Definition Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome.
Accession NC_010673
Length 922,307

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 187918600

Identifier: 187918600

GI number: 187918600

Start: 797215

End: 799743

Strand: Direct

Name: 187918600

Synonym: BH0744

Alternate gene names: NA

Gene position: 797215-799743 (Clockwise)

Preceding gene: 187918599

Following gene: 187918601

Centisome position: 86.44

GC content: 34.05

Gene sequence:

>2529_bases
ATGAAAAGAATATGGATACTTTTTAATTTTTTATTTATCTTTTTAAATATTTTTACTTTTCATGCTAGAGAAGTAGATAA
GAAGAAGTTGAAGGATTTTGTTAATATGGATCTTGAATTTGTTAACTATCGGGGTCCTTATGATTCTACAGATACGTACC
TGCAAATAGTAGGTATTGGTGAGTTTTTAGCTAAGAATTTAACTAATAACAAATCTAACTATTATAGTAAGTATTATGTT
AATAGGTACATTGACAGTGAGAGTGAAAAGAGTAGTTCAGATGTTTTTATTATTGGTGAGAGTTCTTCTCTTGATAGTAT
TTTAAATCTTAGAAGGATACTTACAGGATATTTGATGGAAGGTTTTAATTACAGTAAAGAGAGTGCAGAATTACTTGCTA
AAGCTATTACAATATATAATGCTACTTATCGAGGTGATTTGGATTATTATAGTGATGCTTATATTCAGCCTGCCCTTGAG
GGTTTAAGTAAGCATAATGTAGGACTTTCAAGAGTTTATAGCCAATGGGCTGGAAAGACTTATATTTTTGTTCCTCTTAA
GAGAAATATTTTATCAGGAAACATTGAATCAGATGTTGATCTTGACAAAATCGTTACAGATAAGGTAGTAATCTCTCTTT
TAAGTGAAAATGAGGAAGTTGGTACTGACTTTGCAAGAGATTTAACTGATGTTCAGGATGAAATTCGTGATGTTGATCAG
GAAAAAATTGATATTGAGTCTGCTACTTTGAAAAGCATTGATGATGAATTAACCGAGACTATTGATAACTTAAGAGAACA
ACTTGAGAGAGCTACAGATGATGCTGAGAAGGAAGGCATTAAGAAGCAAATTGATGATAAGACAGTTAAGAGAGATGCTT
TAAAGGATAAGACAGATGGGCTTAAAAAGTCACAGAAGAAATTAGATAGTTCGCAGGAGAAATTAGATAGGCAAAGGGAT
GCAGTTAAAGATAAAGTTCAAGAAAGTATTGATAAAGGGAACAGAGATAAGAATTTACCAAAGCCTGGGGCAATAAGTTC
TCCAAAAGTAGATGAGAAATTGCAATTAATTGAAACTATTGAAGATTTGGAAGAGCAGCTTGAGAGAGCTACAGATGATG
CTGAGAAGGAAATAATTAAGAAGCAAATCGATGATAAGCTAGTTAAGCGAGATGCTTTAAAGGATAAGACAGATGGGCCT
AAGGAGCTGCAGAGGCGGTTAGATGGGCAAAGGGATGCAGCTGAAGATAAGGTGCAGGAAGGTATTAATAAAGGGAAGAG
AGATAATAATTTGCCAAAACCTAGGGAAGTAAATTTATTAAAGAAGGATGAAAAATTAAAGTCAGCTTCTGAATTAAAAA
ACCAGCTTAAGAGAGCTACAGATGATGCCGAGAAGGAAATAATTAAGAAGCAAATCGATGATAAGCTAGTTAAGCGAGAT
GCTTTAAAGGATAAGACAGATGGGCCTAAGGAGCTGCAGAGGCGGTTAGATGGGCAAAGGGATGCAGCTGAAGATAAGGT
GCAGGAAGGTATTAATAAAGGGAAGAGAGATAATAATTTGCCAAAACCTAGGGAAGTAAATTTATTAAAGAAGGATGAAA
AATTAAAGTCAGCTTCTGAATTAAAAAACCAGCTTAAGAGAGCTACAGATGATGCCGAGAAGGAAATAATTAAGAAGCAA
ATCGATGATAAGCTAGTTAAGCGAGATGCTTTAAAGGATAAGACAGATGGGCCTAAGGAGCTGCAGAGGCGGTTAGATGG
GCAAAGGGATGCAGCTGAAGATAAGGTGCAGGAAGGTATTAATAAAGGGAAGAGAGATAATAATTTGCCAAAACCTAGGG
AAGTAAGTTTATTAAAGAAGGATGAAAAATTAAAGTCAGCTTCTGAGTTGAAAAAACAACCCAAGAGAGCTACTGCTGAT
ATTTCTAAAAATATTCCTAGTGTTGTAAACAATCAATCTCGACGTTTGCCTGCTAAGCCTTTAGCTTTTAGAAAGCAATC
AGATCAATCTGAAGGTGTAGATAAATTACCCCTTGAAACTGAAAATCAAAAACCTATACATAAACCTATGTTTTTAGAGG
TTCTAAATCCCAATACGAATTTGGGAGTTCTTAGGTTAATTGACTCGGATGGAGGCCAATTGGAAGAGGCTTCTAGGTAT
GGTATTAGGAGGTATGGGGTTTATGAGAGAAAAGATGATTTTGTAGCTATAAAACTTTGTTCAGGTATTGCAAAGCTTCA
GTTGCTTAATAAAGCAGAAAATTTAAAAGTTGAATCTGAAGCAGATTTTGAGTTAAGTAGAGATTCTTCTCTTTATGTTG
ATTCAAAAATGATTTTGGTGGTTGTTAAGGATAATAATGTTTGGAAATTAGCAAAGTTTTCTTCAAAGGATTTAAGTGAA
TTTATTCTATCAGAAGATGAAGTTTTGCCATTTACAAGCTTTACTGTTGATGCAGGTCATGTTTATTTGCAAGATGCATC
TAAAAAGCTTATTACTTTGGATCTAAATACTTTGAAAAAAGTGTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAATACATCTTATAGTAAGTTAAGATTGATGTTTAATTTATGCCGATTTAGTTAATAATAAGGTTTATAATTAACTAGGA
AACTAGGAGAGAATTTTGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTATTTTTTTGATTAAATAGTGTTTAAGTAATTAGAAAAGGAAGAACAAAATTTTGTTCTTCCTTTATATTATAGAAAC
AGTCGGGACAGTGAGATTCG

Product: p93 antigen

Products: NA

Alternate protein names: P93 Antigen; Borrelia; Signal Peptide

Number of amino acids: Translated: 842; Mature: 842

Protein sequence:

>842_residues
MKRIWILFNFLFIFLNIFTFHAREVDKKKLKDFVNMDLEFVNYRGPYDSTDTYLQIVGIGEFLAKNLTNNKSNYYSKYYV
NRYIDSESEKSSSDVFIIGESSSLDSILNLRRILTGYLMEGFNYSKESAELLAKAITIYNATYRGDLDYYSDAYIQPALE
GLSKHNVGLSRVYSQWAGKTYIFVPLKRNILSGNIESDVDLDKIVTDKVVISLLSENEEVGTDFARDLTDVQDEIRDVDQ
EKIDIESATLKSIDDELTETIDNLREQLERATDDAEKEGIKKQIDDKTVKRDALKDKTDGLKKSQKKLDSSQEKLDRQRD
AVKDKVQESIDKGNRDKNLPKPGAISSPKVDEKLQLIETIEDLEEQLERATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGP
KELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRD
ALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQ
IDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVSLLKKDEKLKSASELKKQPKRATAD
ISKNIPSVVNNQSRRLPAKPLAFRKQSDQSEGVDKLPLETENQKPIHKPMFLEVLNPNTNLGVLRLIDSDGGQLEEASRY
GIRRYGVYERKDDFVAIKLCSGIAKLQLLNKAENLKVESEADFELSRDSSLYVDSKMILVVVKDNNVWKLAKFSSKDLSE
FILSEDEVLPFTSFTVDAGHVYLQDASKKLITLDLNTLKKVS

Sequences:

>Translated_842_residues
MKRIWILFNFLFIFLNIFTFHAREVDKKKLKDFVNMDLEFVNYRGPYDSTDTYLQIVGIGEFLAKNLTNNKSNYYSKYYV
NRYIDSESEKSSSDVFIIGESSSLDSILNLRRILTGYLMEGFNYSKESAELLAKAITIYNATYRGDLDYYSDAYIQPALE
GLSKHNVGLSRVYSQWAGKTYIFVPLKRNILSGNIESDVDLDKIVTDKVVISLLSENEEVGTDFARDLTDVQDEIRDVDQ
EKIDIESATLKSIDDELTETIDNLREQLERATDDAEKEGIKKQIDDKTVKRDALKDKTDGLKKSQKKLDSSQEKLDRQRD
AVKDKVQESIDKGNRDKNLPKPGAISSPKVDEKLQLIETIEDLEEQLERATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGP
KELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRD
ALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQ
IDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVSLLKKDEKLKSASELKKQPKRATAD
ISKNIPSVVNNQSRRLPAKPLAFRKQSDQSEGVDKLPLETENQKPIHKPMFLEVLNPNTNLGVLRLIDSDGGQLEEASRY
GIRRYGVYERKDDFVAIKLCSGIAKLQLLNKAENLKVESEADFELSRDSSLYVDSKMILVVVKDNNVWKLAKFSSKDLSE
FILSEDEVLPFTSFTVDAGHVYLQDASKKLITLDLNTLKKVS
>Mature_842_residues
MKRIWILFNFLFIFLNIFTFHAREVDKKKLKDFVNMDLEFVNYRGPYDSTDTYLQIVGIGEFLAKNLTNNKSNYYSKYYV
NRYIDSESEKSSSDVFIIGESSSLDSILNLRRILTGYLMEGFNYSKESAELLAKAITIYNATYRGDLDYYSDAYIQPALE
GLSKHNVGLSRVYSQWAGKTYIFVPLKRNILSGNIESDVDLDKIVTDKVVISLLSENEEVGTDFARDLTDVQDEIRDVDQ
EKIDIESATLKSIDDELTETIDNLREQLERATDDAEKEGIKKQIDDKTVKRDALKDKTDGLKKSQKKLDSSQEKLDRQRD
AVKDKVQESIDKGNRDKNLPKPGAISSPKVDEKLQLIETIEDLEEQLERATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGP
KELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRD
ALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQ
IDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVSLLKKDEKLKSASELKKQPKRATAD
ISKNIPSVVNNQSRRLPAKPLAFRKQSDQSEGVDKLPLETENQKPIHKPMFLEVLNPNTNLGVLRLIDSDGGQLEEASRY
GIRRYGVYERKDDFVAIKLCSGIAKLQLLNKAENLKVESEADFELSRDSSLYVDSKMILVVVKDNNVWKLAKFSSKDLSE
FILSEDEVLPFTSFTVDAGHVYLQDASKKLITLDLNTLKKVS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96254; Mature: 96254

Theoretical pI: Translated: 7.01; Mature: 7.01

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
0.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
0.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKRIWILFNFLFIFLNIFTFHAREVDKKKLKDFVNMDLEFVNYRGPYDSTDTYLQIVGIG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCCCCCEEEEEEHH
EFLAKNLTNNKSNYYSKYYVNRYIDSESEKSSSDVFIIGESSSLDSILNLRRILTGYLME
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFNYSKESAELLAKAITIYNATYRGDLDYYSDAYIQPALEGLSKHNVGLSRVYSQWAGKT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCE
YIFVPLKRNILSGNIESDVDLDKIVTDKVVISLLSENEEVGTDFARDLTDVQDEIRDVDQ
EEEEEEHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
EKIDIESATLKSIDDELTETIDNLREQLERATDDAEKEGIKKQIDDKTVKRDALKDKTDG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKKSQKKLDSSQEKLDRQRDAVKDKVQESIDKGNRDKNLPKPGAISSPKVDEKLQLIETI
HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
EDLEEQLERATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQE
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
GINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRD
HHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASE
HHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGI
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
NKGKRDNNLPKPREVSLLKKDEKLKSASELKKQPKRATADISKNIPSVVNNQSRRLPAKP
HCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCC
LAFRKQSDQSEGVDKLPLETENQKPIHKPMFLEVLNPNTNLGVLRLIDSDGGQLEEASRY
HHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHH
GIRRYGVYERKDDFVAIKLCSGIAKLQLLNKAENLKVESEADFELSRDSSLYVDSKMILV
CHHHCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCEEECCEEEEE
VVKDNNVWKLAKFSSKDLSEFILSEDEVLPFTSFTVDAGHVYLQDASKKLITLDLNTLKK
EEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEHHHHHC
VS
CC
>Mature Secondary Structure
MKRIWILFNFLFIFLNIFTFHAREVDKKKLKDFVNMDLEFVNYRGPYDSTDTYLQIVGIG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCCCCCEEEEEEHH
EFLAKNLTNNKSNYYSKYYVNRYIDSESEKSSSDVFIIGESSSLDSILNLRRILTGYLME
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFNYSKESAELLAKAITIYNATYRGDLDYYSDAYIQPALEGLSKHNVGLSRVYSQWAGKT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCE
YIFVPLKRNILSGNIESDVDLDKIVTDKVVISLLSENEEVGTDFARDLTDVQDEIRDVDQ
EEEEEEHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
EKIDIESATLKSIDDELTETIDNLREQLERATDDAEKEGIKKQIDDKTVKRDALKDKTDG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKKSQKKLDSSQEKLDRQRDAVKDKVQESIDKGNRDKNLPKPGAISSPKVDEKLQLIETI
HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
EDLEEQLERATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQE
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
GINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRD
HHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASE
HHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGI
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
NKGKRDNNLPKPREVSLLKKDEKLKSASELKKQPKRATADISKNIPSVVNNQSRRLPAKP
HCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCC
LAFRKQSDQSEGVDKLPLETENQKPIHKPMFLEVLNPNTNLGVLRLIDSDGGQLEEASRY
HHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHH
GIRRYGVYERKDDFVAIKLCSGIAKLQLLNKAENLKVESEADFELSRDSSLYVDSKMILV
CHHHCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCEEECCEEEEE
VVKDNNVWKLAKFSSKDLSEFILSEDEVLPFTSFTVDAGHVYLQDASKKLITLDLNTLKK
EEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEHHHHHC
VS
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA