| Definition | Clostridium perfringens str. 13, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003366 |
| Length | 3,031,430 |
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The map label for this gene is ytvI [H]
Identifier: 18311630
GI number: 18311630
Start: 3019835
End: 3020899
Strand: Direct
Name: ytvI [H]
Synonym: CPE2648
Alternate gene names: 18311630
Gene position: 3019835-3020899 (Clockwise)
Preceding gene: 18311629
Following gene: 18311631
Centisome position: 99.62
GC content: 20.66
Gene sequence:
>1065_bases ATGAAAAATTTAATAATCAAAAGTGAAAAAATAAGTGTGTTTTTTATTTTATACACACTTATATTTTTTACGTTTTTTAA TACATTAAAATATACTTTGCCCTTTCTACTAGCATTCATATTTTCATTGCTACTAAAGACACCCACTCAATTTTTAATAA AAAAATTCAAATTAAATGTTGGACTTGCTTCCTTTATAAGTACATTTATTTTTTTCTTAATAATAATAATTTTATTTACA TTATTTATTACATCTTTAGCTTATGAATCTTCATCCTTAACAAACTATATTCAAGAAATAATAAATACTAACTCTAAGGA ATTTCAAAATTATTTTATATCACTACAAAATTGGATTGAAGTAAACTTTATTGATAATGCAGTTTTAAACTTAATAAAAA ATACTTTAATATCTTCATTTAAAGAAATAACTGTACTTATTCTCTCTTTTGGAACTGAATTAATTCAAAAAGTTTTTTTA TTAATAAGTTATTTACCTTATACCTTTATGCTTCTTATTTTTACTGTACTATCAACTTATTTTTTATCAAAGGAATTAAA CACTATTAACTTTAGTAAGACTTTGTCTAATTATCTTAACTCTAATTACAGCAATAGAATTTTAACCATTTTATATGAAA TAAAAAAAATGTTTTTGACATACTGTTTCTCTTATTTATTTTTAATTTTTATTTCTTTTGTATTAACCTTTTTAGGATTT TCTTTTTTAAATATTAAATATGCCCTATTGCTTAGTGTAATTGCTGCTTTATTAGATCTACTCCCTGTGCTAGGTATGCC CTTAATTTATTTTCCTCTTATTTTTATTTCATATAACTCAGGAAATATTTTTTCAGCTATTTCATTATTTATATTGTATA TATTTATTTTTTTATTACGCCAATTTTTAGAACCTAAATTAATGGCATCCACTTTAGGAATACACCCTTTATTAATATTA ATTTGTATTTTTATAGGATTAGAATTAAATGGACTTTTAGGAATAGTATTTTGCATCTTTCTAATTATTTTTTTCAATAT ATTTAAAAAAGTTAATGTTTTATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GCATAAGAATAAGTTTAGGGTACTTTAATACAATAGAAGAAGTCTATAGATTTGTTGAGGTTATAAAAGAATTAATTTCA AGGAGGTAGACTTCTGACCT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATAGACTTTTTGTTTTTGGTAATAATTTCAAGTAAGGAGGTTGGTATAATGTGTACAAGTTTTTATATAAATTCTTTAG ATCCTAAAGCTTCTTTTAAA
Product: sporulation integral membrane protein YtvI
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 354; Mature: 354
Protein sequence:
>354_residues MKNLIIKSEKISVFFILYTLIFFTFFNTLKYTLPFLLAFIFSLLLKTPTQFLIKKFKLNVGLASFISTFIFFLIIIILFT LFITSLAYESSSLTNYIQEIINTNSKEFQNYFISLQNWIEVNFIDNAVLNLIKNTLISSFKEITVLILSFGTELIQKVFL LISYLPYTFMLLIFTVLSTYFLSKELNTINFSKTLSNYLNSNYSNRILTILYEIKKMFLTYCFSYLFLIFISFVLTFLGF SFLNIKYALLLSVIAALLDLLPVLGMPLIYFPLIFISYNSGNIFSAISLFILYIFIFLLRQFLEPKLMASTLGIHPLLIL ICIFIGLELNGLLGIVFCIFLIIFFNIFKKVNVL
Sequences:
>Translated_354_residues MKNLIIKSEKISVFFILYTLIFFTFFNTLKYTLPFLLAFIFSLLLKTPTQFLIKKFKLNVGLASFISTFIFFLIIIILFT LFITSLAYESSSLTNYIQEIINTNSKEFQNYFISLQNWIEVNFIDNAVLNLIKNTLISSFKEITVLILSFGTELIQKVFL LISYLPYTFMLLIFTVLSTYFLSKELNTINFSKTLSNYLNSNYSNRILTILYEIKKMFLTYCFSYLFLIFISFVLTFLGF SFLNIKYALLLSVIAALLDLLPVLGMPLIYFPLIFISYNSGNIFSAISLFILYIFIFLLRQFLEPKLMASTLGIHPLLIL ICIFIGLELNGLLGIVFCIFLIIFFNIFKKVNVL >Mature_354_residues MKNLIIKSEKISVFFILYTLIFFTFFNTLKYTLPFLLAFIFSLLLKTPTQFLIKKFKLNVGLASFISTFIFFLIIIILFT LFITSLAYESSSLTNYIQEIINTNSKEFQNYFISLQNWIEVNFIDNAVLNLIKNTLISSFKEITVLILSFGTELIQKVFL LISYLPYTFMLLIFTVLSTYFLSKELNTINFSKTLSNYLNSNYSNRILTILYEIKKMFLTYCFSYLFLIFISFVLTFLGF SFLNIKYALLLSVIAALLDLLPVLGMPLIYFPLIFISYNSGNIFSAISLFILYIFIFLLRQFLEPKLMASTLGIHPLLIL ICIFIGLELNGLLGIVFCIFLIIFFNIFKKVNVL
Specific function: Unknown
COG id: COG0628
COG function: function code R; Predicted permease
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR014227 - InterPro: IPR002549 [H]
Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 41141; Mature: 41141
Theoretical pI: Translated: 9.60; Mature: 9.60
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKNLIIKSEKISVFFILYTLIFFTFFNTLKYTLPFLLAFIFSLLLKTPTQFLIKKFKLNV CCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH GLASFISTFIFFLIIIILFTLFITSLAYESSSLTNYIQEIINTNSKEFQNYFISLQNWIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VNFIDNAVLNLIKNTLISSFKEITVLILSFGTELIQKVFLLISYLPYTFMLLIFTVLSTY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLSKELNTINFSKTLSNYLNSNYSNRILTILYEIKKMFLTYCFSYLFLIFISFVLTFLGF HHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFLNIKYALLLSVIAALLDLLPVLGMPLIYFPLIFISYNSGNIFSAISLFILYIFIFLLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFLEPKLMASTLGIHPLLILICIFIGLELNGLLGIVFCIFLIIFFNIFKKVNVL HHHCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKNLIIKSEKISVFFILYTLIFFTFFNTLKYTLPFLLAFIFSLLLKTPTQFLIKKFKLNV CCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH GLASFISTFIFFLIIIILFTLFITSLAYESSSLTNYIQEIINTNSKEFQNYFISLQNWIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VNFIDNAVLNLIKNTLISSFKEITVLILSFGTELIQKVFLLISYLPYTFMLLIFTVLSTY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLSKELNTINFSKTLSNYLNSNYSNRILTILYEIKKMFLTYCFSYLFLIFISFVLTFLGF HHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFLNIKYALLLSVIAALLDLLPVLGMPLIYFPLIFISYNSGNIFSAISLFILYIFIFLLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFLEPKLMASTLGIHPLLILICIFIGLELNGLLGIVFCIFLIIFFNIFKKVNVL HHHCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9387221; 9384377 [H]