| Definition | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010674 |
| Length | 3,800,327 |
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The map label for this gene is ndvB [H]
Identifier: 187933785
GI number: 187933785
Start: 2093589
End: 2102807
Strand: Reverse
Name: ndvB [H]
Synonym: CLL_A2012
Alternate gene names: 187933785
Gene position: 2102807-2093589 (Counterclockwise)
Preceding gene: 187933500
Following gene: 187932354
Centisome position: 55.33
GC content: 28.63
Gene sequence:
>9219_bases TTGAAGAAAAATAATTCTTATGGATTAAGAAGGAATATTTTAAGAGAACTTAATCAAGGATTTTCTTGTATTCATGAAAA TTTTAAGTACTTTAAAAAATTATCCAAAGGTAGAAATAAAGTCCTCGGAGCAGCTGAGTGGCTTCTTGATAATATATATT TAATTGAAAAAGAATATAAGGCAATTAAGAAGGAAATGCCTATTGATTATTTTAAATCATTACCTTCTATAACAGAATTT AATGATAATGTAGATCATAATAAAGCTCATAGAATTAATAATTCATTTAAAAGTAAAAATTTTTATGATGAAAGAGGGTA TGAGAAGAAAGGTTACAATGAAGTTGAAAATGAACTTCCTCGTATTTTTGTAGTTGCAAAGATGTATGTAGATATGGGAG GAGACATTGATTATGAGAGTTTTATTAAATATATTAATAAAATTCAAGAAGAAAATTTAGGTATAAGTTTAGACTCTAAT AATGTAAGTGAAAAATTGTTTACCAACATAGATAATAGTAGGAATAATTTAGATGGAACTCAAAAAGCTATTAATATTAT TAATAAAGATATGGCTTTTACAATGGGGGAACTTTGGGCTTTTCCACTTATGATTAAGGTAGCAATAATAATAAATTTAT CACAATATACTAATGAGCTTGTTGATATTCAAAAGGAGATTTTACAGGGAAAAATTGTTGCTGATAGGGTTGTAGATGCT ATAAGCAACAATAACCTTAATGAGGAACTTGAAAATATTAATGCTAAAGTTAGTCCGTTATTTTTAAGAGAATTTTTTAG AATTTTAAGGGACAATTCTATAGAAAATAAGAGTATTTATGATTTTGTAAGGCTTAAATGGGGAATAGATGAAGATCTTA ATAATTATACTACTAGGAGTGACTTAAGAGAGGAATTTTTAGAAAGATATATTGGGAATTATATAACTTCAATTAGAAAA 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Product: protein NdvB
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 3072; Mature: 3072
Protein sequence:
>3072_residues MKKNNSYGLRRNILRELNQGFSCIHENFKYFKKLSKGRNKVLGAAEWLLDNIYLIEKEYKAIKKEMPIDYFKSLPSITEF NDNVDHNKAHRINNSFKSKNFYDERGYEKKGYNEVENELPRIFVVAKMYVDMGGDIDYESFIKYINKIQEENLGISLDSN NVSEKLFTNIDNSRNNLDGTQKAINIINKDMAFTMGELWAFPLMIKVAIIINLSQYTNELVDIQKEILQGKIVADRVVDA ISNNNLNEELENINAKVSPLFLREFFRILRDNSIENKSIYDFVRLKWGIDEDLNNYTTRSDLREEFLERYIGNYITSIRK IENISWRNFFEDTSLVDKILREDPVDAYGSMDFESKDYYRHKLENIARITNKNEIKVAHNALQLSIKNKNENKESYKCHV GYYLIDNGISELDGYYNNVNHAISEGTYLAINILGTFLISALFLFIISLGGVKYTKAEYLILFLVSIIPINEIIIGLTNW IVSKTVQIRLVPKMDFSEGIPDNCKTVVVIPAIVNCKEKVKSLMEKLEVAYCGNKDKNIYFALLSDFADSKFQVEENDKE IIKCGIECARKLNNKYSKDNYKSNNNEARFFFFSRERIYNKKQNVFMGRERKRGKLMEFMALIRGKTDHTYNVLSSEIRI LKDVKYLITLDEDTFMPRESTFKLIGAMSHVLNVPYVNKDNEVLRGYGVMQPKVSISLESKNQTYFSNIFGGEGGVDGYS VAYSDTYQDLFGQGSFTGKGIINIDEFYNILNTSIKDDRILSHDLLEGALARCALVSQVEFIDGYPAFYESSCRRLHRWV RGDWQLIGWLFSKKISSLNKWKIFDNLRRSLLAPNLLIALILSLTILNGRSQIALLCFLALMNSLVFTVTDFVVTPKNKL MGTFKSFQQILLIFTFIPYQAFLMMDAIIRTLFRLCISKRNLLEWQSSDSVEKKYSNAFKSYLKRMWIAPIIGLLVLYLS IYNPIGVIVYSAIVAALWIVSPYVAYCISRKTSKNKMILDDEEIVYLRKISRRIYAYYEDFVNEENNYLAPDNYQEKPFK GIAHRTSPTNIGMGLVSNVVAYDLGYITIMEFIDKTEMILNSMKDLQMVNGHYLNWYDTKTKAPLWPRYVSTVDSGNLLG DLWVLKQAIEELKDKEVIRINEIMSLKDIYNIIEKDEDSIETIFDSNINIGEYKDALSKILVKQRLTQYEEDNADNENKA CLHGKENEESNYWRHKFLEETNRKLKYYNYIFNGLEKLYSEEFFEGVPTIRDLIDNCEEYKNEFGDNFNNTIEKKINNFK IYSRKIENIIKDINMISENMDFRFLYDKARQLFFIGYNVDEDSLGNSYYDLLASESRIASFVAIAKNDVPISHWFKLGRS MTNAFHTHSLVSWSGTMFEYFMPSLIMKNYPKTLLSQTYKSVIKAQKSFSKQKKTPWGISECAFYKFDVDENYQYKAFGV PGIGLKRGLEDEIVISPYSTLMTLPFSKNSGIKNLRKLEEIGCLGMYGFIEAIDYTKAREDKYVIKNPMNTNGQDNHLID SDTNNLNNEQIVDSIYSDGIKPNRIMTYMVHHLGMSLMALDNVLLNDILVNRFHSLPEVKATELLLKEKIPNNVTFERNE DFSIKNEYFEGENLIPRKFKGANQDNPEVLLLSNGEYSSMITVAGSGYSKKNDMMLYRWKGNTTSDDSGMFFYIKNLNSN DYWSSTFEPCKNYGDKYVTEFNLDKAKFNRKDGNIETQMEVVVSPDENFEVRKITLNNLSDKGRSLEITSYMEVTLTTFS ADAVHPTFSNLFVQTEYDNNENVLIGSRRGRVKGAKVPYIFHKVIVNGELEGSISYETSRINFIGRNRELKFPLAMDNDK SLDNTVGTVLDPIMSIRARIRLEGNSKKDIYFITGTSDSRESVIDICKQNKEVANLEKVFEGYSIRTQLELKNLGIRSAQ ANIFQSLASYIFFLHSGRKDREEYIKNISKYQKDLWSYGISGDLPIAFLTIENTDDINLVGNMLNLHYYLKLKGVKLDLI IYNNEEISYDEPLQKNIMQLISTSNEGNSLNTPGGIFVHNKATMDEKVKDLIIGIAKLYVDSKKGSILEQIAKIEELKVN SINEFSRYKKSVDEESYKHNNNNILDDNDKENSISQCKNDLLEKRPNKIETKNLEEEAKSLNINYKLEVADEVIPNLDDN ITEYKEYDHDIDFLEKQDLINGVKIAGIKDGIGKSVNKEDLNIEKFDEDFNMNDLDFFNGYGGFSKLDNSYLIKLSNLKN TPAPWINVISNDDFGFHISESGSSYTWCGNSRENKITPWSNDYIRDPLGEALYIRDDYSYKYFSITPKPVRDSGDYFIKH SFGYSEFSHTAYDLKGKLEVFAPKKEKIKIQKVTLENLSENDREISLFYYAKLVMGVYEYDSARYVSTYIHGEFEKNSNI NIKREESNSDSYVYHNGFIRGCNPYSEYFGKFNSYLTILGGENLSFTGDSKEFIGTNGEVSSPKALDNENLSNRCGGIYD PCLAVTTKIKLKKGEKKELLILFGEEEKENIEKVIEKYEVKGNADIELEKVKEYWKNFLGNIQVKTPDKSFNYLLNGWLL YQTLSCRYLSRSAFYQSGGAYGFRDQLQDSMALGVVDPEIPKAQILRSASRQYVEGDVQHWWHPVVNSGIRTRFSDDLLW LPYVTAEYINSTGDYEILQETAPYLEDEPLRDGEDERYTIVNQSSKKGTIYEHCLRAIEKALKFGVHNIPLMGSGDWNDG MSTVGNKGKGESVWLGWFLYSILESFIKIAQIKEDEETKAHYEEQKEFIKESLEKNAWDGGWYRRAYFDDGTPLGSRENP ECQIDSLAQSWAIISGATKIKSNDNSNEHYVDTVEKHSERAFEAMEAVDKNLVKKDKGLILLLAPPFSDSCLEPGYIKGY VPGVRENGGQYTHAAVWVILALTKLGLGDKATKYYNMINPINHTKTELECSIYKLEPYVMAADVYIKEPHGGRGGWSWYT GASGWMYRVGIEDILGLKRVENKGYKVNPCIPKLWNEFEMKIQNDKEDYTIKVIRAYDIDKRKNLNNLVDSQIISNSNQI KDGKYQIIINGKKIDGNIIPRNLGKINVVVYI
Sequences:
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Specific function: Involved in the production of beta-(1,2)-glucan. It is involved not only in invasion but also in bacteroid development [H]
COG id: COG3459
COG function: function code G; Cellobiose phosphorylase
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To A.tumefaciens ChvB [H]
Homologues:
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Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
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Pfam domain/function: PF06204 CBM_X; PF10091 DUF2329; PF11329 DUF3131; PF06165 Glyco_transf_36; PF06205 GT36_AF [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 354339; Mature: 354339
Theoretical pI: Translated: 5.92; Mature: 5.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
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Secondary structure:
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References: 2154461; 11481430 [H]