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The map label for this gene is rnfC [H]

Identifier: 187917951

GI number: 187917951

Start: 66876

End: 69194

Strand: Direct

Name: rnfC [H]

Synonym: BH0072

Alternate gene names: 187917951

Gene position: 66876-69194 (Clockwise)

Preceding gene: 187917950

Following gene: 187917952

Centisome position: 7.25

GC content: 25.1

Gene sequence:

>2319_bases
TTGATGTCTAACTTAAAAACACTAAAAATAAAAACAAAAAGGCAGTATAAAGTAAATATAAATGAAATCCAAATGCCTGA
ATGTGTTTTAATTCCACTAGAAATAGAAAATTCAAAGTCTACAATATATATCATTGAAAATCAAAGAATCTCAGAAGGAC
AAATATTGTCAAAAAATAAAAATGCAGAGCTATACACATATGCTCCAATATCTGGGACAATAGAAAAAATATATATCGCT
AATTTTCCAAATGAACATCAATTAAAATCAGCATTAATAAGATTTCACGGGAGAATCAAAAATGAACAAGAATGCTCAGT
TGAGGAAGAATCAAGAGAAAAAACACTAGAAAAGTTAATTCGACTAGGAATCCCATGGTTTAATGAACATTCATTATTTC
AATATGTAAGTAAATGTAAAAAAATAGATAAAATGATTTTATTAATAAATGGAAAAGATCCATTTACAAATATCTCAGAA
ATATTAATAAAAGAAAAATTAAATGAAATTATTTACGGCTTTGAAACAATCGACAAAATATTTAAATGCAAAGAAATACT
AATAGTACTCAGCAACTATAACCTAAAAAAAGAACTTGAAACCCTAAATATCTTTAAAGACAAAAGATTAAAAATTAAAT
TAATTCCCAATATTTCATATCCATATTCAAATCATGAAATGATAATGCACTTCTTATATAATGAAGAGAGCACAAAAAAT
AACATAAACCCAAATAAAAATATACTTTTAGCCAATGTTGAAGACCTTTATAACGTGTACAACACTCTCAAAACAAACTC
TCCTTATAAAGAAAAGTTTATAACCATAAACGGCAATCAAAAAATACAAAGTAAAATAATCAAAGTCAAAATTGGAACAT
CTATTCAACAAATAATAAATGAAGATATTGATACAAAAAAATATGACGTATTTCTAAACAATCCAGCAAATAAGATTAAA
ATAAATAATCTCAATACACCTATAACAAGAGATATATACAGCATTACAATATTAAGAAAAAAATCAATATTTAGTAAAAT
AAAACTCTTAAAAATACCCAGTTTTTCACCGCTATATATGGAAGAAATTATTTTGTCAAAAATTAAGGATAACAACAATC
TTGTCAATAAAAAATTACAATGCCTTCAATACACTGAAACTGAAATAGAAGATGAAATAAACAAAGTAAAAAAAGAAATA
AAGGAAAAAATCCTAAATCTGGGCCTCAACAATGAACCAATATACACTGAAAATAATTTAAAAGATATCTATTTAACTAT
TATTTTAGCCTTAATGCCCAGTTTAATATTCTCTTTTACAAATAACGTAAAATTTTTAATTGATACATTCATATTGACAA
TCACGAGCTTGTGCTTATACATCCCAATAATGTTAAAATCCAAACATAAATATCTCTCTTTCTTCATATATACTGCATTA
ATTATCAGTATAATCTTACCTTTAAATTTATCCATCATGTTAAAAATAATGGCACTATTTTTCACATTTTTAATATTCTT
TTATTTCTCAAAGCTTTCCAAATTCCTTGTAAACCCCATATTAATTTCATTTATGTTTTTATTAGTCAATTTCCCATCAA
GCTTTAAGCAAACATATTCTAAGGAACTCTCAAGACAAGAAGATATAATTCCTACTTGGCATAAAATAATTCATCAAAAT
CCAAACATTCAAAATTTAGAAAGCTTAAAAGGATTTAAAAGACATGAAAACAAGCACATTGATATGATTGAAAAATTTAT
AAATGACAAGATATTATCTCATCTAAATATAATGATACCAAGATTTCACATTGAAACCCTGTTTGGGCTACAAAACGAAA
AATATTTATCCCCCATTCTGATTTATATTGGTTTTTCATTTATTCTTGGAAAATTCATTATAAATAAATTAATACCACTA
TCTTTTTATGCAAGTCTGCTACTAATTGCCTATACATCAAAAAACTTTGGTCTCTACAGTTATATAAGTTTTGATATGTT
AACTCTAATAATGTCACCAATTCCAATGATTTTAGTATTTGCAATGGGAACAGAACTGCAAATAGCTCCTCCCTTTAAAT
TTGAACAAATACTTTATGGACTTACATTATCTCTAGTATATTTTATAACATTAAGCTATATTCCACTTGAAACTTTATCA
GCTGTAATATCCATTTTCATACTACAGGTAAGTTCAACATTAATAAAAAGATATAGCTTAACATTTCAGATTAAAAAAAT
CTTGCATCATTTAAGCATGAATAAAGCAAAAGTAATAGAACATAAAAACGACAATGGAGAAGAAATTATAAAATTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCCATTTTTCTTATTGCTATTCCTATTTAAAGCAATAAAATTTACAATTCTTTTAAACATGAGTGAAAAAAACTATAAA
AAATATATTAGAGGAATCCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAATAGTTTAATAATGTATTTGTTAATAAATAATCTGTTATTAATACACTTTATTGGAATTGAAGACATAAAGATAAAA
GATAATAAGACATTATCAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 772; Mature: 772

Protein sequence:

>772_residues
MMSNLKTLKIKTKRQYKVNINEIQMPECVLIPLEIENSKSTIYIIENQRISEGQILSKNKNAELYTYAPISGTIEKIYIA
NFPNEHQLKSALIRFHGRIKNEQECSVEEESREKTLEKLIRLGIPWFNEHSLFQYVSKCKKIDKMILLINGKDPFTNISE
ILIKEKLNEIIYGFETIDKIFKCKEILIVLSNYNLKKELETLNIFKDKRLKIKLIPNISYPYSNHEMIMHFLYNEESTKN
NINPNKNILLANVEDLYNVYNTLKTNSPYKEKFITINGNQKIQSKIIKVKIGTSIQQIINEDIDTKKYDVFLNNPANKIK
INNLNTPITRDIYSITILRKKSIFSKIKLLKIPSFSPLYMEEIILSKIKDNNNLVNKKLQCLQYTETEIEDEINKVKKEI
KEKILNLGLNNEPIYTENNLKDIYLTIILALMPSLIFSFTNNVKFLIDTFILTITSLCLYIPIMLKSKHKYLSFFIYTAL
IISIILPLNLSIMLKIMALFFTFLIFFYFSKLSKFLVNPILISFMFLLVNFPSSFKQTYSKELSRQEDIIPTWHKIIHQN
PNIQNLESLKGFKRHENKHIDMIEKFINDKILSHLNIMIPRFHIETLFGLQNEKYLSPILIYIGFSFILGKFIINKLIPL
SFYASLLLIAYTSKNFGLYSYISFDMLTLIMSPIPMILVFAMGTELQIAPPFKFEQILYGLTLSLVYFITLSYIPLETLS
AVISIFILQVSSTLIKRYSLTFQIKKILHHLSMNKAKVIEHKNDNGEEIIKL

Sequences:

>Translated_772_residues
MMSNLKTLKIKTKRQYKVNINEIQMPECVLIPLEIENSKSTIYIIENQRISEGQILSKNKNAELYTYAPISGTIEKIYIA
NFPNEHQLKSALIRFHGRIKNEQECSVEEESREKTLEKLIRLGIPWFNEHSLFQYVSKCKKIDKMILLINGKDPFTNISE
ILIKEKLNEIIYGFETIDKIFKCKEILIVLSNYNLKKELETLNIFKDKRLKIKLIPNISYPYSNHEMIMHFLYNEESTKN
NINPNKNILLANVEDLYNVYNTLKTNSPYKEKFITINGNQKIQSKIIKVKIGTSIQQIINEDIDTKKYDVFLNNPANKIK
INNLNTPITRDIYSITILRKKSIFSKIKLLKIPSFSPLYMEEIILSKIKDNNNLVNKKLQCLQYTETEIEDEINKVKKEI
KEKILNLGLNNEPIYTENNLKDIYLTIILALMPSLIFSFTNNVKFLIDTFILTITSLCLYIPIMLKSKHKYLSFFIYTAL
IISIILPLNLSIMLKIMALFFTFLIFFYFSKLSKFLVNPILISFMFLLVNFPSSFKQTYSKELSRQEDIIPTWHKIIHQN
PNIQNLESLKGFKRHENKHIDMIEKFINDKILSHLNIMIPRFHIETLFGLQNEKYLSPILIYIGFSFILGKFIINKLIPL
SFYASLLLIAYTSKNFGLYSYISFDMLTLIMSPIPMILVFAMGTELQIAPPFKFEQILYGLTLSLVYFITLSYIPLETLS
AVISIFILQVSSTLIKRYSLTFQIKKILHHLSMNKAKVIEHKNDNGEEIIKL
>Mature_772_residues
MMSNLKTLKIKTKRQYKVNINEIQMPECVLIPLEIENSKSTIYIIENQRISEGQILSKNKNAELYTYAPISGTIEKIYIA
NFPNEHQLKSALIRFHGRIKNEQECSVEEESREKTLEKLIRLGIPWFNEHSLFQYVSKCKKIDKMILLINGKDPFTNISE
ILIKEKLNEIIYGFETIDKIFKCKEILIVLSNYNLKKELETLNIFKDKRLKIKLIPNISYPYSNHEMIMHFLYNEESTKN
NINPNKNILLANVEDLYNVYNTLKTNSPYKEKFITINGNQKIQSKIIKVKIGTSIQQIINEDIDTKKYDVFLNNPANKIK
INNLNTPITRDIYSITILRKKSIFSKIKLLKIPSFSPLYMEEIILSKIKDNNNLVNKKLQCLQYTETEIEDEINKVKKEI
KEKILNLGLNNEPIYTENNLKDIYLTIILALMPSLIFSFTNNVKFLIDTFILTITSLCLYIPIMLKSKHKYLSFFIYTAL
IISIILPLNLSIMLKIMALFFTFLIFFYFSKLSKFLVNPILISFMFLLVNFPSSFKQTYSKELSRQEDIIPTWHKIIHQN
PNIQNLESLKGFKRHENKHIDMIEKFINDKILSHLNIMIPRFHIETLFGLQNEKYLSPILIYIGFSFILGKFIINKLIPL
SFYASLLLIAYTSKNFGLYSYISFDMLTLIMSPIPMILVFAMGTELQIAPPFKFEQILYGLTLSLVYFITLSYIPLETLS
AVISIFILQVSSTLIKRYSLTFQIKKILHHLSMNKAKVIEHKNDNGEEIIKL

Specific function: May be part of a membrane complex involved in electron transport [H]

COG id: COG4656

COG function: function code C; Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Peripheral membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 4Fe-4S ferredoxin-type domains [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR017896
- InterPro:   IPR017900
- InterPro:   IPR010208
- InterPro:   IPR012285
- InterPro:   IPR009051
- InterPro:   IPR011538
- InterPro:   IPR019554 [H]

Pfam domain/function: PF01512 Complex1_51K; PF10531 SLBB [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90284; Mature: 90284

Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MMSNLKTLKIKTKRQYKVNINEIQMPECVLIPLEIENSKSTIYIIENQRISEGQILSKNK
CCCCCEEEEEEECCEEEEECCEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEECCCC
NAELYTYAPISGTIEKIYIANFPNEHQLKSALIRFHGRIKNEQECSVEEESREKTLEKLI
CCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
RLGIPWFNEHSLFQYVSKCKKIDKMILLINGKDPFTNISEILIKEKLNEIIYGFETIDKI
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKCKEILIVLSNYNLKKELETLNIFKDKRLKIKLIPNISYPYSNHEMIMHFLYNEESTKN
HHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCC
NINPNKNILLANVEDLYNVYNTLKTNSPYKEKFITINGNQKIQSKIIKVKIGTSIQQIIN
CCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEECCCHHHHHEEEEEEECCHHHHHHC
EDIDTKKYDVFLNNPANKIKINNLNTPITRDIYSITILRKKSIFSKIKLLKIPSFSPLYM
CCCCCCEEEEEECCCCCEEEECCCCCCCHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHH
EEIILSKIKDNNNLVNKKLQCLQYTETEIEDEINKVKKEIKEKILNLGLNNEPIYTENNL
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCC
KDIYLTIILALMPSLIFSFTNNVKFLIDTFILTITSLCLYIPIMLKSKHKYLSFFIYTAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
IISIILPLNLSIMLKIMALFFTFLIFFYFSKLSKFLVNPILISFMFLLVNFPSSFKQTYS
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
KELSRQEDIIPTWHKIIHQNPNIQNLESLKGFKRHENKHIDMIEKFINDKILSHLNIMIP
HHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
RFHIETLFGLQNEKYLSPILIYIGFSFILGKFIINKLIPLSFYASLLLIAYTSKNFGLYS
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHH
YISFDMLTLIMSPIPMILVFAMGTELQIAPPFKFEQILYGLTLSLVYFITLSYIPLETLS
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
AVISIFILQVSSTLIKRYSLTFQIKKILHHLSMNKAKVIEHKNDNGEEIIKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MMSNLKTLKIKTKRQYKVNINEIQMPECVLIPLEIENSKSTIYIIENQRISEGQILSKNK
CCCCCEEEEEEECCEEEEECCEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEECCCC
NAELYTYAPISGTIEKIYIANFPNEHQLKSALIRFHGRIKNEQECSVEEESREKTLEKLI
CCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
RLGIPWFNEHSLFQYVSKCKKIDKMILLINGKDPFTNISEILIKEKLNEIIYGFETIDKI
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKCKEILIVLSNYNLKKELETLNIFKDKRLKIKLIPNISYPYSNHEMIMHFLYNEESTKN
HHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCC
NINPNKNILLANVEDLYNVYNTLKTNSPYKEKFITINGNQKIQSKIIKVKIGTSIQQIIN
CCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEECCCHHHHHEEEEEEECCHHHHHHC
EDIDTKKYDVFLNNPANKIKINNLNTPITRDIYSITILRKKSIFSKIKLLKIPSFSPLYM
CCCCCCEEEEEECCCCCEEEECCCCCCCHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHH
EEIILSKIKDNNNLVNKKLQCLQYTETEIEDEINKVKKEIKEKILNLGLNNEPIYTENNL
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCC
KDIYLTIILALMPSLIFSFTNNVKFLIDTFILTITSLCLYIPIMLKSKHKYLSFFIYTAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
IISIILPLNLSIMLKIMALFFTFLIFFYFSKLSKFLVNPILISFMFLLVNFPSSFKQTYS
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
KELSRQEDIIPTWHKIIHQNPNIQNLESLKGFKRHENKHIDMIEKFINDKILSHLNIMIP
HHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
RFHIETLFGLQNEKYLSPILIYIGFSFILGKFIINKLIPLSFYASLLLIAYTSKNFGLYS
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHH
YISFDMLTLIMSPIPMILVFAMGTELQIAPPFKFEQILYGLTLSLVYFITLSYIPLETLS
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
AVISIFILQVSSTLIKRYSLTFQIKKILHHLSMNKAKVIEHKNDNGEEIIKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: 4Fe-4S clusters [C]

Metal ions: Iron-Sulfur [C]

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]