| Definition | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010674 |
| Length | 3,800,327 |
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The map label for this gene is spoIIIAE [H]
Identifier: 187932815
GI number: 187932815
Start: 2500407
End: 2501663
Strand: Reverse
Name: spoIIIAE [H]
Synonym: CLL_A2411
Alternate gene names: 187932815
Gene position: 2501663-2500407 (Counterclockwise)
Preceding gene: 187934299
Following gene: 187933811
Centisome position: 65.83
GC content: 26.73
Gene sequence:
>1257_bases ATGAAGATAATAAAAAGATGTACAATATTTTTTTTGATAAGTATTATTGTTAGTTCTGTATTTAATTGTATTTTTATACC AGAAAAACCAGTGTATGCTGTTGAACAAAATAACTTAAGTACAAGCAGTAATTCTGATGCTAAAAAAAGTGAATCTATAA TGGATGAAATCAAAATAGAAAGTTTAGATGATAGTACACAAAAACAAATAAATAATTTATATGAGTATATAAATAAAATG AAAAATAATGTAGAGCTCATGAATGATTTGGATCCAGTTCAATATATTAAAGAATATATTAAAAATGGTGAAGGTGATTT TAATATAAAATCCTTGAGCAAGGCATTAACTAGTATATTATTTAAAGAAGTTGGAAGTGTATTAAAACTTATAATATCAA TAGTTACAATAGTTATAATCTGTTCACTGATTAAAATTTTACAAGATGCATTTTCAAGTGACAATGTATCTGAAATAGCT TTTTATGCATGTTATGCATTGATAATAATGATTCTTTCAAAGAGTTTCATTATATCTATAGGGGTTGCAAAGGATGTTAT ATTAAATATTGCTGATTTTATGGCTGCATTATTACCAGTGCTTATAACCATGATAGCGATGGTAGGAGGATTAACTCAGG CGGCAACATTAGATCCTATTATTTTGGCTGCTGTAGTATTTATACCAAGAATTTATTCTAATATTATAATTCCGCTTATA TTAATGGGATTTGTATTAGGATTTGCAAATAATTTATCTAATGATCATAAAATTACAAATCTTTGTAAACTGCTTAAACA GTGTACTTTATGGATGCAAGGAATAATAATAACTGTTTTTATTGGTGTTTTAACAGTAAGGGGGATTACATCAAAAACAA TAGATGCAGTTACATTAAAAACTACTAAATTTGCGGTTGATAATTTCATACCTATTGTAGGAAAGACATTTTCTGATGCT ATTGCTTCTATTGCAGGATATTCATTGATAATTAAGAATGCAATAAGTTCAGTAGGATTATTAATTATAGTACTAATACT TTTATATCCAATAATAAAATTAGTACTTATGACAGTGATATATAAATTGGCAGCAGCATTAATAGAACCTATAAGTGATC CTAGAATAACTAATTCAGTTGCAGCTGCAGGAGATTCAATGACGTTAATTATATCATGTGTTTTAAGTGTAAGTTTAATG TTTTTTATTTTAATAGCTCTTGTTGCATCCTCAGGGCTGTTTATAGTAGGAGGATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGGTAGAGTTTTCAGGGAAAATAATGATTTTAGTATTAGCAATTCCAATTCTTATGGCTGTATTAAATTCTATCCTACAG ATAATGTAGGTGAAATAAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases GACATGAATTTATTAAAGGAACTAGTAACAACCTTAGTGACTGCACTTATATTTATAACAGCAATAGAACTTATAAGTCC TAATAATAGTATGAACAAAT
Product: stage III sporulation protein AE
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 418; Mature: 418
Protein sequence:
>418_residues MKIIKRCTIFFLISIIVSSVFNCIFIPEKPVYAVEQNNLSTSSNSDAKKSESIMDEIKIESLDDSTQKQINNLYEYINKM KNNVELMNDLDPVQYIKEYIKNGEGDFNIKSLSKALTSILFKEVGSVLKLIISIVTIVIICSLIKILQDAFSSDNVSEIA FYACYALIIMILSKSFIISIGVAKDVILNIADFMAALLPVLITMIAMVGGLTQAATLDPIILAAVVFIPRIYSNIIIPLI LMGFVLGFANNLSNDHKITNLCKLLKQCTLWMQGIIITVFIGVLTVRGITSKTIDAVTLKTTKFAVDNFIPIVGKTFSDA IASIAGYSLIIKNAISSVGLLIIVLILLYPIIKLVLMTVIYKLAAALIEPISDPRITNSVAAAGDSMTLIISCVLSVSLM FFILIALVASSGLFIVGG
Sequences:
>Translated_418_residues MKIIKRCTIFFLISIIVSSVFNCIFIPEKPVYAVEQNNLSTSSNSDAKKSESIMDEIKIESLDDSTQKQINNLYEYINKM KNNVELMNDLDPVQYIKEYIKNGEGDFNIKSLSKALTSILFKEVGSVLKLIISIVTIVIICSLIKILQDAFSSDNVSEIA FYACYALIIMILSKSFIISIGVAKDVILNIADFMAALLPVLITMIAMVGGLTQAATLDPIILAAVVFIPRIYSNIIIPLI LMGFVLGFANNLSNDHKITNLCKLLKQCTLWMQGIIITVFIGVLTVRGITSKTIDAVTLKTTKFAVDNFIPIVGKTFSDA IASIAGYSLIIKNAISSVGLLIIVLILLYPIIKLVLMTVIYKLAAALIEPISDPRITNSVAAAGDSMTLIISCVLSVSLM FFILIALVASSGLFIVGG >Mature_418_residues MKIIKRCTIFFLISIIVSSVFNCIFIPEKPVYAVEQNNLSTSSNSDAKKSESIMDEIKIESLDDSTQKQINNLYEYINKM KNNVELMNDLDPVQYIKEYIKNGEGDFNIKSLSKALTSILFKEVGSVLKLIISIVTIVIICSLIKILQDAFSSDNVSEIA FYACYALIIMILSKSFIISIGVAKDVILNIADFMAALLPVLITMIAMVGGLTQAATLDPIILAAVVFIPRIYSNIIIPLI LMGFVLGFANNLSNDHKITNLCKLLKQCTLWMQGIIITVFIGVLTVRGITSKTIDAVTLKTTKFAVDNFIPIVGKTFSDA IASIAGYSLIIKNAISSVGLLIIVLILLYPIIKLVLMTVIYKLAAALIEPISDPRITNSVAAAGDSMTLIISCVLSVSLM FFILIALVASSGLFIVGG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR014194 [H]
Pfam domain/function: PF09546 Spore_III_AE [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 45546; Mature: 45546
Theoretical pI: Translated: 8.01; Mature: 8.01
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 4.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKIIKRCTIFFLISIIVSSVFNCIFIPEKPVYAVEQNNLSTSSNSDAKKSESIMDEIKIE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH SLDDSTQKQINNLYEYINKMKNNVELMNDLDPVQYIKEYIKNGEGDFNIKSLSKALTSIL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH FKEVGSVLKLIISIVTIVIICSLIKILQDAFSSDNVSEIAFYACYALIIMILSKSFIISI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVAKDVILNIADFMAALLPVLITMIAMVGGLTQAATLDPIILAAVVFIPRIYSNIIIPLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMGFVLGFANNLSNDHKITNLCKLLKQCTLWMQGIIITVFIGVLTVRGITSKTIDAVTLK HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHEEH TTKFAVDNFIPIVGKTFSDAIASIAGYSLIIKNAISSVGLLIIVLILLYPIIKLVLMTVI HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YKLAAALIEPISDPRITNSVAAAGDSMTLIISCVLSVSLMFFILIALVASSGLFIVGG HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECC >Mature Secondary Structure MKIIKRCTIFFLISIIVSSVFNCIFIPEKPVYAVEQNNLSTSSNSDAKKSESIMDEIKIE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH SLDDSTQKQINNLYEYINKMKNNVELMNDLDPVQYIKEYIKNGEGDFNIKSLSKALTSIL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH FKEVGSVLKLIISIVTIVIICSLIKILQDAFSSDNVSEIAFYACYALIIMILSKSFIISI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVAKDVILNIADFMAALLPVLITMIAMVGGLTQAATLDPIILAAVVFIPRIYSNIIIPLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMGFVLGFANNLSNDHKITNLCKLLKQCTLWMQGIIITVFIGVLTVRGITSKTIDAVTLK HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHEEH TTKFAVDNFIPIVGKTFSDAIASIAGYSLIIKNAISSVGLLIIVLILLYPIIKLVLMTVI HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YKLAAALIEPISDPRITNSVAAAGDSMTLIISCVLSVSLMFFILIALVASSGLFIVGG HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8969508; 9384377 [H]