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The map label for this gene is glnL [H]

Identifier: 183220678

GI number: 183220678

Start: 1343536

End: 1346247

Strand: Direct

Name: glnL [H]

Synonym: LEPBI_I1288

Alternate gene names: 183220678

Gene position: 1343536-1346247 (Clockwise)

Preceding gene: 183220677

Following gene: 183220679

Centisome position: 37.32

GC content: 38.68

Gene sequence:

>2712_bases
TTGGCTATGGCAGAGATCATCATTTGGTTAGAGTTATTCATTTCCAAAATCCCTTTGCCAATCTTAGAAGTCTGGGGAAG
GTTTTCGTTTTTACTCGGTTCGATGATTGCCATTTTTGCCTTTACCGGTTTTACCTTTCGGAATGGAAAACAGTTCCGAA
TTTCCAGAGAGGTTTGGACTTGGAACCTCAAAAGTTTTTATTTTTTTCTCATCACCTTTGTTTCCATTTTTGTGACAGGG
TATCTTGGTAGTTCCATTGTACTCATCCCTGGTGCACAAACCTTAGAAAGCTTAAAAGACTTATCAGTCTTCCTATGTTT
GAATTTTTTTGGTTACCCTGCTTTACTCGCCGTTCCCTTTGCCTACGGACTTTCTGATTTGATCGAAGGAGTTCCTCCTG
AATTTTTATGGGACTGGTTACCTGGATACTTTATCAATCCATCTCTTTTTTGGATCTCTTACCAAATGATCGGAAAATCA
CCAAACTTTCGTAATGTGAGAATTTGGGTGTATTACCTTATCTTTGTTTTTCTATTTTTGTTATTAGAACCATTTTTATG
GGGATTCCTTTGTTCCAAACAATTTGGCCCGGAAATTTCCTATCATACCATTAGTTCTGCTTTGATTTTTACTACGGGCA
TCACTTGGATCCTTGCACCTTTGGTTACGTTTTTACTGTTTCCAATTGTCAAACGTTTTGGATACTTCTGGGCTAAAATT
CCATTACAGGTAAAAGAGGTGAGTATCACCGAACCAAGACTCATTTGGTTATCTTCTTCAGAAAATTTGAATCCAACAGA
TTCGTTGGCAAATGATCGCACGGGGATTTCATTACAATTATTTATCGTTGCACCGTTTGTATGTTTGGTTTTGTTTTTGG
TGGGGATTACATCCTATGTGACCTTAAAGAATGCGGAATTGTCTGCCTACCAAATGGTAGAAATCTTACACAAACAATGG
TCAAAAAACATCCGATTACAATTAGCCGAATTGGAAACAAACACGGGAGAGATCACTTCCCAAAAAGAGGCACTCTCTCA
AATATTAGAAACATCCGTAGTGAATCCGCAAGGAAGAATTTTTTTACTCGATTCACAACTATCTCTCATATCCAGCTTAT
CGAACGAACCAAAATCCTCGCGACTTCTGGAAACCCTACGAGTCGAATTAAAAAAACAAGCAAGTGATATCCTATACCCC
GAAACACGATTGAGTTTTTCTGTTGTCACCAAAAAACCACTTTCCAGAGAAAATTGGAATGCGAATGTCTCACGTTATGC
GGTCTCCAAAACAAAGGAAACGATTTACCTTGTGACTCTTTTCCCCTATTCGTTTTATCTGAGTGGGGTGTATACGGGGA
ATAGTGAGTCAGCGATGGTATTTGCTTGGGCGATTTTACTCAGTTTGATCCTTGCTGTGATGCTTGCCGAACTTGTGACA
AGGCCCATTTTGCGATTTTCCAGTGCTTCCAAGTCATTGGCAAAAGGAGACTGGGACTTTCCTGTGGGCGAAAGTATGAT
TGCGGAACTACGTGGCCTTTCGGATGCCTTTCGGTTTATGTCGAGAGAACTTAAGTTCAGTTTTGAAAGGGTGAGTGCAA
GCCAAAGGATGGTGATGGAAACAAACACAAATTTAGAAAAAATTGTGAATGATCGCACCTTGGCTCTTATGGAAAGCAAT
CGAAACCTACTTGATACCATTGAAACGAAAGAGCGGATCTTACTCGACCTTCACAATACACAAAACCAATTATTACTCAG
TGAAAAATTGGCGGCTCTTGGACAATTTGCCGCAGGGATCACACACGAATTGAATACACCACTTGGTGCCATCTCCTCCA
GTGTTCGCGCCATGTCCGAGATTTTAAAGAAAGATGTCTCAAATCTACCTTTATTTTTAGAAACATTAGACCATGACCAA
TTAAATGATTTTCAAACCTTACTCATGTTAAGTGTCAATTTTGGAGATCGAAGCTCAGGTCTTATGAGCCGTGCAGAAAA
AAAAGAAAGATTGGCCTTACTCCAATCAAAGAATATCGAATACCCTGATGAGATTTTAGACCATTTAACATCGATTGGAG
TCACAATCTGGGATTCCCAAATTTATGAAATCATCCAAAAACCAGGAGCTCATCTCATCCTTTCAAATGTTGTCACATTG
GGAAGTTTGTATCGATTGGTGTATGTGGTCCAATCAGCTACGGAAAAAGCCTCACATGTGGTGAATGCCCTCAAACATTA
TCTCTATACAGACCAATTGGTGGGGGATTCTAACACACAACATGTAAACATTCCTTCCGAACTTGATTCGATTTTGACAC
TTTACCAAGCCAAAATCAAAAAAGATGTGGAAATCATTAAGAACTATTTTACATCTGATTCTTGTTTGGCGGATCGCGAT
AAACTCAATCAAGTATGGATTAATTTGATCAATAATGCTTTACAAGCAATGGACTATAAGGGTAAAATCAAAATCTCTGT
AACCTCAGAATCAGATTTTATATTAACATCGATTAAGGATAATGGGAAAGGGATCGATCCAGAAATCCAAGATAAGATTT
TTTTGCCATTTTTTACGACAAAAAAACATGGGGAAGGGATCGGGCTTGGGCTTGACATTTGTAAACAAATCGTGGAAAAA
ATGAATGGAAAAATTGATTTTATTTCGGATCCTTCTGGAACTGAATTTCGTGTCTACATACCAAGAGTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTAGAAGTATCGGATTTAGAATCTGAGTTCCCATCTTCCCTCGCAAAGAAAGTAAAAAAGATTTTGCTTTACTAATTCA
AAAATACCTCTTACGATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGAAGGGGAAAACGTTTGAATTTATCACAGATCAAAAATGAGAAAAATGCCATTCTATGTGTTGATGACGAACCCATCTT
ACTTCTTTCTCTCGTACAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 903; Mature: 902

Protein sequence:

>903_residues
MAMAEIIIWLELFISKIPLPILEVWGRFSFLLGSMIAIFAFTGFTFRNGKQFRISREVWTWNLKSFYFFLITFVSIFVTG
YLGSSIVLIPGAQTLESLKDLSVFLCLNFFGYPALLAVPFAYGLSDLIEGVPPEFLWDWLPGYFINPSLFWISYQMIGKS
PNFRNVRIWVYYLIFVFLFLLLEPFLWGFLCSKQFGPEISYHTISSALIFTTGITWILAPLVTFLLFPIVKRFGYFWAKI
PLQVKEVSITEPRLIWLSSSENLNPTDSLANDRTGISLQLFIVAPFVCLVLFLVGITSYVTLKNAELSAYQMVEILHKQW
SKNIRLQLAELETNTGEITSQKEALSQILETSVVNPQGRIFLLDSQLSLISSLSNEPKSSRLLETLRVELKKQASDILYP
ETRLSFSVVTKKPLSRENWNANVSRYAVSKTKETIYLVTLFPYSFYLSGVYTGNSESAMVFAWAILLSLILAVMLAELVT
RPILRFSSASKSLAKGDWDFPVGESMIAELRGLSDAFRFMSRELKFSFERVSASQRMVMETNTNLEKIVNDRTLALMESN
RNLLDTIETKERILLDLHNTQNQLLLSEKLAALGQFAAGITHELNTPLGAISSSVRAMSEILKKDVSNLPLFLETLDHDQ
LNDFQTLLMLSVNFGDRSSGLMSRAEKKERLALLQSKNIEYPDEILDHLTSIGVTIWDSQIYEIIQKPGAHLILSNVVTL
GSLYRLVYVVQSATEKASHVVNALKHYLYTDQLVGDSNTQHVNIPSELDSILTLYQAKIKKDVEIIKNYFTSDSCLADRD
KLNQVWINLINNALQAMDYKGKIKISVTSESDFILTSIKDNGKGIDPEIQDKIFLPFFTTKKHGEGIGLGLDICKQIVEK
MNGKIDFISDPSGTEFRVYIPRV

Sequences:

>Translated_903_residues
MAMAEIIIWLELFISKIPLPILEVWGRFSFLLGSMIAIFAFTGFTFRNGKQFRISREVWTWNLKSFYFFLITFVSIFVTG
YLGSSIVLIPGAQTLESLKDLSVFLCLNFFGYPALLAVPFAYGLSDLIEGVPPEFLWDWLPGYFINPSLFWISYQMIGKS
PNFRNVRIWVYYLIFVFLFLLLEPFLWGFLCSKQFGPEISYHTISSALIFTTGITWILAPLVTFLLFPIVKRFGYFWAKI
PLQVKEVSITEPRLIWLSSSENLNPTDSLANDRTGISLQLFIVAPFVCLVLFLVGITSYVTLKNAELSAYQMVEILHKQW
SKNIRLQLAELETNTGEITSQKEALSQILETSVVNPQGRIFLLDSQLSLISSLSNEPKSSRLLETLRVELKKQASDILYP
ETRLSFSVVTKKPLSRENWNANVSRYAVSKTKETIYLVTLFPYSFYLSGVYTGNSESAMVFAWAILLSLILAVMLAELVT
RPILRFSSASKSLAKGDWDFPVGESMIAELRGLSDAFRFMSRELKFSFERVSASQRMVMETNTNLEKIVNDRTLALMESN
RNLLDTIETKERILLDLHNTQNQLLLSEKLAALGQFAAGITHELNTPLGAISSSVRAMSEILKKDVSNLPLFLETLDHDQ
LNDFQTLLMLSVNFGDRSSGLMSRAEKKERLALLQSKNIEYPDEILDHLTSIGVTIWDSQIYEIIQKPGAHLILSNVVTL
GSLYRLVYVVQSATEKASHVVNALKHYLYTDQLVGDSNTQHVNIPSELDSILTLYQAKIKKDVEIIKNYFTSDSCLADRD
KLNQVWINLINNALQAMDYKGKIKISVTSESDFILTSIKDNGKGIDPEIQDKIFLPFFTTKKHGEGIGLGLDICKQIVEK
MNGKIDFISDPSGTEFRVYIPRV
>Mature_902_residues
AMAEIIIWLELFISKIPLPILEVWGRFSFLLGSMIAIFAFTGFTFRNGKQFRISREVWTWNLKSFYFFLITFVSIFVTGY
LGSSIVLIPGAQTLESLKDLSVFLCLNFFGYPALLAVPFAYGLSDLIEGVPPEFLWDWLPGYFINPSLFWISYQMIGKSP
NFRNVRIWVYYLIFVFLFLLLEPFLWGFLCSKQFGPEISYHTISSALIFTTGITWILAPLVTFLLFPIVKRFGYFWAKIP
LQVKEVSITEPRLIWLSSSENLNPTDSLANDRTGISLQLFIVAPFVCLVLFLVGITSYVTLKNAELSAYQMVEILHKQWS
KNIRLQLAELETNTGEITSQKEALSQILETSVVNPQGRIFLLDSQLSLISSLSNEPKSSRLLETLRVELKKQASDILYPE
TRLSFSVVTKKPLSRENWNANVSRYAVSKTKETIYLVTLFPYSFYLSGVYTGNSESAMVFAWAILLSLILAVMLAELVTR
PILRFSSASKSLAKGDWDFPVGESMIAELRGLSDAFRFMSRELKFSFERVSASQRMVMETNTNLEKIVNDRTLALMESNR
NLLDTIETKERILLDLHNTQNQLLLSEKLAALGQFAAGITHELNTPLGAISSSVRAMSEILKKDVSNLPLFLETLDHDQL
NDFQTLLMLSVNFGDRSSGLMSRAEKKERLALLQSKNIEYPDEILDHLTSIGVTIWDSQIYEIIQKPGAHLILSNVVTLG
SLYRLVYVVQSATEKASHVVNALKHYLYTDQLVGDSNTQHVNIPSELDSILTLYQAKIKKDVEIIKNYFTSDSCLADRDK
LNQVWINLINNALQAMDYKGKIKISVTSESDFILTSIKDNGKGIDPEIQDKIFLPFFTTKKHGEGIGLGLDICKQIVEKM
NGKIDFISDPSGTEFRVYIPRV

Specific function: NtrB acts as a signal transducer which responds to the nitrogen level of cell and modulates the activity of ntrC. In nitrogen limitation ntrB activates ntrC by phosphorylating it, while in nitrogen excess ntrC is dephosphorylated and consequently inactiva

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 PAS (PER-ARNT-SIM) domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790300, Length=206, Percent_Identity=31.5533980582524, Blast_Score=95, Evalue=2e-20,
Organism=Escherichia coli, GI1788549, Length=146, Percent_Identity=39.041095890411, Blast_Score=82, Evalue=1e-16,
Organism=Escherichia coli, GI1790436, Length=187, Percent_Identity=31.0160427807487, Blast_Score=82, Evalue=1e-16,
Organism=Escherichia coli, GI145693157, Length=110, Percent_Identity=34.5454545454545, Blast_Score=68, Evalue=3e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003594
- InterPro:   IPR000014
- InterPro:   IPR013767
- InterPro:   IPR004358
- InterPro:   IPR003661
- InterPro:   IPR005467
- InterPro:   IPR009082 [H]

Pfam domain/function: PF02518 HATPase_c; PF00512 HisKA; PF00989 PAS [H]

EC number: =2.7.13.3 [H]

Molecular weight: Translated: 102403; Mature: 102272

Theoretical pI: Translated: 6.60; Mature: 6.60

Prosite motif: PS50885 HAMP ; PS50109 HIS_KIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAMAEIIIWLELFISKIPLPILEVWGRFSFLLGSMIAIFAFTGFTFRNGKQFRISREVWT
CCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCEEEEEHHHEE
WNLKSFYFFLITFVSIFVTGYLGSSIVLIPGAQTLESLKDLSVFLCLNFFGYPALLAVPF
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
AYGLSDLIEGVPPEFLWDWLPGYFINPSLFWISYQMIGKSPNFRNVRIWVYYLIFVFLFL
HHCHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCEECCEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LLEPFLWGFLCSKQFGPEISYHTISSALIFTTGITWILAPLVTFLLFPIVKRFGYFWAKI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCC
PLQVKEVSITEPRLIWLSSSENLNPTDSLANDRTGISLQLFIVAPFVCLVLFLVGITSYV
CEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
TLKNAELSAYQMVEILHKQWSKNIRLQLAELETNTGEITSQKEALSQILETSVVNPQGRI
EEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE
FLLDSQLSLISSLSNEPKSSRLLETLRVELKKQASDILYPETRLSFSVVTKKPLSRENWN
EEEECHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCC
ANVSRYAVSKTKETIYLVTLFPYSFYLSGVYTGNSESAMVFAWAILLSLILAVMLAELVT
CCHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RPILRFSSASKSLAKGDWDFPVGESMIAELRGLSDAFRFMSRELKFSFERVSASQRMVME
HHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEE
TNTNLEKIVNDRTLALMESNRNLLDTIETKERILLDLHNTQNQLLLSEKLAALGQFAAGI
CCCCHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
THELNTPLGAISSSVRAMSEILKKDVSNLPLFLETLDHDQLNDFQTLLMLSVNFGDRSSG
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHCCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCCHH
LMSRAEKKERLALLQSKNIEYPDEILDHLTSIGVTIWDSQIYEIIQKPGAHLILSNVVTL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
GSLYRLVYVVQSATEKASHVVNALKHYLYTDQLVGDSNTQHVNIPSELDSILTLYQAKIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHH
KDVEIIKNYFTSDSCLADRDKLNQVWINLINNALQAMDYKGKIKISVTSESDFILTSIKD
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECC
NGKGIDPEIQDKIFLPFFTTKKHGEGIGLGLDICKQIVEKMNGKIDFISDPSGTEFRVYI
CCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEEE
PRV
CCC
>Mature Secondary Structure 
AMAEIIIWLELFISKIPLPILEVWGRFSFLLGSMIAIFAFTGFTFRNGKQFRISREVWT
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCEEEEEHHHEE
WNLKSFYFFLITFVSIFVTGYLGSSIVLIPGAQTLESLKDLSVFLCLNFFGYPALLAVPF
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
AYGLSDLIEGVPPEFLWDWLPGYFINPSLFWISYQMIGKSPNFRNVRIWVYYLIFVFLFL
HHCHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCEECCEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LLEPFLWGFLCSKQFGPEISYHTISSALIFTTGITWILAPLVTFLLFPIVKRFGYFWAKI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCC
PLQVKEVSITEPRLIWLSSSENLNPTDSLANDRTGISLQLFIVAPFVCLVLFLVGITSYV
CEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
TLKNAELSAYQMVEILHKQWSKNIRLQLAELETNTGEITSQKEALSQILETSVVNPQGRI
EEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE
FLLDSQLSLISSLSNEPKSSRLLETLRVELKKQASDILYPETRLSFSVVTKKPLSRENWN
EEEECHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCC
ANVSRYAVSKTKETIYLVTLFPYSFYLSGVYTGNSESAMVFAWAILLSLILAVMLAELVT
CCHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RPILRFSSASKSLAKGDWDFPVGESMIAELRGLSDAFRFMSRELKFSFERVSASQRMVME
HHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEE
TNTNLEKIVNDRTLALMESNRNLLDTIETKERILLDLHNTQNQLLLSEKLAALGQFAAGI
CCCCHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
THELNTPLGAISSSVRAMSEILKKDVSNLPLFLETLDHDQLNDFQTLLMLSVNFGDRSSG
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHCCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCCHH
LMSRAEKKERLALLQSKNIEYPDEILDHLTSIGVTIWDSQIYEIIQKPGAHLILSNVVTL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
GSLYRLVYVVQSATEKASHVVNALKHYLYTDQLVGDSNTQHVNIPSELDSILTLYQAKIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHH
KDVEIIKNYFTSDSCLADRDKLNQVWINLINNALQAMDYKGKIKISVTSESDFILTSIKD
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECC
NGKGIDPEIQDKIFLPFFTTKKHGEGIGLGLDICKQIVEKMNGKIDFISDPSGTEFRVYI
CCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEEE
PRV
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]