Definition Clostridium perfringens str. 13, complete genome.
Accession NC_003366
Length 3,031,430

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The map label for this gene is spoIIIAE [H]

Identifier: 18310811

GI number: 18310811

Start: 2105007

End: 2106179

Strand: Reverse

Name: spoIIIAE [H]

Synonym: CPE1829

Alternate gene names: 18310811

Gene position: 2106179-2105007 (Counterclockwise)

Preceding gene: 18310812

Following gene: 18310810

Centisome position: 69.48

GC content: 30.09

Gene sequence:

>1173_bases
ATGAAAAAGTTGATAAACATAATATTATTATCTCTTATCTTTGTATTTTGCTTTAACTTAAAAGTTTTGGCGAATGATAA
CTTAGAGAGTTCAAAAGAAAAAATAGACAATGACTCAAGAATAGAAAGATTTTATGATTATATAAATAATTTAGAAACAG
AAGAAGATATATTAGGCAATATGTCTGCTAAGGAATATATAATGAATTATTTAGAGAGTGGAGAAGATCCAATAACCTTA
AAGAAAATAGGTGCTTCAATACTTAGTTATATCTTTAGAGAACTTAACATAGTTTTAAAGTTTATCGCTTCAATACTAGT
AATTGCTCTTTTAAGTGCCTTACTTAAAAATTTACAGGATGCTTTTAATATTGAAGAGGGAGTAACACAGATAGCATTTT
TTGCTTGCTATGCCCTACTTATAATGCTTTTAACTAAAAGTTTCTTTATATCTCTTAACTTAGGAAAGGAAGTCTTAACT
TCAATTATAGATTTTATGAATGTTATTGTTCCAGTTATTGTAATGCTTATAGCTACCTCAGGGGGAGTAACATCAGCTGT
TACCATAGACCCCATAGTACTAGGGGCAGTTTCTATAACTCCTAGAATTTACACATACTTTTTATTCCCACTAATATTAG
CATATTTTACATTACAGTTTGTTAATAATCTTTCTAGCGAATTTAAAATAGATAGAATGTGTAAGTTTATAAAACAGGTT
GTTATGATATCTCAAGGGTTTATATTAACAATATTTGTTGGAATATTAACTTTAAGAGGAATGACGGCAGATACCTTAGA
TGCAGTGGCTGTAAAAACAGTAAAGTTTGCTGTAGATAATTTTGTGCCTATAGTGGGAAAGGCATTTTCAGATGCAATAA
CCACAGTAGCAGGATATTCCTTAGCTATGAAAAGTGTAATAACTTCTTTAGGAGTAATAGTTCTAGTTGTAATTGTAATT
TATCCAATAATAAAAATAGGCCTTATGGCTATATGTTTTAAACTTACCTCCGCGGTTATTGAGCCTGTTGTTGATTCAAA
GATTTCTAGCAGTGTGGAAACCGTTGGAGAAGCCTTATTTATGATAATGTCATGCATAATAAGTGTCAGCATAATGTTCT
TTATTATGGCATCTATGATGGCTACAGCAGGTAATTTTATAGTAGGAGGATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGGTAGAGTTTACGGGAAAAATTATGATTCTATTATTAGCTATACCAATAATGGCTAATATTTTGAATTCTATTTTAAG
TATAATGTAGGAGCTAAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATAAGATGGAACTTTTAAAAAATTGGATTTCAACCCTTTGCGTTGTTATAGTCATCTATATCTATTGCTCATATAATT
TTACCTAATTCTTCAATAAA

Product: stage III sporulation protein AE

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 390; Mature: 390

Protein sequence:

>390_residues
MKKLINIILLSLIFVFCFNLKVLANDNLESSKEKIDNDSRIERFYDYINNLETEEDILGNMSAKEYIMNYLESGEDPITL
KKIGASILSYIFRELNIVLKFIASILVIALLSALLKNLQDAFNIEEGVTQIAFFACYALLIMLLTKSFFISLNLGKEVLT
SIIDFMNVIVPVIVMLIATSGGVTSAVTIDPIVLGAVSITPRIYTYFLFPLILAYFTLQFVNNLSSEFKIDRMCKFIKQV
VMISQGFILTIFVGILTLRGMTADTLDAVAVKTVKFAVDNFVPIVGKAFSDAITTVAGYSLAMKSVITSLGVIVLVVIVI
YPIIKIGLMAICFKLTSAVIEPVVDSKISSSVETVGEALFMIMSCIISVSIMFFIMASMMATAGNFIVGG

Sequences:

>Translated_390_residues
MKKLINIILLSLIFVFCFNLKVLANDNLESSKEKIDNDSRIERFYDYINNLETEEDILGNMSAKEYIMNYLESGEDPITL
KKIGASILSYIFRELNIVLKFIASILVIALLSALLKNLQDAFNIEEGVTQIAFFACYALLIMLLTKSFFISLNLGKEVLT
SIIDFMNVIVPVIVMLIATSGGVTSAVTIDPIVLGAVSITPRIYTYFLFPLILAYFTLQFVNNLSSEFKIDRMCKFIKQV
VMISQGFILTIFVGILTLRGMTADTLDAVAVKTVKFAVDNFVPIVGKAFSDAITTVAGYSLAMKSVITSLGVIVLVVIVI
YPIIKIGLMAICFKLTSAVIEPVVDSKISSSVETVGEALFMIMSCIISVSIMFFIMASMMATAGNFIVGG
>Mature_390_residues
MKKLINIILLSLIFVFCFNLKVLANDNLESSKEKIDNDSRIERFYDYINNLETEEDILGNMSAKEYIMNYLESGEDPITL
KKIGASILSYIFRELNIVLKFIASILVIALLSALLKNLQDAFNIEEGVTQIAFFACYALLIMLLTKSFFISLNLGKEVLT
SIIDFMNVIVPVIVMLIATSGGVTSAVTIDPIVLGAVSITPRIYTYFLFPLILAYFTLQFVNNLSSEFKIDRMCKFIKQV
VMISQGFILTIFVGILTLRGMTADTLDAVAVKTVKFAVDNFVPIVGKAFSDAITTVAGYSLAMKSVITSLGVIVLVVIVI
YPIIKIGLMAICFKLTSAVIEPVVDSKISSSVETVGEALFMIMSCIISVSIMFFIMASMMATAGNFIVGG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014194 [H]

Pfam domain/function: PF09546 Spore_III_AE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 42885; Mature: 42885

Theoretical pI: Translated: 4.87; Mature: 4.87

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
5.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
5.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKLINIILLSLIFVFCFNLKVLANDNLESSKEKIDNDSRIERFYDYINNLETEEDILGN
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCC
MSAKEYIMNYLESGEDPITLKKIGASILSYIFRELNIVLKFIASILVIALLSALLKNLQD
CCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFNIEEGVTQIAFFACYALLIMLLTKSFFISLNLGKEVLTSIIDFMNVIVPVIVMLIATS
HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GGVTSAVTIDPIVLGAVSITPRIYTYFLFPLILAYFTLQFVNNLSSEFKIDRMCKFIKQV
CCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMISQGFILTIFVGILTLRGMTADTLDAVAVKTVKFAVDNFVPIVGKAFSDAITTVAGYS
HHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAMKSVITSLGVIVLVVIVIYPIIKIGLMAICFKLTSAVIEPVVDSKISSSVETVGEALF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MIMSCIISVSIMFFIMASMMATAGNFIVGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKKLINIILLSLIFVFCFNLKVLANDNLESSKEKIDNDSRIERFYDYINNLETEEDILGN
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCC
MSAKEYIMNYLESGEDPITLKKIGASILSYIFRELNIVLKFIASILVIALLSALLKNLQD
CCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFNIEEGVTQIAFFACYALLIMLLTKSFFISLNLGKEVLTSIIDFMNVIVPVIVMLIATS
HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GGVTSAVTIDPIVLGAVSITPRIYTYFLFPLILAYFTLQFVNNLSSEFKIDRMCKFIKQV
CCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMISQGFILTIFVGILTLRGMTADTLDAVAVKTVKFAVDNFVPIVGKAFSDAITTVAGYS
HHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAMKSVITSLGVIVLVVIVIYPIIKIGLMAICFKLTSAVIEPVVDSKISSSVETVGEALF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MIMSCIISVSIMFFIMASMMATAGNFIVGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377 [H]