| Definition | Clostridium perfringens str. 13, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003366 |
| Length | 3,031,430 |
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The map label for this gene is 18310112
Identifier: 18310112
GI number: 18310112
Start: 1321368
End: 1324169
Strand: Direct
Name: 18310112
Synonym: CPE1130
Alternate gene names: NA
Gene position: 1321368-1324169 (Clockwise)
Preceding gene: 18310111
Following gene: 18310113
Centisome position: 43.59
GC content: 31.69
Gene sequence:
>2802_bases ATGGCAGCTAATGTTAAGATTGGTGCTAATTCGAGTGATTTTCAGAAGCAGATGAAGGAAATGACACAAGAACTTAAGAA AGTTAGTAGTAGCTTTAATTTAGCTAATACACAGGCTAAACTTTTTGGAAAAAGCACAGATTTACTTAAAAGTAGACAAT CAGAATTAACTTCTAAGATGCAGATACAAAATAGAATTATAGAAGCACAGAATAACAATATAAAAAAGTTAAATGGAGAT TTAGATAAGCAAAAATCTACACAAAAAGACTTATCTTCTAAAATAGAAGAAACAACTAGAAAGTATAAAGAAAGCGTAGA AGCAACAGGCAAGAATAGTAAAGAATCTAAAGAATTAGCTAAAGAGCTTAAAGGATTAAAAGAAGATTATGCACAAAATA CTAAGGCTATAGAAACTAATACTACTAAGCTTAATAATGCAGAAACTAAGCTTAATAATAGTAAGAAAGCACTGTTAGAG AATAAGAAAGCATTAGAAGAAGTTAATAAAGAGTTAGAGAAGAGTAAGTTAGATAAATTTACAGAAGGACTTGGAAAAGC TGGAGAAAAAGCCTCAAAAATAAGTAATAAAATGAAACCAGCTAGTGTTGCTATAACTGGCTTAGGAACTGCTGCTGGAT ATGCAGAGATGAAGTTTGAAGATGGAGTAGCTAATATTAATACTTTGTTAGATGATCAAAGTCATCTTGATGGATATAAA AATAAAGTTATAGAAGTTTCTAATGATACAGGTAAAAGTTTAGAAGATATAACAGATGGTATGTACACTTGTATTTCTTC TATTGGAGATGGTGGAGAAGAAACTGCTAAAATTTTCGAAACTATGGCAAAAAGTGCTAAAGCTGGTGGAGCAGAAACAA ATGATGCGGTTGCTTTAATTAGTGCTGGTATGAAGGGATATAATAAAGTAAATAATGAAACAGCTAAGCAAATTTCTGAC TTAGCATTCCAAACAGCTAAATTAGGAGTAACAACATTCCCAGAAATGGCTAGTAGTATGAAACCTTTATTTCCTTTATC TTCTACGTTAAATATTAGTATGCAAGAATTGTTTGGTTCAATGGCTACTTTAACAGGTGTAACAGGTAATACTGCTGAAG TGAGTACACAAATGAAAGCTGTATTTAGTAACTTGATTAAACCAACTGGAGACATGGATAAGTTAATAAAGAAATATGGT TATAGTAACGGACAAGCTATGATAAAAGCTAAAGGGCTTACAGGAGTTTTACAGATCTTGCAAAAAGAAACTGGTGGACA ATCAGATAAGTTGGGTAAATTATTTAGTAGTACAGAAGCACTTACAGCAGTTACAGCACTTACTGGAACACAATTTGATA ATTTTAAGGATAAAACAAAGGCTATGAATGATGCTTTAGGTTCTACAGATAAAGCTTTGGAGAAGATTAATAATACTACT GGTAATGATTTAAGAACTTCTTTGAATATGGCTAAAAATAGTCTAGTTGGATTTGGAGAAGTATTAGCACCTTTTATTTC TATGGGAGCTAAGGCATTGAGTACATTAACAAAAGGACTACAAGATATGTCTGGATGGCAAAAGAATTTAGTGGTTGGTT TTGGAGCAACGTTTGTAGGAACTAACTTATTATTAGGTGGTTTTAGTAAACTATCGAAAGGTTTAAAAGATAATATAAAA TTTGCTAAAGACACAGCAAAAGCATTTAAAAATGGTGCTAGTAAATTAAAAGACTTTGCTAAAGCAACAAAAGAAGGTAC TAATATAATTGGAAAATTTGGTAAAGGTATAGTTAATGGTACTAAAACAGTAGCTAGCTTTACTAAAGCAATAATATTAA ATACTGCACAAGGTATAAAAAATGGAGCTATATGGGTAGCTAATAAGGTGAAAATGTTAGCTTATAAAACAGCACAGATT GCCGTAACTGGAGCAACTAAAGCAATGACATTAGCACAAAAAACATTGAATTTAGCGTTATCCATGAATCCAATAGGAGT TGTTATAACATTATTAGTAGCATTAGCAGCAACATTTGTAGTTTTATATAACAAATGTACATGGTTTAGAAATGGAGTTA ATGCGGTATGGGCAGGAGTTAAATCTGTATTTAAAGGTTTTGCTAACTTTTTCAAAGGAGCATTTAGTAGAGATTGGACA CAAACATTTGGTCTACTAGGTATTCAACTTAATAGTTTCTTTGGTACAGTAAGTGCAATATGGAATGGTGTTAAAGGTGT CTTTACTGGAATAATAACATTTATTAAGGGTGTCTTTACTGGAAACTGGAGAAGTGCATTTCAAGGCTTAGCTGATATAG TTAAGTCTATTTTTGGTATGCTAGGTGGAATAATTAAAGCTCCAATTAATGCTGCAATAAGTGGAATTAATATGGCAATT CGAGGAATAAATAGTTTAAGCTTTAATGTACCTTCATGGATTCCTGGCATAGGTGGAAGTCATTTTGGTGTTAACTTACC AACTATACCAGCTTTAGCAGAAGGGGGAATAGTTACTAAAGCAACTATGGCTTTAGTAGGAGAAGGAAAAGAACATGAAG CAGTAATTCCATTGTCAAAGTTAGATAAGTTAGTAAGTAGAAGTGTAGAAAAGGTTCTTAATGCTAAAGAAGATAGTAAA GACAATAAGCCAAACAATAATATTTATGAAATTATAATACCTATAGATGGTAAAACTATCGCTAAAGTAGTTATAGATTC TATGGGAAATATATTAAATAGTAATGCAAATAGTAGAGCAGTTGTAAGGGGAGGTGGAACAAATGCTAGATTTGCTTTTT AA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAACTTTAAACATGGATATATTAGATTTATTAGACTATATAGAGTTTAGTATAAATCAGAGAAATGAGGAGGAGATAGAG TAGAAAGGAGGTAGTTACAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCTTAAATTTTTAAAACAAGATATAGGGGTAAGTATAGTTAGGCGTTCCCCTGCTATACTTGCTAATAAGAACATAAATG TAATAAATAGAGTTGGAGCA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Phage Minor Tail Protein; Phage Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Family Core Region; Phage-Related Protein-Like Protein; Tail Tape Measure Protein; Tail Tape Meausure Protein; TMP Repeat Family; Prophage; Phage Tail Tape Measure Protein Family
Number of amino acids: Translated: 933; Mature: 932
Protein sequence:
>933_residues MAANVKIGANSSDFQKQMKEMTQELKKVSSSFNLANTQAKLFGKSTDLLKSRQSELTSKMQIQNRIIEAQNNNIKKLNGD LDKQKSTQKDLSSKIEETTRKYKESVEATGKNSKESKELAKELKGLKEDYAQNTKAIETNTTKLNNAETKLNNSKKALLE NKKALEEVNKELEKSKLDKFTEGLGKAGEKASKISNKMKPASVAITGLGTAAGYAEMKFEDGVANINTLLDDQSHLDGYK NKVIEVSNDTGKSLEDITDGMYTCISSIGDGGEETAKIFETMAKSAKAGGAETNDAVALISAGMKGYNKVNNETAKQISD LAFQTAKLGVTTFPEMASSMKPLFPLSSTLNISMQELFGSMATLTGVTGNTAEVSTQMKAVFSNLIKPTGDMDKLIKKYG YSNGQAMIKAKGLTGVLQILQKETGGQSDKLGKLFSSTEALTAVTALTGTQFDNFKDKTKAMNDALGSTDKALEKINNTT GNDLRTSLNMAKNSLVGFGEVLAPFISMGAKALSTLTKGLQDMSGWQKNLVVGFGATFVGTNLLLGGFSKLSKGLKDNIK FAKDTAKAFKNGASKLKDFAKATKEGTNIIGKFGKGIVNGTKTVASFTKAIILNTAQGIKNGAIWVANKVKMLAYKTAQI AVTGATKAMTLAQKTLNLALSMNPIGVVITLLVALAATFVVLYNKCTWFRNGVNAVWAGVKSVFKGFANFFKGAFSRDWT QTFGLLGIQLNSFFGTVSAIWNGVKGVFTGIITFIKGVFTGNWRSAFQGLADIVKSIFGMLGGIIKAPINAAISGINMAI RGINSLSFNVPSWIPGIGGSHFGVNLPTIPALAEGGIVTKATMALVGEGKEHEAVIPLSKLDKLVSRSVEKVLNAKEDSK DNKPNNNIYEIIIPIDGKTIAKVVIDSMGNILNSNANSRAVVRGGGTNARFAF
Sequences:
>Translated_933_residues MAANVKIGANSSDFQKQMKEMTQELKKVSSSFNLANTQAKLFGKSTDLLKSRQSELTSKMQIQNRIIEAQNNNIKKLNGD LDKQKSTQKDLSSKIEETTRKYKESVEATGKNSKESKELAKELKGLKEDYAQNTKAIETNTTKLNNAETKLNNSKKALLE NKKALEEVNKELEKSKLDKFTEGLGKAGEKASKISNKMKPASVAITGLGTAAGYAEMKFEDGVANINTLLDDQSHLDGYK NKVIEVSNDTGKSLEDITDGMYTCISSIGDGGEETAKIFETMAKSAKAGGAETNDAVALISAGMKGYNKVNNETAKQISD LAFQTAKLGVTTFPEMASSMKPLFPLSSTLNISMQELFGSMATLTGVTGNTAEVSTQMKAVFSNLIKPTGDMDKLIKKYG YSNGQAMIKAKGLTGVLQILQKETGGQSDKLGKLFSSTEALTAVTALTGTQFDNFKDKTKAMNDALGSTDKALEKINNTT GNDLRTSLNMAKNSLVGFGEVLAPFISMGAKALSTLTKGLQDMSGWQKNLVVGFGATFVGTNLLLGGFSKLSKGLKDNIK FAKDTAKAFKNGASKLKDFAKATKEGTNIIGKFGKGIVNGTKTVASFTKAIILNTAQGIKNGAIWVANKVKMLAYKTAQI AVTGATKAMTLAQKTLNLALSMNPIGVVITLLVALAATFVVLYNKCTWFRNGVNAVWAGVKSVFKGFANFFKGAFSRDWT QTFGLLGIQLNSFFGTVSAIWNGVKGVFTGIITFIKGVFTGNWRSAFQGLADIVKSIFGMLGGIIKAPINAAISGINMAI RGINSLSFNVPSWIPGIGGSHFGVNLPTIPALAEGGIVTKATMALVGEGKEHEAVIPLSKLDKLVSRSVEKVLNAKEDSK DNKPNNNIYEIIIPIDGKTIAKVVIDSMGNILNSNANSRAVVRGGGTNARFAF >Mature_932_residues AANVKIGANSSDFQKQMKEMTQELKKVSSSFNLANTQAKLFGKSTDLLKSRQSELTSKMQIQNRIIEAQNNNIKKLNGDL DKQKSTQKDLSSKIEETTRKYKESVEATGKNSKESKELAKELKGLKEDYAQNTKAIETNTTKLNNAETKLNNSKKALLEN KKALEEVNKELEKSKLDKFTEGLGKAGEKASKISNKMKPASVAITGLGTAAGYAEMKFEDGVANINTLLDDQSHLDGYKN KVIEVSNDTGKSLEDITDGMYTCISSIGDGGEETAKIFETMAKSAKAGGAETNDAVALISAGMKGYNKVNNETAKQISDL AFQTAKLGVTTFPEMASSMKPLFPLSSTLNISMQELFGSMATLTGVTGNTAEVSTQMKAVFSNLIKPTGDMDKLIKKYGY SNGQAMIKAKGLTGVLQILQKETGGQSDKLGKLFSSTEALTAVTALTGTQFDNFKDKTKAMNDALGSTDKALEKINNTTG NDLRTSLNMAKNSLVGFGEVLAPFISMGAKALSTLTKGLQDMSGWQKNLVVGFGATFVGTNLLLGGFSKLSKGLKDNIKF AKDTAKAFKNGASKLKDFAKATKEGTNIIGKFGKGIVNGTKTVASFTKAIILNTAQGIKNGAIWVANKVKMLAYKTAQIA VTGATKAMTLAQKTLNLALSMNPIGVVITLLVALAATFVVLYNKCTWFRNGVNAVWAGVKSVFKGFANFFKGAFSRDWTQ TFGLLGIQLNSFFGTVSAIWNGVKGVFTGIITFIKGVFTGNWRSAFQGLADIVKSIFGMLGGIIKAPINAAISGINMAIR GINSLSFNVPSWIPGIGGSHFGVNLPTIPALAEGGIVTKATMALVGEGKEHEAVIPLSKLDKLVSRSVEKVLNAKEDSKD NKPNNNIYEIIIPIDGKTIAKVVIDSMGNILNSNANSRAVVRGGGTNARFAF
Specific function: Unknown
COG id: COG5283
COG function: function code S; Phage-related tail protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 99624; Mature: 99493
Theoretical pI: Translated: 10.37; Mature: 10.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAANVKIGANSSDFQKQMKEMTQELKKVSSSFNLANTQAKLFGKSTDLLKSRQSELTSKM CCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH QIQNRIIEAQNNNIKKLNGDLDKQKSTQKDLSSKIEETTRKYKESVEATGKNSKESKELA HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH KELKGLKEDYAQNTKAIETNTTKLNNAETKLNNSKKALLENKKALEEVNKELEKSKLDKF HHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEGLGKAGEKASKISNKMKPASVAITGLGTAAGYAEMKFEDGVANINTLLDDQSHLDGYK HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCHHEECCCCHHHHHHHHCCHHHCCHHH NKVIEVSNDTGKSLEDITDGMYTCISSIGDGGEETAKIFETMAKSAKAGGAETNDAVALI CCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH SAGMKGYNKVNNETAKQISDLAFQTAKLGVTTFPEMASSMKPLFPLSSTLNISMQELFGS HHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHH MATLTGVTGNTAEVSTQMKAVFSNLIKPTGDMDKLIKKYGYSNGQAMIKAKGLTGVLQIL HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHH QKETGGQSDKLGKLFSSTEALTAVTALTGTQFDNFKDKTKAMNDALGSTDKALEKINNTT HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCC GNDLRTSLNMAKNSLVGFGEVLAPFISMGAKALSTLTKGLQDMSGWQKNLVVGFGATFVG CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCEEEECCHHHHH TNLLLGGFSKLSKGLKDNIKFAKDTAKAFKNGASKLKDFAKATKEGTNIIGKFGKGIVNG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCH TKTVASFTKAIILNTAQGIKNGAIWVANKVKMLAYKTAQIAVTGATKAMTLAQKTLNLAL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHC SMNPIGVVITLLVALAATFVVLYNKCTWFRNGVNAVWAGVKSVFKGFANFFKGAFSRDWT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH QTFGLLGIQLNSFFGTVSAIWNGVKGVFTGIITFIKGVFTGNWRSAFQGLADIVKSIFGM HHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGGIIKAPINAAISGINMAIRGINSLSFNVPSWIPGIGGSHFGVNLPTIPALAEGGIVTK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHH ATMALVGEGKEHEAVIPLSKLDKLVSRSVEKVLNAKEDSKDNKPNNNIYEIIIPIDGKTI HHHHHHCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHH AKVVIDSMGNILNSNANSRAVVRGGGTNARFAF HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure AANVKIGANSSDFQKQMKEMTQELKKVSSSFNLANTQAKLFGKSTDLLKSRQSELTSKM CCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH QIQNRIIEAQNNNIKKLNGDLDKQKSTQKDLSSKIEETTRKYKESVEATGKNSKESKELA HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH KELKGLKEDYAQNTKAIETNTTKLNNAETKLNNSKKALLENKKALEEVNKELEKSKLDKF HHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEGLGKAGEKASKISNKMKPASVAITGLGTAAGYAEMKFEDGVANINTLLDDQSHLDGYK HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCHHEECCCCHHHHHHHHCCHHHCCHHH NKVIEVSNDTGKSLEDITDGMYTCISSIGDGGEETAKIFETMAKSAKAGGAETNDAVALI CCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH SAGMKGYNKVNNETAKQISDLAFQTAKLGVTTFPEMASSMKPLFPLSSTLNISMQELFGS HHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHH MATLTGVTGNTAEVSTQMKAVFSNLIKPTGDMDKLIKKYGYSNGQAMIKAKGLTGVLQIL HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHH QKETGGQSDKLGKLFSSTEALTAVTALTGTQFDNFKDKTKAMNDALGSTDKALEKINNTT HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCC GNDLRTSLNMAKNSLVGFGEVLAPFISMGAKALSTLTKGLQDMSGWQKNLVVGFGATFVG CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCEEEECCHHHHH TNLLLGGFSKLSKGLKDNIKFAKDTAKAFKNGASKLKDFAKATKEGTNIIGKFGKGIVNG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCH TKTVASFTKAIILNTAQGIKNGAIWVANKVKMLAYKTAQIAVTGATKAMTLAQKTLNLAL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHC SMNPIGVVITLLVALAATFVVLYNKCTWFRNGVNAVWAGVKSVFKGFANFFKGAFSRDWT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH QTFGLLGIQLNSFFGTVSAIWNGVKGVFTGIITFIKGVFTGNWRSAFQGLADIVKSIFGM HHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGGIIKAPINAAISGINMAIRGINSLSFNVPSWIPGIGGSHFGVNLPTIPALAEGGIVTK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHH ATMALVGEGKEHEAVIPLSKLDKLVSRSVEKVLNAKEDSKDNKPNNNIYEIIIPIDGKTI HHHHHHCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHH AKVVIDSMGNILNSNANSRAVVRGGGTNARFAF HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA