Definition Nostoc sp. PCC 7120, complete genome.
Accession NC_003272
Length 6,413,771

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The map label for this gene is 17229053

Identifier: 17229053

GI number: 17229053

Start: 1824897

End: 1827590

Strand: Direct

Name: 17229053

Synonym: alr1561

Alternate gene names: NA

Gene position: 1824897-1827590 (Clockwise)

Preceding gene: 17229052

Following gene: 17229054

Centisome position: 28.45

GC content: 38.68

Gene sequence:

>2694_bases
ATGATTAAGCGCAGTCGGCTTTTAAATGGCCTTCCAAAGTCTTTGGAGGAGCGTTATTTCACCGAAATTCGCCCCCAGCT
TTACGAAAATCATGCACATCGTCATCAGTACGGAGTAAGAACAGGTACAACCCTTGCAGAACACCTCGATTCTGCGTGTC
AGTTCATTTTGACAGTCAGCCGAATCGCAGAAGTCCCAGAAGATAAAAGACCTTTGCTACTAGCTGCAACTGCGGTTCAT
GACCTGAATAAATTAGATACCCAAGGACGCAATGTTAAAACCCTAGCCAGAAATCAGGCATTTTTACGAGAACAGCTTGA
AAAGGCTTGTGTACTTAGCTTTGTTGTTTCAGAAGCTGATTTGGAGTTAGTCAGAAAGCTAATTGAGCGCCATTCAGGTC
ATAACGTCAGCGATGGAGCAAGATTTTTACCAGAAGACCCAAATATTGAACGATGGGCGGCGATGCTTACATCTGCGGAT
TTATTTGATTTAGGAATTCCAGATGCACAACGTTTTCGCAAACTGGAAAAAGAGTTAACAGTTGCTTTTGGACGAAGCTG
TAACCTCTTTAGAATCCGCATCTCTGAGGATAAAGGCTATATTACAGCCCTATTGCTGGGTGCTTGCGAAGAAGTTTTAC
AAAAACATGGGTTAAATCCTTTAGCGATTTTCCCTGATGGCGAACTTTTTGAAGGAGGAGCTTTACCAAATGTTGATTTG
ACACAAGAAATAGCTGCTGTTTGGCAAATTAAAATTGACCAAGTTTTTGGAAATAATATCGAAAGACTTGTCAGAGCTAC
TAAGGATGGTATTAAGATTTCTCATCAAGCTATCCAACAAAATATTGAAGAAGTATTAGTAAATGTTGAGGCTCTTTTAG
AAAGAAAAAAAGCTGGTTATAAACCAGACAAGATTTCTAAAGATATAACTAAATGGGGTGAAGCGGCTGGTGCAGATGCA
ATAATAAAAGCATCTGAACTTCAGTTATTACCTGTAAGCAATGCAGAAGAATTTGCCATATCTGAAGGTTTGAAGGCAGC
TTATCTTAGTTACCGTGAAGCCGGATTAAATCCTAAAGAAGCTTGGGATAAAATTGCTCATCATACGGGTATATCTGAAC
TCCAGCGCACTGCAATTGAGTCGTTTAATGGTCAATATGGGCGACCTTTATTTGCTGCTAAGGCTGCTGTTAAAGGAATG
GAGGGTATTAAAGAAGCTCTACAAGAATCTTTCCAACTAAGAAAAGAAAGTACACAAATATCTGAGGAAACAGAAGTATC
TGAAGAGATGATTGCAGCTGTTAGCAGAATGGTAAATTTACCTTTTGCTATTCGCTTAAATGGAGTCGATCATTTAAATG
CTTATGTAGAAGCAAATCCCAGACAAAGATGCTCTTTAGGTTCTACTTCTACTGATATAGATGAGCTAATTTCAGATAAT
ATGCCTCCTGGTACAAAAGTACAAGCTTTTTCTAACCGCTTACCAGGTGGTATCAGTGCTGAACCGAAAAGACAAGCAGA
TTCAATTGCAGCTTTAGCCTATCAATTAATGGCAGTTGGGGCAAACTTTCCTGCTGTTAAAAAACAAGACCCGCTTTATT
TGCACTTAGCATTACCTAAAGGTTCTGCACCAGAACTGTTGAGAATTTGGCGTGGACTTTTAAAACAACTTGCAGCGACA
AATGCTGAAGGTGGTACTGTCACTATTGATGAATTGAAATTATATAAAGATAACCTGCTTGAATTTAAAGCTAACAAAGT
AGTCGGTTTAGCATTACCAAAGCGTCCTGATTTTGTTCATACATCTGTCATTATTCCTTTACTTTGGGGAGATGTTAATA
ATTCTTTAGCTTTACTAAAATCACTGAGACTTGCTTTAGAAATTTCCTTATCTTTAGATATTGGCTTTCCTTTTACCTTG
AGTAGCAATCTAGAGGTGGAGTTATTTAGTGATGTTTACGGACGAATAGAGGGAATTCCTTCTGCGCTGCAAACTTTATT
AGGAAATGGACAATATCAGCAACGCCAAGATGCAGAAAAAATTCTTGAGCGACTACGTTGCATTGGCAAACTAGCAACAT
CTGTTGCAAGTATTCAGAAAGCTGATGATTGTTTGTATGATTTGGCTCGTGCTTGTGTCAGACCAATTGAACTTTATTAT
GTGTTGCTGCGTTGGACTCTGCGAGAACAAGACGAACCAAATTTGAGTGTTATTTGGAGTCGCATTTGTGAGCCGTTAAA
TATTTTACTGGAGAGCTTTATGCCGGATGAAAACTTACTCTTAACTAAATATCTTAAGGAAGCTGCTCAAGTTGCAGCAG
AGGGAAAAATTTGGGGAAGTTCTTTTAAACGAACTGCTCAAGCAGAACCATTTACAGCTTTTATTGCTGCTATTCGTTCT
CAAAAGTCTTATTTGGGATTAGATGTAATTTTTGCTGCTTTAGTACAGCAATATCATACTCGCTTAGACCGTATCCGTGA
GCATGGCGTAGGTGCGACAAAGTATGAACAGGTCAAGCGTTATTACGAGCTATTACGAAAACTATATGAGGAGGTTTATT
CAGCACGTCCTGAAAAGTTTTTATCTGACCAAAAAACTTTAGAAGCTGCTTATCTATTCTTCCTTGAGGAAGCACGTAAA
CAACTTAAAAGTCAATCTGAAGATGATTCTATCGCAACAACTACAACTGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTAAAAATTATTACTAGTGGCGCAATTAATTAGGACGGACTATGGTGTTTGTTGACCACTTAATGAGACTGAGTTTGGTA
TTAAATCTATATCTTTCAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAATTAGGAGTTTTTCATCATGTCCATTTCAAAACTTTCTTCAGTTCTAGCAACAAGTTATGAGAATTTCCCCAAGGGA
CGTTTTATCACTTTAGTTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 897; Mature: 897

Protein sequence:

>897_residues
MIKRSRLLNGLPKSLEERYFTEIRPQLYENHAHRHQYGVRTGTTLAEHLDSACQFILTVSRIAEVPEDKRPLLLAATAVH
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QLKSQSEDDSIATTTTV

Sequences:

>Translated_897_residues
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DLNKLDTQGRNVKTLARNQAFLREQLEKACVLSFVVSEADLELVRKLIERHSGHNVSDGARFLPEDPNIERWAAMLTSAD
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QKSYLGLDVIFAALVQQYHTRLDRIREHGVGATKYEQVKRYYELLRKLYEEVYSARPEKFLSDQKTLEAAYLFFLEEARK
QLKSQSEDDSIATTTTV
>Mature_897_residues
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QKSYLGLDVIFAALVQQYHTRLDRIREHGVGATKYEQVKRYYELLRKLYEEVYSARPEKFLSDQKTLEAAYLFFLEEARK
QLKSQSEDDSIATTTTV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100410; Mature: 100410

Theoretical pI: Translated: 6.43; Mature: 6.43

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKRSRLLNGLPKSLEERYFTEIRPQLYENHAHRHQYGVRTGTTLAEHLDSACQFILTVS
CCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RIAEVPEDKRPLLLAATAVHDLNKLDTQGRNVKTLARNQAFLREQLEKACVLSFVVSEAD
HHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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>Mature Secondary Structure
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YYELLRKLYEEVYSARPEKFLSDQKTLEAAYLFFLEEARKQLKSQSEDDSIATTTTV
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA