Definition Clostridium perfringens str. 13, complete genome.
Accession NC_003366
Length 3,031,430

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 18310112

Identifier: 18310112

GI number: 18310112

Start: 1321368

End: 1324169

Strand: Direct

Name: 18310112

Synonym: CPE1130

Alternate gene names: NA

Gene position: 1321368-1324169 (Clockwise)

Preceding gene: 18310111

Following gene: 18310113

Centisome position: 43.59

GC content: 31.69

Gene sequence:

>2802_bases
ATGGCAGCTAATGTTAAGATTGGTGCTAATTCGAGTGATTTTCAGAAGCAGATGAAGGAAATGACACAAGAACTTAAGAA
AGTTAGTAGTAGCTTTAATTTAGCTAATACACAGGCTAAACTTTTTGGAAAAAGCACAGATTTACTTAAAAGTAGACAAT
CAGAATTAACTTCTAAGATGCAGATACAAAATAGAATTATAGAAGCACAGAATAACAATATAAAAAAGTTAAATGGAGAT
TTAGATAAGCAAAAATCTACACAAAAAGACTTATCTTCTAAAATAGAAGAAACAACTAGAAAGTATAAAGAAAGCGTAGA
AGCAACAGGCAAGAATAGTAAAGAATCTAAAGAATTAGCTAAAGAGCTTAAAGGATTAAAAGAAGATTATGCACAAAATA
CTAAGGCTATAGAAACTAATACTACTAAGCTTAATAATGCAGAAACTAAGCTTAATAATAGTAAGAAAGCACTGTTAGAG
AATAAGAAAGCATTAGAAGAAGTTAATAAAGAGTTAGAGAAGAGTAAGTTAGATAAATTTACAGAAGGACTTGGAAAAGC
TGGAGAAAAAGCCTCAAAAATAAGTAATAAAATGAAACCAGCTAGTGTTGCTATAACTGGCTTAGGAACTGCTGCTGGAT
ATGCAGAGATGAAGTTTGAAGATGGAGTAGCTAATATTAATACTTTGTTAGATGATCAAAGTCATCTTGATGGATATAAA
AATAAAGTTATAGAAGTTTCTAATGATACAGGTAAAAGTTTAGAAGATATAACAGATGGTATGTACACTTGTATTTCTTC
TATTGGAGATGGTGGAGAAGAAACTGCTAAAATTTTCGAAACTATGGCAAAAAGTGCTAAAGCTGGTGGAGCAGAAACAA
ATGATGCGGTTGCTTTAATTAGTGCTGGTATGAAGGGATATAATAAAGTAAATAATGAAACAGCTAAGCAAATTTCTGAC
TTAGCATTCCAAACAGCTAAATTAGGAGTAACAACATTCCCAGAAATGGCTAGTAGTATGAAACCTTTATTTCCTTTATC
TTCTACGTTAAATATTAGTATGCAAGAATTGTTTGGTTCAATGGCTACTTTAACAGGTGTAACAGGTAATACTGCTGAAG
TGAGTACACAAATGAAAGCTGTATTTAGTAACTTGATTAAACCAACTGGAGACATGGATAAGTTAATAAAGAAATATGGT
TATAGTAACGGACAAGCTATGATAAAAGCTAAAGGGCTTACAGGAGTTTTACAGATCTTGCAAAAAGAAACTGGTGGACA
ATCAGATAAGTTGGGTAAATTATTTAGTAGTACAGAAGCACTTACAGCAGTTACAGCACTTACTGGAACACAATTTGATA
ATTTTAAGGATAAAACAAAGGCTATGAATGATGCTTTAGGTTCTACAGATAAAGCTTTGGAGAAGATTAATAATACTACT
GGTAATGATTTAAGAACTTCTTTGAATATGGCTAAAAATAGTCTAGTTGGATTTGGAGAAGTATTAGCACCTTTTATTTC
TATGGGAGCTAAGGCATTGAGTACATTAACAAAAGGACTACAAGATATGTCTGGATGGCAAAAGAATTTAGTGGTTGGTT
TTGGAGCAACGTTTGTAGGAACTAACTTATTATTAGGTGGTTTTAGTAAACTATCGAAAGGTTTAAAAGATAATATAAAA
TTTGCTAAAGACACAGCAAAAGCATTTAAAAATGGTGCTAGTAAATTAAAAGACTTTGCTAAAGCAACAAAAGAAGGTAC
TAATATAATTGGAAAATTTGGTAAAGGTATAGTTAATGGTACTAAAACAGTAGCTAGCTTTACTAAAGCAATAATATTAA
ATACTGCACAAGGTATAAAAAATGGAGCTATATGGGTAGCTAATAAGGTGAAAATGTTAGCTTATAAAACAGCACAGATT
GCCGTAACTGGAGCAACTAAAGCAATGACATTAGCACAAAAAACATTGAATTTAGCGTTATCCATGAATCCAATAGGAGT
TGTTATAACATTATTAGTAGCATTAGCAGCAACATTTGTAGTTTTATATAACAAATGTACATGGTTTAGAAATGGAGTTA
ATGCGGTATGGGCAGGAGTTAAATCTGTATTTAAAGGTTTTGCTAACTTTTTCAAAGGAGCATTTAGTAGAGATTGGACA
CAAACATTTGGTCTACTAGGTATTCAACTTAATAGTTTCTTTGGTACAGTAAGTGCAATATGGAATGGTGTTAAAGGTGT
CTTTACTGGAATAATAACATTTATTAAGGGTGTCTTTACTGGAAACTGGAGAAGTGCATTTCAAGGCTTAGCTGATATAG
TTAAGTCTATTTTTGGTATGCTAGGTGGAATAATTAAAGCTCCAATTAATGCTGCAATAAGTGGAATTAATATGGCAATT
CGAGGAATAAATAGTTTAAGCTTTAATGTACCTTCATGGATTCCTGGCATAGGTGGAAGTCATTTTGGTGTTAACTTACC
AACTATACCAGCTTTAGCAGAAGGGGGAATAGTTACTAAAGCAACTATGGCTTTAGTAGGAGAAGGAAAAGAACATGAAG
CAGTAATTCCATTGTCAAAGTTAGATAAGTTAGTAAGTAGAAGTGTAGAAAAGGTTCTTAATGCTAAAGAAGATAGTAAA
GACAATAAGCCAAACAATAATATTTATGAAATTATAATACCTATAGATGGTAAAACTATCGCTAAAGTAGTTATAGATTC
TATGGGAAATATATTAAATAGTAATGCAAATAGTAGAGCAGTTGTAAGGGGAGGTGGAACAAATGCTAGATTTGCTTTTT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAACTTTAAACATGGATATATTAGATTTATTAGACTATATAGAGTTTAGTATAAATCAGAGAAATGAGGAGGAGATAGAG
TAGAAAGGAGGTAGTTACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTAAATTTTTAAAACAAGATATAGGGGTAAGTATAGTTAGGCGTTCCCCTGCTATACTTGCTAATAAGAACATAAATG
TAATAAATAGAGTTGGAGCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Phage Minor Tail Protein; Phage Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Family Core Region; Phage-Related Protein-Like Protein; Tail Tape Measure Protein; Tail Tape Meausure Protein; TMP Repeat Family; Prophage; Phage Tail Tape Measure Protein Family

Number of amino acids: Translated: 933; Mature: 932

Protein sequence:

>933_residues
MAANVKIGANSSDFQKQMKEMTQELKKVSSSFNLANTQAKLFGKSTDLLKSRQSELTSKMQIQNRIIEAQNNNIKKLNGD
LDKQKSTQKDLSSKIEETTRKYKESVEATGKNSKESKELAKELKGLKEDYAQNTKAIETNTTKLNNAETKLNNSKKALLE
NKKALEEVNKELEKSKLDKFTEGLGKAGEKASKISNKMKPASVAITGLGTAAGYAEMKFEDGVANINTLLDDQSHLDGYK
NKVIEVSNDTGKSLEDITDGMYTCISSIGDGGEETAKIFETMAKSAKAGGAETNDAVALISAGMKGYNKVNNETAKQISD
LAFQTAKLGVTTFPEMASSMKPLFPLSSTLNISMQELFGSMATLTGVTGNTAEVSTQMKAVFSNLIKPTGDMDKLIKKYG
YSNGQAMIKAKGLTGVLQILQKETGGQSDKLGKLFSSTEALTAVTALTGTQFDNFKDKTKAMNDALGSTDKALEKINNTT
GNDLRTSLNMAKNSLVGFGEVLAPFISMGAKALSTLTKGLQDMSGWQKNLVVGFGATFVGTNLLLGGFSKLSKGLKDNIK
FAKDTAKAFKNGASKLKDFAKATKEGTNIIGKFGKGIVNGTKTVASFTKAIILNTAQGIKNGAIWVANKVKMLAYKTAQI
AVTGATKAMTLAQKTLNLALSMNPIGVVITLLVALAATFVVLYNKCTWFRNGVNAVWAGVKSVFKGFANFFKGAFSRDWT
QTFGLLGIQLNSFFGTVSAIWNGVKGVFTGIITFIKGVFTGNWRSAFQGLADIVKSIFGMLGGIIKAPINAAISGINMAI
RGINSLSFNVPSWIPGIGGSHFGVNLPTIPALAEGGIVTKATMALVGEGKEHEAVIPLSKLDKLVSRSVEKVLNAKEDSK
DNKPNNNIYEIIIPIDGKTIAKVVIDSMGNILNSNANSRAVVRGGGTNARFAF

Sequences:

>Translated_933_residues
MAANVKIGANSSDFQKQMKEMTQELKKVSSSFNLANTQAKLFGKSTDLLKSRQSELTSKMQIQNRIIEAQNNNIKKLNGD
LDKQKSTQKDLSSKIEETTRKYKESVEATGKNSKESKELAKELKGLKEDYAQNTKAIETNTTKLNNAETKLNNSKKALLE
NKKALEEVNKELEKSKLDKFTEGLGKAGEKASKISNKMKPASVAITGLGTAAGYAEMKFEDGVANINTLLDDQSHLDGYK
NKVIEVSNDTGKSLEDITDGMYTCISSIGDGGEETAKIFETMAKSAKAGGAETNDAVALISAGMKGYNKVNNETAKQISD
LAFQTAKLGVTTFPEMASSMKPLFPLSSTLNISMQELFGSMATLTGVTGNTAEVSTQMKAVFSNLIKPTGDMDKLIKKYG
YSNGQAMIKAKGLTGVLQILQKETGGQSDKLGKLFSSTEALTAVTALTGTQFDNFKDKTKAMNDALGSTDKALEKINNTT
GNDLRTSLNMAKNSLVGFGEVLAPFISMGAKALSTLTKGLQDMSGWQKNLVVGFGATFVGTNLLLGGFSKLSKGLKDNIK
FAKDTAKAFKNGASKLKDFAKATKEGTNIIGKFGKGIVNGTKTVASFTKAIILNTAQGIKNGAIWVANKVKMLAYKTAQI
AVTGATKAMTLAQKTLNLALSMNPIGVVITLLVALAATFVVLYNKCTWFRNGVNAVWAGVKSVFKGFANFFKGAFSRDWT
QTFGLLGIQLNSFFGTVSAIWNGVKGVFTGIITFIKGVFTGNWRSAFQGLADIVKSIFGMLGGIIKAPINAAISGINMAI
RGINSLSFNVPSWIPGIGGSHFGVNLPTIPALAEGGIVTKATMALVGEGKEHEAVIPLSKLDKLVSRSVEKVLNAKEDSK
DNKPNNNIYEIIIPIDGKTIAKVVIDSMGNILNSNANSRAVVRGGGTNARFAF
>Mature_932_residues
AANVKIGANSSDFQKQMKEMTQELKKVSSSFNLANTQAKLFGKSTDLLKSRQSELTSKMQIQNRIIEAQNNNIKKLNGDL
DKQKSTQKDLSSKIEETTRKYKESVEATGKNSKESKELAKELKGLKEDYAQNTKAIETNTTKLNNAETKLNNSKKALLEN
KKALEEVNKELEKSKLDKFTEGLGKAGEKASKISNKMKPASVAITGLGTAAGYAEMKFEDGVANINTLLDDQSHLDGYKN
KVIEVSNDTGKSLEDITDGMYTCISSIGDGGEETAKIFETMAKSAKAGGAETNDAVALISAGMKGYNKVNNETAKQISDL
AFQTAKLGVTTFPEMASSMKPLFPLSSTLNISMQELFGSMATLTGVTGNTAEVSTQMKAVFSNLIKPTGDMDKLIKKYGY
SNGQAMIKAKGLTGVLQILQKETGGQSDKLGKLFSSTEALTAVTALTGTQFDNFKDKTKAMNDALGSTDKALEKINNTTG
NDLRTSLNMAKNSLVGFGEVLAPFISMGAKALSTLTKGLQDMSGWQKNLVVGFGATFVGTNLLLGGFSKLSKGLKDNIKF
AKDTAKAFKNGASKLKDFAKATKEGTNIIGKFGKGIVNGTKTVASFTKAIILNTAQGIKNGAIWVANKVKMLAYKTAQIA
VTGATKAMTLAQKTLNLALSMNPIGVVITLLVALAATFVVLYNKCTWFRNGVNAVWAGVKSVFKGFANFFKGAFSRDWTQ
TFGLLGIQLNSFFGTVSAIWNGVKGVFTGIITFIKGVFTGNWRSAFQGLADIVKSIFGMLGGIIKAPINAAISGINMAIR
GINSLSFNVPSWIPGIGGSHFGVNLPTIPALAEGGIVTKATMALVGEGKEHEAVIPLSKLDKLVSRSVEKVLNAKEDSKD
NKPNNNIYEIIIPIDGKTIAKVVIDSMGNILNSNANSRAVVRGGGTNARFAF

Specific function: Unknown

COG id: COG5283

COG function: function code S; Phage-related tail protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 99624; Mature: 99493

Theoretical pI: Translated: 10.37; Mature: 10.37

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAANVKIGANSSDFQKQMKEMTQELKKVSSSFNLANTQAKLFGKSTDLLKSRQSELTSKM
CCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
QIQNRIIEAQNNNIKKLNGDLDKQKSTQKDLSSKIEETTRKYKESVEATGKNSKESKELA
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
KELKGLKEDYAQNTKAIETNTTKLNNAETKLNNSKKALLENKKALEEVNKELEKSKLDKF
HHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TEGLGKAGEKASKISNKMKPASVAITGLGTAAGYAEMKFEDGVANINTLLDDQSHLDGYK
HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCHHEECCCCHHHHHHHHCCHHHCCHHH
NKVIEVSNDTGKSLEDITDGMYTCISSIGDGGEETAKIFETMAKSAKAGGAETNDAVALI
CCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
SAGMKGYNKVNNETAKQISDLAFQTAKLGVTTFPEMASSMKPLFPLSSTLNISMQELFGS
HHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHH
MATLTGVTGNTAEVSTQMKAVFSNLIKPTGDMDKLIKKYGYSNGQAMIKAKGLTGVLQIL
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHH
QKETGGQSDKLGKLFSSTEALTAVTALTGTQFDNFKDKTKAMNDALGSTDKALEKINNTT
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCC
GNDLRTSLNMAKNSLVGFGEVLAPFISMGAKALSTLTKGLQDMSGWQKNLVVGFGATFVG
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCEEEECCHHHHH
TNLLLGGFSKLSKGLKDNIKFAKDTAKAFKNGASKLKDFAKATKEGTNIIGKFGKGIVNG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCH
TKTVASFTKAIILNTAQGIKNGAIWVANKVKMLAYKTAQIAVTGATKAMTLAQKTLNLAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHC
SMNPIGVVITLLVALAATFVVLYNKCTWFRNGVNAVWAGVKSVFKGFANFFKGAFSRDWT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
QTFGLLGIQLNSFFGTVSAIWNGVKGVFTGIITFIKGVFTGNWRSAFQGLADIVKSIFGM
HHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGGIIKAPINAAISGINMAIRGINSLSFNVPSWIPGIGGSHFGVNLPTIPALAEGGIVTK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHH
ATMALVGEGKEHEAVIPLSKLDKLVSRSVEKVLNAKEDSKDNKPNNNIYEIIIPIDGKTI
HHHHHHCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHH
AKVVIDSMGNILNSNANSRAVVRGGGTNARFAF
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AANVKIGANSSDFQKQMKEMTQELKKVSSSFNLANTQAKLFGKSTDLLKSRQSELTSKM
CCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
QIQNRIIEAQNNNIKKLNGDLDKQKSTQKDLSSKIEETTRKYKESVEATGKNSKESKELA
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
KELKGLKEDYAQNTKAIETNTTKLNNAETKLNNSKKALLENKKALEEVNKELEKSKLDKF
HHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TEGLGKAGEKASKISNKMKPASVAITGLGTAAGYAEMKFEDGVANINTLLDDQSHLDGYK
HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCHHEECCCCHHHHHHHHCCHHHCCHHH
NKVIEVSNDTGKSLEDITDGMYTCISSIGDGGEETAKIFETMAKSAKAGGAETNDAVALI
CCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
SAGMKGYNKVNNETAKQISDLAFQTAKLGVTTFPEMASSMKPLFPLSSTLNISMQELFGS
HHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHH
MATLTGVTGNTAEVSTQMKAVFSNLIKPTGDMDKLIKKYGYSNGQAMIKAKGLTGVLQIL
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHH
QKETGGQSDKLGKLFSSTEALTAVTALTGTQFDNFKDKTKAMNDALGSTDKALEKINNTT
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCC
GNDLRTSLNMAKNSLVGFGEVLAPFISMGAKALSTLTKGLQDMSGWQKNLVVGFGATFVG
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCEEEECCHHHHH
TNLLLGGFSKLSKGLKDNIKFAKDTAKAFKNGASKLKDFAKATKEGTNIIGKFGKGIVNG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCH
TKTVASFTKAIILNTAQGIKNGAIWVANKVKMLAYKTAQIAVTGATKAMTLAQKTLNLAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHC
SMNPIGVVITLLVALAATFVVLYNKCTWFRNGVNAVWAGVKSVFKGFANFFKGAFSRDWT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
QTFGLLGIQLNSFFGTVSAIWNGVKGVFTGIITFIKGVFTGNWRSAFQGLADIVKSIFGM
HHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGGIIKAPINAAISGINMAIRGINSLSFNVPSWIPGIGGSHFGVNLPTIPALAEGGIVTK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHH
ATMALVGEGKEHEAVIPLSKLDKLVSRSVEKVLNAKEDSKDNKPNNNIYEIIIPIDGKTI
HHHHHHCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHH
AKVVIDSMGNILNSNANSRAVVRGGGTNARFAF
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA