| Definition | Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010673 |
| Length | 922,307 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 187918600
Identifier: 187918600
GI number: 187918600
Start: 797215
End: 799743
Strand: Direct
Name: 187918600
Synonym: BH0744
Alternate gene names: NA
Gene position: 797215-799743 (Clockwise)
Preceding gene: 187918599
Following gene: 187918601
Centisome position: 86.44
GC content: 34.05
Gene sequence:
>2529_bases ATGAAAAGAATATGGATACTTTTTAATTTTTTATTTATCTTTTTAAATATTTTTACTTTTCATGCTAGAGAAGTAGATAA GAAGAAGTTGAAGGATTTTGTTAATATGGATCTTGAATTTGTTAACTATCGGGGTCCTTATGATTCTACAGATACGTACC TGCAAATAGTAGGTATTGGTGAGTTTTTAGCTAAGAATTTAACTAATAACAAATCTAACTATTATAGTAAGTATTATGTT AATAGGTACATTGACAGTGAGAGTGAAAAGAGTAGTTCAGATGTTTTTATTATTGGTGAGAGTTCTTCTCTTGATAGTAT TTTAAATCTTAGAAGGATACTTACAGGATATTTGATGGAAGGTTTTAATTACAGTAAAGAGAGTGCAGAATTACTTGCTA AAGCTATTACAATATATAATGCTACTTATCGAGGTGATTTGGATTATTATAGTGATGCTTATATTCAGCCTGCCCTTGAG GGTTTAAGTAAGCATAATGTAGGACTTTCAAGAGTTTATAGCCAATGGGCTGGAAAGACTTATATTTTTGTTCCTCTTAA GAGAAATATTTTATCAGGAAACATTGAATCAGATGTTGATCTTGACAAAATCGTTACAGATAAGGTAGTAATCTCTCTTT TAAGTGAAAATGAGGAAGTTGGTACTGACTTTGCAAGAGATTTAACTGATGTTCAGGATGAAATTCGTGATGTTGATCAG GAAAAAATTGATATTGAGTCTGCTACTTTGAAAAGCATTGATGATGAATTAACCGAGACTATTGATAACTTAAGAGAACA ACTTGAGAGAGCTACAGATGATGCTGAGAAGGAAGGCATTAAGAAGCAAATTGATGATAAGACAGTTAAGAGAGATGCTT TAAAGGATAAGACAGATGGGCTTAAAAAGTCACAGAAGAAATTAGATAGTTCGCAGGAGAAATTAGATAGGCAAAGGGAT GCAGTTAAAGATAAAGTTCAAGAAAGTATTGATAAAGGGAACAGAGATAAGAATTTACCAAAGCCTGGGGCAATAAGTTC TCCAAAAGTAGATGAGAAATTGCAATTAATTGAAACTATTGAAGATTTGGAAGAGCAGCTTGAGAGAGCTACAGATGATG CTGAGAAGGAAATAATTAAGAAGCAAATCGATGATAAGCTAGTTAAGCGAGATGCTTTAAAGGATAAGACAGATGGGCCT AAGGAGCTGCAGAGGCGGTTAGATGGGCAAAGGGATGCAGCTGAAGATAAGGTGCAGGAAGGTATTAATAAAGGGAAGAG AGATAATAATTTGCCAAAACCTAGGGAAGTAAATTTATTAAAGAAGGATGAAAAATTAAAGTCAGCTTCTGAATTAAAAA ACCAGCTTAAGAGAGCTACAGATGATGCCGAGAAGGAAATAATTAAGAAGCAAATCGATGATAAGCTAGTTAAGCGAGAT GCTTTAAAGGATAAGACAGATGGGCCTAAGGAGCTGCAGAGGCGGTTAGATGGGCAAAGGGATGCAGCTGAAGATAAGGT GCAGGAAGGTATTAATAAAGGGAAGAGAGATAATAATTTGCCAAAACCTAGGGAAGTAAATTTATTAAAGAAGGATGAAA AATTAAAGTCAGCTTCTGAATTAAAAAACCAGCTTAAGAGAGCTACAGATGATGCCGAGAAGGAAATAATTAAGAAGCAA ATCGATGATAAGCTAGTTAAGCGAGATGCTTTAAAGGATAAGACAGATGGGCCTAAGGAGCTGCAGAGGCGGTTAGATGG GCAAAGGGATGCAGCTGAAGATAAGGTGCAGGAAGGTATTAATAAAGGGAAGAGAGATAATAATTTGCCAAAACCTAGGG AAGTAAGTTTATTAAAGAAGGATGAAAAATTAAAGTCAGCTTCTGAGTTGAAAAAACAACCCAAGAGAGCTACTGCTGAT ATTTCTAAAAATATTCCTAGTGTTGTAAACAATCAATCTCGACGTTTGCCTGCTAAGCCTTTAGCTTTTAGAAAGCAATC AGATCAATCTGAAGGTGTAGATAAATTACCCCTTGAAACTGAAAATCAAAAACCTATACATAAACCTATGTTTTTAGAGG TTCTAAATCCCAATACGAATTTGGGAGTTCTTAGGTTAATTGACTCGGATGGAGGCCAATTGGAAGAGGCTTCTAGGTAT GGTATTAGGAGGTATGGGGTTTATGAGAGAAAAGATGATTTTGTAGCTATAAAACTTTGTTCAGGTATTGCAAAGCTTCA GTTGCTTAATAAAGCAGAAAATTTAAAAGTTGAATCTGAAGCAGATTTTGAGTTAAGTAGAGATTCTTCTCTTTATGTTG ATTCAAAAATGATTTTGGTGGTTGTTAAGGATAATAATGTTTGGAAATTAGCAAAGTTTTCTTCAAAGGATTTAAGTGAA TTTATTCTATCAGAAGATGAAGTTTTGCCATTTACAAGCTTTACTGTTGATGCAGGTCATGTTTATTTGCAAGATGCATC TAAAAAGCTTATTACTTTGGATCTAAATACTTTGAAAAAAGTGTCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GAATACATCTTATAGTAAGTTAAGATTGATGTTTAATTTATGCCGATTTAGTTAATAATAAGGTTTATAATTAACTAGGA AACTAGGAGAGAATTTTGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTATTTTTTTGATTAAATAGTGTTTAAGTAATTAGAAAAGGAAGAACAAAATTTTGTTCTTCCTTTATATTATAGAAAC AGTCGGGACAGTGAGATTCG
Product: p93 antigen
Products: NA
Alternate protein names: P93 Antigen; Borrelia; Signal Peptide
Number of amino acids: Translated: 842; Mature: 842
Protein sequence:
>842_residues MKRIWILFNFLFIFLNIFTFHAREVDKKKLKDFVNMDLEFVNYRGPYDSTDTYLQIVGIGEFLAKNLTNNKSNYYSKYYV NRYIDSESEKSSSDVFIIGESSSLDSILNLRRILTGYLMEGFNYSKESAELLAKAITIYNATYRGDLDYYSDAYIQPALE GLSKHNVGLSRVYSQWAGKTYIFVPLKRNILSGNIESDVDLDKIVTDKVVISLLSENEEVGTDFARDLTDVQDEIRDVDQ EKIDIESATLKSIDDELTETIDNLREQLERATDDAEKEGIKKQIDDKTVKRDALKDKTDGLKKSQKKLDSSQEKLDRQRD AVKDKVQESIDKGNRDKNLPKPGAISSPKVDEKLQLIETIEDLEEQLERATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGP KELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRD ALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQ IDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVSLLKKDEKLKSASELKKQPKRATAD ISKNIPSVVNNQSRRLPAKPLAFRKQSDQSEGVDKLPLETENQKPIHKPMFLEVLNPNTNLGVLRLIDSDGGQLEEASRY GIRRYGVYERKDDFVAIKLCSGIAKLQLLNKAENLKVESEADFELSRDSSLYVDSKMILVVVKDNNVWKLAKFSSKDLSE FILSEDEVLPFTSFTVDAGHVYLQDASKKLITLDLNTLKKVS
Sequences:
>Translated_842_residues MKRIWILFNFLFIFLNIFTFHAREVDKKKLKDFVNMDLEFVNYRGPYDSTDTYLQIVGIGEFLAKNLTNNKSNYYSKYYV NRYIDSESEKSSSDVFIIGESSSLDSILNLRRILTGYLMEGFNYSKESAELLAKAITIYNATYRGDLDYYSDAYIQPALE GLSKHNVGLSRVYSQWAGKTYIFVPLKRNILSGNIESDVDLDKIVTDKVVISLLSENEEVGTDFARDLTDVQDEIRDVDQ EKIDIESATLKSIDDELTETIDNLREQLERATDDAEKEGIKKQIDDKTVKRDALKDKTDGLKKSQKKLDSSQEKLDRQRD AVKDKVQESIDKGNRDKNLPKPGAISSPKVDEKLQLIETIEDLEEQLERATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGP KELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRD ALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQ IDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVSLLKKDEKLKSASELKKQPKRATAD ISKNIPSVVNNQSRRLPAKPLAFRKQSDQSEGVDKLPLETENQKPIHKPMFLEVLNPNTNLGVLRLIDSDGGQLEEASRY GIRRYGVYERKDDFVAIKLCSGIAKLQLLNKAENLKVESEADFELSRDSSLYVDSKMILVVVKDNNVWKLAKFSSKDLSE FILSEDEVLPFTSFTVDAGHVYLQDASKKLITLDLNTLKKVS >Mature_842_residues MKRIWILFNFLFIFLNIFTFHAREVDKKKLKDFVNMDLEFVNYRGPYDSTDTYLQIVGIGEFLAKNLTNNKSNYYSKYYV NRYIDSESEKSSSDVFIIGESSSLDSILNLRRILTGYLMEGFNYSKESAELLAKAITIYNATYRGDLDYYSDAYIQPALE GLSKHNVGLSRVYSQWAGKTYIFVPLKRNILSGNIESDVDLDKIVTDKVVISLLSENEEVGTDFARDLTDVQDEIRDVDQ EKIDIESATLKSIDDELTETIDNLREQLERATDDAEKEGIKKQIDDKTVKRDALKDKTDGLKKSQKKLDSSQEKLDRQRD AVKDKVQESIDKGNRDKNLPKPGAISSPKVDEKLQLIETIEDLEEQLERATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGP KELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRD ALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQ IDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVSLLKKDEKLKSASELKKQPKRATAD ISKNIPSVVNNQSRRLPAKPLAFRKQSDQSEGVDKLPLETENQKPIHKPMFLEVLNPNTNLGVLRLIDSDGGQLEEASRY GIRRYGVYERKDDFVAIKLCSGIAKLQLLNKAENLKVESEADFELSRDSSLYVDSKMILVVVKDNNVWKLAKFSSKDLSE FILSEDEVLPFTSFTVDAGHVYLQDASKKLITLDLNTLKKVS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 96254; Mature: 96254
Theoretical pI: Translated: 7.01; Mature: 7.01
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 0.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 0.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKRIWILFNFLFIFLNIFTFHAREVDKKKLKDFVNMDLEFVNYRGPYDSTDTYLQIVGIG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCCCCCEEEEEEHH EFLAKNLTNNKSNYYSKYYVNRYIDSESEKSSSDVFIIGESSSLDSILNLRRILTGYLME HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH GFNYSKESAELLAKAITIYNATYRGDLDYYSDAYIQPALEGLSKHNVGLSRVYSQWAGKT CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCE YIFVPLKRNILSGNIESDVDLDKIVTDKVVISLLSENEEVGTDFARDLTDVQDEIRDVDQ EEEEEEHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH EKIDIESATLKSIDDELTETIDNLREQLERATDDAEKEGIKKQIDDKTVKRDALKDKTDG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKKSQKKLDSSQEKLDRQRDAVKDKVQESIDKGNRDKNLPKPGAISSPKVDEKLQLIETI HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH EDLEEQLERATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQE HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH GINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRD HHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASE HHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH LKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGI HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH NKGKRDNNLPKPREVSLLKKDEKLKSASELKKQPKRATADISKNIPSVVNNQSRRLPAKP HCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCC LAFRKQSDQSEGVDKLPLETENQKPIHKPMFLEVLNPNTNLGVLRLIDSDGGQLEEASRY HHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHH GIRRYGVYERKDDFVAIKLCSGIAKLQLLNKAENLKVESEADFELSRDSSLYVDSKMILV CHHHCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCEEECCEEEEE VVKDNNVWKLAKFSSKDLSEFILSEDEVLPFTSFTVDAGHVYLQDASKKLITLDLNTLKK EEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEHHHHHC VS CC >Mature Secondary Structure MKRIWILFNFLFIFLNIFTFHAREVDKKKLKDFVNMDLEFVNYRGPYDSTDTYLQIVGIG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCCCCCEEEEEEHH EFLAKNLTNNKSNYYSKYYVNRYIDSESEKSSSDVFIIGESSSLDSILNLRRILTGYLME HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH GFNYSKESAELLAKAITIYNATYRGDLDYYSDAYIQPALEGLSKHNVGLSRVYSQWAGKT CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCE YIFVPLKRNILSGNIESDVDLDKIVTDKVVISLLSENEEVGTDFARDLTDVQDEIRDVDQ EEEEEEHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH EKIDIESATLKSIDDELTETIDNLREQLERATDDAEKEGIKKQIDDKTVKRDALKDKTDG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKKSQKKLDSSQEKLDRQRDAVKDKVQESIDKGNRDKNLPKPGAISSPKVDEKLQLIETI HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH EDLEEQLERATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQE HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH GINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASELKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRD HHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGINKGKRDNNLPKPREVNLLKKDEKLKSASE HHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH LKNQLKRATDDAEKEIIKKQIDDKLVKRDALKDKTDGPKELQRRLDGQRDAAEDKVQEGI HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH NKGKRDNNLPKPREVSLLKKDEKLKSASELKKQPKRATADISKNIPSVVNNQSRRLPAKP HCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCC LAFRKQSDQSEGVDKLPLETENQKPIHKPMFLEVLNPNTNLGVLRLIDSDGGQLEEASRY HHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHH GIRRYGVYERKDDFVAIKLCSGIAKLQLLNKAENLKVESEADFELSRDSSLYVDSKMILV CHHHCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCEEECCEEEEE VVKDNNVWKLAKFSSKDLSEFILSEDEVLPFTSFTVDAGHVYLQDASKKLITLDLNTLKK EEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEHHHHHC VS CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA