Definition Clostridium perfringens str. 13, complete genome.
Accession NC_003366
Length 3,031,430

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The map label for this gene is ytvI [H]

Identifier: 18311630

GI number: 18311630

Start: 3019835

End: 3020899

Strand: Direct

Name: ytvI [H]

Synonym: CPE2648

Alternate gene names: 18311630

Gene position: 3019835-3020899 (Clockwise)

Preceding gene: 18311629

Following gene: 18311631

Centisome position: 99.62

GC content: 20.66

Gene sequence:

>1065_bases
ATGAAAAATTTAATAATCAAAAGTGAAAAAATAAGTGTGTTTTTTATTTTATACACACTTATATTTTTTACGTTTTTTAA
TACATTAAAATATACTTTGCCCTTTCTACTAGCATTCATATTTTCATTGCTACTAAAGACACCCACTCAATTTTTAATAA
AAAAATTCAAATTAAATGTTGGACTTGCTTCCTTTATAAGTACATTTATTTTTTTCTTAATAATAATAATTTTATTTACA
TTATTTATTACATCTTTAGCTTATGAATCTTCATCCTTAACAAACTATATTCAAGAAATAATAAATACTAACTCTAAGGA
ATTTCAAAATTATTTTATATCACTACAAAATTGGATTGAAGTAAACTTTATTGATAATGCAGTTTTAAACTTAATAAAAA
ATACTTTAATATCTTCATTTAAAGAAATAACTGTACTTATTCTCTCTTTTGGAACTGAATTAATTCAAAAAGTTTTTTTA
TTAATAAGTTATTTACCTTATACCTTTATGCTTCTTATTTTTACTGTACTATCAACTTATTTTTTATCAAAGGAATTAAA
CACTATTAACTTTAGTAAGACTTTGTCTAATTATCTTAACTCTAATTACAGCAATAGAATTTTAACCATTTTATATGAAA
TAAAAAAAATGTTTTTGACATACTGTTTCTCTTATTTATTTTTAATTTTTATTTCTTTTGTATTAACCTTTTTAGGATTT
TCTTTTTTAAATATTAAATATGCCCTATTGCTTAGTGTAATTGCTGCTTTATTAGATCTACTCCCTGTGCTAGGTATGCC
CTTAATTTATTTTCCTCTTATTTTTATTTCATATAACTCAGGAAATATTTTTTCAGCTATTTCATTATTTATATTGTATA
TATTTATTTTTTTATTACGCCAATTTTTAGAACCTAAATTAATGGCATCCACTTTAGGAATACACCCTTTATTAATATTA
ATTTGTATTTTTATAGGATTAGAATTAAATGGACTTTTAGGAATAGTATTTTGCATCTTTCTAATTATTTTTTTCAATAT
ATTTAAAAAAGTTAATGTTTTATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCATAAGAATAAGTTTAGGGTACTTTAATACAATAGAAGAAGTCTATAGATTTGTTGAGGTTATAAAAGAATTAATTTCA
AGGAGGTAGACTTCTGACCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAGACTTTTTGTTTTTGGTAATAATTTCAAGTAAGGAGGTTGGTATAATGTGTACAAGTTTTTATATAAATTCTTTAG
ATCCTAAAGCTTCTTTTAAA

Product: sporulation integral membrane protein YtvI

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 354; Mature: 354

Protein sequence:

>354_residues
MKNLIIKSEKISVFFILYTLIFFTFFNTLKYTLPFLLAFIFSLLLKTPTQFLIKKFKLNVGLASFISTFIFFLIIIILFT
LFITSLAYESSSLTNYIQEIINTNSKEFQNYFISLQNWIEVNFIDNAVLNLIKNTLISSFKEITVLILSFGTELIQKVFL
LISYLPYTFMLLIFTVLSTYFLSKELNTINFSKTLSNYLNSNYSNRILTILYEIKKMFLTYCFSYLFLIFISFVLTFLGF
SFLNIKYALLLSVIAALLDLLPVLGMPLIYFPLIFISYNSGNIFSAISLFILYIFIFLLRQFLEPKLMASTLGIHPLLIL
ICIFIGLELNGLLGIVFCIFLIIFFNIFKKVNVL

Sequences:

>Translated_354_residues
MKNLIIKSEKISVFFILYTLIFFTFFNTLKYTLPFLLAFIFSLLLKTPTQFLIKKFKLNVGLASFISTFIFFLIIIILFT
LFITSLAYESSSLTNYIQEIINTNSKEFQNYFISLQNWIEVNFIDNAVLNLIKNTLISSFKEITVLILSFGTELIQKVFL
LISYLPYTFMLLIFTVLSTYFLSKELNTINFSKTLSNYLNSNYSNRILTILYEIKKMFLTYCFSYLFLIFISFVLTFLGF
SFLNIKYALLLSVIAALLDLLPVLGMPLIYFPLIFISYNSGNIFSAISLFILYIFIFLLRQFLEPKLMASTLGIHPLLIL
ICIFIGLELNGLLGIVFCIFLIIFFNIFKKVNVL
>Mature_354_residues
MKNLIIKSEKISVFFILYTLIFFTFFNTLKYTLPFLLAFIFSLLLKTPTQFLIKKFKLNVGLASFISTFIFFLIIIILFT
LFITSLAYESSSLTNYIQEIINTNSKEFQNYFISLQNWIEVNFIDNAVLNLIKNTLISSFKEITVLILSFGTELIQKVFL
LISYLPYTFMLLIFTVLSTYFLSKELNTINFSKTLSNYLNSNYSNRILTILYEIKKMFLTYCFSYLFLIFISFVLTFLGF
SFLNIKYALLLSVIAALLDLLPVLGMPLIYFPLIFISYNSGNIFSAISLFILYIFIFLLRQFLEPKLMASTLGIHPLLIL
ICIFIGLELNGLLGIVFCIFLIIFFNIFKKVNVL

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014227
- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41141; Mature: 41141

Theoretical pI: Translated: 9.60; Mature: 9.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNLIIKSEKISVFFILYTLIFFTFFNTLKYTLPFLLAFIFSLLLKTPTQFLIKKFKLNV
CCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
GLASFISTFIFFLIIIILFTLFITSLAYESSSLTNYIQEIINTNSKEFQNYFISLQNWIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VNFIDNAVLNLIKNTLISSFKEITVLILSFGTELIQKVFLLISYLPYTFMLLIFTVLSTY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLSKELNTINFSKTLSNYLNSNYSNRILTILYEIKKMFLTYCFSYLFLIFISFVLTFLGF
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFLNIKYALLLSVIAALLDLLPVLGMPLIYFPLIFISYNSGNIFSAISLFILYIFIFLLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFLEPKLMASTLGIHPLLILICIFIGLELNGLLGIVFCIFLIIFFNIFKKVNVL
HHHCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKNLIIKSEKISVFFILYTLIFFTFFNTLKYTLPFLLAFIFSLLLKTPTQFLIKKFKLNV
CCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
GLASFISTFIFFLIIIILFTLFITSLAYESSSLTNYIQEIINTNSKEFQNYFISLQNWIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VNFIDNAVLNLIKNTLISSFKEITVLILSFGTELIQKVFLLISYLPYTFMLLIFTVLSTY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLSKELNTINFSKTLSNYLNSNYSNRILTILYEIKKMFLTYCFSYLFLIFISFVLTFLGF
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFLNIKYALLLSVIAALLDLLPVLGMPLIYFPLIFISYNSGNIFSAISLFILYIFIFLLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFLEPKLMASTLGIHPLLILICIFIGLELNGLLGIVFCIFLIIFFNIFKKVNVL
HHHCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9387221; 9384377 [H]