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The map label for this gene is yccS [C]

Identifier: 18309951

GI number: 18309951

Start: 1167573

End: 1169483

Strand: Direct

Name: yccS [C]

Synonym: CPE0969

Alternate gene names: 18309951

Gene position: 1167573-1169483 (Clockwise)

Preceding gene: 18309950

Following gene: 18309954

Centisome position: 38.52

GC content: 24.8

Gene sequence:

>1911_bases
ATGTGGAAGAAACAAATTATGTATCTTAAAATGTTTTTGATAGTGGTAATTTCTATACTAATATTTGTTTTATTATTTGG
AAAAGAAAATCTTTTTATTGGATTAGCCGCTGTTATTACAGTTACTACAATGTTTGGAGAGGATTATACAATAAATCCAA
TACATCATACATTATACTTTATTGGAGTTGAACTTTTTGTAGGTTTAGGAGCATATTTTGCAGGATTAAATCCTATTTTA
GGGGCTATAATGACTTTAATTGTATCCTTCTTTATATACTTTGCTTTTACTTATGATACAAAGCCTACTAAATCCTTAGG
ATTTATACAGTTATATTTATTTTTATTATATGAACCAGTTACAACTAGCGAATTACCAAAAAGAGTATTTGCTTTGGTTT
TTGGTGGTATAGTCATAATGACACTTTACTATACTTTAGCTAGATATAATTTTAATAATATATTTAACAAATCAATAAAA
GGGTGTATTAATTCATTAATTGAAAACTTAAATGAATTGATAAATACTGGTTGTATAGAAAAAGATAATAGTGAAAAGGT
GGCTTTAATGATTAAAGAACTTGAGATAAAGGTTCATGAAAGATTGGAATTAGATAAAAATCAAGTTTATTCTATATATT
CAAAAGATTTAATAGTAGTTTTTCTAAAGAGAGTATCAAGTCTTTCATCTGAAGCCATGAAGAGAGATGTTAATAAGGAA
CTTATTAAAAAGACCATTGAATTACTTAAAAATGTGCAAGACTTTATAGAGGATGGAAATAAGGAAGAGTTAAAAAATAT
ACTAAATGAATATTATAATTATTTAGATTCTTTTAAGTTAAGAGATGATTTAGATAGGTATAGCTATTACAATGCTAAAT
TAAGTGTAAAGGAGTTTTTACAAGGACTTAATGTGAAAGAAAATCAGATTGAAAGCTATTCAAATTATATTGCAAATTTT
TTAAAAGCTTTAAAATCTAATTCAAATAATTTTAGAAAAAGCCTAAACATAAGATCCCTAAGATTTAATTTGGCAGTAAA
AGCAGCCATAACATTGGCTTTTTCAGTATTTATAGTAAATTACTTTGAAATTTTTCAAGGTAAGTGGGCATTATTCACTA
TTTCCTTATTATTAATTCCCTATGCTGAACAAAGTAATAAGAAGGCAAAGGCAAGGGTTTTAGGAACTATAATAGGAGCA
ATTTTATTTAATGTAATTTTTTATTTTATTCAGTCAAATGTAATACTGATATTTGCTTTTATAGTTGTTTGTATATACTT
AAGTATGTCTGTTGTTTCTTATAAAATTAGATGTATATTTATAACATTAAATGCATTATTAATGGCTGGGGTAATGGATC
CATCACATACTCCTTATTATGTGCTAAGTGAATATAGGGTATTTTTTATCTTAATAGCATCTATAATTGTTGCTATAGTA
ATGAATTATATTTTCCCTTATAAAATGAAGGATGAAACTAATAAAGCAATAAAATTATATGTTTATTTAAATGAGAGAAT
ATTAGATGGTTTAATAGAAGAAAATTCAGATAAGGAAAAATTAGTATTATCTTTTTTTGAAAGTTATAGAATATGGAAGA
AGATAAATTATAACAATAAAGAGATGAAATCAGAGCAAATTCAAGAGTTATTGATATTGCAAAATGATTTTGTATCAGAT
GTAAACTTCTTAATAAAAAGCCCTATGATACATAATAATAAAAGCTTATTTAAAAAGAGCTTTGAAGACTTTAAAAATTA
CACTAAGAAAAAAGACTTTGAAGATTTAGCAATAGAAGATTTAGAGAAGGCAAAAACAGAAGAAGAGAGATTAATACTTG
TATTGCTTTATAAACTTTTCTATGTGGTAAAAGAGATGGGAAAGTTAAGTGATTTAATATGTAAAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATATTTTTAGCTTATAATATAAGTATAAAACTTAATTATAGTATTATTCTAGAATTTACTATAAAAATAGTATAAGTTT
TTGACAAGAGGTGATAAAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGAGAGTTTATTTAAACTCTCTTTTTTATTCTTCTGGCAAAGTTAAATCGCAGGTTGAAAGCATATTAAGGGTTTC
ATTTACATCATGCTTAACTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 636; Mature: 636

Protein sequence:

>636_residues
MWKKQIMYLKMFLIVVISILIFVLLFGKENLFIGLAAVITVTTMFGEDYTINPIHHTLYFIGVELFVGLGAYFAGLNPIL
GAIMTLIVSFFIYFAFTYDTKPTKSLGFIQLYLFLLYEPVTTSELPKRVFALVFGGIVIMTLYYTLARYNFNNIFNKSIK
GCINSLIENLNELINTGCIEKDNSEKVALMIKELEIKVHERLELDKNQVYSIYSKDLIVVFLKRVSSLSSEAMKRDVNKE
LIKKTIELLKNVQDFIEDGNKEELKNILNEYYNYLDSFKLRDDLDRYSYYNAKLSVKEFLQGLNVKENQIESYSNYIANF
LKALKSNSNNFRKSLNIRSLRFNLAVKAAITLAFSVFIVNYFEIFQGKWALFTISLLLIPYAEQSNKKAKARVLGTIIGA
ILFNVIFYFIQSNVILIFAFIVVCIYLSMSVVSYKIRCIFITLNALLMAGVMDPSHTPYYVLSEYRVFFILIASIIVAIV
MNYIFPYKMKDETNKAIKLYVYLNERILDGLIEENSDKEKLVLSFFESYRIWKKINYNNKEMKSEQIQELLILQNDFVSD
VNFLIKSPMIHNNKSLFKKSFEDFKNYTKKKDFEDLAIEDLEKAKTEEERLILVLLYKLFYVVKEMGKLSDLICKE

Sequences:

>Translated_636_residues
MWKKQIMYLKMFLIVVISILIFVLLFGKENLFIGLAAVITVTTMFGEDYTINPIHHTLYFIGVELFVGLGAYFAGLNPIL
GAIMTLIVSFFIYFAFTYDTKPTKSLGFIQLYLFLLYEPVTTSELPKRVFALVFGGIVIMTLYYTLARYNFNNIFNKSIK
GCINSLIENLNELINTGCIEKDNSEKVALMIKELEIKVHERLELDKNQVYSIYSKDLIVVFLKRVSSLSSEAMKRDVNKE
LIKKTIELLKNVQDFIEDGNKEELKNILNEYYNYLDSFKLRDDLDRYSYYNAKLSVKEFLQGLNVKENQIESYSNYIANF
LKALKSNSNNFRKSLNIRSLRFNLAVKAAITLAFSVFIVNYFEIFQGKWALFTISLLLIPYAEQSNKKAKARVLGTIIGA
ILFNVIFYFIQSNVILIFAFIVVCIYLSMSVVSYKIRCIFITLNALLMAGVMDPSHTPYYVLSEYRVFFILIASIIVAIV
MNYIFPYKMKDETNKAIKLYVYLNERILDGLIEENSDKEKLVLSFFESYRIWKKINYNNKEMKSEQIQELLILQNDFVSD
VNFLIKSPMIHNNKSLFKKSFEDFKNYTKKKDFEDLAIEDLEKAKTEEERLILVLLYKLFYVVKEMGKLSDLICKE
>Mature_636_residues
MWKKQIMYLKMFLIVVISILIFVLLFGKENLFIGLAAVITVTTMFGEDYTINPIHHTLYFIGVELFVGLGAYFAGLNPIL
GAIMTLIVSFFIYFAFTYDTKPTKSLGFIQLYLFLLYEPVTTSELPKRVFALVFGGIVIMTLYYTLARYNFNNIFNKSIK
GCINSLIENLNELINTGCIEKDNSEKVALMIKELEIKVHERLELDKNQVYSIYSKDLIVVFLKRVSSLSSEAMKRDVNKE
LIKKTIELLKNVQDFIEDGNKEELKNILNEYYNYLDSFKLRDDLDRYSYYNAKLSVKEFLQGLNVKENQIESYSNYIANF
LKALKSNSNNFRKSLNIRSLRFNLAVKAAITLAFSVFIVNYFEIFQGKWALFTISLLLIPYAEQSNKKAKARVLGTIIGA
ILFNVIFYFIQSNVILIFAFIVVCIYLSMSVVSYKIRCIFITLNALLMAGVMDPSHTPYYVLSEYRVFFILIASIIVAIV
MNYIFPYKMKDETNKAIKLYVYLNERILDGLIEENSDKEKLVLSFFESYRIWKKINYNNKEMKSEQIQELLILQNDFVSD
VNFLIKSPMIHNNKSLFKKSFEDFKNYTKKKDFEDLAIEDLEKAKTEEERLILVLLYKLFYVVKEMGKLSDLICKE

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74093; Mature: 74093

Theoretical pI: Translated: 9.07; Mature: 9.07

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MWKKQIMYLKMFLIVVISILIFVLLFGKENLFIGLAAVITVTTMFGEDYTINPIHHTLYF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
IGVELFVGLGAYFAGLNPILGAIMTLIVSFFIYFAFTYDTKPTKSLGFIQLYLFLLYEPV
HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC
TTSELPKRVFALVFGGIVIMTLYYTLARYNFNNIFNKSIKGCINSLIENLNELINTGCIE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
KDNSEKVALMIKELEIKVHERLELDKNQVYSIYSKDLIVVFLKRVSSLSSEAMKRDVNKE
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIKKTIELLKNVQDFIEDGNKEELKNILNEYYNYLDSFKLRDDLDRYSYYNAKLSVKEFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
QGLNVKENQIESYSNYIANFLKALKSNSNNFRKSLNIRSLRFNLAVKAAITLAFSVFIVN
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFEIFQGKWALFTISLLLIPYAEQSNKKAKARVLGTIIGAILFNVIFYFIQSNVILIFAF
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVVCIYLSMSVVSYKIRCIFITLNALLMAGVMDPSHTPYYVLSEYRVFFILIASIIVAIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MNYIFPYKMKDETNKAIKLYVYLNERILDGLIEENSDKEKLVLSFFESYRIWKKINYNNK
HHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
EMKSEQIQELLILQNDFVSDVNFLIKSPMIHNNKSLFKKSFEDFKNYTKKKDFEDLAIED
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
LEKAKTEEERLILVLLYKLFYVVKEMGKLSDLICKE
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MWKKQIMYLKMFLIVVISILIFVLLFGKENLFIGLAAVITVTTMFGEDYTINPIHHTLYF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
IGVELFVGLGAYFAGLNPILGAIMTLIVSFFIYFAFTYDTKPTKSLGFIQLYLFLLYEPV
HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC
TTSELPKRVFALVFGGIVIMTLYYTLARYNFNNIFNKSIKGCINSLIENLNELINTGCIE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
KDNSEKVALMIKELEIKVHERLELDKNQVYSIYSKDLIVVFLKRVSSLSSEAMKRDVNKE
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIKKTIELLKNVQDFIEDGNKEELKNILNEYYNYLDSFKLRDDLDRYSYYNAKLSVKEFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
QGLNVKENQIESYSNYIANFLKALKSNSNNFRKSLNIRSLRFNLAVKAAITLAFSVFIVN
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFEIFQGKWALFTISLLLIPYAEQSNKKAKARVLGTIIGAILFNVIFYFIQSNVILIFAF
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVVCIYLSMSVVSYKIRCIFITLNALLMAGVMDPSHTPYYVLSEYRVFFILIASIIVAIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MNYIFPYKMKDETNKAIKLYVYLNERILDGLIEENSDKEKLVLSFFESYRIWKKINYNNK
HHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
EMKSEQIQELLILQNDFVSDVNFLIKSPMIHNNKSLFKKSFEDFKNYTKKKDFEDLAIED
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
LEKAKTEEERLILVLLYKLFYVVKEMGKLSDLICKE
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA