDPTNTARYFSPIGYHIFDLYTVYRDSKPYEFTVE HHCCCCEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEC DENNLNKLFNMKNENLPNNDYFGISKGKNLIYIQVESLENFVINKTINGKEITPVLNNLT CCCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCEEEECCCCCCCHHHHHHCCC SNGFYFPNMFEQVNEGTSSDCDLMVNTSMFPLRRGSTFFRYPNNTYNSLPDILEKNSYSS CCCEECCHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCEECCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCE IAIHPDKGSFWNYSAGLKGIGFDKFNDYYSFNADETIGMGISDASYFKQVVPMLKEQSNP EEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC FYALTVTLTSHGPFDIPKEYRELGLDPELDASELGGYFESLHYTDAQIGNFLKLLDSEGL EEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCC LENSVIAIMGDHTGVHKYYNNGIEKLSNKEDWYLDTGNPVVPLVIYDTSIKTGKTFDLYG CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECC GQIDVMPTLLYMLGIDKEKYEDTALGRNLLNTNKSFAILTDGTIKDQNTLSDEDKETYKN CEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHH ILDLSDKMIRANYFKK HHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MHSYKNKLINIFNKNTLNQLILFLFPLIAIVLKCIFFQSFITGNNPYSFDFNAGYDYAKP CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHH FLNYYLAFVLIFISFSFLFKGKARIIYLFIINILLTAIIILDVCYFRGFLTVPSVLIATQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEC TANLDNLSGAVYSMFSPLDYIFLIDLIVLGIYVYFTRRYISKINKRGIKIFLITFIMPIL CCCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHH FIGYVPFNIHILNNKDVKDAYLYDNYDPTNTARYFSPIGYHIFDLYTVYRDSKPYEFTVE HHCCCCEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEC DENNLNKLFNMKNENLPNNDYFGISKGKNLIYIQVESLENFVINKTINGKEITPVLNNLT CCCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCEEEECCCCCCCHHHHHHCCC SNGFYFPNMFEQVNEGTSSDCDLMVNTSMFPLRRGSTFFRYPNNTYNSLPDILEKNSYSS CCCEECCHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCEECCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCE IAIHPDKGSFWNYSAGLKGIGFDKFNDYYSFNADETIGMGISDASYFKQVVPMLKEQSNP EEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC FYALTVTLTSHGPFDIPKEYRELGLDPELDASELGGYFESLHYTDAQIGNFLKLLDSEGL EEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCC LENSVIAIMGDHTGVHKYYNNGIEKLSNKEDWYLDTGNPVVPLVIYDTSIKTGKTFDLYG CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECC GQIDVMPTLLYMLGIDKEKYEDTALGRNLLNTNKSFAILTDGTIKDQNTLSDEDKETYKN CEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHH ILDLSDKMIRANYFKK HHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8969508; 9384377 [H]