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The map label for this gene is 17231419

Identifier: 17231419

GI number: 17231419

Start: 4739740

End: 4742331

Strand: Reverse

Name: 17231419

Synonym: all3927

Alternate gene names: NA

Gene position: 4742331-4739740 (Counterclockwise)

Preceding gene: 17231420

Following gene: 17231416

Centisome position: 73.94

GC content: 31.52

Gene sequence:

>2592_bases
ATGAATACATTATTAATTGGAGACCGGATAGTTAGTTCTTTATCAAAAATTACTGGTCAAAATATAAGTAAAAGCGATGC
TACGCCACAAGTGATATTTATAACTAATCTGATTGTTGTCCTGTTAGGATCAATGTTTATTGATGGCATCGGTACGGATA
AGCAAAAACAAAAAATGCTTGAAATACTGTATCGCTTTATTGAACCAGAAAGTGATACATATAAGTTAGCATATTTAATA
ATCAAAGGAGTAATAAAACATCAGATTTATCGCAAATTTGATGAGTTAGTAATTATAAGCAGCCTTCTTTCTGAATCAGA
AAGGTTGTTACTAATTGGGCTTGGTTATGAAATGTCTACAAGTGATAATAAATTGGGTTTACGTGAACAAAGGTATTTAG
AGATTTTGGCTCATTATTTGGGCGTTAAAACAGAATATTTGGCAGTTCTGGCATCTGCATTTAGACCCCAAGAGAGTTTA
GATATAGCAGTTTTGAATGAGGTGGAAATTTTACTAGATACACCACGTAATCAAGGATTTAAAAATGTAGAGATTAAACC
ACATTCCAATAATTGGAAGACTCTGATTTCCAACTCTAAGACTAACACAAATCAGCCGCGTGTTTCTATATACTATGAAG
GGTTGAAAAAATTTCAAGAGTTTAACCAACAGTTAGGTAATTATTGCAATCAGATTTCTCAAATAGTTCAAACTTGTCAT
GAACTTGGATTTCTAGCTAAAGATTTAATTGACGAAGTGAATGGGTTATCTAAAAAGTTCCAATTACATCGGTTTCGATT
GGCTGTTATTGGTGAGTTTAGTCAAGGAAAATCAACTTTACTAAATGCTTTACTAGGCGAAGAAATTCAACCAATGCGAG
AGATTCCCTGTAATGGGAATATAGTAGTCTTGAAGTATGGAACGCAAAAACGTGTAATTTACCGCTATAAAGATGGAAGC
GAAAAAGAAATACCATTTGATGAGTATCGACAAAAAGTAAGTATTTCTGAAGATATTGCTCTTAACTCTTTAAATAAAGA
ACTCAAACAATCTGATATTAAAGAAATCATAGTTGAACACTCTAATCTGGCATTATGCAATAGTGGTGTAGAAATCATCG
ATTCACCAGGATTAAATGAGAATCCAGAACTCACAGCTATTACTCAAAACTTACTTCAAGATATAGATGCTGCAATTTTT
GTTACTAATGCTTCACGCTCACTGACGCAAGGCGAACGTCAATCATTAAATGAATTGAGGCTTAAACTCAATGGTGGTAA
AGATCAAGAGCCAGCAAATAACTTATTTATCGTTGTCAATTTTATGGATTTAGTGAATACAGAAAAAAGTCGTGATCAGA
TAAAAAAGAGAATTTACAACTTTGTTGAAGGTGAAAAACCAATAATTACCGGAAAAAATCGTGTTCACTTTATTTCAGCC
CAAGCAGCCTTGAGATCGGTTATGTATGGCTATGAAGACGAATATAAAAAAAGCTTTGATACTTTTATTAAATCAATTGA
AAGATTTTTGATCCTCGAACGTGGAAGGCTAAAACTACAGCCATTACCTGATCAACTTAATAAAATAATTCAAAGAATTA
TTAATAATTTGAGAGAATTTAAAGATGAGTTAGAATCTAAAATAAAAATTGCTGAGGAAGGAAAACGTAAAATTTTAGAG
CAAATTGGAGAGTTTAGTGGACGTGATGTAAAAATATGCTTATTGACCATTCAACTAATAGAAAAATCCCTTGAAAAAGC
AAATGTTTCATGGGGTGAGTGGTATGAAGGTTTAGAAGAGCGTATGTTATTGAAAAGTGAACGTTGGAATTCCGAATATA
AGCTCTTTTGGAAACAAGACAAGTTAGTTCGTGATTATATTCAGTGTTTTGTTAGCGATTTATCTGATGAAATTGATGAC
TGGGTTAATAGTCAACTTAAAAATATAATATTAGAAGAAAATTTACAAAATTTAAATCGAAATATCAAGTATGAGTTAGA
TGCAATTCAAGCAGAATTTAATTTATTAGACATGAGAGATAATACTAAATTCAGCGAAAAGTTAAAGCTTTCTATTAATG
AGATTTCTGACCAATTAATTGAATTAGATAATATTGATTTTAGTACTCCATTAAAGGGGGAATTAATGGAGTTTACAAGA
ATTGGCTTTATCCCGACAGCACTAGCTAATGTTAGTGCTGTAATAGGTAATTCTTTTGCATCTATGATGATGGACAGCGA
TAAATTCCATAGCGAAATTAAATTGTCTGTCTTAGAAATTGGGTTGGAAAAGTTTGACGAATCCTTTGATAAAGTTTACG
AAAAAATCCAGGAAAATATCGAGATATTTTTTGATACTAAGGTTGAATCAGTAAGTCGAGTTATTGAAGGAGCTATATAT
ATGTATGAAAAACTTTTAGAGCAGCAAGAAAAATCTAATCAAGCAATGCTAGAGCAACATTATGCAACTAAATCTTTGAT
TTTAGATAAGTGTGAAGAACTTGAAAAACTAAACAGTAGAATTAGCAAAGATATTGCACTTTGGTATTCAGAGGAAATTA
ATAAAGTAGTTATTAAAGCAGCGCATAATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTCATTCATACCGACATGGTATCGGTCAGGCAATTATTATTTTGTTAAATGTATCTGAAACAAAATATTCCATCAAG
CTAATAGAGAATAATTATTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAGTGCTTAATTACGCTTGCGTCAAGTAAGTTGAGTATTTTTGTATATCACTAACTTGAAATTCGCCATAAGTTATGACG
AAATTAATTTCGCCAAAAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF6 [H]

Number of amino acids: Translated: 863; Mature: 863

Protein sequence:

>863_residues
MNTLLIGDRIVSSLSKITGQNISKSDATPQVIFITNLIVVLLGSMFIDGIGTDKQKQKMLEILYRFIEPESDTYKLAYLI
IKGVIKHQIYRKFDELVIISSLLSESERLLLIGLGYEMSTSDNKLGLREQRYLEILAHYLGVKTEYLAVLASAFRPQESL
DIAVLNEVEILLDTPRNQGFKNVEIKPHSNNWKTLISNSKTNTNQPRVSIYYEGLKKFQEFNQQLGNYCNQISQIVQTCH
ELGFLAKDLIDEVNGLSKKFQLHRFRLAVIGEFSQGKSTLLNALLGEEIQPMREIPCNGNIVVLKYGTQKRVIYRYKDGS
EKEIPFDEYRQKVSISEDIALNSLNKELKQSDIKEIIVEHSNLALCNSGVEIIDSPGLNENPELTAITQNLLQDIDAAIF
VTNASRSLTQGERQSLNELRLKLNGGKDQEPANNLFIVVNFMDLVNTEKSRDQIKKRIYNFVEGEKPIITGKNRVHFISA
QAALRSVMYGYEDEYKKSFDTFIKSIERFLILERGRLKLQPLPDQLNKIIQRIINNLREFKDELESKIKIAEEGKRKILE
QIGEFSGRDVKICLLTIQLIEKSLEKANVSWGEWYEGLEERMLLKSERWNSEYKLFWKQDKLVRDYIQCFVSDLSDEIDD
WVNSQLKNIILEENLQNLNRNIKYELDAIQAEFNLLDMRDNTKFSEKLKLSINEISDQLIELDNIDFSTPLKGELMEFTR
IGFIPTALANVSAVIGNSFASMMMDSDKFHSEIKLSVLEIGLEKFDESFDKVYEKIQENIEIFFDTKVESVSRVIEGAIY
MYEKLLEQQEKSNQAMLEQHYATKSLILDKCEELEKLNSRISKDIALWYSEEINKVVIKAAHN

Sequences:

>Translated_863_residues
MNTLLIGDRIVSSLSKITGQNISKSDATPQVIFITNLIVVLLGSMFIDGIGTDKQKQKMLEILYRFIEPESDTYKLAYLI
IKGVIKHQIYRKFDELVIISSLLSESERLLLIGLGYEMSTSDNKLGLREQRYLEILAHYLGVKTEYLAVLASAFRPQESL
DIAVLNEVEILLDTPRNQGFKNVEIKPHSNNWKTLISNSKTNTNQPRVSIYYEGLKKFQEFNQQLGNYCNQISQIVQTCH
ELGFLAKDLIDEVNGLSKKFQLHRFRLAVIGEFSQGKSTLLNALLGEEIQPMREIPCNGNIVVLKYGTQKRVIYRYKDGS
EKEIPFDEYRQKVSISEDIALNSLNKELKQSDIKEIIVEHSNLALCNSGVEIIDSPGLNENPELTAITQNLLQDIDAAIF
VTNASRSLTQGERQSLNELRLKLNGGKDQEPANNLFIVVNFMDLVNTEKSRDQIKKRIYNFVEGEKPIITGKNRVHFISA
QAALRSVMYGYEDEYKKSFDTFIKSIERFLILERGRLKLQPLPDQLNKIIQRIINNLREFKDELESKIKIAEEGKRKILE
QIGEFSGRDVKICLLTIQLIEKSLEKANVSWGEWYEGLEERMLLKSERWNSEYKLFWKQDKLVRDYIQCFVSDLSDEIDD
WVNSQLKNIILEENLQNLNRNIKYELDAIQAEFNLLDMRDNTKFSEKLKLSINEISDQLIELDNIDFSTPLKGELMEFTR
IGFIPTALANVSAVIGNSFASMMMDSDKFHSEIKLSVLEIGLEKFDESFDKVYEKIQENIEIFFDTKVESVSRVIEGAIY
MYEKLLEQQEKSNQAMLEQHYATKSLILDKCEELEKLNSRISKDIALWYSEEINKVVIKAAHN
>Mature_863_residues
MNTLLIGDRIVSSLSKITGQNISKSDATPQVIFITNLIVVLLGSMFIDGIGTDKQKQKMLEILYRFIEPESDTYKLAYLI
IKGVIKHQIYRKFDELVIISSLLSESERLLLIGLGYEMSTSDNKLGLREQRYLEILAHYLGVKTEYLAVLASAFRPQESL
DIAVLNEVEILLDTPRNQGFKNVEIKPHSNNWKTLISNSKTNTNQPRVSIYYEGLKKFQEFNQQLGNYCNQISQIVQTCH
ELGFLAKDLIDEVNGLSKKFQLHRFRLAVIGEFSQGKSTLLNALLGEEIQPMREIPCNGNIVVLKYGTQKRVIYRYKDGS
EKEIPFDEYRQKVSISEDIALNSLNKELKQSDIKEIIVEHSNLALCNSGVEIIDSPGLNENPELTAITQNLLQDIDAAIF
VTNASRSLTQGERQSLNELRLKLNGGKDQEPANNLFIVVNFMDLVNTEKSRDQIKKRIYNFVEGEKPIITGKNRVHFISA
QAALRSVMYGYEDEYKKSFDTFIKSIERFLILERGRLKLQPLPDQLNKIIQRIINNLREFKDELESKIKIAEEGKRKILE
QIGEFSGRDVKICLLTIQLIEKSLEKANVSWGEWYEGLEERMLLKSERWNSEYKLFWKQDKLVRDYIQCFVSDLSDEIDD
WVNSQLKNIILEENLQNLNRNIKYELDAIQAEFNLLDMRDNTKFSEKLKLSINEISDQLIELDNIDFSTPLKGELMEFTR
IGFIPTALANVSAVIGNSFASMMMDSDKFHSEIKLSVLEIGLEKFDESFDKVYEKIQENIEIFFDTKVESVSRVIEGAIY
MYEKLLEQQEKSNQAMLEQHYATKSLILDKCEELEKLNSRISKDIALWYSEEINKVVIKAAHN

Specific function: Unknown

COG id: COG0699

COG function: function code R; Predicted GTPases (dynamin-related)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.genitalium MG148 [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI189083768, Length=290, Percent_Identity=23.1034482758621, Blast_Score=67, Evalue=8e-11,
Organism=Homo sapiens, GI7662004, Length=290, Percent_Identity=23.1034482758621, Blast_Score=67, Evalue=8e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001401 [H]

Pfam domain/function: PF00350 Dynamin_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 99489; Mature: 99489

Theoretical pI: Translated: 5.10; Mature: 5.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNTLLIGDRIVSSLSKITGQNISKSDATPQVIFITNLIVVLLGSMFIDGIGTDKQKQKML
CCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
EILYRFIEPESDTYKLAYLIIKGVIKHQIYRKFDELVIISSLLSESERLLLIGLGYEMST
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCEECC
SDNKLGLREQRYLEILAHYLGVKTEYLAVLASAFRPQESLDIAVLNEVEILLDTPRNQGF
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCEEEEEECCCCCCC
KNVEIKPHSNNWKTLISNSKTNTNQPRVSIYYEGLKKFQEFNQQLGNYCNQISQIVQTCH
CEEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELGFLAKDLIDEVNGLSKKFQLHRFRLAVIGEFSQGKSTLLNALLGEEIQPMREIPCNGN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCC
IVVLKYGTQKRVIYRYKDGSEKEIPFDEYRQKVSISEDIALNSLNKELKQSDIKEIIVEH
EEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SNLALCNSGVEIIDSPGLNENPELTAITQNLLQDIDAAIFVTNASRSLTQGERQSLNELR
CCEEEECCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
LKLNGGKDQEPANNLFIVVNFMDLVNTEKSRDQIKKRIYNFVEGEKPIITGKNRVHFISA
EEECCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCEEEEEEH
QAALRSVMYGYEDEYKKSFDTFIKSIERFLILERGRLKLQPLPDQLNKIIQRIINNLREF
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDELESKIKIAEEGKRKILEQIGEFSGRDVKICLLTIQLIEKSLEKANVSWGEWYEGLEE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
RMLLKSERWNSEYKLFWKQDKLVRDYIQCFVSDLSDEIDDWVNSQLKNIILEENLQNLNR
HHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NIKYELDAIQAEFNLLDMRDNTKFSEKLKLSINEISDQLIELDNIDFSTPLKGELMEFTR
CCEEEHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
IGFIPTALANVSAVIGNSFASMMMDSDKFHSEIKLSVLEIGLEKFDESFDKVYEKIQENI
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
EIFFDTKVESVSRVIEGAIYMYEKLLEQQEKSNQAMLEQHYATKSLILDKCEELEKLNSR
EEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISKDIALWYSEEINKVVIKAAHN
HHHHHHHHHHHHHCHHHHEECCC
>Mature Secondary Structure
MNTLLIGDRIVSSLSKITGQNISKSDATPQVIFITNLIVVLLGSMFIDGIGTDKQKQKML
CCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
EILYRFIEPESDTYKLAYLIIKGVIKHQIYRKFDELVIISSLLSESERLLLIGLGYEMST
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCEECC
SDNKLGLREQRYLEILAHYLGVKTEYLAVLASAFRPQESLDIAVLNEVEILLDTPRNQGF
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCEEEEEECCCCCCC
KNVEIKPHSNNWKTLISNSKTNTNQPRVSIYYEGLKKFQEFNQQLGNYCNQISQIVQTCH
CEEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELGFLAKDLIDEVNGLSKKFQLHRFRLAVIGEFSQGKSTLLNALLGEEIQPMREIPCNGN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCC
IVVLKYGTQKRVIYRYKDGSEKEIPFDEYRQKVSISEDIALNSLNKELKQSDIKEIIVEH
EEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SNLALCNSGVEIIDSPGLNENPELTAITQNLLQDIDAAIFVTNASRSLTQGERQSLNELR
CCEEEECCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
LKLNGGKDQEPANNLFIVVNFMDLVNTEKSRDQIKKRIYNFVEGEKPIITGKNRVHFISA
EEECCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCEEEEEEH
QAALRSVMYGYEDEYKKSFDTFIKSIERFLILERGRLKLQPLPDQLNKIIQRIINNLREF
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HHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NIKYELDAIQAEFNLLDMRDNTKFSEKLKLSINEISDQLIELDNIDFSTPLKGELMEFTR
CCEEEHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
IGFIPTALANVSAVIGNSFASMMMDSDKFHSEIKLSVLEIGLEKFDESFDKVYEKIQENI
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
EIFFDTKVESVSRVIEGAIYMYEKLLEQQEKSNQAMLEQHYATKSLILDKCEELEKLNSR
EEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISKDIALWYSEEINKVVIKAAHN
HHHHHHHHHHHHHCHHHHEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8920183 [H]