Definition Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome.
Accession NC_010674
Length 3,800,327

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The map label for this gene is spoIIIAE [H]

Identifier: 187932815

GI number: 187932815

Start: 2500407

End: 2501663

Strand: Reverse

Name: spoIIIAE [H]

Synonym: CLL_A2411

Alternate gene names: 187932815

Gene position: 2501663-2500407 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187934299

Following gene: 187933811

Centisome position: 65.83

GC content: 26.73

Gene sequence:

>1257_bases
ATGAAGATAATAAAAAGATGTACAATATTTTTTTTGATAAGTATTATTGTTAGTTCTGTATTTAATTGTATTTTTATACC
AGAAAAACCAGTGTATGCTGTTGAACAAAATAACTTAAGTACAAGCAGTAATTCTGATGCTAAAAAAAGTGAATCTATAA
TGGATGAAATCAAAATAGAAAGTTTAGATGATAGTACACAAAAACAAATAAATAATTTATATGAGTATATAAATAAAATG
AAAAATAATGTAGAGCTCATGAATGATTTGGATCCAGTTCAATATATTAAAGAATATATTAAAAATGGTGAAGGTGATTT
TAATATAAAATCCTTGAGCAAGGCATTAACTAGTATATTATTTAAAGAAGTTGGAAGTGTATTAAAACTTATAATATCAA
TAGTTACAATAGTTATAATCTGTTCACTGATTAAAATTTTACAAGATGCATTTTCAAGTGACAATGTATCTGAAATAGCT
TTTTATGCATGTTATGCATTGATAATAATGATTCTTTCAAAGAGTTTCATTATATCTATAGGGGTTGCAAAGGATGTTAT
ATTAAATATTGCTGATTTTATGGCTGCATTATTACCAGTGCTTATAACCATGATAGCGATGGTAGGAGGATTAACTCAGG
CGGCAACATTAGATCCTATTATTTTGGCTGCTGTAGTATTTATACCAAGAATTTATTCTAATATTATAATTCCGCTTATA
TTAATGGGATTTGTATTAGGATTTGCAAATAATTTATCTAATGATCATAAAATTACAAATCTTTGTAAACTGCTTAAACA
GTGTACTTTATGGATGCAAGGAATAATAATAACTGTTTTTATTGGTGTTTTAACAGTAAGGGGGATTACATCAAAAACAA
TAGATGCAGTTACATTAAAAACTACTAAATTTGCGGTTGATAATTTCATACCTATTGTAGGAAAGACATTTTCTGATGCT
ATTGCTTCTATTGCAGGATATTCATTGATAATTAAGAATGCAATAAGTTCAGTAGGATTATTAATTATAGTACTAATACT
TTTATATCCAATAATAAAATTAGTACTTATGACAGTGATATATAAATTGGCAGCAGCATTAATAGAACCTATAAGTGATC
CTAGAATAACTAATTCAGTTGCAGCTGCAGGAGATTCAATGACGTTAATTATATCATGTGTTTTAAGTGTAAGTTTAATG
TTTTTTATTTTAATAGCTCTTGTTGCATCCTCAGGGCTGTTTATAGTAGGAGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGTAGAGTTTTCAGGGAAAATAATGATTTTAGTATTAGCAATTCCAATTCTTATGGCTGTATTAAATTCTATCCTACAG
ATAATGTAGGTGAAATAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GACATGAATTTATTAAAGGAACTAGTAACAACCTTAGTGACTGCACTTATATTTATAACAGCAATAGAACTTATAAGTCC
TAATAATAGTATGAACAAAT

Product: stage III sporulation protein AE

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 418; Mature: 418

Protein sequence:

>418_residues
MKIIKRCTIFFLISIIVSSVFNCIFIPEKPVYAVEQNNLSTSSNSDAKKSESIMDEIKIESLDDSTQKQINNLYEYINKM
KNNVELMNDLDPVQYIKEYIKNGEGDFNIKSLSKALTSILFKEVGSVLKLIISIVTIVIICSLIKILQDAFSSDNVSEIA
FYACYALIIMILSKSFIISIGVAKDVILNIADFMAALLPVLITMIAMVGGLTQAATLDPIILAAVVFIPRIYSNIIIPLI
LMGFVLGFANNLSNDHKITNLCKLLKQCTLWMQGIIITVFIGVLTVRGITSKTIDAVTLKTTKFAVDNFIPIVGKTFSDA
IASIAGYSLIIKNAISSVGLLIIVLILLYPIIKLVLMTVIYKLAAALIEPISDPRITNSVAAAGDSMTLIISCVLSVSLM
FFILIALVASSGLFIVGG

Sequences:

>Translated_418_residues
MKIIKRCTIFFLISIIVSSVFNCIFIPEKPVYAVEQNNLSTSSNSDAKKSESIMDEIKIESLDDSTQKQINNLYEYINKM
KNNVELMNDLDPVQYIKEYIKNGEGDFNIKSLSKALTSILFKEVGSVLKLIISIVTIVIICSLIKILQDAFSSDNVSEIA
FYACYALIIMILSKSFIISIGVAKDVILNIADFMAALLPVLITMIAMVGGLTQAATLDPIILAAVVFIPRIYSNIIIPLI
LMGFVLGFANNLSNDHKITNLCKLLKQCTLWMQGIIITVFIGVLTVRGITSKTIDAVTLKTTKFAVDNFIPIVGKTFSDA
IASIAGYSLIIKNAISSVGLLIIVLILLYPIIKLVLMTVIYKLAAALIEPISDPRITNSVAAAGDSMTLIISCVLSVSLM
FFILIALVASSGLFIVGG
>Mature_418_residues
MKIIKRCTIFFLISIIVSSVFNCIFIPEKPVYAVEQNNLSTSSNSDAKKSESIMDEIKIESLDDSTQKQINNLYEYINKM
KNNVELMNDLDPVQYIKEYIKNGEGDFNIKSLSKALTSILFKEVGSVLKLIISIVTIVIICSLIKILQDAFSSDNVSEIA
FYACYALIIMILSKSFIISIGVAKDVILNIADFMAALLPVLITMIAMVGGLTQAATLDPIILAAVVFIPRIYSNIIIPLI
LMGFVLGFANNLSNDHKITNLCKLLKQCTLWMQGIIITVFIGVLTVRGITSKTIDAVTLKTTKFAVDNFIPIVGKTFSDA
IASIAGYSLIIKNAISSVGLLIIVLILLYPIIKLVLMTVIYKLAAALIEPISDPRITNSVAAAGDSMTLIISCVLSVSLM
FFILIALVASSGLFIVGG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014194 [H]

Pfam domain/function: PF09546 Spore_III_AE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45546; Mature: 45546

Theoretical pI: Translated: 8.01; Mature: 8.01

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIIKRCTIFFLISIIVSSVFNCIFIPEKPVYAVEQNNLSTSSNSDAKKSESIMDEIKIE
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
SLDDSTQKQINNLYEYINKMKNNVELMNDLDPVQYIKEYIKNGEGDFNIKSLSKALTSIL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
FKEVGSVLKLIISIVTIVIICSLIKILQDAFSSDNVSEIAFYACYALIIMILSKSFIISI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVAKDVILNIADFMAALLPVLITMIAMVGGLTQAATLDPIILAAVVFIPRIYSNIIIPLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMGFVLGFANNLSNDHKITNLCKLLKQCTLWMQGIIITVFIGVLTVRGITSKTIDAVTLK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHEEH
TTKFAVDNFIPIVGKTFSDAIASIAGYSLIIKNAISSVGLLIIVLILLYPIIKLVLMTVI
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YKLAAALIEPISDPRITNSVAAAGDSMTLIISCVLSVSLMFFILIALVASSGLFIVGG
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECC
>Mature Secondary Structure
MKIIKRCTIFFLISIIVSSVFNCIFIPEKPVYAVEQNNLSTSSNSDAKKSESIMDEIKIE
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
SLDDSTQKQINNLYEYINKMKNNVELMNDLDPVQYIKEYIKNGEGDFNIKSLSKALTSIL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
FKEVGSVLKLIISIVTIVIICSLIKILQDAFSSDNVSEIAFYACYALIIMILSKSFIISI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVAKDVILNIADFMAALLPVLITMIAMVGGLTQAATLDPIILAAVVFIPRIYSNIIIPLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMGFVLGFANNLSNDHKITNLCKLLKQCTLWMQGIIITVFIGVLTVRGITSKTIDAVTLK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHEEH
TTKFAVDNFIPIVGKTFSDAIASIAGYSLIIKNAISSVGLLIIVLILLYPIIKLVLMTVI
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YKLAAALIEPISDPRITNSVAAAGDSMTLIISCVLSVSLMFFILIALVASSGLFIVGG
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377 [H]