Definition Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome.
Accession NC_010674
Length 3,800,327

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yqgS [H]

Identifier: 187934728

GI number: 187934728

Start: 447503

End: 449353

Strand: Reverse

Name: yqgS [H]

Synonym: CLL_A0449

Alternate gene names: 187934728

Gene position: 449353-447503 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187934743

Following gene: 187933607

Centisome position: 11.82

GC content: 25.34

Gene sequence:

>1851_bases
ATGCATTCTTACAAAAATAAACTTATTAATATTTTTAATAAAAATACACTAAATCAATTAATATTATTCCTATTTCCGTT
AATTGCTATAGTACTTAAATGTATATTTTTTCAAAGCTTTATTACTGGTAATAATCCTTACAGTTTTGATTTTAATGCTG
GTTATGATTATGCTAAACCATTTTTAAATTATTATCTAGCTTTCGTCTTAATATTCATAAGTTTTTCATTTTTATTTAAA
GGAAAAGCAAGGATAATATATCTTTTTATAATAAACATTTTATTAACTGCAATTATTATCTTAGATGTTTGTTATTTTAG
AGGATTTTTAACTGTTCCTTCTGTTCTTATTGCTACACAAACAGCAAATTTAGATAATCTTTCTGGAGCAGTCTACTCTA
TGTTTAGTCCTTTAGACTACATTTTTTTAATAGATTTAATTGTATTAGGAATTTATGTTTATTTTACTAGAAGATATATA
TCTAAAATAAATAAAAGAGGAATAAAAATTTTCCTTATAACTTTTATTATGCCAATATTATTCATAGGTTATGTTCCTTT
TAATATACATATTTTAAATAATAAAGATGTTAAAGATGCCTATTTATATGATAATTACGATCCAACAAATACAGCTAGAT
ATTTTTCACCAATTGGATATCATATATTTGACTTATATACAGTTTATCGTGATTCAAAACCATATGAATTTACAGTTGAA
GATGAAAATAATTTAAATAAATTATTTAATATGAAGAATGAAAACTTACCTAACAATGATTACTTTGGTATATCTAAAGG
TAAAAATCTTATTTATATTCAAGTTGAATCGTTAGAAAATTTTGTTATAAATAAAACTATTAATGGAAAAGAAATTACTC
CTGTATTAAACAATTTAACATCTAACGGTTTTTATTTTCCAAATATGTTTGAACAAGTTAATGAGGGTACAAGTTCCGAT
TGTGACTTAATGGTTAATACATCTATGTTTCCATTAAGAAGAGGTAGTACTTTCTTTAGATATCCAAATAATACTTATAA
TTCTTTACCTGATATATTAGAAAAAAATAGTTATAGCAGTATTGCTATACATCCTGATAAGGGCTCCTTCTGGAATTATT
CTGCTGGACTTAAAGGAATAGGATTTGATAAATTTAATGATTACTATTCATTCAATGCAGATGAAACAATTGGAATGGGT
ATAAGTGATGCAAGCTACTTTAAACAAGTGGTTCCAATGTTGAAAGAACAATCTAATCCATTTTATGCTCTTACAGTAAC
ACTAACAAGTCATGGTCCATTTGATATACCAAAAGAGTATAGAGAATTAGGACTTGATCCAGAATTAGATGCTAGTGAGT
TAGGTGGCTATTTTGAAAGCTTACACTATACAGATGCTCAAATAGGTAACTTCTTAAAACTATTAGATAGTGAAGGATTA
TTAGAAAATAGTGTAATAGCTATTATGGGTGATCATACAGGAGTTCATAAATACTATAATAATGGGATTGAAAAATTATC
TAATAAAGAAGATTGGTATTTAGATACTGGCAATCCTGTAGTTCCTCTTGTAATTTATGATACTTCTATAAAAACAGGTA
AAACTTTTGATTTATATGGTGGACAAATTGATGTTATGCCAACCCTACTTTATATGCTTGGTATAGATAAAGAAAAATAT
GAAGATACTGCTTTAGGAAGAAATCTTCTAAATACAAATAAATCATTTGCTATATTAACAGATGGTACTATAAAAGACCA
AAATACCCTTTCTGATGAAGATAAAGAAACATACAAAAACATATTAGATTTATCAGATAAAATGATAAGGGCGAATTACT
TTAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATTTATGTATTTATGTATAATATAAGATGTTAACTATTTGATAACAATTACTATGTTAATTTTATCATTTTTTATTAAT
TCGTAGATTGAGGTGAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACCTATATAATTAGGCTATCTTTTTGACACCTATTCAAAGCATAGCTAAATAAAAAATAGAAGGACTATAAAATTAGTC
CTTCTATTTTTTATGTCTAT

Product: sulfatase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 616; Mature: 616

Protein sequence:

>616_residues
MHSYKNKLINIFNKNTLNQLILFLFPLIAIVLKCIFFQSFITGNNPYSFDFNAGYDYAKPFLNYYLAFVLIFISFSFLFK
GKARIIYLFIINILLTAIIILDVCYFRGFLTVPSVLIATQTANLDNLSGAVYSMFSPLDYIFLIDLIVLGIYVYFTRRYI
SKINKRGIKIFLITFIMPILFIGYVPFNIHILNNKDVKDAYLYDNYDPTNTARYFSPIGYHIFDLYTVYRDSKPYEFTVE
DENNLNKLFNMKNENLPNNDYFGISKGKNLIYIQVESLENFVINKTINGKEITPVLNNLTSNGFYFPNMFEQVNEGTSSD
CDLMVNTSMFPLRRGSTFFRYPNNTYNSLPDILEKNSYSSIAIHPDKGSFWNYSAGLKGIGFDKFNDYYSFNADETIGMG
ISDASYFKQVVPMLKEQSNPFYALTVTLTSHGPFDIPKEYRELGLDPELDASELGGYFESLHYTDAQIGNFLKLLDSEGL
LENSVIAIMGDHTGVHKYYNNGIEKLSNKEDWYLDTGNPVVPLVIYDTSIKTGKTFDLYGGQIDVMPTLLYMLGIDKEKY
EDTALGRNLLNTNKSFAILTDGTIKDQNTLSDEDKETYKNILDLSDKMIRANYFKK

Sequences:

>Translated_616_residues
MHSYKNKLINIFNKNTLNQLILFLFPLIAIVLKCIFFQSFITGNNPYSFDFNAGYDYAKPFLNYYLAFVLIFISFSFLFK
GKARIIYLFIINILLTAIIILDVCYFRGFLTVPSVLIATQTANLDNLSGAVYSMFSPLDYIFLIDLIVLGIYVYFTRRYI
SKINKRGIKIFLITFIMPILFIGYVPFNIHILNNKDVKDAYLYDNYDPTNTARYFSPIGYHIFDLYTVYRDSKPYEFTVE
DENNLNKLFNMKNENLPNNDYFGISKGKNLIYIQVESLENFVINKTINGKEITPVLNNLTSNGFYFPNMFEQVNEGTSSD
CDLMVNTSMFPLRRGSTFFRYPNNTYNSLPDILEKNSYSSIAIHPDKGSFWNYSAGLKGIGFDKFNDYYSFNADETIGMG
ISDASYFKQVVPMLKEQSNPFYALTVTLTSHGPFDIPKEYRELGLDPELDASELGGYFESLHYTDAQIGNFLKLLDSEGL
LENSVIAIMGDHTGVHKYYNNGIEKLSNKEDWYLDTGNPVVPLVIYDTSIKTGKTFDLYGGQIDVMPTLLYMLGIDKEKY
EDTALGRNLLNTNKSFAILTDGTIKDQNTLSDEDKETYKNILDLSDKMIRANYFKK
>Mature_616_residues
MHSYKNKLINIFNKNTLNQLILFLFPLIAIVLKCIFFQSFITGNNPYSFDFNAGYDYAKPFLNYYLAFVLIFISFSFLFK
GKARIIYLFIINILLTAIIILDVCYFRGFLTVPSVLIATQTANLDNLSGAVYSMFSPLDYIFLIDLIVLGIYVYFTRRYI
SKINKRGIKIFLITFIMPILFIGYVPFNIHILNNKDVKDAYLYDNYDPTNTARYFSPIGYHIFDLYTVYRDSKPYEFTVE
DENNLNKLFNMKNENLPNNDYFGISKGKNLIYIQVESLENFVINKTINGKEITPVLNNLTSNGFYFPNMFEQVNEGTSSD
CDLMVNTSMFPLRRGSTFFRYPNNTYNSLPDILEKNSYSSIAIHPDKGSFWNYSAGLKGIGFDKFNDYYSFNADETIGMG
ISDASYFKQVVPMLKEQSNPFYALTVTLTSHGPFDIPKEYRELGLDPELDASELGGYFESLHYTDAQIGNFLKLLDSEGL
LENSVIAIMGDHTGVHKYYNNGIEKLSNKEDWYLDTGNPVVPLVIYDTSIKTGKTFDLYGGQIDVMPTLLYMLGIDKEKY
EDTALGRNLLNTNKSFAILTDGTIKDQNTLSDEDKETYKNILDLSDKMIRANYFKK

Specific function: Unknown

COG id: COG1368

COG function: function code M; Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily

Gene ontology:

Cell location: Processed uncharacterized protein yqgS:Secreted [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the LTA synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR017849
- InterPro:   IPR017850
- InterPro:   IPR012160
- InterPro:   IPR000917 [H]

Pfam domain/function: PF00884 Sulfatase [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70788; Mature: 70788

Theoretical pI: Translated: 5.14; Mature: 5.14

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHSYKNKLINIFNKNTLNQLILFLFPLIAIVLKCIFFQSFITGNNPYSFDFNAGYDYAKP
CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHH
FLNYYLAFVLIFISFSFLFKGKARIIYLFIINILLTAIIILDVCYFRGFLTVPSVLIATQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEC
TANLDNLSGAVYSMFSPLDYIFLIDLIVLGIYVYFTRRYISKINKRGIKIFLITFIMPIL
CCCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHH
FIGYVPFNIHILNNKDVKDAYLYDNYDPTNTARYFSPIGYHIFDLYTVYRDSKPYEFTVE
HHCCCCEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEC
DENNLNKLFNMKNENLPNNDYFGISKGKNLIYIQVESLENFVINKTINGKEITPVLNNLT
CCCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCEEEECCCCCCCHHHHHHCCC
SNGFYFPNMFEQVNEGTSSDCDLMVNTSMFPLRRGSTFFRYPNNTYNSLPDILEKNSYSS
CCCEECCHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCEECCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCE
IAIHPDKGSFWNYSAGLKGIGFDKFNDYYSFNADETIGMGISDASYFKQVVPMLKEQSNP
EEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
FYALTVTLTSHGPFDIPKEYRELGLDPELDASELGGYFESLHYTDAQIGNFLKLLDSEGL
EEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
LENSVIAIMGDHTGVHKYYNNGIEKLSNKEDWYLDTGNPVVPLVIYDTSIKTGKTFDLYG
CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECC
GQIDVMPTLLYMLGIDKEKYEDTALGRNLLNTNKSFAILTDGTIKDQNTLSDEDKETYKN
CEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
ILDLSDKMIRANYFKK
HHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MHSYKNKLINIFNKNTLNQLILFLFPLIAIVLKCIFFQSFITGNNPYSFDFNAGYDYAKP
CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHH
FLNYYLAFVLIFISFSFLFKGKARIIYLFIINILLTAIIILDVCYFRGFLTVPSVLIATQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEC
TANLDNLSGAVYSMFSPLDYIFLIDLIVLGIYVYFTRRYISKINKRGIKIFLITFIMPIL
CCCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHH
FIGYVPFNIHILNNKDVKDAYLYDNYDPTNTARYFSPIGYHIFDLYTVYRDSKPYEFTVE
HHCCCCEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEC
DENNLNKLFNMKNENLPNNDYFGISKGKNLIYIQVESLENFVINKTINGKEITPVLNNLT
CCCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCEEEECCCCCCCHHHHHHCCC
SNGFYFPNMFEQVNEGTSSDCDLMVNTSMFPLRRGSTFFRYPNNTYNSLPDILEKNSYSS
CCCEECCHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCEECCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCE
IAIHPDKGSFWNYSAGLKGIGFDKFNDYYSFNADETIGMGISDASYFKQVVPMLKEQSNP
EEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
FYALTVTLTSHGPFDIPKEYRELGLDPELDASELGGYFESLHYTDAQIGNFLKLLDSEGL
EEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
LENSVIAIMGDHTGVHKYYNNGIEKLSNKEDWYLDTGNPVVPLVIYDTSIKTGKTFDLYG
CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECC
GQIDVMPTLLYMLGIDKEKYEDTALGRNLLNTNKSFAILTDGTIKDQNTLSDEDKETYKN
CEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
ILDLSDKMIRANYFKK
HHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377 [H]