| Definition | Nostoc sp. PCC 7120, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003272 |
| Length | 6,413,771 |
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The map label for this gene is 17231967
Identifier: 17231967
GI number: 17231967
Start: 5358545
End: 5361274
Strand: Reverse
Name: 17231967
Synonym: all4475
Alternate gene names: NA
Gene position: 5361274-5358545 (Counterclockwise)
Preceding gene: 17231968
Following gene: 17231966
Centisome position: 83.59
GC content: 38.35
Gene sequence:
>2730_bases ATGAACCTGCTGGAAAGCTTAAATAAATTAACTAAGAATCATTTAGGAATAGGAATTGTTGATGCTTGGCTGAAAGCACC ACAAACGAAGGAAGCGAGCCAAAAAGCCGCACAACTAGCCCAAACAAAACACCTGCGGGAAGCCATCACCATCGCCGAAA AAGCCTTGAGTTTTTGGTCGAGAAAACCCGGTTTTTGGGAACGGTTGATTTGCCAAATCCTTTTAGGTAAGCTGGTGAAT CAACTAACTCAGCAATTACAAGAATGGCGCAAACAAGTAGGGATGGTTGACAAACAACTTGCTAGTGCTAAAACTCTGCT CAAACTAGATACTGGCGATCCTTGGGAAACCACAAACCTGGCAAATATCATTACCATTTATCAGCGTTGTAGCAAGATTC TCCACGATGAGAGAATATTGCAAGCAATTAACCAATATCAACAAGAACTACGGAAACGCCACCAGTTCCAAGGATTGGTA AAGCAAGCCGAATCCCTGGCAGAAAATCTATTTTTTAAAAATGCGATCGCCACTTACCAGCAAGCTGAACAACTTTACTC TACACAGGCTGTAACACAAGCCATTGCTACCGCTACACAGCAAGTCCCACAAGAAGAACTGTACGCCGCGAGTTTACAAA GAGTGCGACAAGGGGAAACGGAAGGAAAGCTACGGGGAGCGATCGCCCTTTTAGAATCGGCTTTAGTTAGATTTCCCCGC ACAGATGGACGTGAGTTACTACACAAACTCAAATCACTAGTTAAAGGTAGGGAACTATTTCGCCGAGGTTTAGCAGCAGA AGAAGTTGGTGATTTCCCCACAGCTATTTCTTTATATGAAAATGCTGAATCCCTATTGCCAGAAAGTACTAATTGCCGCA TCAGGTTAGGCTTAGTAACAATTAAAATTCAAGACTGGGAAACAGCATTATCTTACTTGGAAGATTTACCGGGAGAACAA GCGGCATATCTCCGGGGATTTGCTCATGCACAACAGGAAAATTTACAAATAGCCTATCGAGAATGGCAAGGTTTATCGGG CGCACAAATCAGTGAACAACGAGAAATTCTTAAAGTTCTCAGCCAAAGACAACGGCTATGCTCTCTACAAAATATTGAAG AATTAGTTAAGGCTGAAAATCTAGAACAAGCTAAAATAGCTAGTACAGAATTTACCCAAAAATTTGGTTTTAACAAGTTA ATAGAAGAAAATCTCCAACAACATATCCAGCCACGTCTTGAAGCAGCAGTTTGGCAAGGATATCACTGGAAAGTTATTAG CCAACAAGCTGAAAATGATTGGATTGCCAACCCTAATATTATTAATTTACACAATTGGGCAGTAGCCAATTACTATCACG CTCAAAAGGACTCAACTCATCTCATAAATTTAATTATTTCCTTATCCACAGCCTTAGCGAATCTCCACAAAGATGTCAAC CTTCAAGATGTACCTTGGCTGGGAAGCAAACCTGTTGATTTCAACTTAGTATTTAACCAAATAAAAAATAGGATGGAAAC GTTTATTGATACTATAAAAGATAAAAATATTGATAATTATTTAAAGTTTCGTGATTGCTGGCGATTGGAAACCTTAGCCC TAGAAATAATGGGTCAGCCTCCAATCAAAGGAATAAAAATCAACGATATATTTTTAACTCCTGGTTGTTATAATCATTAT CTCGCTCTCGCCCAAAGCAATAATTTCAATCAAATAGATCCTAACCAAAAAATTCTACATTGCTTATACACAAATTGGGG ATTAGCAGTAGCAGCTTGTGTGGCAGGAGATAGCCAAAGAGCAATTAAACTTAAACCTATAAATCCAGCAATTTCTGAGT TAGAAATATTTGCTAATAACTTTGTTGCTTACTATGAAGGATGCTATTACCTACAACAGCATAAATGGCGTGAGGCAATT AATCCACTCAAGCAAGCAAAATCAGAAATTCAGGTTAATAAAGAATGGCAAAATGAAGTAGATAGACTTTGCTTATTACA GCGTCAAGACATCTCCGAAGACCATGAACATTTAGTTCTTGCCCAATTTTGGTACGATATTTTAGACAGTCCCAAGGCGA GAAATTATTTAGCTGAATACAAAGCAGAAAAAGTCAGAGAGCAAGTTGCTAATAAACAGATATCTAAGCAGAAAGCTCTT AAAGAACTAGAGAAAATTAAACTAATTGATGCTGATAATCCGATTGTCATTGATCTAATTCAGCGAATTGAAGTGGCATT AGCAGTAGAAGTAATTGAAGAACTTTTAAATAAAAATAATCTGGAAGGAGCAGTGAATTTTGCCAAACAAAACCGACATC CTAAGGTTAAAAATATAGTCACTGAAATTTGTGTAGATATTTTAGTCGATGGATTTAAGACCCGAAAAGTGGGCTTTGAA GAGATTTATGATTTAGGTCGTTGGGCTTATGAACTTAGTCCTGATGAGCCAAACATCCAAGAAATCTATCTGATTAGCCA AGAACTACATCAAATCCATCATCTCATCAAACGCGATCGCTATGAAGAAGCTGTCCGCCGCACCCAGTCCTCACAATACG ATGCGATTCGTTCCTATGTGGGTGACTATTTCATGATGACCTTGATTAGAGGAATTAAAAGTGAAACATTATCTACTCAT TTAGTCCATCAATTAGGTCGTTGGGTTTATGAACTTTGTCCTTATGACCCAGATTATCAAGAAATTTACCACCGACTAAA TATCCGTTGA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ACAAAGGTGAGATATGGAACAGAATCCTTACGATATTTTGGGTATATCTCAAGCAGCATCAAAAGCTGAGATTACCAAAG CTGTAGCAGTGGCGATGAAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 909; Mature: 909
Protein sequence:
>909_residues MNLLESLNKLTKNHLGIGIVDAWLKAPQTKEASQKAAQLAQTKHLREAITIAEKALSFWSRKPGFWERLICQILLGKLVN QLTQQLQEWRKQVGMVDKQLASAKTLLKLDTGDPWETTNLANIITIYQRCSKILHDERILQAINQYQQELRKRHQFQGLV KQAESLAENLFFKNAIATYQQAEQLYSTQAVTQAIATATQQVPQEELYAASLQRVRQGETEGKLRGAIALLESALVRFPR TDGRELLHKLKSLVKGRELFRRGLAAEEVGDFPTAISLYENAESLLPESTNCRIRLGLVTIKIQDWETALSYLEDLPGEQ AAYLRGFAHAQQENLQIAYREWQGLSGAQISEQREILKVLSQRQRLCSLQNIEELVKAENLEQAKIASTEFTQKFGFNKL IEENLQQHIQPRLEAAVWQGYHWKVISQQAENDWIANPNIINLHNWAVANYYHAQKDSTHLINLIISLSTALANLHKDVN LQDVPWLGSKPVDFNLVFNQIKNRMETFIDTIKDKNIDNYLKFRDCWRLETLALEIMGQPPIKGIKINDIFLTPGCYNHY LALAQSNNFNQIDPNQKILHCLYTNWGLAVAACVAGDSQRAIKLKPINPAISELEIFANNFVAYYEGCYYLQQHKWREAI NPLKQAKSEIQVNKEWQNEVDRLCLLQRQDISEDHEHLVLAQFWYDILDSPKARNYLAEYKAEKVREQVANKQISKQKAL KELEKIKLIDADNPIVIDLIQRIEVALAVEVIEELLNKNNLEGAVNFAKQNRHPKVKNIVTEICVDILVDGFKTRKVGFE EIYDLGRWAYELSPDEPNIQEIYLISQELHQIHHLIKRDRYEEAVRRTQSSQYDAIRSYVGDYFMMTLIRGIKSETLSTH LVHQLGRWVYELCPYDPDYQEIYHRLNIR
Sequences:
>Translated_909_residues MNLLESLNKLTKNHLGIGIVDAWLKAPQTKEASQKAAQLAQTKHLREAITIAEKALSFWSRKPGFWERLICQILLGKLVN QLTQQLQEWRKQVGMVDKQLASAKTLLKLDTGDPWETTNLANIITIYQRCSKILHDERILQAINQYQQELRKRHQFQGLV KQAESLAENLFFKNAIATYQQAEQLYSTQAVTQAIATATQQVPQEELYAASLQRVRQGETEGKLRGAIALLESALVRFPR TDGRELLHKLKSLVKGRELFRRGLAAEEVGDFPTAISLYENAESLLPESTNCRIRLGLVTIKIQDWETALSYLEDLPGEQ AAYLRGFAHAQQENLQIAYREWQGLSGAQISEQREILKVLSQRQRLCSLQNIEELVKAENLEQAKIASTEFTQKFGFNKL IEENLQQHIQPRLEAAVWQGYHWKVISQQAENDWIANPNIINLHNWAVANYYHAQKDSTHLINLIISLSTALANLHKDVN LQDVPWLGSKPVDFNLVFNQIKNRMETFIDTIKDKNIDNYLKFRDCWRLETLALEIMGQPPIKGIKINDIFLTPGCYNHY LALAQSNNFNQIDPNQKILHCLYTNWGLAVAACVAGDSQRAIKLKPINPAISELEIFANNFVAYYEGCYYLQQHKWREAI NPLKQAKSEIQVNKEWQNEVDRLCLLQRQDISEDHEHLVLAQFWYDILDSPKARNYLAEYKAEKVREQVANKQISKQKAL KELEKIKLIDADNPIVIDLIQRIEVALAVEVIEELLNKNNLEGAVNFAKQNRHPKVKNIVTEICVDILVDGFKTRKVGFE EIYDLGRWAYELSPDEPNIQEIYLISQELHQIHHLIKRDRYEEAVRRTQSSQYDAIRSYVGDYFMMTLIRGIKSETLSTH LVHQLGRWVYELCPYDPDYQEIYHRLNIR >Mature_909_residues MNLLESLNKLTKNHLGIGIVDAWLKAPQTKEASQKAAQLAQTKHLREAITIAEKALSFWSRKPGFWERLICQILLGKLVN QLTQQLQEWRKQVGMVDKQLASAKTLLKLDTGDPWETTNLANIITIYQRCSKILHDERILQAINQYQQELRKRHQFQGLV KQAESLAENLFFKNAIATYQQAEQLYSTQAVTQAIATATQQVPQEELYAASLQRVRQGETEGKLRGAIALLESALVRFPR TDGRELLHKLKSLVKGRELFRRGLAAEEVGDFPTAISLYENAESLLPESTNCRIRLGLVTIKIQDWETALSYLEDLPGEQ AAYLRGFAHAQQENLQIAYREWQGLSGAQISEQREILKVLSQRQRLCSLQNIEELVKAENLEQAKIASTEFTQKFGFNKL IEENLQQHIQPRLEAAVWQGYHWKVISQQAENDWIANPNIINLHNWAVANYYHAQKDSTHLINLIISLSTALANLHKDVN LQDVPWLGSKPVDFNLVFNQIKNRMETFIDTIKDKNIDNYLKFRDCWRLETLALEIMGQPPIKGIKINDIFLTPGCYNHY LALAQSNNFNQIDPNQKILHCLYTNWGLAVAACVAGDSQRAIKLKPINPAISELEIFANNFVAYYEGCYYLQQHKWREAI NPLKQAKSEIQVNKEWQNEVDRLCLLQRQDISEDHEHLVLAQFWYDILDSPKARNYLAEYKAEKVREQVANKQISKQKAL KELEKIKLIDADNPIVIDLIQRIEVALAVEVIEELLNKNNLEGAVNFAKQNRHPKVKNIVTEICVDILVDGFKTRKVGFE EIYDLGRWAYELSPDEPNIQEIYLISQELHQIHHLIKRDRYEEAVRRTQSSQYDAIRSYVGDYFMMTLIRGIKSETLSTH LVHQLGRWVYELCPYDPDYQEIYHRLNIR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 105089; Mature: 105089
Theoretical pI: Translated: 7.14; Mature: 7.14
Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNLLESLNKLTKNHLGIGIVDAWLKAPQTKEASQKAAQLAQTKHLREAITIAEKALSFWS CCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RKPGFWERLICQILLGKLVNQLTQQLQEWRKQVGMVDKQLASAKTLLKLDTGDPWETTNL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHH ANIITIYQRCSKILHDERILQAINQYQQELRKRHQFQGLVKQAESLAENLFFKNAIATYQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QAEQLYSTQAVTQAIATATQQVPQEELYAASLQRVRQGETEGKLRGAIALLESALVRFPR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TDGRELLHKLKSLVKGRELFRRGLAAEEVGDFPTAISLYENAESLLPESTNCRIRLGLVT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEE IKIQDWETALSYLEDLPGEQAAYLRGFAHAQQENLQIAYREWQGLSGAQISEQREILKVL EEECCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH SQRQRLCSLQNIEELVKAENLEQAKIASTEFTQKFGFNKLIEENLQQHIQPRLEAAVWQG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC YHWKVISQQAENDWIANPNIINLHNWAVANYYHAQKDSTHLINLIISLSTALANLHKDVN CCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LQDVPWLGSKPVDFNLVFNQIKNRMETFIDTIKDKNIDNYLKFRDCWRLETLALEIMGQP CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC PIKGIKINDIFLTPGCYNHYLALAQSNNFNQIDPNQKILHCLYTNWGLAVAACVAGDSQR CCCCEEEEEEEECCCHHHHHEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC AIKLKPINPAISELEIFANNFVAYYEGCYYLQQHKWREAINPLKQAKSEIQVNKEWQNEV EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH DRLCLLQRQDISEDHEHLVLAQFWYDILDSPKARNYLAEYKAEKVREQVANKQISKQKAL HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KELEKIKLIDADNPIVIDLIQRIEVALAVEVIEELLNKNNLEGAVNFAKQNRHPKVKNIV HHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHH TEICVDILVDGFKTRKVGFEEIYDLGRWAYELSPDEPNIQEIYLISQELHQIHHLIKRDR HHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YEEAVRRTQSSQYDAIRSYVGDYFMMTLIRGIKSETLSTHLVHQLGRWVYELCPYDPDYQ HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH EIYHRLNIR HHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MNLLESLNKLTKNHLGIGIVDAWLKAPQTKEASQKAAQLAQTKHLREAITIAEKALSFWS CCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RKPGFWERLICQILLGKLVNQLTQQLQEWRKQVGMVDKQLASAKTLLKLDTGDPWETTNL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHH ANIITIYQRCSKILHDERILQAINQYQQELRKRHQFQGLVKQAESLAENLFFKNAIATYQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QAEQLYSTQAVTQAIATATQQVPQEELYAASLQRVRQGETEGKLRGAIALLESALVRFPR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TDGRELLHKLKSLVKGRELFRRGLAAEEVGDFPTAISLYENAESLLPESTNCRIRLGLVT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEE IKIQDWETALSYLEDLPGEQAAYLRGFAHAQQENLQIAYREWQGLSGAQISEQREILKVL EEECCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH SQRQRLCSLQNIEELVKAENLEQAKIASTEFTQKFGFNKLIEENLQQHIQPRLEAAVWQG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC YHWKVISQQAENDWIANPNIINLHNWAVANYYHAQKDSTHLINLIISLSTALANLHKDVN CCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LQDVPWLGSKPVDFNLVFNQIKNRMETFIDTIKDKNIDNYLKFRDCWRLETLALEIMGQP CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC PIKGIKINDIFLTPGCYNHYLALAQSNNFNQIDPNQKILHCLYTNWGLAVAACVAGDSQR CCCCEEEEEEEECCCHHHHHEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC AIKLKPINPAISELEIFANNFVAYYEGCYYLQQHKWREAINPLKQAKSEIQVNKEWQNEV EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH DRLCLLQRQDISEDHEHLVLAQFWYDILDSPKARNYLAEYKAEKVREQVANKQISKQKAL HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KELEKIKLIDADNPIVIDLIQRIEVALAVEVIEELLNKNNLEGAVNFAKQNRHPKVKNIV HHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHH TEICVDILVDGFKTRKVGFEEIYDLGRWAYELSPDEPNIQEIYLISQELHQIHHLIKRDR HHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YEEAVRRTQSSQYDAIRSYVGDYFMMTLIRGIKSETLSTHLVHQLGRWVYELCPYDPDYQ HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH EIYHRLNIR HHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA