| Definition | Nostoc sp. PCC 7120, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003272 |
| Length | 6,413,771 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 17229053
Identifier: 17229053
GI number: 17229053
Start: 1824897
End: 1827590
Strand: Direct
Name: 17229053
Synonym: alr1561
Alternate gene names: NA
Gene position: 1824897-1827590 (Clockwise)
Preceding gene: 17229052
Following gene: 17229054
Centisome position: 28.45
GC content: 38.68
Gene sequence:
>2694_bases ATGATTAAGCGCAGTCGGCTTTTAAATGGCCTTCCAAAGTCTTTGGAGGAGCGTTATTTCACCGAAATTCGCCCCCAGCT TTACGAAAATCATGCACATCGTCATCAGTACGGAGTAAGAACAGGTACAACCCTTGCAGAACACCTCGATTCTGCGTGTC AGTTCATTTTGACAGTCAGCCGAATCGCAGAAGTCCCAGAAGATAAAAGACCTTTGCTACTAGCTGCAACTGCGGTTCAT GACCTGAATAAATTAGATACCCAAGGACGCAATGTTAAAACCCTAGCCAGAAATCAGGCATTTTTACGAGAACAGCTTGA AAAGGCTTGTGTACTTAGCTTTGTTGTTTCAGAAGCTGATTTGGAGTTAGTCAGAAAGCTAATTGAGCGCCATTCAGGTC ATAACGTCAGCGATGGAGCAAGATTTTTACCAGAAGACCCAAATATTGAACGATGGGCGGCGATGCTTACATCTGCGGAT TTATTTGATTTAGGAATTCCAGATGCACAACGTTTTCGCAAACTGGAAAAAGAGTTAACAGTTGCTTTTGGACGAAGCTG TAACCTCTTTAGAATCCGCATCTCTGAGGATAAAGGCTATATTACAGCCCTATTGCTGGGTGCTTGCGAAGAAGTTTTAC AAAAACATGGGTTAAATCCTTTAGCGATTTTCCCTGATGGCGAACTTTTTGAAGGAGGAGCTTTACCAAATGTTGATTTG ACACAAGAAATAGCTGCTGTTTGGCAAATTAAAATTGACCAAGTTTTTGGAAATAATATCGAAAGACTTGTCAGAGCTAC TAAGGATGGTATTAAGATTTCTCATCAAGCTATCCAACAAAATATTGAAGAAGTATTAGTAAATGTTGAGGCTCTTTTAG AAAGAAAAAAAGCTGGTTATAAACCAGACAAGATTTCTAAAGATATAACTAAATGGGGTGAAGCGGCTGGTGCAGATGCA ATAATAAAAGCATCTGAACTTCAGTTATTACCTGTAAGCAATGCAGAAGAATTTGCCATATCTGAAGGTTTGAAGGCAGC TTATCTTAGTTACCGTGAAGCCGGATTAAATCCTAAAGAAGCTTGGGATAAAATTGCTCATCATACGGGTATATCTGAAC TCCAGCGCACTGCAATTGAGTCGTTTAATGGTCAATATGGGCGACCTTTATTTGCTGCTAAGGCTGCTGTTAAAGGAATG GAGGGTATTAAAGAAGCTCTACAAGAATCTTTCCAACTAAGAAAAGAAAGTACACAAATATCTGAGGAAACAGAAGTATC TGAAGAGATGATTGCAGCTGTTAGCAGAATGGTAAATTTACCTTTTGCTATTCGCTTAAATGGAGTCGATCATTTAAATG CTTATGTAGAAGCAAATCCCAGACAAAGATGCTCTTTAGGTTCTACTTCTACTGATATAGATGAGCTAATTTCAGATAAT ATGCCTCCTGGTACAAAAGTACAAGCTTTTTCTAACCGCTTACCAGGTGGTATCAGTGCTGAACCGAAAAGACAAGCAGA TTCAATTGCAGCTTTAGCCTATCAATTAATGGCAGTTGGGGCAAACTTTCCTGCTGTTAAAAAACAAGACCCGCTTTATT TGCACTTAGCATTACCTAAAGGTTCTGCACCAGAACTGTTGAGAATTTGGCGTGGACTTTTAAAACAACTTGCAGCGACA AATGCTGAAGGTGGTACTGTCACTATTGATGAATTGAAATTATATAAAGATAACCTGCTTGAATTTAAAGCTAACAAAGT AGTCGGTTTAGCATTACCAAAGCGTCCTGATTTTGTTCATACATCTGTCATTATTCCTTTACTTTGGGGAGATGTTAATA ATTCTTTAGCTTTACTAAAATCACTGAGACTTGCTTTAGAAATTTCCTTATCTTTAGATATTGGCTTTCCTTTTACCTTG AGTAGCAATCTAGAGGTGGAGTTATTTAGTGATGTTTACGGACGAATAGAGGGAATTCCTTCTGCGCTGCAAACTTTATT AGGAAATGGACAATATCAGCAACGCCAAGATGCAGAAAAAATTCTTGAGCGACTACGTTGCATTGGCAAACTAGCAACAT CTGTTGCAAGTATTCAGAAAGCTGATGATTGTTTGTATGATTTGGCTCGTGCTTGTGTCAGACCAATTGAACTTTATTAT GTGTTGCTGCGTTGGACTCTGCGAGAACAAGACGAACCAAATTTGAGTGTTATTTGGAGTCGCATTTGTGAGCCGTTAAA TATTTTACTGGAGAGCTTTATGCCGGATGAAAACTTACTCTTAACTAAATATCTTAAGGAAGCTGCTCAAGTTGCAGCAG AGGGAAAAATTTGGGGAAGTTCTTTTAAACGAACTGCTCAAGCAGAACCATTTACAGCTTTTATTGCTGCTATTCGTTCT CAAAAGTCTTATTTGGGATTAGATGTAATTTTTGCTGCTTTAGTACAGCAATATCATACTCGCTTAGACCGTATCCGTGA GCATGGCGTAGGTGCGACAAAGTATGAACAGGTCAAGCGTTATTACGAGCTATTACGAAAACTATATGAGGAGGTTTATT CAGCACGTCCTGAAAAGTTTTTATCTGACCAAAAAACTTTAGAAGCTGCTTATCTATTCTTCCTTGAGGAAGCACGTAAA CAACTTAAAAGTCAATCTGAAGATGATTCTATCGCAACAACTACAACTGTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTAAAAATTATTACTAGTGGCGCAATTAATTAGGACGGACTATGGTGTTTGTTGACCACTTAATGAGACTGAGTTTGGTA TTAAATCTATATCTTTCAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAATTAGGAGTTTTTCATCATGTCCATTTCAAAACTTTCTTCAGTTCTAGCAACAAGTTATGAGAATTTCCCCAAGGGA CGTTTTATCACTTTAGTTAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 897; Mature: 897
Protein sequence:
>897_residues MIKRSRLLNGLPKSLEERYFTEIRPQLYENHAHRHQYGVRTGTTLAEHLDSACQFILTVSRIAEVPEDKRPLLLAATAVH DLNKLDTQGRNVKTLARNQAFLREQLEKACVLSFVVSEADLELVRKLIERHSGHNVSDGARFLPEDPNIERWAAMLTSAD LFDLGIPDAQRFRKLEKELTVAFGRSCNLFRIRISEDKGYITALLLGACEEVLQKHGLNPLAIFPDGELFEGGALPNVDL TQEIAAVWQIKIDQVFGNNIERLVRATKDGIKISHQAIQQNIEEVLVNVEALLERKKAGYKPDKISKDITKWGEAAGADA IIKASELQLLPVSNAEEFAISEGLKAAYLSYREAGLNPKEAWDKIAHHTGISELQRTAIESFNGQYGRPLFAAKAAVKGM EGIKEALQESFQLRKESTQISEETEVSEEMIAAVSRMVNLPFAIRLNGVDHLNAYVEANPRQRCSLGSTSTDIDELISDN MPPGTKVQAFSNRLPGGISAEPKRQADSIAALAYQLMAVGANFPAVKKQDPLYLHLALPKGSAPELLRIWRGLLKQLAAT NAEGGTVTIDELKLYKDNLLEFKANKVVGLALPKRPDFVHTSVIIPLLWGDVNNSLALLKSLRLALEISLSLDIGFPFTL SSNLEVELFSDVYGRIEGIPSALQTLLGNGQYQQRQDAEKILERLRCIGKLATSVASIQKADDCLYDLARACVRPIELYY VLLRWTLREQDEPNLSVIWSRICEPLNILLESFMPDENLLLTKYLKEAAQVAAEGKIWGSSFKRTAQAEPFTAFIAAIRS QKSYLGLDVIFAALVQQYHTRLDRIREHGVGATKYEQVKRYYELLRKLYEEVYSARPEKFLSDQKTLEAAYLFFLEEARK QLKSQSEDDSIATTTTV
Sequences:
>Translated_897_residues MIKRSRLLNGLPKSLEERYFTEIRPQLYENHAHRHQYGVRTGTTLAEHLDSACQFILTVSRIAEVPEDKRPLLLAATAVH DLNKLDTQGRNVKTLARNQAFLREQLEKACVLSFVVSEADLELVRKLIERHSGHNVSDGARFLPEDPNIERWAAMLTSAD LFDLGIPDAQRFRKLEKELTVAFGRSCNLFRIRISEDKGYITALLLGACEEVLQKHGLNPLAIFPDGELFEGGALPNVDL TQEIAAVWQIKIDQVFGNNIERLVRATKDGIKISHQAIQQNIEEVLVNVEALLERKKAGYKPDKISKDITKWGEAAGADA IIKASELQLLPVSNAEEFAISEGLKAAYLSYREAGLNPKEAWDKIAHHTGISELQRTAIESFNGQYGRPLFAAKAAVKGM EGIKEALQESFQLRKESTQISEETEVSEEMIAAVSRMVNLPFAIRLNGVDHLNAYVEANPRQRCSLGSTSTDIDELISDN MPPGTKVQAFSNRLPGGISAEPKRQADSIAALAYQLMAVGANFPAVKKQDPLYLHLALPKGSAPELLRIWRGLLKQLAAT NAEGGTVTIDELKLYKDNLLEFKANKVVGLALPKRPDFVHTSVIIPLLWGDVNNSLALLKSLRLALEISLSLDIGFPFTL SSNLEVELFSDVYGRIEGIPSALQTLLGNGQYQQRQDAEKILERLRCIGKLATSVASIQKADDCLYDLARACVRPIELYY VLLRWTLREQDEPNLSVIWSRICEPLNILLESFMPDENLLLTKYLKEAAQVAAEGKIWGSSFKRTAQAEPFTAFIAAIRS QKSYLGLDVIFAALVQQYHTRLDRIREHGVGATKYEQVKRYYELLRKLYEEVYSARPEKFLSDQKTLEAAYLFFLEEARK QLKSQSEDDSIATTTTV >Mature_897_residues MIKRSRLLNGLPKSLEERYFTEIRPQLYENHAHRHQYGVRTGTTLAEHLDSACQFILTVSRIAEVPEDKRPLLLAATAVH DLNKLDTQGRNVKTLARNQAFLREQLEKACVLSFVVSEADLELVRKLIERHSGHNVSDGARFLPEDPNIERWAAMLTSAD LFDLGIPDAQRFRKLEKELTVAFGRSCNLFRIRISEDKGYITALLLGACEEVLQKHGLNPLAIFPDGELFEGGALPNVDL TQEIAAVWQIKIDQVFGNNIERLVRATKDGIKISHQAIQQNIEEVLVNVEALLERKKAGYKPDKISKDITKWGEAAGADA IIKASELQLLPVSNAEEFAISEGLKAAYLSYREAGLNPKEAWDKIAHHTGISELQRTAIESFNGQYGRPLFAAKAAVKGM EGIKEALQESFQLRKESTQISEETEVSEEMIAAVSRMVNLPFAIRLNGVDHLNAYVEANPRQRCSLGSTSTDIDELISDN MPPGTKVQAFSNRLPGGISAEPKRQADSIAALAYQLMAVGANFPAVKKQDPLYLHLALPKGSAPELLRIWRGLLKQLAAT NAEGGTVTIDELKLYKDNLLEFKANKVVGLALPKRPDFVHTSVIIPLLWGDVNNSLALLKSLRLALEISLSLDIGFPFTL SSNLEVELFSDVYGRIEGIPSALQTLLGNGQYQQRQDAEKILERLRCIGKLATSVASIQKADDCLYDLARACVRPIELYY VLLRWTLREQDEPNLSVIWSRICEPLNILLESFMPDENLLLTKYLKEAAQVAAEGKIWGSSFKRTAQAEPFTAFIAAIRS QKSYLGLDVIFAALVQQYHTRLDRIREHGVGATKYEQVKRYYELLRKLYEEVYSARPEKFLSDQKTLEAAYLFFLEEARK QLKSQSEDDSIATTTTV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 100410; Mature: 100410
Theoretical pI: Translated: 6.43; Mature: 6.43
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIKRSRLLNGLPKSLEERYFTEIRPQLYENHAHRHQYGVRTGTTLAEHLDSACQFILTVS CCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH RIAEVPEDKRPLLLAATAVHDLNKLDTQGRNVKTLARNQAFLREQLEKACVLSFVVSEAD HHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LELVRKLIERHSGHNVSDGARFLPEDPNIERWAAMLTSADLFDLGIPDAQRFRKLEKELT HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH VAFGRSCNLFRIRISEDKGYITALLLGACEEVLQKHGLNPLAIFPDGELFEGGALPNVDL HHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEECCCCCCCCCH TQEIAAVWQIKIDQVFGNNIERLVRATKDGIKISHQAIQQNIEEVLVNVEALLERKKAGY HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KPDKISKDITKWGEAAGADAIIKASELQLLPVSNAEEFAISEGLKAAYLSYREAGLNPKE CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCEEEEECCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHH AWDKIAHHTGISELQRTAIESFNGQYGRPLFAAKAAVKGMEGIKEALQESFQLRKESTQI HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SEETEVSEEMIAAVSRMVNLPFAIRLNGVDHLNAYVEANPRQRCSLGSTSTDIDELISDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHEECCCHHHCCCCCCCCCHHHHHCCC MPPGTKVQAFSNRLPGGISAEPKRQADSIAALAYQLMAVGANFPAVKKQDPLYLHLALPK CCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCC GSAPELLRIWRGLLKQLAATNAEGGTVTIDELKLYKDNLLEFKANKVVGLALPKRPDFVH CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCH TSVIIPLLWGDVNNSLALLKSLRLALEISLSLDIGFPFTLSSNLEVELFSDVYGRIEGIP HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCH SALQTLLGNGQYQQRQDAEKILERLRCIGKLATSVASIQKADDCLYDLARACVRPIELYY HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLLRWTLREQDEPNLSVIWSRICEPLNILLESFMPDENLLLTKYLKEAAQVAAEGKIWGS HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH SFKRTAQAEPFTAFIAAIRSQKSYLGLDVIFAALVQQYHTRLDRIREHGVGATKYEQVKR HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH YYELLRKLYEEVYSARPEKFLSDQKTLEAAYLFFLEEARKQLKSQSEDDSIATTTTV HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MIKRSRLLNGLPKSLEERYFTEIRPQLYENHAHRHQYGVRTGTTLAEHLDSACQFILTVS CCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH RIAEVPEDKRPLLLAATAVHDLNKLDTQGRNVKTLARNQAFLREQLEKACVLSFVVSEAD HHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LELVRKLIERHSGHNVSDGARFLPEDPNIERWAAMLTSADLFDLGIPDAQRFRKLEKELT HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH VAFGRSCNLFRIRISEDKGYITALLLGACEEVLQKHGLNPLAIFPDGELFEGGALPNVDL HHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEECCCCCCCCCH TQEIAAVWQIKIDQVFGNNIERLVRATKDGIKISHQAIQQNIEEVLVNVEALLERKKAGY HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KPDKISKDITKWGEAAGADAIIKASELQLLPVSNAEEFAISEGLKAAYLSYREAGLNPKE CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCEEEEECCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHH AWDKIAHHTGISELQRTAIESFNGQYGRPLFAAKAAVKGMEGIKEALQESFQLRKESTQI HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SEETEVSEEMIAAVSRMVNLPFAIRLNGVDHLNAYVEANPRQRCSLGSTSTDIDELISDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHEECCCHHHCCCCCCCCCHHHHHCCC MPPGTKVQAFSNRLPGGISAEPKRQADSIAALAYQLMAVGANFPAVKKQDPLYLHLALPK CCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCC GSAPELLRIWRGLLKQLAATNAEGGTVTIDELKLYKDNLLEFKANKVVGLALPKRPDFVH CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCH TSVIIPLLWGDVNNSLALLKSLRLALEISLSLDIGFPFTLSSNLEVELFSDVYGRIEGIP HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCH SALQTLLGNGQYQQRQDAEKILERLRCIGKLATSVASIQKADDCLYDLARACVRPIELYY HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLLRWTLREQDEPNLSVIWSRICEPLNILLESFMPDENLLLTKYLKEAAQVAAEGKIWGS HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH SFKRTAQAEPFTAFIAAIRSQKSYLGLDVIFAALVQQYHTRLDRIREHGVGATKYEQVKR HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH YYELLRKLYEEVYSARPEKFLSDQKTLEAAYLFFLEEARKQLKSQSEDDSIATTTTV HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA