| Definition | Xylella fastidiosa M23 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010577 |
| Length | 2,535,690 |
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The map label for this gene is cheA [H]
Identifier: 182681445
GI number: 182681445
Start: 1060631
End: 1065808
Strand: Direct
Name: cheA [H]
Synonym: XfasM23_0896
Alternate gene names: 182681445
Gene position: 1060631-1065808 (Clockwise)
Preceding gene: 182681444
Following gene: 182681446
Centisome position: 41.83
GC content: 49.05
Gene sequence:
>5178_bases ATGAACGCACTTCGTGATGCGATGAGCCATGCTGTGCTTGGCTGGGTAAAGCCTGATCTAGATGAAGCTTTGGGCCAAGC ACGCCAGGAGATTGAGTTATTCGTTGAGAACCCTGTAGACACTAGTCGGATACTTTCTTGCGCTGATTACCTGCATCAGG TGCAGGGTACCTTGCGAATGCTTGAATTATATGCTCCCGCAATGGTGGCCGAGGAAATGGAACGGCTAGCTAAGGTGATG CAAGTCGATGGAGTCAATGATCGCGAGGAAGCCTGTGCAGTACTGATGCGCGGCACTCTATTGCTGCCTGATTACCTGGA ACGCTTGCAGAACGGTCATCGTGATATTCCAATTGTTCTTCTGCCTCTGCTTAACGAGATCCGTGCTGCGCGTGGCGAAT CAAGATTGAATGAGAATGTGTTATTTGCTTTCGACCCTGAGGTGCGCAATGCCACTGAGGTTGAACTTGATCATGCACGT AGCAGTCTGACTGGATGTAATCGCCAACTGTTGGATACAGCTGCCAGTGCAGTCAAGGAAGAGTTGCTCCGAGTCAAAGA AGCTTTGGATCTGTATCTGCGTATCGGTGGCGATGTTACTGATTTAAGGACGCAGATTACCGTACTGAGTAGTGTTGCTG ATACTTTAGCAATGATGGGTTTGGGCATGGCTGGCAGCTTGGTCCTGCAACAGCGTGATGCGTTATTGCGTATTGTTGAA TCTGATGAGAAAGCTGATGAGGCGCTGTTGTTGGAGATCGCTGGCGCATTGCTCCATGTCGATGCTTCCTTGGACAACCA AGTCGCCAACTTGGGTGCAGAGACTGATGCGGATGTGGTTCTGGCAAACGCAGAAACACGTCGGACGTTAGATGTTCTGG CGCATGAGGCGATTAGCAATTTTACTGCAGCCCGTGAATGCTTTATTGCTTTCATTGAGAGTAATTGGGACCAAGCGCGC 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Upstream 100 bases:
>100_bases TCGGCTTGGAAAGGATGAGCAGATTGAAGTACAGCATCATATCAAAGCGAAATATGTGGTCACCTCATTCTTTGAACGGT GGCGTGGCAGGGGAATTTCG
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGCGTCCAAGGTAAGTTGGTTGCATTACTGGGGTGTGCTGGCTCGGCGAGAAAGCGCTTGCGTGAAGTGTTAATACAAG CAGGTGTTGATCTTGTACTT
Product: CheA signal transduction histidine kinase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1725; Mature: 1725
Protein sequence:
>1725_residues MNALRDAMSHAVLGWVKPDLDEALGQARQEIELFVENPVDTSRILSCADYLHQVQGTLRMLELYAPAMVAEEMERLAKVM QVDGVNDREEACAVLMRGTLLLPDYLERLQNGHRDIPIVLLPLLNEIRAARGESRLNENVLFAFDPEVRNATEVELDHAR SSLTGCNRQLLDTAASAVKEELLRVKEALDLYLRIGGDVTDLRTQITVLSSVADTLAMMGLGMAGSLVLQQRDALLRIVE SDEKADEALLLEIAGALLHVDASLDNQVANLGAETDADVVLANAETRRTLDVLAHEAISNFTAARECFIAFIESNWDQAR LLKVPGLLSEVGGALSILELSQAASYLEGVRRYIECELITKRRVPAARQLDTLADAMASLEYYLEALRERRPGREDILEI TRNSLEALSYWPIPAEEGDSVGSQQSTDVLTLSAVATESMSPNEALPELTVVEDGTVTFQEAVSELLTLVEPESADIFDA SLGEPMQPIVTDLYEGDRRSELPTESMPDDETVIQSIPTVVAPLSSGGFEDDVGVIIDSDIRDVFLEELDEEQGNLRRLL TIWGTAPDDMDSLRQIRRVFHTLKGSGRLVGALTLGHFAWKIENLINRVLDGSRAASPAVVALVERACEVVLPEMNAALR GKASISTDLEATQALIDLVASGEEAFYTSPDSIADDSATLKLVPQLIEGGAPFFVDSVLREILEAEIANHLDTIKDWLNT AAGQSYSVNESLLRAVHTLNGAFAMTKMPEITQVMQSAETYIKRLLTKHQKASVEGVGVLSAMATAIADTLTALRSDSPR IPSFVSLVSCLSELVTTMPDGGQSQQQYFESVAEQNLESVPEQTQDVSLSNDVLTDVYDLSVNLDVLEPLSAVVEPEKHI VDRPQHEVAHQYNNVAASTMSDVVAADSNLDVAAHQYDLVSGNESPADELGLLAFDEPAFELVDLFVEESSDLLDHCDNL LAKLHEAPQDRELLVGLQRDLHTLKGGARMAGINAIGDLGHSIESMLESVMADYIMLNRDDMRLLEYSFDYLHQMLTQTR QHRVVTMPSDLVATLKARTQGATHDGMSNFGEVAELSLIADVSSNTLLDKESQVLPDTPAILPPLSLPIPLEGQDEDSSL ERLVQEQVRVRADLLDRLVNHAGEVAIYRSQLEQRLSAFRNAMSELGRTNTRLRDQLRRLDLETEAQIVARYQHEKSLVS RDFDPLELDRFSTLQQLSRALNESAADLTGLQGVLDELARQYDGLLQQQFRVSSELQDGLMRARMVPFNSILPRLRRVVR QAEADTNKHVHLVLEGTHGELDRNVIDRMVAPLEHMLRNAVAHGLEMPEKRRAAGKADEGKITIQLQREGSEILLKVSDD GAGLDRDAIQRRAKQRGLIPIDVNLSDAELDGIIFTSGFTTYDEVNQLAGRGVGMDVVRSEVSQLGGSVSINSVRGHGVT FTLRLPQTLAVTQAVFIRIGQSTFAVPVASVIGIGRIAHERYKSDHESYHYDGEQYVLYDLGFLIGQPGIHADRQQVPLL LVRTGDLRVAVAVDEVLGNREIVVKPVGLQIASVPGIYGATITGDGCVIVILDLAPLVRRYLNQPIHLEVEEAPVTQSQM PLVMVVDDSLTMRKVTSRVLERHNFSVSVARDGIEALELLEERIPDLMLLDIEMPRMDGYELVAAMRADDRFKSIPILMI TSRSGDKHRQRAFEIGVQRYLGKPYQEFDLMKNVYDLLGVVRVRE
Sequences:
>Translated_1725_residues MNALRDAMSHAVLGWVKPDLDEALGQARQEIELFVENPVDTSRILSCADYLHQVQGTLRMLELYAPAMVAEEMERLAKVM QVDGVNDREEACAVLMRGTLLLPDYLERLQNGHRDIPIVLLPLLNEIRAARGESRLNENVLFAFDPEVRNATEVELDHAR SSLTGCNRQLLDTAASAVKEELLRVKEALDLYLRIGGDVTDLRTQITVLSSVADTLAMMGLGMAGSLVLQQRDALLRIVE SDEKADEALLLEIAGALLHVDASLDNQVANLGAETDADVVLANAETRRTLDVLAHEAISNFTAARECFIAFIESNWDQAR LLKVPGLLSEVGGALSILELSQAASYLEGVRRYIECELITKRRVPAARQLDTLADAMASLEYYLEALRERRPGREDILEI TRNSLEALSYWPIPAEEGDSVGSQQSTDVLTLSAVATESMSPNEALPELTVVEDGTVTFQEAVSELLTLVEPESADIFDA SLGEPMQPIVTDLYEGDRRSELPTESMPDDETVIQSIPTVVAPLSSGGFEDDVGVIIDSDIRDVFLEELDEEQGNLRRLL TIWGTAPDDMDSLRQIRRVFHTLKGSGRLVGALTLGHFAWKIENLINRVLDGSRAASPAVVALVERACEVVLPEMNAALR GKASISTDLEATQALIDLVASGEEAFYTSPDSIADDSATLKLVPQLIEGGAPFFVDSVLREILEAEIANHLDTIKDWLNT AAGQSYSVNESLLRAVHTLNGAFAMTKMPEITQVMQSAETYIKRLLTKHQKASVEGVGVLSAMATAIADTLTALRSDSPR IPSFVSLVSCLSELVTTMPDGGQSQQQYFESVAEQNLESVPEQTQDVSLSNDVLTDVYDLSVNLDVLEPLSAVVEPEKHI VDRPQHEVAHQYNNVAASTMSDVVAADSNLDVAAHQYDLVSGNESPADELGLLAFDEPAFELVDLFVEESSDLLDHCDNL LAKLHEAPQDRELLVGLQRDLHTLKGGARMAGINAIGDLGHSIESMLESVMADYIMLNRDDMRLLEYSFDYLHQMLTQTR QHRVVTMPSDLVATLKARTQGATHDGMSNFGEVAELSLIADVSSNTLLDKESQVLPDTPAILPPLSLPIPLEGQDEDSSL ERLVQEQVRVRADLLDRLVNHAGEVAIYRSQLEQRLSAFRNAMSELGRTNTRLRDQLRRLDLETEAQIVARYQHEKSLVS RDFDPLELDRFSTLQQLSRALNESAADLTGLQGVLDELARQYDGLLQQQFRVSSELQDGLMRARMVPFNSILPRLRRVVR QAEADTNKHVHLVLEGTHGELDRNVIDRMVAPLEHMLRNAVAHGLEMPEKRRAAGKADEGKITIQLQREGSEILLKVSDD GAGLDRDAIQRRAKQRGLIPIDVNLSDAELDGIIFTSGFTTYDEVNQLAGRGVGMDVVRSEVSQLGGSVSINSVRGHGVT FTLRLPQTLAVTQAVFIRIGQSTFAVPVASVIGIGRIAHERYKSDHESYHYDGEQYVLYDLGFLIGQPGIHADRQQVPLL LVRTGDLRVAVAVDEVLGNREIVVKPVGLQIASVPGIYGATITGDGCVIVILDLAPLVRRYLNQPIHLEVEEAPVTQSQM PLVMVVDDSLTMRKVTSRVLERHNFSVSVARDGIEALELLEERIPDLMLLDIEMPRMDGYELVAAMRADDRFKSIPILMI TSRSGDKHRQRAFEIGVQRYLGKPYQEFDLMKNVYDLLGVVRVRE >Mature_1725_residues MNALRDAMSHAVLGWVKPDLDEALGQARQEIELFVENPVDTSRILSCADYLHQVQGTLRMLELYAPAMVAEEMERLAKVM QVDGVNDREEACAVLMRGTLLLPDYLERLQNGHRDIPIVLLPLLNEIRAARGESRLNENVLFAFDPEVRNATEVELDHAR SSLTGCNRQLLDTAASAVKEELLRVKEALDLYLRIGGDVTDLRTQITVLSSVADTLAMMGLGMAGSLVLQQRDALLRIVE SDEKADEALLLEIAGALLHVDASLDNQVANLGAETDADVVLANAETRRTLDVLAHEAISNFTAARECFIAFIESNWDQAR LLKVPGLLSEVGGALSILELSQAASYLEGVRRYIECELITKRRVPAARQLDTLADAMASLEYYLEALRERRPGREDILEI TRNSLEALSYWPIPAEEGDSVGSQQSTDVLTLSAVATESMSPNEALPELTVVEDGTVTFQEAVSELLTLVEPESADIFDA SLGEPMQPIVTDLYEGDRRSELPTESMPDDETVIQSIPTVVAPLSSGGFEDDVGVIIDSDIRDVFLEELDEEQGNLRRLL TIWGTAPDDMDSLRQIRRVFHTLKGSGRLVGALTLGHFAWKIENLINRVLDGSRAASPAVVALVERACEVVLPEMNAALR GKASISTDLEATQALIDLVASGEEAFYTSPDSIADDSATLKLVPQLIEGGAPFFVDSVLREILEAEIANHLDTIKDWLNT AAGQSYSVNESLLRAVHTLNGAFAMTKMPEITQVMQSAETYIKRLLTKHQKASVEGVGVLSAMATAIADTLTALRSDSPR IPSFVSLVSCLSELVTTMPDGGQSQQQYFESVAEQNLESVPEQTQDVSLSNDVLTDVYDLSVNLDVLEPLSAVVEPEKHI VDRPQHEVAHQYNNVAASTMSDVVAADSNLDVAAHQYDLVSGNESPADELGLLAFDEPAFELVDLFVEESSDLLDHCDNL LAKLHEAPQDRELLVGLQRDLHTLKGGARMAGINAIGDLGHSIESMLESVMADYIMLNRDDMRLLEYSFDYLHQMLTQTR QHRVVTMPSDLVATLKARTQGATHDGMSNFGEVAELSLIADVSSNTLLDKESQVLPDTPAILPPLSLPIPLEGQDEDSSL ERLVQEQVRVRADLLDRLVNHAGEVAIYRSQLEQRLSAFRNAMSELGRTNTRLRDQLRRLDLETEAQIVARYQHEKSLVS RDFDPLELDRFSTLQQLSRALNESAADLTGLQGVLDELARQYDGLLQQQFRVSSELQDGLMRARMVPFNSILPRLRRVVR QAEADTNKHVHLVLEGTHGELDRNVIDRMVAPLEHMLRNAVAHGLEMPEKRRAAGKADEGKITIQLQREGSEILLKVSDD GAGLDRDAIQRRAKQRGLIPIDVNLSDAELDGIIFTSGFTTYDEVNQLAGRGVGMDVVRSEVSQLGGSVSINSVRGHGVT FTLRLPQTLAVTQAVFIRIGQSTFAVPVASVIGIGRIAHERYKSDHESYHYDGEQYVLYDLGFLIGQPGIHADRQQVPLL LVRTGDLRVAVAVDEVLGNREIVVKPVGLQIASVPGIYGATITGDGCVIVILDLAPLVRRYLNQPIHLEVEEAPVTQSQM PLVMVVDDSLTMRKVTSRVLERHNFSVSVARDGIEALELLEERIPDLMLLDIEMPRMDGYELVAAMRADDRFKSIPILMI TSRSGDKHRQRAFEIGVQRYLGKPYQEFDLMKNVYDLLGVVRVRE
Specific function: Involved in the transmission of sensory signals from the chemoreceptors to the flagellar motors. CheA is autophosphorylated; it can transfer its phosphate group to either CheB or CheY [H]
COG id: COG0643
COG function: function code NT; Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 HPt domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788197, Length=344, Percent_Identity=35.1744186046512, Blast_Score=216, Evalue=1e-56, Organism=Escherichia coli, GI1788191, Length=121, Percent_Identity=32.2314049586777, Blast_Score=67, Evalue=1e-11, Organism=Escherichia coli, GI1786599, Length=112, Percent_Identity=30.3571428571429, Blast_Score=66, Evalue=3e-11, Organism=Escherichia coli, GI145693157, Length=404, Percent_Identity=21.5346534653465, Blast_Score=65, Evalue=3e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003594 - InterPro: IPR002545 - InterPro: IPR004358 - InterPro: IPR008207 - InterPro: IPR004105 - InterPro: IPR005467 - InterPro: IPR009082 - InterPro: IPR010808 [H]
Pfam domain/function: PF01584 CheW; PF02895 H-kinase_dim; PF02518 HATPase_c; PF01627 Hpt; PF07194 P2 [H]
EC number: =2.7.13.3 [H]
Molecular weight: Translated: 190275; Mature: 190275
Theoretical pI: Translated: 4.40; Mature: 4.40
Prosite motif: PS50851 CHEW ; PS50894 HPT ; PS50110 RESPONSE_REGULATORY ; PS50109 HIS_KIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNALRDAMSHAVLGWVKPDLDEALGQARQEIELFVENPVDTSRILSCADYLHQVQGTLRM CCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LELYAPAMVAEEMERLAKVMQVDGVNDREEACAVLMRGTLLLPDYLERLQNGHRDIPIVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH LPLLNEIRAARGESRLNENVLFAFDPEVRNATEVELDHARSSLTGCNRQLLDTAASAVKE HHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH ELLRVKEALDLYLRIGGDVTDLRTQITVLSSVADTLAMMGLGMAGSLVLQQRDALLRIVE HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SDEKADEALLLEIAGALLHVDASLDNQVANLGAETDADVVLANAETRRTLDVLAHEAISN CCCCHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHH FTAARECFIAFIESNWDQARLLKVPGLLSEVGGALSILELSQAASYLEGVRRYIECELIT HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRRVPAARQLDTLADAMASLEYYLEALRERRPGREDILEITRNSLEALSYWPIPAEEGDS HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC VGSQQSTDVLTLSAVATESMSPNEALPELTVVEDGTVTFQEAVSELLTLVEPESADIFDA 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